Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R4B4

Protein Details
Accession A6R4B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-226RGAAERKAKRQKIRPDNNTKGEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-214RKAKRQ
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 8.666, mito 8.5, cyto_mito 7.499, cyto 5, cyto_pero 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG aje:HCAG_04472  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MSASAGGSSKRAGTAEHKELASALYARCLSNFPPDHLFYQQDLVGLGIIPNNDLSLLMKCAQSLVDQSLMRMLYGNDDRLAWKIIAQSDAEKLQNLNAEERLIYSVVESTGRSGVWTRTIKSRTNLHQTIVNRCLKSLETKNYIKSVRNVKYPQRKMYMLSGLQPSEDVTGGAWFTDGVLDSDFIRGLGGWIEHWVSSRSWYDRGAAERKAKRQKIRPDNNTKGEPQYLPYLPSYNGYPTVSDITNAINNSGLTPVTMGESSIAQLLEMLCFDGKLISLRDGAAYKSVKKPNQISLQRDLGLQTGDQTDQDKADQDNLTLGGNGMTEAPCGRCPVFALCEEGGPVNAENCEYFDAWIKKSLAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.4
4 0.39
5 0.37
6 0.37
7 0.34
8 0.3
9 0.24
10 0.17
11 0.17
12 0.19
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.27
18 0.29
19 0.28
20 0.33
21 0.35
22 0.37
23 0.39
24 0.4
25 0.32
26 0.32
27 0.29
28 0.23
29 0.21
30 0.17
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.11
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.17
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.19
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.21
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.18
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.12
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.18
103 0.21
104 0.21
105 0.28
106 0.33
107 0.36
108 0.39
109 0.46
110 0.45
111 0.52
112 0.52
113 0.45
114 0.47
115 0.45
116 0.48
117 0.48
118 0.46
119 0.36
120 0.35
121 0.35
122 0.3
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.35
127 0.38
128 0.4
129 0.44
130 0.46
131 0.41
132 0.41
133 0.44
134 0.41
135 0.46
136 0.49
137 0.53
138 0.61
139 0.65
140 0.65
141 0.6
142 0.56
143 0.51
144 0.5
145 0.47
146 0.37
147 0.34
148 0.31
149 0.25
150 0.24
151 0.22
152 0.17
153 0.12
154 0.11
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.07
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.23
192 0.24
193 0.27
194 0.34
195 0.37
196 0.46
197 0.54
198 0.58
199 0.61
200 0.66
201 0.71
202 0.74
203 0.79
204 0.81
205 0.82
206 0.84
207 0.82
208 0.76
209 0.68
210 0.6
211 0.52
212 0.42
213 0.33
214 0.3
215 0.24
216 0.23
217 0.21
218 0.2
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.14
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.29
274 0.37
275 0.39
276 0.45
277 0.5
278 0.53
279 0.61
280 0.65
281 0.62
282 0.61
283 0.62
284 0.55
285 0.51
286 0.43
287 0.34
288 0.26
289 0.21
290 0.16
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.15
300 0.2
301 0.2
302 0.18
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.15
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.17
321 0.21
322 0.24
323 0.23
324 0.27
325 0.24
326 0.24
327 0.25
328 0.23
329 0.19
330 0.17
331 0.16
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.15
338 0.13
339 0.14
340 0.22
341 0.25
342 0.26
343 0.33