FuNGI

A6R760

Protein Details

Accession

A6R760

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
115-138	LTLFARHRRYYRKEERKINDAKLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	aje:HCAG_05468 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MVSTRARSLGNQPESSTTSDDHNARLQQLNDQIREREQQLAILHAQQRLNELEAQIREDTFIESRPTQDIAAELPQNRPADNMDDDNETPPRLEIKDYYRGKNMLEFEDYKDRMLTLFARHRRYYRKEERKINDAKLYLDAHVKQKWLNFVSAYERRGGATPLTFDDMLSHLEMQINDPQNQRRLASQRFQDAKQQEWQSIRDFSKYLEDWEYYLPPYSEEQRMDNLRTAMKIIDDEHVLREGFHHFEEADISGYDVILGMPWLQAANPDIDWVRRCWTYRKASNISHVHLDTAKEFATLMDNSNIIFAAFPLRAAHAATEPNIPDDYKDYLDVFREDIPDAEHAPHDHAIDLKPGKEPPYRPIYNLSPQELSVLREYIEKALEKNWIRPSKSPAGAPVLFAPKKDGTLRLCVDYRGLNEITVKNRYPLPLISEILDRLAGAKLYTQLDLRDAYHRIRIRAGDEWKTAFRTRYGHFEYLVLPFGLTNAPATFQSYINKALSDILDVYCVAYLDDIVIYSNTLDEHVAHVKNVLERLRRWRLYVKLKTDGSGVAIAAVISQLMDDGHWHPIAFWSRKLTEAERRYQTYDLEMLPIVEAFRQWRHYLHGSRHPIVVLSDHANLRRFMTTKQLNGRQIRWMQMLSAFDFEIEHHPGENNPADAPSRHSDYIKHAAPLTGLPTLQEKLHENEVAGVTGLDLGTLVPRILAVKVFESEIAYREEVAESIVELLLQVQNRDAGTSELRRRLEVGDASVGDRSTWAVDKDGLLRKDGKVYVPQDKAVRHEIMKMNHDDPQGGHFGRDKTIEAIKRKYSWHGMSDEIAEYVRTCDVCQRVKIPRHKPYGLLQPHPVPDKKWHTISMDFIEGLPDNKKGSQTYNAIVVFVDSFTKWAIIVPTSSKLDAEGLADIIVWKLAKNFGLPANIISDRDSLINSKFWSTLCYLLHVRRKLSTAFHPQTDGQTERLNQVIEHYLRTYCSYQQDNWIEWIPLAQWAYNNAFHASIKMTPSEAMIGRPTELRIDVEPPSTGASKSAIEQVERMKQAENRIRECLEAAKAAEKKYYDQRHIPKSFKIGDWVMLRAKIYPPCDLHPN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.46
3	0.4
4	0.31
5	0.28
6	0.32
7	0.32
8	0.31
9	0.34
10	0.34
11	0.35
12	0.4
13	0.36
14	0.36
15	0.44
16	0.48
17	0.47
18	0.48
19	0.47
20	0.46
21	0.5
22	0.46
23	0.44
24	0.36
25	0.36
26	0.33
27	0.35
28	0.32
29	0.34
30	0.35
31	0.34
32	0.35
33	0.31
34	0.33
35	0.31
36	0.32
37	0.27
38	0.24
39	0.25
40	0.25
41	0.28
42	0.26
43	0.23
44	0.22
45	0.2
46	0.22
47	0.17
48	0.19
49	0.21
50	0.21
51	0.23
52	0.24
53	0.25
54	0.22
55	0.21
56	0.19
57	0.17
58	0.22
59	0.24
60	0.24
61	0.25
62	0.3
63	0.31
64	0.3
65	0.28
66	0.25
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.25
71	0.29
72	0.3
73	0.32
74	0.31
75	0.27
76	0.23
77	0.21
78	0.22
79	0.19
80	0.21
81	0.23
82	0.27
83	0.37
84	0.43
85	0.47
86	0.49
87	0.5
88	0.48
89	0.49
90	0.46
91	0.39
92	0.39
93	0.36
94	0.36
95	0.44
96	0.43
97	0.38
98	0.34
99	0.31
100	0.25
101	0.26
102	0.23
103	0.22
104	0.31
105	0.38
106	0.45
107	0.49
108	0.56
109	0.63
110	0.68
111	0.71
112	0.72
113	0.76
114	0.78
115	0.85
116	0.84
117	0.84
118	0.84
119	0.8
120	0.76
121	0.67
122	0.59
123	0.53
124	0.48
125	0.4
126	0.38
127	0.35
128	0.33
129	0.34
130	0.34
131	0.32
132	0.33
133	0.39
134	0.35
135	0.34
136	0.29
137	0.29
138	0.37
139	0.4
140	0.38
141	0.32
142	0.3
143	0.29
144	0.29
145	0.28
146	0.22
147	0.18
148	0.19
149	0.19
150	0.22
151	0.21
152	0.19
153	0.19
154	0.18
155	0.17
156	0.16
157	0.14
158	0.11
159	0.14
160	0.14
161	0.15
162	0.21
163	0.23
