FuNGI

A6R768

Protein Details

Accession

A6R768

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-114	QYEIRKKYQNLQKVPKQNLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 12.333, cyto 9.5, cyto_mito 6.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	aje:HCAG_05476 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2

Amino Acid Sequences

MSAENSSSKASLFLDSPRKWNLWYTVILDLADELQVLDLISEESPHRMSEIPVPVPPEFPTEHTMEARVKWEMENSKYNNDRNLYKDKLAGADRQYEIRKKYQNLQKVPKQNLDQWLDAWTLIETEIKHSGIDGNFDIWEDFFLINMSIDNPYAATRKREVEIGGKENFSFADVVNDFRSEYRKKGYSKPGPLLSNLATFNGRQAGQSRSRTCVCGSKHSWVKCYYLNPSQRPEGWKENEQRQEQVYTGDSTTRVLEYGTVWTYMTNAAGKQFRVILRNAAYIPLSHTNLIAWKPCYHIGGIYLDGRTFRLRRISNDSIFARIEVYGGLLVTEYHRTSENTLVLANIAPPSNPAEPARISQSEPTKISKSSKSSTTPSYTAKSSTASSKIWHQRLGHPSMRAVEHLPIDAKGVQISDIKDIAKNIDIEDKELCEPCHLAKAKNQISRRPHIRSKLPFERLHADIVQGPSYCYNGERWLIHFDWVIELGLEIEYSSEYIHEQNGAAERAGAIITTRARALRIESLLPQSLFPEIATAAVYLLNRTPTKILGWKSPLRALEEYLHINHHSCAHLRAYGCRAYAKIPNEILNRNRSQKLDPRAHIEYLVEFLDIEVQEPRVGNPQQENNLCSDIDIFHPDEIPPRTESVDKDNEDINEALEAQLMADILPTPDPTSESDSNVSIESDFSIDTHPILSSSNQASRANEISSDFNESNIIEGKRTRKATHHIAVSIAKDNPNRMINAAFAEPLSRSEPLKIHRSQLPDPPQHWNDINKHPYRDEWINAAKREWDSITQQNTYEIVNRPSKDTSVIPLHWVFTYKFDDDGYLVKFKARICVRGDLQPVSDLDTKAHTLAARTFRILLAIINAFDLDAEQLNGVNAFVNSSLDELVYVELPDDGKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.39
4	0.42
5	0.42
6	0.42
7	0.46
8	0.44
9	0.38
10	0.39
11	0.38
12	0.36
13	0.36
14	0.34
15	0.27
16	0.22
17	0.18
18	0.14
19	0.1
20	0.07
21	0.06
22	0.06
23	0.06
24	0.05
25	0.05
26	0.06
27	0.06
28	0.08
29	0.08
30	0.11
31	0.12
32	0.13
33	0.14
34	0.14
35	0.16
36	0.23
37	0.29
38	0.29
39	0.31
40	0.35
41	0.34
42	0.34
43	0.33
44	0.29
45	0.24
46	0.25
47	0.27
48	0.25
49	0.28
50	0.27
51	0.3
52	0.29
53	0.3
54	0.29
55	0.28
56	0.26
57	0.24
58	0.3
59	0.33
60	0.35
61	0.42
62	0.43
63	0.5
64	0.55
65	0.58
66	0.57
67	0.55
68	0.54
69	0.51
70	0.56
71	0.52
72	0.48
73	0.48
74	0.43
75	0.44
76	0.43
77	0.43
78	0.38
79	0.4
80	0.39
81	0.41
82	0.46
83	0.46
84	0.48
85	0.51
86	0.55
87	0.52
88	0.61
89	0.64
90	0.67
91	0.71
92	0.77
93	0.77
94	0.79
95	0.81
96	0.79
97	0.76
98	0.72
99	0.71
100	0.65
101	0.57
102	0.48
103	0.44
104	0.36
105	0.31
106	0.25
107	0.16
108	0.11
109	0.1
110	0.12
111	0.09
112	0.12
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.15
117	0.19
118	0.17
119	0.2
120	0.18
121	0.16
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.11
126	0.11
127	0.1
128	0.09
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.09
140	0.14
141	0.16
142	0.2
143	0.23
144	0.26
145	0.28
146	0.3
147	0.3
148	0.34
149	0.38
150	0.39
151	0.38
152	0.36
153	0.34
154	0.32
155	0.29
156	0.22
157	0.16
158	0.1
159	0.15
160	0.14
161	0.16
162	0.17
163	0.18
164	0.17
165	0.18
166	0.24
167	0.2
168	0.24
169	0.29
170	0.34
171	0.39
172	0.47
173	0.57
174	0.61
175	0.67
176	0.7
177	0.7
178	0.65
179	0.62
180	0.57
181	0.48
182	0.42
183	0.34
184	0.27
185	0.22
186	0.19
187	0.2
188	0.19
189	0.17
190	0.14
191	0.17
192	0.22
193	0.29
194	0.37
195	0.38
196	0.4
197	0.41
198	0.42
199	0.41
200	0.42
201	0.38
202	0.39
203	0.4
204	0.44
205	0.5
206	0.51
207	0.54
208	0.49
209	0.49
210	0.44
211	0.44
212	0.42
213	0.43
214	0.49
215	0.49
216	0.51
217	0.51
218	0.51
219	0.51
220	0.5
221	0.5
222	0.47
223	0.51
224	0.53
225	0.58
226	0.62
227	0.6
228	0.57
229	0.5
230	0.46
231	0.39
232	0.34
233	0.27
234	0.2
235	0.19
236	0.17
237	0.15
238	0.14
239	0.14
240	0.12
241	0.1
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.1
249	0.1
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.08
255	0.12
256	0.14
257	0.14
258	0.15
259	0.18
260	0.19
261	0.21
262	0.22
263	0.23
264	0.23
265	0.26
266	0.25
267	0.22
268	0.2
269	0.17
270	0.2
271	0.19
272	0.18
273	0.16
274	0.16
275	0.15
276	0.18
277	0.19
278	0.19
279	0.17
280	0.16
281	0.19
282	0.2
283	0.21
284	0.18
285	0.17
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.15
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.15
297	0.22
298	0.24
299	0.28
300	0.37
301	0.43
302	0.41
303	0.47
304	0.45
305	0.4
306	0.37
307	0.33
308	0.24
309	0.17
310	0.15
311	0.09
312	0.08
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.13
325	0.16
326	0.16
327	0.14
328	0.14
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.1
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.1
338	0.1
339	0.12
340	0.12
341	0.14
342	0.15
343	0.17
344	0.2
345	0.18
346	0.19
347	0.21
348	0.26
349	0.27
350	0.28
351	0.3
352	0.28
353	0.29
354	0.32
355	0.33
356	0.33
357	0.33
358	0.36
359	0.37
360	0.38
361	0.4
362	0.4
363	0.38
364	0.36
365	0.35
366	0.3
367	0.28
368	0.25
369	0.22
370	0.19
371	0.19
372	0.2
373	0.18
374	0.18
375	0.25
376	0.32
377	0.33
378	0.36
379	0.35
380	0.39
381	0.45
382	0.5
383	0.45
384	0.38
385	0.37
386	0.34
387	0.33
388	0.27
389	0.22
390	0.17
391	0.14
392	0.14
393	0.13
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.14
418	0.15
419	0.14
420	0.1
421	0.1
422	0.09
423	0.16
424	0.16
425	0.16
426	0.19
427	0.29
428	0.35
429	0.41
430	0.43
431	0.44
432	0.48
433	0.55
434	0.58
435	0.55
436	0.54
437	0.54
438	0.59
439	0.58
440	0.62
441	0.63
442	0.62
443	0.57
444	0.55
445	0.53
446	0.46
447	0.41
448	0.32
449	0.24
450	0.2
451	0.19
452	0.17
453	0.13
454	0.12
455	0.1
456	0.11
457	0.1
458	0.08
459	0.08
460	0.09
461	0.11
462	0.11
463	0.12
464	0.16
465	0.17
466	0.17
467	0.16
468	0.14
469	0.13
470	0.13
471	0.11
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.09
490	0.09
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.04
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.11
506	0.13
507	0.14
508	0.15
509	0.16
510	0.18
511	0.19
512	0.19
513	0.17
514	0.13
515	0.12
516	0.11
517	0.09
518	0.07
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.1
529	0.1
530	0.11
531	0.12
532	0.11
533	0.13
534	0.18
535	0.2
536	0.22
537	0.28
538	0.32
539	0.33
540	0.36
541	0.36
542	0.35
543	0.33
544	0.3
545	0.26
546	0.25
547	0.24
548	0.21
549	0.21
550	0.17
551	0.17
552	0.15
553	0.15
554	0.14
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.17
559	0.17
560	0.19
561	0.21
562	0.22
563	0.22
564	0.21
565	0.2
566	0.2
567	0.25
568	0.24
569	0.26
570	0.25
571	0.3
572	0.32
573	0.37
574	0.38
575	0.39
576	0.42
577	0.43
578	0.44
579	0.41
580	0.42
581	0.45
582	0.5
583	0.52
584	0.49
585	0.51
586	0.51
587	0.49
588	0.44
589	0.37
590	0.28
591	0.21
592	0.19
593	0.12
594	0.08
595	0.07
596	0.1
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.1
603	0.11
604	0.15
605	0.16
606	0.18
607	0.22
608	0.26
609	0.32
610	0.34
611	0.34
612	0.3
613	0.31
614	0.28
615	0.23
616	0.19
617	0.13
618	0.12
619	0.14
620	0.13
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.17
625	0.18
626	0.19
627	0.17
628	0.18
629	0.2
630	0.21
631	0.23
632	0.25
633	0.3
634	0.29
635	0.3
636	0.31
637	0.29
638	0.29
639	0.28
640	0.21
641	0.13
642	0.12
643	0.1
644	0.08
645	0.08
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.08
658	0.1
659	0.17
660	0.18
661	0.2
662	0.22
663	0.22
664	0.22
665	0.21
666	0.2
667	0.12
668	0.11
669	0.09
670	0.08
671	0.07
672	0.07
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.09
680	0.09
681	0.12
682	0.16
683	0.19
684	0.23
685	0.24
686	0.25
687	0.28
688	0.29
689	0.25
690	0.23
691	0.21
692	0.2
693	0.19
694	0.25
695	0.21
696	0.19
697	0.19
698	0.18
699	0.18
700	0.21
701	0.2
702	0.15
703	0.2
704	0.24
705	0.31
706	0.35
707	0.36
708	0.37
709	0.44
710	0.52
711	0.55
712	0.55
713	0.48
714	0.48
715	0.48
716	0.44
717	0.41
718	0.34
719	0.32
720	0.29
721	0.3
722	0.32
723	0.31
724	0.29
725	0.27
726	0.25
727	0.21
728	0.22
729	0.21
730	0.16
731	0.13
732	0.13
733	0.12
734	0.13
735	0.15
736	0.14
737	0.14
738	0.17
739	0.22
740	0.26
741	0.34
742	0.34
743	0.37
744	0.4
745	0.46
746	0.47
747	0.52
748	0.56
749	0.56
750	0.56
751	0.6
752	0.57
753	0.55
754	0.55
755	0.52
756	0.5
757	0.52
758	0.59
759	0.55
760	0.57
761	0.54
762	0.53
763	0.53
764	0.51
765	0.44
766	0.41
767	0.45
768	0.48
769	0.48
770	0.47
771	0.44
772	0.4
773	0.4
774	0.36
775	0.3
776	0.29
777	0.36
778	0.4
779	0.37
780	0.37
781	0.35
782	0.34
783	0.31
784	0.3
785	0.27
786	0.28
787	0.33
788	0.34
789	0.36
790	0.37
791	0.37
792	0.35
793	0.33
794	0.33
795	0.33
796	0.33
797	0.34
798	0.33
799	0.33
800	0.3
801	0.32
802	0.26
803	0.23
804	0.28
805	0.23
806	0.23
807	0.22
808	0.23
809	0.21
810	0.24
811	0.23
812	0.21
813	0.2
814	0.21
815	0.24
816	0.23
817	0.31
818	0.31
819	0.34
820	0.35
821	0.44
822	0.45
823	0.5
824	0.54
825	0.47
826	0.44
827	0.41
828	0.36
829	0.33
830	0.35
831	0.27
832	0.24
833	0.25
834	0.25
835	0.22
836	0.24
837	0.19
838	0.18
839	0.25
840	0.31
841	0.3
842	0.3
843	0.31
844	0.29
845	0.29
846	0.27
847	0.2
848	0.18
849	0.17
850	0.15
851	0.14
852	0.14
853	0.12
854	0.12
855	0.11
856	0.08
857	0.07
858	0.07
859	0.07
860	0.08
861	0.08
862	0.09
863	0.08
864	0.08
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.09
869	0.09
870	0.1
871	0.1
872	0.09
873	0.09
874	0.08
875	0.09
876	0.09
877	0.09
878	0.08
879	0.09

A6R768

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer