Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6QS92

Protein Details
Accession A6QS92    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-48NDDSPKSQRKSRAHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIAALEQRVHydrophilic
66-91KSQLMECGSRSRRRRHPHHANQLAEGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
KEGG aje:HCAG_00248  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
CDD cd14856  TRAPPC4_synbindin  
Amino Acid Sequences MSTPTSNNDDSPKSQRKSRAHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIAALEQRVEETGRLLEEARAEIDSLKSQLMECGSRSRRRRHPHHANQLAEGESAVSYSGGGGGGSIDAAAWMMSLGQQGGYRQVSGQIEEVGELPALLPGPLPAPPEREDDWPATTSHQQTSDIGYNATPNMLALQQLDNTHPRRPSSSSLALANQRETAVCGSRPPNAVNSDTTLTTSTNAPSPLSTLWTPTLTALQLEGLILPDIPDTSNSDYTLSPADESTTPCSQAFIFISQQNFKGLDASSIERWLCRGFRQATDPREGCRVENTLLLQVLDFASFKDEDGTLPNRQHRHSAIRSSWGKAGGFTTSPRGAPKVLENLTPNKLYCRERFVKQTCTPVYSLIIINKAGGLIYNREFHSGLLKLSTNDYLVLAGTFHGIHAITRSLTPRLPTNPTTTPSSVPSAGTAIPSHTHAHSSSSSISSPLNPSTTSTVTSSSLPSHTTVPNPTQPITGIEVLETDKFRLTCFQTVTGTKFLLFTDPLMAGVDVVMRKIYELYADYVMKNPFYQLEMPVRCEAFDRHVAGWVKGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.64
3 0.68
4 0.72
5 0.78
6 0.78
7 0.76
8 0.81
9 0.84
10 0.85
11 0.86
12 0.88
13 0.88
14 0.85
15 0.88
16 0.89
17 0.89
18 0.89
19 0.89
20 0.89
21 0.9
22 0.92
23 0.93
24 0.92
25 0.88
26 0.84
27 0.85
28 0.83
29 0.81
30 0.74
31 0.63
32 0.55
33 0.48
34 0.42
35 0.33
36 0.23
37 0.16
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.26
60 0.33
61 0.41
62 0.49
63 0.56
64 0.63
65 0.72
66 0.8
67 0.82
68 0.86
69 0.88
70 0.91
71 0.91
72 0.83
73 0.76
74 0.69
75 0.59
76 0.47
77 0.36
78 0.25
79 0.15
80 0.13
81 0.09
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.07
105 0.07
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.15
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.11
131 0.14
132 0.17
133 0.22
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.3
139 0.27
140 0.26
141 0.24
142 0.26
143 0.25
144 0.25
145 0.24
146 0.23
147 0.22
148 0.27
149 0.27
150 0.23
151 0.21
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.16
156 0.11
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.19
167 0.21
168 0.25
169 0.26
170 0.27
171 0.29
172 0.32
173 0.35
174 0.36
175 0.38
176 0.36
177 0.36
178 0.39
179 0.4
180 0.37
181 0.33
182 0.26
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.15
190 0.16
191 0.2
192 0.22
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.25
197 0.23
198 0.24
199 0.22
200 0.2
201 0.2
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.12
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.14
251 0.13
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.11
259 0.13
260 0.13
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.13
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.27
284 0.32
285 0.34
286 0.4
287 0.4
288 0.34
289 0.36
290 0.35
291 0.28
292 0.24
293 0.24
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.04
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.11
313 0.14
314 0.15
315 0.19
316 0.24
317 0.26
318 0.27
319 0.3
320 0.3
321 0.36
322 0.37
323 0.41
324 0.38
325 0.44
326 0.45
327 0.43
328 0.42
329 0.36
330 0.31
331 0.24
332 0.24
333 0.16
334 0.15
335 0.13
336 0.16
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.15
343 0.18
344 0.22
345 0.22
346 0.24
347 0.26
348 0.29
349 0.31
350 0.32
351 0.28
352 0.24
353 0.28
354 0.3
355 0.3
356 0.34
357 0.35
358 0.37
359 0.47
360 0.49
361 0.53
362 0.52
363 0.58
364 0.52
365 0.5
366 0.47
367 0.38
368 0.34
369 0.27
370 0.25
371 0.18
372 0.18
373 0.15
374 0.14
375 0.13
376 0.11
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.12
382 0.15
383 0.16
384 0.18
385 0.19
386 0.18
387 0.21
388 0.19
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.15
393 0.17
394 0.17
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.1
413 0.13
414 0.15
415 0.16
416 0.18
417 0.22
418 0.25
419 0.31
420 0.31
421 0.35
422 0.38
423 0.39
424 0.43
425 0.4
426 0.37
427 0.34
428 0.36
429 0.3
430 0.26
431 0.24
432 0.2
433 0.18
434 0.17
435 0.15
436 0.13
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.15
441 0.17
442 0.16
443 0.19
444 0.19
445 0.2
446 0.2
447 0.2
448 0.2
449 0.19
450 0.19
451 0.18
452 0.2
453 0.2
454 0.19
455 0.18
456 0.2
457 0.23
458 0.24
459 0.23
460 0.21
461 0.21
462 0.21
463 0.22
464 0.21
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.26
473 0.3
474 0.34
475 0.36
476 0.36
477 0.33
478 0.32
479 0.31
480 0.31
481 0.27
482 0.21
483 0.17
484 0.18
485 0.18
486 0.2
487 0.18
488 0.14
489 0.16
490 0.16
491 0.17
492 0.22
493 0.25
494 0.28
495 0.3
496 0.33
497 0.34
498 0.38
499 0.41
500 0.38
501 0.34
502 0.28
503 0.26
504 0.23
505 0.21
506 0.18
507 0.16
508 0.15
509 0.15
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.11
514 0.1
515 0.13
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.1
524 0.12
525 0.15
526 0.19
527 0.21
528 0.22
529 0.26
530 0.28
531 0.26
532 0.24
533 0.23
534 0.19
535 0.21
536 0.22
537 0.23
538 0.31
539 0.33
540 0.37
541 0.4
542 0.39
543 0.36
544 0.36
545 0.34
546 0.3
547 0.33
548 0.33
549 0.29
550 0.37
551 0.39
552 0.38