164	0.26
165	0.31
166	0.35
167	0.38
168	0.4
169	0.38
170	0.38
171	0.42
172	0.46
173	0.48
174	0.48
175	0.53
176	0.56
177	0.56
178	0.58
179	0.53
180	0.5
181	0.51
182	0.48
183	0.43
184	0.42
185	0.43
186	0.38
187	0.42
188	0.4
189	0.34
190	0.32
191	0.28
192	0.33
193	0.31
194	0.3
195	0.26
196	0.26
197	0.25
198	0.27
199	0.27
200	0.21
201	0.22
202	0.18
203	0.16
204	0.19
205	0.21
206	0.24
207	0.24
208	0.25
209	0.29
210	0.33
211	0.34
212	0.34
213	0.33
214	0.29
215	0.28
216	0.27
217	0.21
218	0.18
219	0.17
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.17
226	0.16
227	0.14
228	0.14
229	0.15
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.11
234	0.12
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.13
259	0.15
260	0.15
261	0.18
262	0.2
263	0.22
264	0.27
265	0.36
266	0.43
267	0.48
268	0.55
269	0.58
270	0.59
271	0.66
272	0.65
273	0.58
274	0.54
275	0.47
276	0.4
277	0.34
278	0.32
279	0.23
280	0.19
281	0.17
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.11
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.08
294	0.07
295	0.05
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.11
304	0.09
305	0.11
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.15
312	0.13
313	0.15
314	0.16
315	0.14
316	0.15
317	0.14
318	0.15
319	0.17
320	0.17
321	0.15
322	0.14
323	0.15
324	0.14
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.12
331	0.11
332	0.13
333	0.14
334	0.13
335	0.12
336	0.13
337	0.12
338	0.18
339	0.19
340	0.17
341	0.18
342	0.19
343	0.24
344	0.27
345	0.29
346	0.28
347	0.37
348	0.37
349	0.36
350	0.41
351	0.41
352	0.44
353	0.46
354	0.43
355	0.34
356	0.33
357	0.34
358	0.29
359	0.25
360	0.19
361	0.15
362	0.13
363	0.13
364	0.14
365	0.13
366	0.14
367	0.13
368	0.12
369	0.14
370	0.21
371	0.21
372	0.26
373	0.34
374	0.38
375	0.4
376	0.43
377	0.48
378	0.49
379	0.5
380	0.45
381	0.39
382	0.39
383	0.37
384	0.34
385	0.3
386	0.3
387	0.28
388	0.27
389	0.28
390	0.21
391	0.24
392	0.24
393	0.26
394	0.2
395	0.27
396	0.28
397	0.28
398	0.28
399	0.26
400	0.26
401	0.23
402	0.21
403	0.19
404	0.17
405	0.14
406	0.17
407	0.19
408	0.21
409	0.23
410	0.23
411	0.2
412	0.21
413	0.22
414	0.21
415	0.19
416	0.2
417	0.2
418	0.2
419	0.19
420	0.19
421	0.18
422	0.16
423	0.15
424	0.1
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.05
429	0.06
430	0.09
431	0.1
432	0.11
433	0.1
434	0.1
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.14
439	0.15
440	0.15
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.24
445	0.24
446	0.24
447	0.28
448	0.32
449	0.29
450	0.29
451	0.3
452	0.29
453	0.31
454	0.3
455	0.24
456	0.22
457	0.22
458	0.22
459	0.28
460	0.32
461	0.3
462	0.29
463	0.29
464	0.27
465	0.24
466	0.24
467	0.16
468	0.1
469	0.08
470	0.09
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.05
476	0.05
477	0.07
478	0.08
479	0.09
480	0.1
481	0.12
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.13
486	0.13
487	0.12
488	0.11
489	0.1
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.04
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.06
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.11
516	0.12
517	0.13
518	0.16
519	0.17
520	0.16
521	0.18
522	0.27
523	0.34
524	0.34
525	0.36
526	0.38
527	0.43
528	0.5
529	0.55
530	0.52
531	0.5
532	0.5
533	0.48
534	0.43
535	0.35
536	0.26
537	0.19
538	0.14
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.05
543	0.04
544	0.03
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.04
551	0.05
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.11
557	0.17
558	0.17
559	0.18
560	0.2
561	0.2
562	0.23
563	0.25
564	0.25
565	0.28
566	0.31
567	0.37
568	0.37
569	0.39
570	0.39
571	0.38
572	0.35
573	0.27
574	0.25
575	0.18
576	0.15
577	0.13
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.07
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.08
586	0.1
587	0.11
588	0.12
589	0.16
590	0.23
591	0.28
592	0.32
593	0.39
594	0.43
595	0.43
596	0.43
597	0.38
598	0.32
599	0.27
600	0.23
601	0.15
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.16
606	0.17
607	0.17
608	0.18
609	0.18
610	0.17
611	0.15
612	0.23
613	0.25
614	0.28
615	0.36
616	0.41
617	0.46
618	0.48
619	0.49
620	0.46
621	0.45
622	0.43
623	0.37
624	0.3
625	0.24
626	0.23
627	0.23
628	0.17
629	0.15
630	0.12
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.11
635	0.12
636	0.11
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.14
641	0.14
642	0.12
643	0.1
644	0.11
645	0.11
646	0.12
647	0.16
648	0.15
649	0.18
650	0.19
651	0.2
652	0.21
653	0.26
654	0.33
655	0.3
656	0.28
657	0.24
658	0.24
659	0.24
660	0.22
661	0.18
662	0.12
663	0.1
664	0.09
665	0.11
666	0.12
667	0.11
668	0.13
669	0.13
670	0.14
671	0.18
672	0.18
673	0.16
674	0.17
675	0.17
676	0.15
677	0.13
678	0.1
679	0.07
680	0.07
681	0.06
682	0.04
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.04
687	0.04
688	0.03
689	0.03
690	0.04
691	0.05
692	0.06
693	0.07
694	0.08
695	0.08
696	0.09
697	0.09
698	0.1
699	0.1
700	0.11
701	0.12
702	0.11
703	0.11
704	0.11
705	0.11
706	0.09
707	0.09
708	0.07
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.04
713	0.04
714	0.05
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.12
725	0.19
726	0.24
727	0.29
728	0.3
729	0.3
730	0.31
731	0.3
732	0.31
733	0.25
734	0.22
735	0.18
736	0.18
737	0.18
738	0.18
739	0.16
740	0.12
741	0.1
742	0.09
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.1
748	0.12
749	0.18
750	0.25
751	0.24
752	0.24
753	0.26
754	0.26
755	0.3
756	0.31
757	0.26
758	0.27
759	0.31
760	0.37
761	0.37
762	0.4
763	0.38
764	0.38
765	0.4
766	0.38
767	0.36
768	0.29
769	0.34
770	0.36
771	0.36
772	0.4
773	0.4
774	0.36
775	0.38
