Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R1T8

Protein Details
Accession A6R1T8    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-250AISGAKKKRKRAPPDPNAPKRALHydrophilic
383-408SPEPVREPTPPRSNKRRRTTGGATSDHydrophilic
419-442ASAKKASPEKKMRGAARKEKEKEEBasic
454-475ANETPKGERRGGKKKRKSEAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-247GAKKKRKRAPPDPNAPK
420-472SAKKASPEKKMRGAARKEKEKEETAAKPKRGAAAANETPKGERRGGKKKRKSE
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG aje:HCAG_03596  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDKSKESTAIVTVNIDDFTRTRDSLPLRRWSSPSLPGVGLAVPPSAGVPAFAIPYPPIPILRHLTTSPAPKATKISPVMPSSRATLPTILRHLLIPNSPPYTHAPPLSLTPPSLLETINRVILPINVACGDLIAASEDPTNRSALALTHIQVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSTLDLGGITSSLLENGFLSGGRGLSPGGGLAAGPRTLGRVDAISGAKKKRKRAPPDPNAPKRALTPYFLYMQHNRASIAQELGENARPKEVADEGTRRWAEMPDEEKQIWKKLYAENLAVYQEKMRAYKAGLPVPEDGLSTTAAANANANAAAMQLQQGVHRAAAGEEDVSSEGSEQESDEEDEEEEEEEEEEEESSPEPVREPTPPRSNKRRRTTGGATSDAKVATPTAGSASAKKASPEKKMRGAARKEKEKEETAAKPKRGAAAANETPKGERRGGKKKRKSEAGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.23
4 0.2
5 0.17
6 0.15
7 0.14
8 0.12
9 0.16
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.26
14 0.33
15 0.4
16 0.47
17 0.53
18 0.54
19 0.59
20 0.61
21 0.61
22 0.59
23 0.58
24 0.54
25 0.48
26 0.43
27 0.38
28 0.35
29 0.29
30 0.24
31 0.17
32 0.13
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.14
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.22
51 0.27
52 0.29
53 0.31
54 0.28
55 0.33
56 0.34
57 0.4
58 0.38
59 0.39
60 0.38
61 0.36
62 0.41
63 0.38
64 0.41
65 0.38
66 0.39
67 0.38
68 0.41
69 0.43
70 0.4
71 0.39
72 0.35
73 0.34
74 0.32
75 0.28
76 0.28
77 0.28
78 0.3
79 0.33
80 0.3
81 0.27
82 0.26
83 0.26
84 0.25
85 0.24
86 0.22
87 0.23
88 0.25
89 0.24
90 0.26
91 0.3
92 0.33
93 0.34
94 0.32
95 0.29
96 0.26
97 0.3
98 0.3
99 0.25
100 0.19
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.15
106 0.13
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.09
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.04
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.11
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.23
168 0.2
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.12
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.21
219 0.27
220 0.3
221 0.38
222 0.43
223 0.52
224 0.59
225 0.66
226 0.72
227 0.77
228 0.84
229 0.87
230 0.86
231 0.81
232 0.72
233 0.62
234 0.53
235 0.49
236 0.39
237 0.31
238 0.25
239 0.23
240 0.25
241 0.25
242 0.27
243 0.23
244 0.25
245 0.25
246 0.23
247 0.21
248 0.19
249 0.2
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.15
266 0.18
267 0.18
268 0.26
269 0.26
270 0.24
271 0.24
272 0.22
273 0.2
274 0.21
275 0.24
276 0.2
277 0.24
278 0.24
279 0.27
280 0.27
281 0.31
282 0.26
283 0.24
284 0.23
285 0.24
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.25
290 0.26
291 0.26
292 0.24
293 0.2
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.2
302 0.24
303 0.25
304 0.24
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.25
309 0.19
310 0.15
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.2
376 0.25
377 0.33
378 0.43
379 0.52
380 0.6
381 0.7
382 0.78
383 0.82
384 0.86
385 0.88
386 0.83
387 0.83
388 0.82
389 0.8
390 0.77
391 0.72
392 0.65
393 0.56
394 0.52
395 0.43
396 0.35
397 0.26
398 0.19
399 0.13
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.12
404 0.13
405 0.15
406 0.19
407 0.22
408 0.23
409 0.25
410 0.32
411 0.35
412 0.45
413 0.52
414 0.56
415 0.61
416 0.69
417 0.75
418 0.77
419 0.81
420 0.81
421 0.81
422 0.84
423 0.8
424 0.8
425 0.78
426 0.72
427 0.67
428 0.65
429 0.64
430 0.64
431 0.67
432 0.63
433 0.6
434 0.59
435 0.59
436 0.53
437 0.47
438 0.43
439 0.44
440 0.48
441 0.51
442 0.49
443 0.44
444 0.45
445 0.47
446 0.46
447 0.42
448 0.41
449 0.44
450 0.54
451 0.64
452 0.73
453 0.78
454 0.83
455 0.87