FuNGI

A6QVL5

Protein Details

Accession

A6QVL5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
635-659	CATCVKAKQRRATYKNSAPRRATRK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
311-323	GRSGRGRGGSRGS

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 7, mito 4, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	aje:HCAG_01422 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MQRLMVTFEMEKERRKALEEKRKTVELQLRLEEVRERRAAAGQIPSAGHTPTTPTGRTPTRVGKAIAQFKEDVKSMTKPNALTGTSNFLTWNTSMKTKLVDAQCWGIIEKQQVQNPLQDPEWAPFWDARNRWTYAFISNSLGANVRPRFIKNDENRIAYTLWRAIEEEYSIPKTQLRREAVLEFTSLGGTQVTNVHSSPDKFRAAIMKLEMMDAHPPDAWVFDIFYSALPNVWRGYVQKKIEKAQESKSIPVVLDVHLLMEEIRSRLDPPKDKKPAQSVDTAANAAQSGATAAADSANNNSANTSNSARGGRSGRGRGGSRGSGRGGAGNPPTCSECNRSHFGTVFKGVQEKKEKAKKDKDNSGGKTQLVITDGSESFQMANVAKVINVPACFVEPHKDPLTIWDSGAGCHIASDRSRFSTLFTIDGPTVQVANKAVLKVQGVGMASIPVGERLIEFNHVYYVPGLSANLISAGLMERQGYIRRDMHVDAGNYFEFLSPTGNDVFYANLSRNNIYILSDSPPTFDGVMNDQEYGAVAYVAVPKPKTISTDYDPNAGSLGPFNREEVEQLINPKDPDTDSFVISPPNRLPAVVPKQLPFDEWHRRLGHIGENNILKMARDPRFGIAIIGPKKLSFCATCVKAKQRRATYKNSAPRRATRKALKIWVDIFGGGETLGTENDISSYAGKKLAMIITDDATRMRWVFLLERKDETLKYLRIFNQFIKNLLGRGIAIIHSDRGELNSNAATAYMLSEGIKWEPTPPHTP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.44
3	0.5
4	0.52
5	0.59
6	0.63
7	0.68
8	0.69
9	0.72
10	0.68
11	0.68
12	0.66
13	0.62
14	0.59
15	0.54
16	0.51
17	0.47
18	0.48
19	0.46
20	0.4
21	0.4
22	0.35
23	0.33
24	0.31
25	0.35
26	0.36
27	0.33
28	0.36
29	0.3
30	0.31
31	0.3
32	0.29
33	0.27
34	0.24
35	0.2
36	0.14
37	0.18
38	0.2
39	0.25
40	0.24
41	0.25
42	0.32
43	0.37
44	0.41
45	0.43
46	0.47
47	0.48
48	0.51
49	0.51
50	0.51
51	0.55
52	0.61
53	0.56
54	0.5
55	0.46
56	0.43
57	0.45
58	0.38
59	0.32
60	0.26
61	0.29
62	0.3
63	0.35
64	0.37
65	0.34
66	0.37
67	0.4
68	0.37
69	0.35
70	0.33
71	0.33
72	0.29
73	0.29
74	0.25
75	0.2
76	0.21
77	0.19
78	0.23
79	0.18
80	0.2
81	0.22
82	0.23
83	0.25
84	0.24
85	0.31
86	0.3
87	0.3
88	0.3
89	0.32
90	0.31
91	0.3
92	0.29
93	0.23
94	0.22
95	0.24
96	0.29
97	0.31
98	0.33
99	0.37
100	0.38
101	0.42
102	0.42
103	0.4
104	0.34
105	0.32
106	0.3
107	0.27
108	0.29
109	0.22
110	0.21
111	0.21
112	0.25
113	0.29
114	0.29
115	0.31
116	0.33
117	0.35
118	0.35
119	0.35
120	0.33
121	0.3
122	0.32
123	0.29
124	0.27
125	0.27
126	0.26
127	0.23
128	0.22
129	0.18
130	0.22
131	0.21
132	0.2
133	0.21
134	0.22
135	0.27
136	0.31
137	0.41
138	0.41
139	0.5
140	0.53
141	0.55
142	0.54
143	0.5
144	0.46
145	0.37
146	0.33
147	0.26
148	0.21
149	0.18
150	0.18
151	0.17
152	0.17
153	0.18
154	0.16
155	0.16
156	0.19
157	0.19
158	0.19
159	0.21
160	0.24
161	0.28
162	0.35
163	0.35
164	0.35
165	0.38
166	0.4
167	0.4
168	0.37
169	0.32
170	0.23
171	0.19
172	0.16
173	0.13
174	0.1
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.13
183	0.16
184	0.18
185	0.22
186	0.24
187	0.25
188	0.23
189	0.25
190	0.29
191	0.28
192	0.3
193	0.27
194	0.24
195	0.23
196	0.23
197	0.21
198	0.16
199	0.17
200	0.14
201	0.14
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.08
208	0.08
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.12
222	0.16
223	0.23
224	0.28
225	0.32
226	0.36
227	0.41
228	0.47
229	0.51
230	0.51
231	0.49
232	0.53
233	0.5
234	0.48
235	0.44
236	0.38
237	0.31
238	0.29
239	0.24
240	0.15
241	0.15
242	0.12
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.07
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.09
253	0.15
254	0.22
255	0.3
256	0.35
257	0.46
258	0.54
259	0.57
260	0.61
261	0.64
262	0.63
263	0.57
264	0.56
265	0.47
266	0.41
267	0.39
268	0.34
269	0.25
270	0.19
271	0.16
272	0.11
273	0.09
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.18
297	0.19
298	0.21
299	0.24
300	0.26
301	0.26
302	0.29
303	0.31
