Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RFG0

Protein Details
Accession A6RFG0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-88QLGPAHTSRRNRKGDKTKKKTEEEAANKKKKKKRIIMSSFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-81TSRRNRKGDKTKKKTEEEAANKKKKKKR
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13.833, nucl 5, mito_nucl 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
IPR009287  Spt4  
IPR022800  Spt4/RpoE2_Znf  
IPR038510  Spt4_sf  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
KEGG aje:HCAG_08376  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06093  Spt4  
CDD cd07973  Spt4  
Amino Acid Sequences MDVEQNAGRKDVLKSGQGVKVSVGGYVSVDLGHGIIVATSKEQGKGAQLGPAHTSRRNRKGDKTKKKTEEEAANKKKKKKRIIMSSFYVPTGQQRSLRACMVCSIVQVHSKFMREGCPNCDHILGLAGNGEKIQQCTSQVFEGLITLADQQASWVARWQRLEGYVPGTYAVKVTGTLPPGVLGDLEDSGIRYIPRDGSSIDEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.39
4 0.37
5 0.35
6 0.29
7 0.29
8 0.26
9 0.22
10 0.16
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.05
25 0.05
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.19
37 0.21
38 0.25
39 0.25
40 0.27
41 0.35
42 0.41
43 0.5
44 0.57
45 0.6
46 0.66
47 0.74
48 0.8
49 0.83
50 0.83
51 0.84
52 0.84
53 0.84
54 0.79
55 0.75
56 0.74
57 0.72
58 0.74
59 0.74
60 0.75
61 0.75
62 0.78
63 0.78
64 0.76
65 0.77
66 0.75
67 0.75
68 0.77
69 0.8
70 0.78
71 0.76
72 0.72
73 0.63
74 0.53
75 0.43
76 0.32
77 0.26
78 0.23
79 0.2
80 0.17
81 0.19
82 0.22
83 0.24
84 0.26
85 0.23
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.2
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.27
105 0.28
106 0.28
107 0.28
108 0.22
109 0.17
110 0.18
111 0.12
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.14
142 0.16
143 0.2
144 0.21
145 0.23
146 0.23
147 0.24
148 0.27
149 0.23
150 0.25
151 0.22
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.16
156 0.13
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.12
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.22