776	0.38
777	0.31
778	0.26
779	0.25
780	0.24
781	0.2
782	0.2
783	0.19
784	0.2
785	0.21
786	0.22
787	0.21
788	0.19
789	0.26
790	0.31
791	0.33
792	0.37
793	0.4
794	0.42
795	0.43
796	0.45
797	0.46
798	0.44
799	0.43
800	0.39
801	0.37
802	0.34
803	0.34
804	0.29
805	0.21
806	0.17
807	0.13
808	0.11
809	0.1
810	0.1
811	0.09
812	0.08
813	0.14
814	0.2
815	0.24
816	0.26
817	0.32
818	0.39
819	0.48
820	0.58
821	0.63
822	0.66
823	0.7
824	0.69
825	0.66
826	0.64
827	0.66
828	0.62
829	0.57
830	0.52
831	0.48
832	0.51
833	0.53
834	0.48
835	0.4
836	0.43
837	0.47
838	0.48
839	0.47
840	0.47
841	0.45
842	0.46
843	0.48
844	0.42
845	0.36
846	0.3
847	0.26
848	0.24
849	0.2
850	0.19
851	0.16
852	0.14
853	0.14
854	0.15
855	0.17
856	0.17
857	0.21
858	0.26
859	0.28
860	0.28
861	0.33
862	0.32
863	0.3
864	0.28
865	0.24
866	0.18
867	0.14
868	0.14
869	0.07
870	0.08
871	0.08
872	0.08
873	0.07
874	0.08
875	0.1
876	0.1
877	0.12
878	0.14
879	0.18
880	0.2
881	0.21
882	0.19
883	0.18
884	0.18
885	0.17
886	0.15
887	0.11
888	0.09
889	0.09
890	0.09
891	0.08
892	0.07
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.09
898	0.1
899	0.11
900	0.14
901	0.17
902	0.2
903	0.2
904	0.19
905	0.23
906	0.23
907	0.22
908	0.21
909	0.19
910	0.17
911	0.17
912	0.17
913	0.15
914	0.16
915	0.19
916	0.18
917	0.19
918	0.2
919	0.19
920	0.21
921	0.21
922	0.25
923	0.21
924	0.25
925	0.28
926	0.35
927	0.43
928	0.44
929	0.45
930	0.42
931	0.45
932	0.43
933	0.43
934	0.44
935	0.46
936	0.47
937	0.47
938	0.47
939	0.45
940	0.47
941	0.47
942	0.4
943	0.32
944	0.32
945	0.32
946	0.3
947	0.31
948	0.27
949	0.21
950	0.23
951	0.28
952	0.24
953	0.25
954	0.25
955	0.23
956	0.24
957	0.28
958	0.27
959	0.24
960	0.3
961	0.32
962	0.32
963	0.41
964	0.44
965	0.42
966	0.43
967	0.41
968	0.34
969	0.29
970	0.29
971	0.19
972	0.19
973	0.18
974	0.15
975	0.13
976	0.17
977	0.22
978	0.23
979	0.24
980	0.21
981	0.22
982	0.21
983	0.22
984	0.2
985	0.19
986	0.19
987	0.18
988	0.18
989	0.17
990	0.18
991	0.21
992	0.19
993	0.18
994	0.19
995	0.19
996	0.19
997	0.2
998	0.2
999	0.19
1000	0.19
1001	0.2
1002	0.18
1003	0.21
1004	0.22
1005	0.22
1006	0.22
1007	0.2
1008	0.22
1009	0.21
1010	0.19
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.23
1016	0.22
1017	0.21
1018	0.24
1019	0.29
1020	0.35
1021	0.37
1022	0.36
1023	0.35
1024	0.36
1025	0.46
1026	0.51
1027	0.53
1028	0.49
1029	0.53
1030	0.53
1031	0.49
1032	0.47
1033	0.42
1034	0.36
1035	0.31
1036	0.28
1037	0.31
1038	0.33
1039	0.34
1040	0.37
1041	0.33
1042	0.36
1043	0.43
1044	0.51
1045	0.5
1046	0.57
1047	0.65
1048	0.71
1049	0.78
1050	0.76
1051	0.72
1052	0.71
1053	0.69
1054	0.61
1055	0.58
1056	0.5
1057	0.49
1058	0.47
1059	0.45
1060	0.4
1061	0.37
1062	0.36
1063	0.31
1064	0.35
1065	0.34
1066	0.34
1067	0.37
1068	0.37

A6R760

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer