FuNGI

A6RA01

Protein Details

Accession

A6RA01

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
193-216	TLGHFAFRRRQQRKLERVRLLQDT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 22, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032190 NPC1_N IPR003392 Ptc/Disp IPR000731 SSD
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0015918 P:sterol transport
KEGG	aje:HCAG_05789 -
Pfam	View protein in Pfam PF16414 NPC1_N PF02460 Patched
PROSITE	View protein in PROSITE PS50156 SSD

Amino Acid Sequences

MRLGCLPLLAGLVAVQYSSVFAQGGTKIHEEGRCAIRGHCGKKSLFGGQLPCVDNGFAKKPAAVTRAKLVSLCGDKWKTGNVCCNDDQIAALSSNLKLAAGIIASCPACKENFFNLFCSFTCSPNQSLFINVTQTDKINGRTAVTELDNLWSEGYQTGFYDSCKDVKNGATGGKAMDFIVIYSVFLLLLVAGTLGHFAFRRRQQRKLERVRLLQDTSPSDDEDEGDLIDDAGILDRPQTSYRLNSIFDAMFNRLGGACARFPALTITTSIILCGLLSLGWLRFAVEIDPVKLWVSPDSAAAREKAFFDENFGPFFRAEQAFLVNDTHPSGPGPVLSYETLSWWFDVESRVRRMISLDKGLSLDDICFNPTGKACVVQSLTGYFGGSFANVDPNTWEAHLKHCTESPGSVECLPDFQQPLKPEMILGGYGQTDNVLNATALVVTWVVNNHAPGTIAEAGAIDWEGSLKRVLEVVQEEATEHGLRVSFNTEISLEQELNKSTNTDAKIVVISYVIMFVYASLALGSTTLTWKSILSNPANSLVQSKFTLGIVGILIVLMSVSASVGIFSAAGIKVTLIIAEVIPFLVLAIGVDNIFLIVHEFERVNGNHPDEEIDERIARSLGRMGPSILLSATTETIAFAMGAFVGMPAVKNFAAYAAGAVLINALLQVTMFVSVLALNQRRVESLRADCLPCLTVRKANSSSIPGGQPYDHAEEGALQRFIRKIYATRLLQKRTKFLVVTVFLGIFTAGLALLPTVALGLDQRIAIPSDSYLIDYFNDMYDYFGSGPPVYFVTRDVNITTRNHQKQLCGRFSTCEEYSLGFVLEQESKRANVSYISGSAASWIDDFFYWLNPHQNCCKEDGQTCFEDRNPPWNISLHGMPEGSEFIHYAQKWLQSPTDETCPLGGLAPYSNALVLDSKHVTTNASHFRTSHTPLRSQKDFIKAYASARRIADGISQEHGIDVFPYSKFYIFFDQYTSIIRLTGTLLGCATAIIFVVTSIFVGSIATGAVVTATVIMTVVDIIGTMAIANVSLNAVSLVNLIICVGIAFEFCAHVARAFMFPSSPLLEQARGKFRHRTARSWVALVNVGSSVFTGITVTKLLGVCVLAFTRSKIFEIYYFRIWLALVIFAASHALIFLPVALSFLGGDGYCDPQTDGGLEEDLAARRYRSLLPDDYDSEDDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.04
4	0.06
5	0.06
6	0.07
7	0.06
8	0.06
9	0.1
10	0.13
11	0.15
12	0.18
13	0.19
14	0.2
15	0.25
16	0.27
17	0.27
18	0.3
19	0.33
20	0.34
21	0.34
22	0.33
23	0.38
24	0.45
25	0.48
26	0.48
27	0.49
28	0.46
29	0.51
30	0.55
31	0.51
32	0.48
33	0.47
34	0.45
35	0.43
36	0.49
37	0.44
38	0.41
39	0.35
40	0.3
41	0.28
42	0.29
43	0.29
44	0.25
45	0.24
46	0.24
47	0.27
48	0.33
49	0.36
50	0.35
51	0.34
52	0.39
53	0.42
54	0.41
55	0.38
56	0.34
57	0.35
58	0.36
59	0.35
60	0.36
61	0.35
62	0.35
63	0.36
64	0.43
65	0.4
66	0.42
67	0.49
68	0.45
69	0.49
70	0.49
71	0.51
72	0.45
73	0.4
74	0.34
75	0.27
76	0.23
77	0.17
78	0.16
79	0.14
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.1
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.07
88	0.08
89	0.07
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.13
96	0.15
97	0.19
98	0.24
99	0.33
100	0.34
101	0.37
102	0.37
103	0.39
104	0.37
105	0.4
106	0.33
107	0.26
108	0.3
109	0.3
110	0.31
111	0.31
112	0.34
113	0.27
114	0.28
115	0.28
116	0.26
117	0.26
118	0.23
119	0.23
120	0.22
121	0.22
122	0.23
123	0.23
124	0.24
125	0.26
126	0.26
127	0.24
128	0.24
129	0.24
130	0.24
131	0.23
132	0.21
133	0.17
134	0.19
135	0.18
136	0.17
137	0.17
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.1
143	0.09
144	0.11
145	0.12
146	0.12
147	0.16
148	0.17
149	0.2
150	0.22
151	0.23
152	0.24
153	0.26
154	0.3
155	0.28
156	0.29
157	0.26
158	0.24
159	0.24
160	0.21
161	0.19
162	0.15
163	0.13
164	0.1
165	0.09
166	0.1
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.06
184	0.08
185	0.17
186	0.25
187	0.37
188	0.41
189	0.5
190	0.6
191	0.71
192	0.8
193	0.83
194	0.85
195	0.82
196	0.85
197	0.82
198	0.77
199	0.7
200	0.61
201	0.55
202	0.48
203	0.44
204	0.38
205	0.33
206	0.28
207	0.24
208	0.23
209	0.19
210	0.16
211	0.11
212	0.1
213	0.09
214	0.08
215	0.07
216	0.06
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.06
222	0.06
223	0.08
224	0.1
225	0.13
226	0.15
227	0.18
228	0.23
229	0.26
230	0.26
231	0.25
232	0.27
233	0.25
234	0.24
235	0.23
236	0.2
237	0.18
238	0.16
239	0.16
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.11
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.14
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.11
258	0.09
259	0.08
260	0.07
261	0.05
262	0.03
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.11
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.14
280	0.11
281	0.12
282	0.11
283	0.14
284	0.15
285	0.16
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.17
293	0.15
294	0.2
295	0.25
296	0.25
297	0.26
298	0.25
299	0.24
300	0.21
301	0.22
302	0.2
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.15
307	0.14
308	0.15
309	0.17
310	0.13
311	0.13
312	0.14
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.09
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.12
326	0.14
327	0.12
328	0.12
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.12
333	0.17
334	0.21
335	0.24
336	0.26
337	0.26
338	0.26
339	0.28
340	0.31
341	0.31
342	0.31
343	0.28
344	0.27
345	0.27
346	0.27
347	0.24
348	0.18
349	0.14
350	0.1
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.13
358	0.11
359	0.13
360	0.12
361	0.15
362	0.16
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.14
367	0.12
368	0.12
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.15
383	0.1
384	0.15
385	0.2
386	0.21
387	0.21
388	0.22
389	0.24
390	0.23
391	0.23
392	0.2
393	0.18
394	0.18
395	0.18
396	0.16
397	0.14
398	0.15
399	0.16
400	0.15
401	0.15
402	0.15
403	0.18
404	0.19
405	0.22
406	0.21
407	0.19
408	0.17
409	0.16
410	0.15
411	0.11
412	0.09
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.04
428	0.04
429	0.03
430	0.04
431	0.04
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.07
439	0.11
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.09
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.04
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.07
457	0.09
458	0.1
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.1
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.1
478	0.11
479	0.09
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.09
487	0.13
488	0.14
489	0.14
490	0.13
491	0.13
492	0.14
493	0.13
494	0.12
495	0.08
496	0.07
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.03
503	0.04
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.08
518	0.12
519	0.17
520	0.18
521	0.19
522	0.2
523	0.22
524	0.22
525	0.2
526	0.19
527	0.14
528	0.15
529	0.13
530	0.13
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.08
535	0.08
536	0.06
537	0.05
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.02
544	0.02
545	0.01
546	0.01
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.04
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.02
573	0.02
574	0.02
575	0.02
576	0.02
577	0.03
578	0.02
579	0.03
580	0.03
581	0.02
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.09
589	0.09
590	0.13
591	0.15
592	0.16
593	0.15
594	0.15
595	0.16
596	0.13
597	0.15
598	0.12
599	0.11
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.09
607	0.1
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.09
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.04
624	0.04
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.02
630	0.02
631	0.02
632	0.02
633	0.03
634	0.03
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.02
652	0.02
653	0.02
654	0.02
655	0.02
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.04
662	0.09
663	0.1
664	0.1
665	0.12
666	0.12
667	0.13
668	0.15
669	0.16
670	0.16
671	0.17
672	0.2
673	0.21
674	0.22
675	0.21
676	0.2
677	0.19
678	0.15
679	0.17
680	0.15
681	0.16
682	0.17
683	0.23
684	0.25
685	0.26
686	0.27
687	0.27
688	0.27
689	0.25
690	0.24
691	0.19
692	0.18
693	0.16
694	0.15
695	0.15
696	0.16
697	0.14
698	0.13
699	0.12
700	0.14
701	0.15
702	0.17
703	0.14
704	0.11
705	0.12
706	0.13
707	0.13
708	0.13
709	0.12
710	0.12
711	0.17
712	0.26
713	0.27
714	0.36
715	0.42
716	0.47
717	0.51
718	0.51
719	0.51
720	0.46
721	0.47
722	0.38
723	0.32
724	0.33
725	0.29
726	0.29
727	0.24
728	0.2
729	0.16
730	0.16
731	0.14
732	0.07
733	0.05
734	0.03
735	0.03
736	0.02
737	0.02
738	0.02
739	0.02
740	0.02
741	0.02
742	0.02
743	0.02
744	0.02
745	0.02
746	0.03
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.05
751	0.06
752	0.06
753	0.07
754	0.06
755	0.07
756	0.08
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.09
762	0.09
763	0.07
764	0.08
765	0.07
766	0.08
767	0.07
768	0.08
769	0.09
770	0.09
771	0.1
772	0.09
773	0.09
774	0.09
775	0.1
776	0.1
777	0.09
778	0.1
779	0.12
780	0.13
781	0.14
782	0.15
783	0.16
784	0.19
785	0.21
786	0.25
787	0.32
788	0.35
789	0.39
790	0.4
791	0.43
792	0.48
793	0.55
794	0.55
795	0.5
796	0.47
797	0.44
798	0.46
799	0.46
800	0.38
801	0.31
802	0.25
803	0.21
804	0.21
805	0.18
806	0.15
807	0.09
808	0.09
809	0.09
810	0.13
811	0.13
812	0.14
813	0.15
814	0.15
815	0.16
816	0.17
817	0.15
818	0.12
819	0.14
820	0.14
821	0.13
822	0.14
823	0.13
824	0.12
825	0.13
826	0.12
827	0.1
828	0.08
829	0.07
830	0.07
831	0.06
832	0.08
833	0.07
834	0.09
835	0.1
836	0.12
837	0.2
838	0.2
839	0.24
840	0.3
841	0.35
842	0.34
843	0.38
844	0.39
845	0.35
846	0.39
847	0.41
848	0.38
849	0.35
850	0.35
851	0.32
852	0.31
853	0.34
854	0.3
855	0.33
856	0.32
857	0.31
858	0.31
859	0.31
860	0.31
861	0.27
862	0.28
863	0.21
864	0.19
865	0.18
866	0.16
867	0.16
868	0.14
869	0.11
870	0.1
871	0.09
872	0.09
873	0.14
874	0.14
875	0.15
876	0.17
877	0.21
878	0.23
879	0.25
880	0.26
881	0.22
882	0.26
883	0.27
884	0.31
885	0.27
886	0.25
887	0.23
888	0.22
889	0.2
890	0.17
891	0.14
892	0.08
893	0.08
894	0.09
895	0.09
896	0.08
897	0.08
898	0.07
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.12
903	0.13
904	0.13
905	0.14
906	0.15
907	0.15
908	0.16
909	0.23
910	0.28
911	0.29
912	0.3
913	0.29
914	0.34
915	0.38
916	0.43
917	0.43
918	0.37
919	0.43
920	0.5
921	0.57
922	0.56
923	0.54
924	0.54
925	0.56
926	0.54
927	0.46
928	0.44
929	0.38
930	0.4
931	0.43
932	0.39
933	0.35
934	0.33
935	0.33
936	0.28
937	0.27
938	0.26
939	0.21
940	0.22
941	0.19
942	0.19
943	0.18
944	0.18
945	0.17
946	0.13
947	0.09
948	0.09
949	0.09
950	0.09
951	0.11
952	0.12
953	0.13
954	0.14
955	0.16
956	0.22
957	0.22
958	0.23
959	0.24
960	0.24
961	0.24
962	0.27
963	0.26
964	0.18
965	0.17
966	0.16
967	0.13
968	0.13
969	0.17
970	0.14
971	0.13
972	0.12
973	0.12
974	0.12
975	0.11
976	0.1
977	0.05
978	0.05
979	0.04
980	0.04
981	0.03
982	0.04
983	0.04
984	0.04
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.04
993	0.03
994	0.03
995	0.03
996	0.03
997	0.03
998	0.03
999	0.03
1000	0.03
1001	0.03
1002	0.03
1003	0.04
1004	0.04
1005	0.04
1006	0.03
1007	0.03
1008	0.03
1009	0.03
1010	0.03
1011	0.03
1012	0.03
1013	0.03
1014	0.03
1015	0.03
1016	0.03
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.05
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.06
1024	0.06
1025	0.05
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.04
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.04
1032	0.04
1033	0.04
1034	0.04
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.06
1038	0.08
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.12
1044	0.12
1045	0.13
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.14
1049	0.17
1050	0.16
1051	0.18
1052	0.2
1053	0.24
1054	0.28
1055	0.34
1056	0.4
1057	0.42
1058	0.45
1059	0.51
1060	0.55
1061	0.62
1062	0.62
1063	0.62
1064	0.62
1065	0.68
1066	0.67
1067	0.61
1068	0.55
1069	0.46
1070	0.45
1071	0.39
1072	0.3
1073	0.2
1074	0.17
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.11
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.06
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.11
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.1
1091	0.12
1092	0.12
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.13
1096	0.17
1097	0.18
1098	0.19
1099	0.19
1100	0.2
1101	0.24
1102	0.31
1103	0.34
1104	0.34
1105	0.34
1106	0.33
1107	0.32
1108	0.3
1109	0.25
1110	0.18
1111	0.14
1112	0.1
1113	0.09
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.09
1117	0.07
1118	0.06
1119	0.05
1120	0.05
1121	0.05
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.05
1125	0.05
1126	0.06
1127	0.06
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.06
1131	0.07
1132	0.06
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.12
1136	0.13
1137	0.13
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.14
1141	0.14
1142	0.14
1143	0.11
1144	0.12
1145	0.11
1146	0.12
1147	0.14
1148	0.15
1149	0.16
1150	0.16
1151	0.15
1152	0.15
1153	0.19
1154	0.22
1155	0.24
1156	0.29
1157	0.33
1158	0.37
1159	0.42
1160	0.43
1161	0.45

A6RA01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer