Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QVD2

Protein Details
Accession A6QVD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-385MGAGRHSKAHARKRKKRVVDLRRRPKNTDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-381RHSKAHARKRKKRVVDLRRRPK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 10, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
KEGG aje:HCAG_01339  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MAFNFNWSPLMADAGFYTRAQELLTVALNKSPKPPIIVDDIVVTELNLGSNPPELEILEIGDLAEDRFRGIFKMSYAGDAFLTLKTCVQANPLNTYLLTRHPFASPQPLAAATGLTIPLQITLSDIKLSGFVILVFSKQKGITVVFRNDPLESLKVSSTFDSIPFVRDYLQKEIEGQLRILFMDELPAIIHRLSLRLWGTEYSELETTSAQVTNPPLEGPGLDPLLNPPEDPVDASGNVLSTSEIASLSLDSGVEMHSLFSRKNVLRLAALTDSQRTLSLFTPSIQEVVFRAWTGLMEQADGPSGLVSPMSPPLSRTHSHVATSSLSLQDAASLASSSHSRLSLPSTGFSGYGLSMGAGRHSKAHARKRKKRVVDLRRRPKNTDDMESVSGESAFTESTSAASVFSGSTIPEENNDDPVTPPGSPPRTIRQPTLCDPIVARNGAERNARRGSLSLFIVWNSDTISLLPALRRLLPTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.15
4 0.17
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.16
12 0.16
13 0.16
14 0.2
15 0.22
16 0.22
17 0.27
18 0.29
19 0.28
20 0.3
21 0.32
22 0.31
23 0.37
24 0.37
25 0.32
26 0.29
27 0.27
28 0.24
29 0.22
30 0.18
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.13
59 0.13
60 0.18
61 0.18
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.13
69 0.14
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.16
76 0.19
77 0.2
78 0.25
79 0.25
80 0.26
81 0.25
82 0.26
83 0.23
84 0.25
85 0.25
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.24
90 0.25
91 0.33
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.23
97 0.21
98 0.18
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.15
129 0.2
130 0.25
131 0.29
132 0.28
133 0.3
134 0.31
135 0.29
136 0.27
137 0.24
138 0.19
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.14
154 0.17
155 0.2
156 0.23
157 0.25
158 0.23
159 0.23
160 0.27
161 0.29
162 0.26
163 0.22
164 0.18
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.11
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.14
249 0.14
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.21
256 0.16
257 0.17
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.14
301 0.19
302 0.2
303 0.24
304 0.28
305 0.28
306 0.29
307 0.29
308 0.28
309 0.25
310 0.25
311 0.22
312 0.16
313 0.14
314 0.13
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.14
330 0.18
331 0.19
332 0.18
333 0.18
334 0.19
335 0.18
336 0.17
337 0.14
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.12
348 0.14
349 0.22
350 0.29
351 0.4
352 0.48
353 0.58
354 0.68
355 0.78
356 0.86
357 0.88
358 0.89
359 0.9
360 0.91
361 0.91
362 0.92
363 0.92
364 0.93
365 0.89
366 0.83
367 0.78
368 0.76
369 0.71
370 0.66
371 0.6
372 0.54
373 0.51
374 0.48
375 0.42
376 0.32
377 0.26
378 0.19
379 0.14
380 0.09
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.17
400 0.17
401 0.21
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.22
406 0.23
407 0.18
408 0.19
409 0.24
410 0.27
411 0.3
412 0.33
413 0.4
414 0.48
415 0.52
416 0.58
417 0.57
418 0.6
419 0.63
420 0.66
421 0.58
422 0.49
423 0.46
424 0.46
425 0.43
426 0.37
427 0.32
428 0.29
429 0.31
430 0.35
431 0.42
432 0.38
433 0.4
434 0.44
435 0.44
436 0.4
437 0.39
438 0.37
439 0.34
440 0.33
441 0.29
442 0.25
443 0.25
444 0.25
445 0.23
446 0.2
447 0.16
448 0.14
449 0.11
450 0.1
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.16
456 0.18
457 0.21