Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6QY79

Protein Details
Accession A6QY79    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24DDDTDNPRKRRRIAAPETSPYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG aje:HCAG_02336  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSSDDDTDNPRKRRRIAAPETSPYVLRELIDSVPVAGDGAEQDAYITCVEYWNDNLYVGTSAGEVLHFVSFPSDSQVLDEPSFILASRLSITPSQSSLPPDTPLGVQQILILPSTYKACILCNGVVTFYSLPELSPTYGTTKVGNCKWIGGLDLNESHEGADLFDPVVMIAVSNRIMLVRIGDEPRRPPSISNAPGHGRSASLNTLSGIGNIQLNPHPNFPQRSSSITQESYMKNRTLPGSPGSPEKKSPDSSGPSSENGGPGSDGSSPLYQKPLPPPPPKQSTTRLKPHVVSPTASEFLLVTGTEPSEPGVGMFVNVEGDVVRGTLEFRKYPMAIVVDDDSNEGSHPRTSDENQNGYVLAVISADDDDEDSRTYLEVQRWNAVPGERRLQKTSVEIPSASPSPGAVGIRRSVGASRASFSEIVEVMRMVRLKLSSVISPTIPSTPSENSDPRTRASLEHLQKERELFDNQDTDSDGQKHPSSSSVNRDWEVQRNQEEAKFARGLATVNSSILLWEGNKIWRVLRNPLALQLENSLELAKQKSSTDQNDVVIDREAIIGLIQGLQDMEPKTETEYIGLRYVRQKASLLLFVDLLSANAGSRVESTIKSTEDALVAGELDPRVFLLLIPLLKDEVLQGPQGIWVYNGLVKVISSCFSPPDVETEHKLPNFRIDDDILHMVRRYLLGWQKKRGYGSVTDETCETYSRKKCTTWRFSAVRAEQTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.78
4 0.8
5 0.8
6 0.79
7 0.78
8 0.7
9 0.61
10 0.51
11 0.44
12 0.34
13 0.25
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.09
32 0.08
33 0.09
34 0.07
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.15
39 0.17
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.14
46 0.12
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.15
63 0.19
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.18
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.25
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.14
99 0.1
100 0.12
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.17
115 0.14
116 0.14
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.22
129 0.28
130 0.3
131 0.33
132 0.3
133 0.29
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.19
138 0.18
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.11
168 0.15
169 0.18
170 0.22
171 0.25
172 0.29
173 0.32
174 0.31
175 0.29
176 0.34
177 0.4
178 0.43
179 0.42
180 0.43
181 0.42
182 0.43
183 0.43
184 0.35
185 0.25
186 0.2
187 0.2
188 0.17
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.16
202 0.17
203 0.19
204 0.23
205 0.26
206 0.31
207 0.31
208 0.35
209 0.33
210 0.37
211 0.37
212 0.38
213 0.38
214 0.34
215 0.33
216 0.33
217 0.33
218 0.33
219 0.34
220 0.3
221 0.26
222 0.27
223 0.28
224 0.25
225 0.25
226 0.23
227 0.23
228 0.23
229 0.3
230 0.31
231 0.31
232 0.32
233 0.34
234 0.36
235 0.34
236 0.37
237 0.36
238 0.38
239 0.38
240 0.4
241 0.38
242 0.34
243 0.34
244 0.31
245 0.25
246 0.2
247 0.17
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.15
258 0.14
259 0.17
260 0.23
261 0.31
262 0.38
263 0.44
264 0.51
265 0.55
266 0.62
267 0.62
268 0.6
269 0.6
270 0.61
271 0.63
272 0.65
273 0.63
274 0.59
275 0.58
276 0.57
277 0.56
278 0.47
279 0.4
280 0.33
281 0.31
282 0.28
283 0.27
284 0.22
285 0.14
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.07
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.08
336 0.1
337 0.13
338 0.2
339 0.25
340 0.26
341 0.26
342 0.26
343 0.24
344 0.21
345 0.19
346 0.11
347 0.07
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.09
363 0.12
364 0.16
365 0.16
366 0.19
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.25
374 0.28
375 0.3
376 0.31
377 0.31
378 0.31
379 0.31
380 0.34
381 0.3
382 0.26
383 0.24
384 0.22
385 0.24
386 0.23
387 0.19
388 0.13
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.09
400 0.11
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.14
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.11
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.16
434 0.2
435 0.21
436 0.23
437 0.29
438 0.29
439 0.27
440 0.29
441 0.27
442 0.24
443 0.28
444 0.35
445 0.34
446 0.41
447 0.43
448 0.41
449 0.41
450 0.41
451 0.36
452 0.3
453 0.26
454 0.2
455 0.2
456 0.21
457 0.2
458 0.2
459 0.19
460 0.17
461 0.19
462 0.19
463 0.17
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.2
469 0.22
470 0.23
471 0.3
472 0.33
473 0.35
474 0.35
475 0.39
476 0.38
477 0.42
478 0.42
479 0.4
480 0.37
481 0.36
482 0.37
483 0.35
484 0.36
485 0.28
486 0.28
487 0.23
488 0.2
489 0.19
490 0.18
491 0.17
492 0.15
493 0.17
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.05
502 0.07
503 0.08
504 0.11
505 0.13
506 0.14
507 0.16
508 0.2
509 0.24
510 0.29
511 0.33
512 0.35
513 0.34
514 0.39
515 0.41
516 0.36
517 0.33
518 0.29
519 0.23
520 0.19
521 0.19
522 0.13
523 0.1
524 0.12
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.18
530 0.25
531 0.28
532 0.32
533 0.33
534 0.34
535 0.36
536 0.35
537 0.31
538 0.25
539 0.21
540 0.15
541 0.12
542 0.11
543 0.07
544 0.07
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.14
558 0.16
559 0.16
560 0.14
561 0.16
562 0.17
563 0.22
564 0.22
565 0.22
566 0.26
567 0.32
568 0.32
569 0.31
570 0.3
571 0.29
572 0.32
573 0.34
574 0.29
575 0.24
576 0.23
577 0.2
578 0.2
579 0.16
580 0.13
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.07
588 0.09
589 0.11
590 0.12
591 0.16
592 0.18
593 0.19
594 0.2
595 0.2
596 0.19
597 0.18
598 0.17
599 0.13
600 0.1
601 0.1
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.11
613 0.12
614 0.13
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.14
619 0.12
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.12
624 0.12
625 0.14
626 0.15
627 0.13
628 0.1
629 0.09
630 0.11
631 0.13
632 0.13
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.12
637 0.12
638 0.11
639 0.1
640 0.11
641 0.13
642 0.14
643 0.16
644 0.15
645 0.19
646 0.23
647 0.25
648 0.29
649 0.32
650 0.38
651 0.39
652 0.41
653 0.37
654 0.41
655 0.41
656 0.38
657 0.37
658 0.32
659 0.31
660 0.33
661 0.38
662 0.3
663 0.28
664 0.26
665 0.23
666 0.22
667 0.21
668 0.17
669 0.19
670 0.27
671 0.36
672 0.43
673 0.52
674 0.58
675 0.62
676 0.65
677 0.61
678 0.57
679 0.53
680 0.54
681 0.54
682 0.48
683 0.45
684 0.42
685 0.41
686 0.36
687 0.32
688 0.27
689 0.27
690 0.33
691 0.39
692 0.42
693 0.46
694 0.55
695 0.63
696 0.71
697 0.71
698 0.73
699 0.71
700 0.73
701 0.77
702 0.73