FuNGI

A6RDD0

Protein Details

Accession

A6RDD0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-51	GPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGH	Basic
531-550	GTDTGRKKPKNKHADVQVES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-58	RPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGHPGAGPVA
474-487	ERGKKEKGKESDKN
499-524	SGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGSP
535-542	GRKKPKNK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	aje:HCAG_07638 -

Amino Acid Sequences

MSSTPPNRPPVTRPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGHPGAGPVANGRVGSPRPRPLQTAPRSQPSATQPKSAIPSADDLTVNGFSGPLLSKTYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPASEKDDQPSRRHGELNEAEREELEAKKAAREKQRADNLAQIAPSAAVTQKKTNALKQRTQQVFKSEMNPEEIVKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPLDKWYKFTTKTPFKTLSIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKALEEYAKQSRLFTGRKEGHTRVSEGFERDDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDERMYDEEENQEKKEKEALRNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETEQLKEEKPEEERGKKEKGKESDKNSGISTKGTNTPSGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGSPNLSEASGTDTGRKKPKNKHADVQVESRTMSPGPSGQRKPNVAADQASKKRGRNGAPGSGSDGERGAGSGAEMSDSAAAGSKKLKLNPPGVLSKMGTPRGSRPGSPRVNSPVPPTRTSSPGLTTPVSTNLAFPTALEIHSAIPATGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKEGTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.65
4	0.63
5	0.59
6	0.59
7	0.56
8	0.6
9	0.59
10	0.62
11	0.66
12	0.67
13	0.69
14	0.67
15	0.69
16	0.69
17	0.74
18	0.73
19	0.76
20	0.82
21	0.82
22	0.83
23	0.86
24	0.87
25	0.86
26	0.87
27	0.85
28	0.84
29	0.85
30	0.86
31	0.84
32	0.82
33	0.76
34	0.67
35	0.62
36	0.52
37	0.45
38	0.35
39	0.28
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.15
44	0.17
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.18
49	0.21
50	0.28
51	0.33
52	0.39
53	0.44
54	0.47
55	0.53
56	0.55
57	0.63
58	0.62
59	0.67
60	0.64
61	0.66
62	0.67
63	0.61
64	0.6
65	0.58
66	0.62
67	0.53
68	0.53
69	0.46
70	0.47
71	0.51
72	0.46
73	0.38
74	0.29
75	0.31
76	0.27
77	0.29
78	0.23
79	0.19
80	0.2
81	0.19
82	0.17
83	0.13
84	0.11
85	0.08
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.11
90	0.12
91	0.13
92	0.15
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.28
99	0.29
100	0.28
101	0.27
102	0.33
103	0.4
104	0.43
105	0.43
106	0.41
107	0.48
108	0.56
109	0.64
110	0.65
111	0.62
112	0.6
113	0.63
114	0.56
115	0.56
116	0.56
117	0.54
118	0.54
119	0.51
120	0.55
121	0.59
122	0.68
123	0.64
124	0.61
125	0.57
126	0.58
127	0.59
128	0.55
129	0.5
130	0.48
131	0.46
132	0.46
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.57
137	0.62
138	0.65
139	0.74
140	0.76
141	0.75
142	0.73
143	0.71
144	0.64
145	0.6
146	0.52
147	0.45
148	0.38
149	0.36
150	0.35
151	0.31
152	0.3
153	0.27
154	0.33
155	0.34
156	0.36
157	0.44
158	0.43
159	0.42
160	0.45
161	0.42
162	0.44
163	0.47
164	0.49
165	0.46
166	0.41
167	0.38
168	0.35
169	0.36
170	0.28
171	0.21
172	0.17
173	0.15
174	0.15
175	0.2
176	0.25
177	0.3
178	0.38
179	0.45
180	0.49
181	0.55
182	0.63
183	0.62
184	0.59
185	0.58
186	0.51
187	0.45
188	0.39
189	0.29
190	0.21
191	0.18
192	0.15
193	0.1
194	0.09
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.2
199	0.27
200	0.3
201	0.37
202	0.44
203	0.48
204	0.53
205	0.56
206	0.63
207	0.63
208	0.65
209	0.61
210	0.56
211	0.55
212	0.5
213	0.49
214	0.43
215	0.37
216	0.36
217	0.34
218	0.29
219	0.26
220	0.25
221	0.23
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.18
226	0.19
227	0.17
228	0.19
229	0.21
230	0.22
231	0.24
232	0.24
233	0.23
234	0.23
235	0.22
236	0.19
237	0.14
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.14
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.19
273	0.28
274	0.28
275	0.31
276	0.33
277	0.34
278	0.35
279	0.39
280	0.43
281	0.42
282	0.46
283	0.48
284	0.5
285	0.47
286	0.48
287	0.44
288	0.39
289	0.33
290	0.31
291	0.26
292	0.23
293	0.22
294	0.19
295	0.18
296	0.16
297	0.16
298	0.14
299	0.21
300	0.29
301	0.38
302	0.44
303	0.49
304	0.5
305	0.54
306	0.56
307	0.51
308	0.52
309	0.48
310	0.45
311	0.49
312	0.52
313	0.46
314	0.46
315	0.47
316	0.4
317	0.35
318	0.37
319	0.33
320	0.29
321	0.28
322	0.32
323	0.38
324	0.37
325	0.37
326	0.32
327	0.3
328	0.31
329	0.31
330	0.27
331	0.28
332	0.3
333	0.34
334	0.4
335	0.39
336	0.4
337	0.4
338	0.41
339	0.33
340	0.31
341	0.29
342	0.24
343	0.23
344	0.17
345	0.17
346	0.15
347	0.14
348	0.11
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.12
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.09
375	0.11
376	0.13
377	0.16
378	0.19
379	0.28
380	0.32
381	0.38
382	0.43
383	0.49
384	0.48
385	0.46
386	0.44
387	0.38
388	0.33
389	0.28
390	0.23
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.15
397	0.14
398	0.15
399	0.18
400	0.21
401	0.23
402	0.22
403	0.27
404	0.25
405	0.25
406	0.29
407	0.3
408	0.34
409	0.4
410	0.46
411	0.48
412	0.52
413	0.53
414	0.54
415	0.55
416	0.49
417	0.47
418	0.47
419	0.47
420	0.53
421	0.61
422	0.63
423	0.66
424	0.7
425	0.73
426	0.69
427	0.66
428	0.59
429	0.51
430	0.46
431	0.4
432	0.36
433	0.3
434	0.27
435	0.23
436	0.21
437	0.19
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.14
449	0.15
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.15
454	0.17
455	0.18
456	0.18
457	0.2
458	0.28
459	0.33
460	0.37
461	0.42
462	0.45
463	0.53
464	0.54
465	0.59
466	0.58
467	0.6
468	0.64
469	0.66
470	0.68
471	0.69
472	0.67
473	0.62
474	0.54
475	0.48
476	0.39
477	0.33
478	0.27
479	0.2
480	0.24
481	0.23
482	0.27
483	0.25
484	0.3
485	0.35
486	0.36
487	0.37
488	0.35
489	0.37
490	0.39
491	0.43
492	0.46
493	0.41
494	0.45
495	0.46
496	0.43
497	0.41
498	0.39
499	0.41
500	0.4
501	0.47
502	0.5
503	0.55
504	0.63
505	0.65
506	0.69
507	0.71
508	0.72
509	0.69
510	0.62
511	0.57
512	0.5
513	0.48
514	0.4
515	0.31
516	0.28
517	0.24
518	0.22
519	0.23
520	0.25
521	0.29
522	0.38
523	0.45
524	0.48
525	0.56
526	0.66
527	0.71
528	0.74
529	0.77
530	0.78
531	0.81
532	0.76
533	0.73
534	0.67
535	0.57
536	0.5
537	0.42
538	0.33
539	0.24
540	0.2
541	0.14
542	0.15
543	0.21
544	0.29
545	0.34
546	0.39
547	0.46
548	0.49
549	0.51
550	0.55
551	0.52
552	0.45
553	0.44
554	0.43
555	0.46
556	0.48
557	0.52
558	0.49
559	0.47
560	0.52
561	0.56
562	0.55
563	0.55
564	0.56
565	0.58
566	0.56
567	0.54
568	0.52
569	0.47
570	0.42
571	0.33
572	0.27
573	0.18
574	0.15
575	0.14
576	0.09
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.12
591	0.17
592	0.22
593	0.27
594	0.34
595	0.38
596	0.44
597	0.48
598	0.51
599	0.51
600	0.48
601	0.47
602	0.41
603	0.4
604	0.41
605	0.4
606	0.38
607	0.35
608	0.38
609	0.44
610	0.46
611	0.43
612	0.43
613	0.49
614	0.55
615	0.55
616	0.56
617	0.55
618	0.58
619	0.56
620	0.58
621	0.57
622	0.54
623	0.54
624	0.54
625	0.49
626	0.47
627	0.47
628	0.43
629	0.37
630	0.36
631	0.37
632	0.33
633	0.31
634	0.29
635	0.3
636	0.3
637	0.26
638	0.23
639	0.2
640	0.21
641	0.18
642	0.16
643	0.17
644	0.15
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.16
650	0.16
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.09
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.14
665	0.16
666	0.17
667	0.21
668	0.25
669	0.33
670	0.4
671	0.45
672	0.46
673	0.56
674	0.64
675	0.64
676	0.63
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.48
681	0.46
682	0.4
683	0.39
684	0.38
685	0.39
686	0.38
687	0.37
688	0.3
689	0.24
690	0.22
691	0.21
692	0.21
693	0.24
694	0.27
695	0.32
696	0.34
697	0.33
698	0.34
699	0.35
700	0.4

A6RDD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer