FuNGI

A6XPC3

Protein Details

Accession

A6XPC3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	EFKEKKEKAKKDKDNSGGKTQL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-11	KEKAKK

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	aje:HCAG_09224 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

EFKEKKEKAKKDKDNSGGKTQLVITDGSESFQMANLAKVINVPACFVEPHKDPLTIWDSGAGCHIASDRSRFSMLFTIDGPTVQVANKAVLKVQGVGMASIPVGERLIEFNHVYYVPGLSANLISAGLMERQGYIRRDMHVDAGNYFEFLSPTGNDVFYANLSRNNIYILSDSPPTFDGVMNDQEYGAVAYVAVPKPKTISTDYDPNAGSLGPFSREEVERLINPKDPDTDSFVISPPNRLPAVVPKQLPFDEWHRRLGHIGENNILKMARDPRFGIAIIGPKKLSFCATCVKAKQRRATYKNSAPRRATRKALKIWVDIFGGGETLGTENDISSYAGKKLAMVITDDATRMRWIFLLERKDETLKYLRIFNQFIKNLLGRGIAIIHSDRGELNSNAATAYMLSEGIKWEPTPPHTPQQDGVSERSIGLIIEKARSLLIDSSAPEKMWGEAVIAATELLNLMPTSTILYGGPENMKPITPYEAWLGALPSARGIRRWGCKAFLKIAPKPTNKMASRSLELIFVGYDGFTNYRLVDPSNGRLYISKDVIFQEDLHLMDPSAPATGHPKTLPTAARQAAAAIPSPIPSPTPGPIPSVNDLFIDEEVQPLRPLFLVPTNNWWIDYEISARIPTFLVQNTPISPSPPIEIEDTPTITGNNDSVGESSVGDGSDDLPSDPEIYGLPIPKNLTRAKASPEWKFYYKACVKEVNRLKQIGAWRLIERTPNMAVLRGQWVFDKKFNNMGKVVRYKARWVVCGNYQQKGVDYSKTFAPVVSASTSRALMAISASRGWHVLQIDMVTAFLNAQLPADERIYMSQPTELP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.86
3	0.84
4	0.78
5	0.67
6	0.6
7	0.51
8	0.43
9	0.34
10	0.29
11	0.2
12	0.21
13	0.2
14	0.18
15	0.17
16	0.15
17	0.13
18	0.14
19	0.16
20	0.11
21	0.12
22	0.13
23	0.13
24	0.12
25	0.13
26	0.15
27	0.16
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.16
32	0.17
33	0.18
34	0.22
35	0.21
36	0.28
37	0.29
38	0.29
39	0.28
40	0.34
41	0.37
42	0.31
43	0.28
44	0.27
45	0.25
46	0.24
47	0.26
48	0.2
49	0.15
50	0.14
51	0.15
52	0.13
53	0.16
54	0.2
55	0.21
56	0.23
57	0.25
58	0.24
59	0.26
60	0.29
61	0.28
62	0.25
63	0.23
64	0.23
65	0.22
66	0.22
67	0.19
68	0.13
69	0.13
70	0.11
71	0.13
72	0.11
73	0.15
74	0.17
75	0.17
76	0.18
77	0.19
78	0.2
79	0.19
80	0.18
81	0.18
82	0.16
83	0.16
84	0.14
85	0.12
86	0.11
87	0.1
88	0.09
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.07
93	0.08
94	0.1
95	0.13
96	0.13
97	0.13
98	0.15
99	0.15
100	0.16
101	0.14
102	0.14
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.08
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.1
119	0.16
120	0.18
121	0.22
122	0.24
123	0.25
124	0.29
125	0.29
126	0.32
127	0.31
128	0.31
129	0.26
130	0.27
131	0.24
132	0.21
133	0.2
134	0.16
135	0.11
136	0.1
137	0.12
138	0.09
139	0.11
140	0.12
141	0.12
142	0.11
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.13
147	0.12
148	0.14
149	0.16
150	0.17
151	0.17
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.14
157	0.15
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.17
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.19
168	0.18
169	0.17
170	0.16
171	0.15
172	0.14
173	0.13
174	0.09
175	0.05
176	0.04
177	0.05
178	0.11
179	0.12
180	0.15
181	0.14
182	0.15
183	0.17
184	0.19
185	0.21
186	0.2
187	0.25
188	0.27
189	0.36
190	0.37
191	0.39
192	0.38
193	0.34
194	0.31
195	0.25
196	0.2
197	0.12
198	0.12
199	0.1
200	0.1
201	0.11
202	0.14
203	0.15
204	0.16
205	0.18
206	0.19
207	0.2
208	0.23
209	0.24
210	0.26
211	0.26
212	0.27
213	0.27
214	0.26
215	0.26
216	0.29
217	0.28
218	0.25
219	0.25
220	0.24
221	0.26
222	0.24
223	0.26
224	0.19
225	0.22
226	0.2
227	0.19
228	0.2
229	0.25
230	0.32
231	0.34
232	0.35
233	0.32
234	0.36
235	0.36
236	0.36
237	0.29
238	0.3
239	0.35
240	0.35
241	0.4
242	0.38
243	0.38
244	0.39
245	0.38
246	0.36
247	0.3
248	0.3
249	0.27
250	0.27
251	0.27
252	0.26
253	0.23
254	0.16
255	0.16
256	0.22
257	0.21
258	0.22
259	0.24
260	0.24
261	0.26
262	0.26
263	0.23
264	0.18
265	0.22
266	0.22
267	0.22
268	0.21
269	0.19
270	0.2
271	0.19
272	0.19
273	0.13
274	0.13
275	0.19
276	0.22
277	0.27
278	0.31
279	0.4
280	0.45
281	0.51
282	0.57
283	0.6
284	0.67
285	0.68
286	0.72
287	0.71
288	0.73
289	0.76
290	0.76
291	0.74
292	0.69
293	0.71
294	0.7
295	0.66
296	0.65
297	0.64
298	0.63
299	0.61
300	0.64
301	0.6
302	0.55
303	0.51
304	0.45
305	0.37
306	0.29
307	0.23
308	0.16
309	0.12
310	0.08
311	0.07
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.03
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.12
343	0.17
344	0.21
345	0.22
346	0.24
347	0.25
348	0.26
349	0.25
350	0.24
351	0.24
352	0.22
353	0.21
354	0.24
355	0.27
356	0.3
357	0.32
358	0.32
359	0.35
360	0.33
361	0.33
362	0.31
363	0.27
364	0.23
365	0.22
366	0.18
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.07
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.05
396	0.08
397	0.09
398	0.13
399	0.17
400	0.2
401	0.27
402	0.28
403	0.29
404	0.28
405	0.3
406	0.3
407	0.27
408	0.26
409	0.2
410	0.19
411	0.17
412	0.16
413	0.13
414	0.09
415	0.07
416	0.08
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.09
459	0.08
460	0.1
461	0.09
462	0.1
463	0.09
464	0.1
465	0.13
466	0.12
467	0.13
468	0.14
469	0.14
470	0.14
471	0.14
472	0.13
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.08
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.13
481	0.18
482	0.23
483	0.29
484	0.29
485	0.32
486	0.36
487	0.39
488	0.4
489	0.4
490	0.41
491	0.4
492	0.48
493	0.52
494	0.5
495	0.5
496	0.5
497	0.54
498	0.48
499	0.49
500	0.45
501	0.41
502	0.41
503	0.4
504	0.35
505	0.27
506	0.25
507	0.21
508	0.14
509	0.1
510	0.08
511	0.05
512	0.05
513	0.04
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.07
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.13
522	0.15
523	0.19
524	0.22
525	0.21
526	0.21
527	0.22
528	0.25
529	0.25
530	0.25
531	0.21
532	0.19
533	0.2
534	0.22
535	0.21
536	0.18
537	0.15
538	0.15
539	0.14
540	0.13
541	0.12
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.08
546	0.07
547	0.06
548	0.06
549	0.11
550	0.12
551	0.13
552	0.14
553	0.15
554	0.16
555	0.21
556	0.22
557	0.21
558	0.27
559	0.26
560	0.26
561	0.25
562	0.24
563	0.21
564	0.2
565	0.17
566	0.11
567	0.1
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.09
572	0.1
573	0.12
574	0.12
575	0.16
576	0.16
577	0.2
578	0.22
579	0.25
580	0.26
581	0.25
582	0.24
583	0.2
584	0.2
585	0.17
586	0.15
587	0.13
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.1
594	0.1
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.14
599	0.18
600	0.18
601	0.25
602	0.28
603	0.28
604	0.29
605	0.28
606	0.23
607	0.2
608	0.21
609	0.16
610	0.14
611	0.15
612	0.15
613	0.14
614	0.13
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.12
619	0.13
620	0.15
621	0.17
622	0.17
623	0.21
624	0.2
625	0.19
626	0.19
627	0.18
628	0.18
629	0.17
630	0.18
631	0.18
632	0.18
633	0.2
634	0.21
635	0.21
636	0.2
637	0.19
638	0.17
639	0.15
640	0.15
641	0.11
642	0.1
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.1
647	0.1
648	0.09
649	0.1
650	0.09
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.1
661	0.09
662	0.09
663	0.08
664	0.1
665	0.12
666	0.15
667	0.15
668	0.17
669	0.2
670	0.22
671	0.27
672	0.28
673	0.31
674	0.32
675	0.35
676	0.38
677	0.44
678	0.48
679	0.5
680	0.54
681	0.55
682	0.53
683	0.54
684	0.48
685	0.51
686	0.5
687	0.48
688	0.45
689	0.48
690	0.47
691	0.54
692	0.63
693	0.62
694	0.62
695	0.58
696	0.55
697	0.49
698	0.55
699	0.52
700	0.47
701	0.41
702	0.37
703	0.38
704	0.4
705	0.4
706	0.35
707	0.31
708	0.28
709	0.29
710	0.28
711	0.27
712	0.25
713	0.23
714	0.28
715	0.24
716	0.24
717	0.23
718	0.29
719	0.31
720	0.35
721	0.37
722	0.33
723	0.42
724	0.46
725	0.46
726	0.44
727	0.45
728	0.49
729	0.52
730	0.54
731	0.52
732	0.51
733	0.52
734	0.55
735	0.56
736	0.52
737	0.48
738	0.48
739	0.48
740	0.56
741	0.54
742	0.49
743	0.47
744	0.43
745	0.41
746	0.42
747	0.37
748	0.34
749	0.33
750	0.32
751	0.33
752	0.35
753	0.34
754	0.27
755	0.27
756	0.21
757	0.21
758	0.22
759	0.2
760	0.18
761	0.2
762	0.2
763	0.18
764	0.17
765	0.14
766	0.11
767	0.12
768	0.13
769	0.13
770	0.14
771	0.14
772	0.15
773	0.16
774	0.16
775	0.18
776	0.16
777	0.15
778	0.15
779	0.16
780	0.16
781	0.15
782	0.15
783	0.11
784	0.1
785	0.09
786	0.08
787	0.09
788	0.08
789	0.08
790	0.09
791	0.11
792	0.14
793	0.15
794	0.15
795	0.14
796	0.17
797	0.2
798	0.2
799	0.2

A6XPC3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer