Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R4H3

Protein Details
Accession A6R4H3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-146NVGNRVRGRARIRMRRRQGTEVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-140GKSGNVGNRVRGRARIRMRRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, cyto 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG aje:HCAG_04531  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSEMEIDPPVLNRQDDGHLPSSHATSETRTQAGAVAVRSIEGWIVLATNIHEEASEEDVTDLFAEYGEIKNFNLNLDRRTGYVKATKAAIEALNGAKLLDQTIQVDFAFVRPPPSNNKGKSGNVGNRVRGRARIRMRRRQGTEVSALDSPEEKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.23
4 0.27
5 0.28
6 0.25
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.23
11 0.21
12 0.17
13 0.16
14 0.21
15 0.23
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.08
29 0.05
30 0.05
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.07
50 0.04
51 0.03
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.18
69 0.16
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.14
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.13
100 0.15
101 0.22
102 0.29
103 0.37
104 0.38
105 0.45
106 0.46
107 0.47
108 0.51
109 0.53
110 0.53
111 0.54
112 0.56
113 0.57
114 0.57
115 0.59
116 0.55
117 0.54
118 0.51
119 0.52
120 0.58
121 0.62
122 0.66
123 0.72
124 0.8
125 0.83
126 0.85
127 0.83
128 0.79
129 0.74
130 0.71
131 0.62
132 0.55
133 0.46
134 0.4
135 0.33