Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A5N1

Protein Details
Accession Q5A5N1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-351MPKVEKKKETPKKIEKTTVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.833, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036770  Ankyrin_rpt-contain_sf  
IPR047139  ANKZ1/VMS1  
IPR041175  VLRF1/Vms1  
Gene Ontology GO:0036266  C:Cdc48p-Npl4p-Vms1p AAA ATPase complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0004045  F:aminoacyl-tRNA hydrolase activity  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0072671  P:mitochondria-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0071630  P:nuclear protein quality control by the ubiquitin-proteasome system  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG cal:CAALFM_C210850CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18826  bVLRF1  
Amino Acid Sequences MEDFYIYNLSDKVINSLELLYFDSKTSESVKADEPPKTPQPPPNQHDTEYYKSDLYRYNLKRKLNDLPPVTEQQFDKLLEEESIESLSGSDDESDDEDKLQHLIQKLDVKDDDNDDESTVSHLNTKSPFILFGSPLVPADKAIGVYKAVFSPSQLDNPTESLHFPKTGKSALFMIGGGHFAGAIISHTRKNTRGNAPTTKESIQEQAVDIVQSKTFHRYTTRRKQGGSQSASDNARGKANSAGSSIRRYNEQALIQEVRELLHDWKNQLAECTAIYIRANGASNRKVLVGEGSPIQANDPRLRGFPFTTRRATTSELKRAWVELTHLHVVDMPKVEKKKETPKKIEKTTVSPPPPPTNTLSTDLITLLKKQKAPKLINFVKQNSIDVNEFRLDYTHTPTLLHYAAANGLGHMVQVLLVNLKANPIVYNAAGRTPAEVADTSARKVFQIVRHKLGEEYCDWNAAKVAPPKSKEEIEQEERTLHEQLELEKKQLIQQELTKPEPKKVTPSFDLTGLSDQQKMRVLREQRARAAEARMKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.15
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.19
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.26
18 0.32
19 0.37
20 0.41
21 0.4
22 0.42
23 0.49
24 0.52
25 0.55
26 0.55
27 0.61
28 0.66
29 0.68
30 0.71
31 0.67
32 0.63
33 0.65
34 0.64
35 0.59
36 0.53
37 0.51
38 0.43
39 0.39
40 0.4
41 0.38
42 0.36
43 0.4
44 0.44
45 0.52
46 0.57
47 0.63
48 0.65
49 0.64
50 0.7
51 0.67
52 0.68
53 0.62
54 0.61
55 0.59
56 0.6
57 0.56
58 0.5
59 0.41
60 0.36
61 0.36
62 0.31
63 0.27
64 0.22
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.16
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.09
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.27
93 0.27
94 0.31
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.31
99 0.29
100 0.25
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.16
106 0.14
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.17
117 0.19
118 0.16
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.21
145 0.22
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.19
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.24
155 0.23
156 0.21
157 0.21
158 0.19
159 0.2
160 0.17
161 0.15
162 0.11
163 0.12
164 0.09
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.06
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.15
176 0.19
177 0.24
178 0.31
179 0.38
180 0.44
181 0.48
182 0.54
183 0.57
184 0.57
185 0.55
186 0.49
187 0.41
188 0.35
189 0.31
190 0.24
191 0.2
192 0.17
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.22
205 0.3
206 0.4
207 0.5
208 0.6
209 0.58
210 0.59
211 0.64
212 0.67
213 0.67
214 0.6
215 0.52
216 0.43
217 0.45
218 0.44
219 0.4
220 0.33
221 0.24
222 0.23
223 0.2
224 0.19
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.17
230 0.16
231 0.21
232 0.22
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.19
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.19
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.17
256 0.15
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.14
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.18
291 0.17
292 0.23
293 0.28
294 0.31
295 0.34
296 0.34
297 0.35
298 0.36
299 0.38
300 0.38
301 0.4
302 0.44
303 0.4
304 0.41
305 0.39
306 0.37
307 0.34
308 0.26
309 0.21
310 0.14
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.14
320 0.17
321 0.2
322 0.21
323 0.23
324 0.29
325 0.38
326 0.46
327 0.54
328 0.6
329 0.69
330 0.77
331 0.8
332 0.82
333 0.74
334 0.7
335 0.68
336 0.67
337 0.6
338 0.56
339 0.54
340 0.52
341 0.51
342 0.48
343 0.43
344 0.38
345 0.37
346 0.37
347 0.34
348 0.27
349 0.26
350 0.24
351 0.22
352 0.19
353 0.19
354 0.21
355 0.23
356 0.26
357 0.31
358 0.35
359 0.43
360 0.48
361 0.51
362 0.55
363 0.58
364 0.63
365 0.65
366 0.62
367 0.59
368 0.54
369 0.48
370 0.39
371 0.35
372 0.29
373 0.23
374 0.23
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.23
387 0.2
388 0.19
389 0.13
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.1
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.12
425 0.18
426 0.19
427 0.19
428 0.21
429 0.21
430 0.19
431 0.22
432 0.25
433 0.27
434 0.37
435 0.42
436 0.46
437 0.48
438 0.49
439 0.49
440 0.45
441 0.4
442 0.33
443 0.32
444 0.26
445 0.29
446 0.28
447 0.26
448 0.25
449 0.23
450 0.26
451 0.28
452 0.35
453 0.36
454 0.4
455 0.45
456 0.49
457 0.5
458 0.48
459 0.49
460 0.51
461 0.51
462 0.52
463 0.48
464 0.45
465 0.44
466 0.42
467 0.36
468 0.27
469 0.22
470 0.2
471 0.23
472 0.31
473 0.31
474 0.3
475 0.31
476 0.31
477 0.33
478 0.37
479 0.36
480 0.31
481 0.37
482 0.44
483 0.48
484 0.53
485 0.56
486 0.52
487 0.55
488 0.58
489 0.53
490 0.54
491 0.55
492 0.58
493 0.55
494 0.6
495 0.55
496 0.5
497 0.49
498 0.42
499 0.39
500 0.35
501 0.32
502 0.3
503 0.29
504 0.3
505 0.35
506 0.35
507 0.35
508 0.39
509 0.44
510 0.47
511 0.57
512 0.62
513 0.62
514 0.66
515 0.65
516 0.6
517 0.63