Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R686

Protein Details
Accession A6R686    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-104SAKDDRKRGNMSRNERRSRSRDRDERRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRSGBasic
252-276NNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-117SAKDDRKRGNMSRNERRSRSRDRDERRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRSGWKDRDRSGSRGRY
130-177RERGRDRSWSRSLSPARSPARNGSASTRSRRSRSPPPPRGSRPDRRGD
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG aje:HCAG_05144  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPAKRARRTDSSTMWEMNDTKSHSDDYGNNELHGDMSKREASAKDDRKRGNMSRNERRSRSRDRDERRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRSGWKDRDRSGSRGRYTRWGDYGKTAQYRERGRDRSWSRSLSPARSPARNGSASTRSRRSRSPPPPRGSRPDRRGDLPPRDQVRESAKMGANGISSESRRHGSTKSKIQPVLESMDVDIDSADAEDLDQLIRKTMGFSSFRTTQNTKVPGNNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNRPLSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.61
4 0.54
5 0.48
6 0.42
7 0.37
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.27
12 0.28
13 0.25
14 0.27
15 0.28
16 0.3
17 0.36
18 0.34
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.27
23 0.26
24 0.2
25 0.12
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.2
30 0.21
31 0.24
32 0.33
33 0.42
34 0.46
35 0.53
36 0.56
37 0.59
38 0.65
39 0.67
40 0.66
41 0.66
42 0.68
43 0.71
44 0.78
45 0.81
46 0.78
47 0.8
48 0.78
49 0.79
50 0.78
51 0.78
52 0.78
53 0.8
54 0.85
55 0.88
56 0.91
57 0.89
58 0.9
59 0.86
60 0.87
61 0.87
62 0.88
63 0.88
64 0.87
65 0.88
66 0.84
67 0.88
68 0.87
69 0.87
70 0.85
71 0.85
72 0.86
73 0.85
74 0.89
75 0.86
76 0.88
77 0.88
78 0.89
79 0.88
80 0.88
81 0.88
82 0.86
83 0.88
84 0.83
85 0.81
86 0.75
87 0.72
88 0.67
89 0.66
90 0.67
91 0.66
92 0.65
93 0.63
94 0.62
95 0.64
96 0.62
97 0.6
98 0.6
99 0.59
100 0.58
101 0.55
102 0.54
103 0.53
104 0.53
105 0.49
106 0.46
107 0.4
108 0.36
109 0.36
110 0.38
111 0.33
112 0.32
113 0.3
114 0.28
115 0.32
116 0.34
117 0.36
118 0.41
119 0.41
120 0.39
121 0.47
122 0.49
123 0.5
124 0.52
125 0.49
126 0.41
127 0.46
128 0.47
129 0.41
130 0.4
131 0.4
132 0.38
133 0.37
134 0.38
135 0.32
136 0.34
137 0.32
138 0.3
139 0.26
140 0.31
141 0.34
142 0.37
143 0.41
144 0.41
145 0.42
146 0.45
147 0.47
148 0.5
149 0.57
150 0.63
151 0.65
152 0.68
153 0.75
154 0.76
155 0.79
156 0.77
157 0.76
158 0.72
159 0.71
160 0.67
161 0.62
162 0.65
163 0.64
164 0.64
165 0.59
166 0.6
167 0.56
168 0.55
169 0.52
170 0.48
171 0.46
172 0.42
173 0.38
174 0.36
175 0.33
176 0.31
177 0.31
178 0.28
179 0.22
180 0.16
181 0.17
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.28
191 0.36
192 0.45
193 0.5
194 0.56
195 0.57
196 0.56
197 0.55
198 0.48
199 0.45
200 0.35
201 0.27
202 0.2
203 0.19
204 0.17
205 0.14
206 0.11
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.19
224 0.19
225 0.21
226 0.26
227 0.32
228 0.35
229 0.4
230 0.41
231 0.4
232 0.47
233 0.51
234 0.47
235 0.47
236 0.48
237 0.45
238 0.46
239 0.46
240 0.41
241 0.39
242 0.42
243 0.45
244 0.48
245 0.49
246 0.52
247 0.56
248 0.63
249 0.69
250 0.74
251 0.77
252 0.81
253 0.86
254 0.9
255 0.91
256 0.88
257 0.83
258 0.77
259 0.69
260 0.67
261 0.63
262 0.55
263 0.49