Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RBM1

Protein Details
Accession A6RBM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24QPTPDDRKPAPAKTHKTWRAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG aje:HCAG_07029  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MNIDQPTPDDRKPAPAKTHKTWRAAIECEEGYPLLRVSKEWIAAELFTTMNNGDSSLTADGNDSEILLVNWIEPPATLVSNPNDVPLDSTALGTTTPNRRFVARLEPPIDMPIIAAAEVYRLLGMNMPVEPKTVTYDGLVVPLPNLTSTGDGQDENSLAAPNGRIHEKVVYSFDDDCQPRKHRHIYTFHPFEHIVGRTIRDLPFSHPRQLADVLPILRQYALLSSLLHRVFVGQNNQTVRSSKSPSAHSVISASPKQTSKSDVTFITNISPTVSKLNAMLSRNDSKHVIERSNGLDSHVNGPFAPAPTTDDRKIDISLRTPILGPPSLMLLFNAPKSGPNASMENPTTITINIDIGLNGNITVSRVSGMWDDINDSGEGLLNDTSRKESQHLHQSLTRVLQISEDFGILVEWVLKWMRNHEDHTNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.69
4 0.72
5 0.82
6 0.8
7 0.79
8 0.76
9 0.74
10 0.7
11 0.65
12 0.6
13 0.55
14 0.47
15 0.41
16 0.37
17 0.29
18 0.23
19 0.21
20 0.17
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.18
25 0.22
26 0.25
27 0.24
28 0.25
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.19
33 0.15
34 0.11
35 0.12
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.09
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.13
66 0.16
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.17
74 0.18
75 0.14
76 0.14
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.15
82 0.21
83 0.24
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.32
88 0.34
89 0.39
90 0.38
91 0.42
92 0.41
93 0.41
94 0.4
95 0.39
96 0.36
97 0.25
98 0.18
99 0.11
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.21
162 0.21
163 0.23
164 0.26
165 0.29
166 0.31
167 0.37
168 0.44
169 0.44
170 0.5
171 0.54
172 0.56
173 0.62
174 0.63
175 0.57
176 0.52
177 0.46
178 0.39
179 0.36
180 0.29
181 0.21
182 0.16
183 0.17
184 0.15
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.18
190 0.26
191 0.28
192 0.32
193 0.31
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.27
198 0.2
199 0.2
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.17
219 0.2
220 0.16
221 0.2
222 0.21
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.25
229 0.25
230 0.28
231 0.29
232 0.32
233 0.34
234 0.31
235 0.27
236 0.25
237 0.22
238 0.23
239 0.21
240 0.19
241 0.19
242 0.19
243 0.21
244 0.2
245 0.23
246 0.22
247 0.23
248 0.25
249 0.23
250 0.25
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.18
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.11
259 0.13
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.15
264 0.18
265 0.19
266 0.21
267 0.23
268 0.3
269 0.3
270 0.31
271 0.28
272 0.26
273 0.31
274 0.33
275 0.29
276 0.24
277 0.27
278 0.28
279 0.3
280 0.28
281 0.24
282 0.22
283 0.22
284 0.25
285 0.23
286 0.21
287 0.17
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.11
293 0.15
294 0.2
295 0.25
296 0.26
297 0.25
298 0.26
299 0.27
300 0.29
301 0.28
302 0.25
303 0.24
304 0.27
305 0.26
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.24
310 0.22
311 0.18
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.12
322 0.13
323 0.16
324 0.18
325 0.16
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.28
330 0.28
331 0.27
332 0.26
333 0.24
334 0.22
335 0.19
336 0.18
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.17
372 0.17
373 0.19
374 0.21
375 0.26
376 0.33
377 0.43
378 0.45
379 0.46
380 0.48
381 0.49
382 0.5
383 0.47
384 0.42
385 0.32
386 0.29
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.21
391 0.17
392 0.14
393 0.12
394 0.12
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.1
401 0.13
402 0.15
403 0.22
404 0.3
405 0.34
406 0.39