304	0.3
305	0.31
306	0.31
307	0.28
308	0.27
309	0.26
310	0.23
311	0.21
312	0.21
313	0.18
314	0.17
315	0.18
316	0.18
317	0.17
318	0.17
319	0.19
320	0.17
321	0.19
322	0.21
323	0.23
324	0.26
325	0.29
326	0.29
327	0.29
328	0.3
329	0.3
330	0.27
331	0.24
332	0.2
333	0.17
334	0.22
335	0.21
336	0.25
337	0.3
338	0.31
339	0.37
340	0.44
341	0.5
342	0.53
343	0.63
344	0.66
345	0.68
346	0.73
347	0.73
348	0.75
349	0.72
350	0.69
351	0.61
352	0.52
353	0.44
354	0.36
355	0.28
356	0.2
357	0.16
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.11
382	0.11
383	0.15
384	0.16
385	0.17
386	0.16
387	0.2
388	0.23
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.16
393	0.15
394	0.16
395	0.12
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.07
400	0.07
401	0.1
402	0.1
403	0.12
404	0.14
405	0.14
406	0.15
407	0.18
408	0.18
409	0.17
410	0.16
411	0.16
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.08
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.06
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.07
466	0.11
467	0.13
468	0.16
469	0.18
470	0.19
471	0.21
472	0.22
473	0.24
474	0.24
475	0.23
476	0.19
477	0.2
478	0.19
479	0.16
480	0.16
481	0.12
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.07
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.1
494	0.09
495	0.11
496	0.13
497	0.13
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.12
505	0.14
506	0.14
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.13
514	0.16
515	0.16
516	0.15
517	0.14
518	0.13
519	0.12
520	0.11
521	0.08
522	0.05
523	0.04
524	0.05
525	0.09
526	0.11
527	0.13
528	0.13
529	0.13
530	0.15
531	0.17
532	0.19
533	0.18
534	0.23
535	0.25
536	0.35
537	0.35
538	0.38
539	0.37
540	0.33
541	0.3
542	0.24
543	0.19
544	0.13
545	0.14
546	0.13
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.15
551	0.16
552	0.15
553	0.17
554	0.15
555	0.18
556	0.2
557	0.21
558	0.21
559	0.21
560	0.2
561	0.17
562	0.18
563	0.22
564	0.21
565	0.2
566	0.21
567	0.21
568	0.26
569	0.26
570	0.27
571	0.21
572	0.23
573	0.22
574	0.21
575	0.22
576	0.26
577	0.34
578	0.36
579	0.37
580	0.34
581	0.39
582	0.39
583	0.39
584	0.32
585	0.33
586	0.37
587	0.37
588	0.43
589	0.4
590	0.41
591	0.41
592	0.41
593	0.4
594	0.34
595	0.34
596	0.32
597	0.32
598	0.31
599	0.31
600	0.28
601	0.2
602	0.2
603	0.26
604	0.25
605	0.27
606	0.28
607	0.29
608	0.31
609	0.31
610	0.28
611	0.23
612	0.27
613	0.27
614	0.27
615	0.26
616	0.24
617	0.25
618	0.24
619	0.25
620	0.17
621	0.18
622	0.24
623	0.28
624	0.34
625	0.4
626	0.49
627	0.54
628	0.61
629	0.67
630	0.69
631	0.76
632	0.76
633	0.79
634	0.79
635	0.8
636	0.82
637	0.83
638	0.81
639	0.77
640	0.8
641	0.79
642	0.76
643	0.75
644	0.75
645	0.74
646	0.73
647	0.76
648	0.72
649	0.69
650	0.64
651	0.58
652	0.49
653	0.4
654	0.32
655	0.23
656	0.18
657	0.12
658	0.1
659	0.07
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.06
666	0.07
667	0.08
668	0.09
669	0.11
670	0.12
671	0.14
672	0.14
673	0.14
674	0.17
675	0.18
676	0.18
677	0.18
678	0.19
679	0.19
680	0.2
681	0.2
682	0.17
683	0.16
684	0.17
685	0.15
686	0.14
687	0.13
688	0.14
689	0.21
690	0.27
691	0.34
692	0.35
693	0.38
694	0.4
695	0.43
696	0.41
697	0.4
698	0.4
699	0.38
700	0.37
701	0.41
702	0.44
703	0.47
704	0.51
705	0.51
706	0.53
707	0.5
708	0.5
709	0.48
710	0.44
711	0.38
712	0.35
713	0.3
714	0.2
715	0.19
716	0.18
717	0.13
718	0.15
719	0.15
720	0.15
721	0.15
722	0.16
723	0.15
724	0.16
725	0.21
726	0.18
727	0.2
728	0.19
729	0.19
730	0.18
731	0.18
732	0.15
733	0.1
734	0.11
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.09
739	0.11
740	0.12
741	0.14
742	0.13
743	0.18
744	0.23

A6QVL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer