Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QXU6

Protein Details
Accession A6QXU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-85NGANNRQPMRPRKEAQKPGDSAHydrophilic
402-422EDPRHRNKPPSPKTRRRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-417RNKPPSPKTRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG aje:HCAG_02203  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKLPAPKIKRPPPSYIQTGINGAKPSQPSPSPLGSASNRASLAKQPCSVTPISATAANGANNRQPMRPRKEAQKPGDSASRLQRLSIKHPGADGAITDRNQLKMFPEPYVKTTSYILKKYSKVPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKIFMKHLKAGTVPHDMMEELVRCGVRFYENCLIVRVVDHKSISTQSNTSSNSNSGEKSSPFSLHNYNQHITPSPFVPYPQQNQSKIKPTTNGSSTGSSHKADEQPVSETSSDTVVPNGVKAGSSNSKQPAMKPKVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRVNRRQSQAYPASRTGSAVQTPSISTLPSSPISDRPPPAKRQKMMVEPSELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDSLTASASLLKFLEDPRHRNKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPSTSGNAGGAKPPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRHEHEEKAKIEHEKKLQQDHAKRLQQEAEKEKRRATEQRLAEEQSREDKRRAQMAAAAAHHAQVQAHAQLLVAQNRARSQSRGNPAMGIPHQPQPRQMVPASQGQQSSPPVRNVTPHSSSPLAGNLMGPQMNQGVPMAITGSSQGVGSPLQVTSGVQHSHPAVMAHPMVNTRSQQGQSRHGTPQMGQGTPAIQHATPIMRNATPTQRMTHASPSASTMAQTPVMNHPIMANPQMNGVMMTPQQQQQAILQQRQQLIMQRNLQAQAGTQQFTPQQMAQLQLQANMHAQQSIQHAQPQQHPNIFMQQQAQTQAQQQQQIQQQQQTQPQQVQQNQFPNAAAYQAHVMRSQLAQLQMSQAQAPHGQQQGSPQQLPPQQAMPQASGVVGQGQGALPPRYRLLYTQRMLPQAQNEVRAKLIQQFGHPSGWHDAVRQQFQEQVEKIAKQYLFDFMKREGQQRAQQAQAQAQAQAQAQAQVIQHQQQQQQQQGMMSNSIAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.75
3 0.74
4 0.78
5 0.78
6 0.78
7 0.74
8 0.69
9 0.64
10 0.56
11 0.57
12 0.51
13 0.47
14 0.41
15 0.35
16 0.35
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.35
23 0.38
24 0.35
25 0.34
26 0.39
27 0.35
28 0.4
29 0.37
30 0.36
31 0.34
32 0.32
33 0.33
34 0.34
35 0.39
36 0.38
37 0.4
38 0.38
39 0.38
40 0.42
41 0.41
42 0.35
43 0.3
44 0.27
45 0.25
46 0.24
47 0.23
48 0.21
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.25
54 0.29
55 0.31
56 0.33
57 0.39
58 0.47
59 0.53
60 0.6
61 0.63
62 0.67
63 0.76
64 0.82
65 0.81
66 0.81
67 0.75
68 0.71
69 0.72
70 0.64
71 0.58
72 0.57
73 0.57
74 0.47
75 0.46
76 0.46
77 0.42
78 0.48
79 0.52
80 0.47
81 0.4
82 0.4
83 0.4
84 0.36
85 0.31
86 0.25
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.24
91 0.25
92 0.26
93 0.26
94 0.26
95 0.23
96 0.27
97 0.29
98 0.29
99 0.34
100 0.34
101 0.37
102 0.43
103 0.41
104 0.34
105 0.35
106 0.4
107 0.4
108 0.42
109 0.44
110 0.44
111 0.47
112 0.52
113 0.59
114 0.57
115 0.55
116 0.55
117 0.58
118 0.58
119 0.6
120 0.57
121 0.5
122 0.49
123 0.47
124 0.46
125 0.42
126 0.38
127 0.39
128 0.35
129 0.35
130 0.33
131 0.33
132 0.39
133 0.36
134 0.39
135 0.36
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.28
141 0.27
142 0.22
143 0.21
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.27
148 0.27
149 0.31
150 0.31
151 0.3
152 0.31
153 0.3
154 0.32
155 0.33
156 0.29
157 0.26
158 0.26
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.17
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.16
170 0.15
171 0.22
172 0.28
173 0.31
174 0.31
175 0.33
176 0.32
177 0.27
178 0.28
179 0.25
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.18
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.23
188 0.21
189 0.21
190 0.27
191 0.29
192 0.29
193 0.28
194 0.27
195 0.28
196 0.29
197 0.27
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.24
202 0.25
203 0.24
204 0.23
205 0.26
206 0.3
207 0.33
208 0.39
209 0.41
210 0.4
211 0.39
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.24
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.32
223 0.39
224 0.45
225 0.48
226 0.54
227 0.58
228 0.62
229 0.6
230 0.58
231 0.54
232 0.5
233 0.51
234 0.47
235 0.45
236 0.38
237 0.37
238 0.35
239 0.35
240 0.34
241 0.28
242 0.27
243 0.27
244 0.28
245 0.27
246 0.27
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.25
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.13
266 0.16
267 0.18
268 0.23
269 0.25
270 0.3
271 0.31
272 0.36
273 0.41
274 0.44
275 0.48
276 0.47
277 0.46
278 0.48
279 0.49
280 0.45
281 0.41
282 0.42
283 0.39
284 0.38
285 0.36
286 0.29
287 0.29
288 0.3
289 0.23
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.12
303 0.14
304 0.21
305 0.29
306 0.35
307 0.4
308 0.45
309 0.51
310 0.49
311 0.56
312 0.58
313 0.56
314 0.55
315 0.5
316 0.48
317 0.4
318 0.39
319 0.32
320 0.26
321 0.22
322 0.17
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.13
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.14
334 0.13
335 0.17
336 0.22
337 0.26
338 0.28
339 0.33
340 0.37
341 0.44
342 0.52
343 0.57
344 0.54
345 0.56
346 0.6
347 0.61
348 0.61
349 0.55
350 0.49
351 0.41
352 0.4
353 0.34
354 0.28
355 0.19
356 0.15
357 0.12
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.17
389 0.2
390 0.26
391 0.32
392 0.42
393 0.43
394 0.49
395 0.55
396 0.58
397 0.64
398 0.69
399 0.73
400 0.74
401 0.79
402 0.82
403 0.82
404 0.76
405 0.72
406 0.65
407 0.62
408 0.54
409 0.48
410 0.39
411 0.32
412 0.26
413 0.2
414 0.15
415 0.07
416 0.05
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.1
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.09
457 0.08
458 0.09
459 0.12
460 0.16
461 0.22
462 0.23
463 0.28
464 0.34
465 0.42
466 0.47
467 0.5
468 0.5
469 0.47
470 0.54
471 0.52
472 0.49
473 0.47
474 0.47
475 0.42
476 0.41
477 0.42
478 0.39
479 0.4
480 0.4
481 0.39
482 0.36
483 0.38
484 0.41
485 0.44
486 0.46
487 0.49
488 0.52
489 0.55
490 0.54
491 0.52
492 0.48
493 0.48
494 0.43
495 0.43
496 0.44
497 0.45
498 0.47
499 0.48
500 0.48
501 0.45
502 0.47
503 0.48
504 0.47
505 0.45
506 0.42
507 0.44
508 0.45
509 0.45
510 0.43
511 0.37
512 0.31
513 0.3
514 0.32
515 0.3
516 0.29
517 0.32
518 0.32
519 0.36
520 0.36
521 0.28
522 0.27
523 0.27
524 0.29
525 0.24
526 0.23
527 0.17
528 0.17
529 0.17
530 0.13
531 0.1
532 0.07
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.09
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.16
545 0.2
546 0.18
547 0.17
548 0.2
549 0.26
550 0.32
551 0.35
552 0.34
553 0.32
554 0.3
555 0.33
556 0.29
557 0.26
558 0.21
559 0.24
560 0.27
561 0.27
562 0.29
563 0.31
564 0.31
565 0.31
566 0.29
567 0.26
568 0.25
569 0.31
570 0.31
571 0.28
572 0.26
573 0.23
574 0.25
575 0.25
576 0.27
577 0.23
578 0.24
579 0.24
580 0.24
581 0.27
582 0.3
583 0.33
584 0.32
585 0.3
586 0.31
587 0.29
588 0.29
589 0.27
590 0.23
591 0.17
592 0.14
593 0.13
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.09
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.07
623 0.1
624 0.11
625 0.1
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.13
630 0.12
631 0.09
632 0.11
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.12
637 0.12
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.17
642 0.19
643 0.25
644 0.28
645 0.35
646 0.38
647 0.41
648 0.42
649 0.4
650 0.4
651 0.33
652 0.37
653 0.33
654 0.28
655 0.24
656 0.22
657 0.21
658 0.2
659 0.2
660 0.14
661 0.09
662 0.1
663 0.11
664 0.13
665 0.13
666 0.14
667 0.15
668 0.14
669 0.16
670 0.19
671 0.24
672 0.27
673 0.28
674 0.28
675 0.29
676 0.32
677 0.33
678 0.36
679 0.33
680 0.28
681 0.27
682 0.27
683 0.26
684 0.23
685 0.2
686 0.15
687 0.14
688 0.15
689 0.15
690 0.14
691 0.17
692 0.2
693 0.19
694 0.18
695 0.17
696 0.17
697 0.19
698 0.2
699 0.17
700 0.14
701 0.15
702 0.15
703 0.15
704 0.13
705 0.11
706 0.09
707 0.09
708 0.12
709 0.14
710 0.16
711 0.18
712 0.18
713 0.18
714 0.18
715 0.26
716 0.3
717 0.31
718 0.32
719 0.35
720 0.36
721 0.37
722 0.36
723 0.35
724 0.34
725 0.37
726 0.38
727 0.37
728 0.39
729 0.38
730 0.37
731 0.3
732 0.25
733 0.25
734 0.23
735 0.2
736 0.17
737 0.18
738 0.19
739 0.21
740 0.23
741 0.17
742 0.18
743 0.18
744 0.21
745 0.2
746 0.23
747 0.22
748 0.23
749 0.23
750 0.2
751 0.2
752 0.2
753 0.19
754 0.14
755 0.13
756 0.13
757 0.19
758 0.21
759 0.21
760 0.23
761 0.27
762 0.3
763 0.39
764 0.42
765 0.43
766 0.43
767 0.43
768 0.4
769 0.45
770 0.42
771 0.35
772 0.33
773 0.3
774 0.3
775 0.31
776 0.31
777 0.25
778 0.28
779 0.33
780 0.33
781 0.34
782 0.33
783 0.37
784 0.42
785 0.48
786 0.48
787 0.46
788 0.49
789 0.49
790 0.56
791 0.56
792 0.54
793 0.5
794 0.52
795 0.55
796 0.56
797 0.56
798 0.55
799 0.56
800 0.54
801 0.51
802 0.45
803 0.39
804 0.32
805 0.27
806 0.2
807 0.13
808 0.16
809 0.16
810 0.17
811 0.16
812 0.17
813 0.17
814 0.17
815 0.18
816 0.17
817 0.18
818 0.17
819 0.17
820 0.2
821 0.2
822 0.2
823 0.19
824 0.16
825 0.16
826 0.18
827 0.19
828 0.22
829 0.23
830 0.23
831 0.23
832 0.3
833 0.35
834 0.39
835 0.39
836 0.34
837 0.38
838 0.41
839 0.44
840 0.39
841 0.35
842 0.32
843 0.35
844 0.37
845 0.31
846 0.28
847 0.25
848 0.23
849 0.19
850 0.16
851 0.12
852 0.1
853 0.08
854 0.08
855 0.07
856 0.09
857 0.13
858 0.15
859 0.15
860 0.17
861 0.19
862 0.21
863 0.22
864 0.26
865 0.3
866 0.38
867 0.39
868 0.45
869 0.48
870 0.5
871 0.51
872 0.49
873 0.45
874 0.45
875 0.46
876 0.46
877 0.43
878 0.41
879 0.4
880 0.38
881 0.35
882 0.32
883 0.35
884 0.29
885 0.31
886 0.36
887 0.37
888 0.4
889 0.39
890 0.35
891 0.34
892 0.36
893 0.33
894 0.27
895 0.31
896 0.34
897 0.39
898 0.37
899 0.34
900 0.35
901 0.37
902 0.43
903 0.39
904 0.38
905 0.38
906 0.37
907 0.37
908 0.39
909 0.37
910 0.3
911 0.3
912 0.32
913 0.32
914 0.33
915 0.35
916 0.31
917 0.4
918 0.42
919 0.46
920 0.45
921 0.48
922 0.53
923 0.59
924 0.61
925 0.57
926 0.58
927 0.56
928 0.54
929 0.52
930 0.46
931 0.38
932 0.34
933 0.32
934 0.28
935 0.28
936 0.24
937 0.21
938 0.2
939 0.22
940 0.21
941 0.23
942 0.26
943 0.27
944 0.32
945 0.36
946 0.41
947 0.44
948 0.52
949 0.53
950 0.54
951 0.51
952 0.48
953 0.47
954 0.43
955 0.38