Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R5L4

Protein Details
Accession A6R5L4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-163EGQIVPPKKKHPRPHGVGRGTCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-154KKKHPR
477-506SGIKGGGRGRGRGGRGAQNGRAVGGRERRR
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5, mito 4, pero 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG aje:HCAG_04922  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MADADEDALIQPPSSHDQSAHIDQDLSDETQDFRFLNSLSFLPDPNQPPSLPRRGEKDFEPNPTLRQTDVLAASRDAMHNALAYPRLHNPKTRVVGIYCPTGLLRPAHAEGSDSADTESGGQVAVSEERKQEEICKVEDRDEGQIVPPKKKHPRPHGVGRGTCVCVPSPRGQHFRTVGRSDQWNRMWLLPEEALYLLERGSLDIRWPARAGGHGAKSTVTEHGENVEDVDGGVPMSLQAAYACFLGRGGLTLQRYIVYANLRRGGYAVIRAPSWDDCDGNDDNRAVNQVATDAAVAMTGAGIRAHMEQSRGGVINLLTRFFNSLFEPGPARRLAHGPVIGLDDIYRALSIITAHNPEHPEPTSPKHTTPPYCLAYYVYKPSTPFRKSTPGTPDFRLAVIDSRRNPTLPTLHELSALLESTPLDPPHGEKMERLTYMRLRHGWRNVILAVVDQGVVSFLRVADAGFVGVRVYEKGAPSGIKGGGRGRGRGGRGAQNGRAVGGRERRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.25
5 0.32
6 0.37
7 0.37
8 0.31
9 0.29
10 0.27
11 0.3
12 0.28
13 0.22
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.18
19 0.15
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.25
31 0.28
32 0.29
33 0.32
34 0.28
35 0.32
36 0.39
37 0.47
38 0.45
39 0.45
40 0.48
41 0.51
42 0.55
43 0.54
44 0.57
45 0.54
46 0.56
47 0.57
48 0.51
49 0.49
50 0.5
51 0.46
52 0.36
53 0.32
54 0.26
55 0.25
56 0.28
57 0.27
58 0.24
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.19
64 0.15
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.24
73 0.32
74 0.34
75 0.39
76 0.43
77 0.48
78 0.53
79 0.53
80 0.49
81 0.42
82 0.47
83 0.44
84 0.43
85 0.33
86 0.29
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.22
99 0.2
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.17
118 0.21
119 0.24
120 0.25
121 0.26
122 0.3
123 0.3
124 0.31
125 0.34
126 0.31
127 0.28
128 0.27
129 0.24
130 0.21
131 0.27
132 0.27
133 0.31
134 0.33
135 0.39
136 0.48
137 0.56
138 0.63
139 0.68
140 0.75
141 0.77
142 0.84
143 0.85
144 0.83
145 0.76
146 0.7
147 0.63
148 0.55
149 0.47
150 0.37
151 0.28
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.29
156 0.33
157 0.39
158 0.39
159 0.44
160 0.47
161 0.49
162 0.49
163 0.45
164 0.41
165 0.38
166 0.45
167 0.43
168 0.46
169 0.42
170 0.39
171 0.37
172 0.36
173 0.36
174 0.28
175 0.28
176 0.2
177 0.18
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.16
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.16
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.14
246 0.16
247 0.21
248 0.2
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.02
286 0.03
287 0.02
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.12
306 0.14
307 0.13
308 0.14
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.2
322 0.2
323 0.17
324 0.17
325 0.18
326 0.17
327 0.14
328 0.12
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.16
342 0.19
343 0.2
344 0.23
345 0.22
346 0.23
347 0.24
348 0.29
349 0.34
350 0.35
351 0.36
352 0.39
353 0.46
354 0.46
355 0.49
356 0.51
357 0.46
358 0.44
359 0.42
360 0.38
361 0.35
362 0.35
363 0.35
364 0.29
365 0.27
366 0.28
367 0.34
368 0.41
369 0.39
370 0.39
371 0.38
372 0.46
373 0.46
374 0.52
375 0.55
376 0.54
377 0.55
378 0.55
379 0.53
380 0.45
381 0.43
382 0.36
383 0.27
384 0.27
385 0.28
386 0.31
387 0.31
388 0.34
389 0.36
390 0.35
391 0.35
392 0.33
393 0.34
394 0.31
395 0.33
396 0.33
397 0.32
398 0.33
399 0.32
400 0.28
401 0.23
402 0.19
403 0.14
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.15
412 0.23
413 0.26
414 0.25
415 0.24
416 0.3
417 0.35
418 0.37
419 0.36
420 0.34
421 0.36
422 0.41
423 0.46
424 0.45
425 0.45
426 0.51
427 0.57
428 0.57
429 0.54
430 0.52
431 0.46
432 0.41
433 0.36
434 0.28
435 0.22
436 0.15
437 0.13
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.07
457 0.1
458 0.13
459 0.14
460 0.15
461 0.18
462 0.18
463 0.19
464 0.23
465 0.24
466 0.22
467 0.24
468 0.26
469 0.32
470 0.34
471 0.35
472 0.36
473 0.4
474 0.41
475 0.45
476 0.47
477 0.48
478 0.54
479 0.58
480 0.56
481 0.55
482 0.53
483 0.47
484 0.44
485 0.38
486 0.37