Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RH24

Protein Details
Accession A6RH24    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-278DEGMGRGERSKKKRRFRSLSPLGGRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-272RGERSKKKRRFRSLS
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.333, cyto 6.5, cyto_mito 6.166, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG aje:HCAG_08941  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MTVAISSQLRQQLEEYAGVALHPLFQSSQQTITNPRAPSSRSVSATPGATNAATPASLVDTAPRKGNVLVSSQQLSMGDNELNPDDAYRCVVNLNINLHNRLYTDKFEWSLLHSQGLAEEFARVTCADLGLGPEWVSAVAHGIYEAVLKLKKEVCESGGLISGLGGYGNEIDNQAANGQEAGWRYDPDGLGDEWEPKVETLSKEEIEKREGDRERQIRRLRRETARFSSTSGIVPELTRQQSSSGGGYFDIPDEGMGRGERSKKKRRFRSLSPLGGRSGTPGGGGRGTPDTGAGAGYGGGGGTLSDWERQTWRCANCSVWGTAVWAVRDGPAGPRTLCHNCGLLYERDKRIPAWSTALHRIDIPAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.18
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.12
13 0.17
14 0.18
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.29
19 0.36
20 0.4
21 0.36
22 0.37
23 0.37
24 0.37
25 0.41
26 0.43
27 0.43
28 0.4
29 0.4
30 0.41
31 0.4
32 0.4
33 0.34
34 0.27
35 0.21
36 0.18
37 0.16
38 0.14
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.13
47 0.17
48 0.19
49 0.22
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.27
54 0.23
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.27
59 0.26
60 0.25
61 0.21
62 0.2
63 0.16
64 0.15
65 0.12
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.11
79 0.13
80 0.16
81 0.2
82 0.24
83 0.26
84 0.28
85 0.28
86 0.27
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.2
91 0.21
92 0.22
93 0.22
94 0.23
95 0.23
96 0.23
97 0.26
98 0.23
99 0.21
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.13
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.1
137 0.13
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.12
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.12
188 0.15
189 0.15
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.23
195 0.21
196 0.27
197 0.28
198 0.29
199 0.35
200 0.41
201 0.44
202 0.5
203 0.57
204 0.57
205 0.64
206 0.68
207 0.67
208 0.68
209 0.71
210 0.7
211 0.69
212 0.65
213 0.57
214 0.51
215 0.45
216 0.37
217 0.3
218 0.23
219 0.18
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.12
246 0.2
247 0.28
248 0.37
249 0.47
250 0.56
251 0.67
252 0.76
253 0.84
254 0.85
255 0.86
256 0.88
257 0.87
258 0.87
259 0.82
260 0.74
261 0.64
262 0.57
263 0.47
264 0.38
265 0.3
266 0.2
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.05
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.16
296 0.18
297 0.24
298 0.31
299 0.33
300 0.34
301 0.36
302 0.36
303 0.38
304 0.4
305 0.34
306 0.28
307 0.25
308 0.24
309 0.25
310 0.26
311 0.2
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.17
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.19
321 0.2
322 0.26
323 0.31
324 0.33
325 0.3
326 0.3
327 0.28
328 0.31
329 0.34
330 0.34
331 0.36
332 0.41
333 0.44
334 0.46
335 0.48
336 0.45
337 0.48
338 0.46
339 0.42
340 0.4
341 0.4
342 0.43
343 0.5
344 0.51
345 0.45
346 0.41
347 0.39