FuNGI

A6QX46

Protein Details

Accession

A6QX46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-53	DPTHLSKQWSRLPRRQKETLWPPIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
KEGG	aje:HCAG_01953 -
Pfam	View protein in Pfam PF13812 PPR_3

Amino Acid Sequences

MARVWDKLKLEREEEALEWLAGVDWTSEDPTHLSKQWSRLPRRQKETLWPPITLWLLLNSPRAALAFLLATDILPSPPFSMVAKCFLYLDAFHYEELTRDERSKQYYHEALHTCLDPEKWPVLKAYERGIRLFLKRGTPEDVNEALSTIINRRIHIGFETATYLMDLFTKQRDIPRALSSLNLITDIRDYPQYLSDLRFQYRCCKLLTLDYVIEKNDERHFRILPEILKIGVPLNQPMLNIIYRNALKQNAPASVLYVLHEMGESGIPPDSYTYISLLDDAVSRRDLQHLDVIIREISSQETLRKNPFITSKMLHVFYSLDRVNPDEGWGDTDVFGRMLKIYNAAHDIQPLVDLGVVRVDEFALEEREKSTNSLPSSHSLVIMISAFLRIQSVRQINNMFDRFLYLRDQGHESFGPLAESDYIFNVFLQEFAQRRSGRLKNCVRVLDTMLQPLPPTAILRSQSNRQIKQVKPTVQTWTILLTAFVRNRHPNAVDKIRVMMQEQVCSGSMNVID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.38
3	0.31
4	0.25
5	0.21
6	0.18
7	0.14
8	0.11
9	0.1
10	0.06
11	0.06
12	0.07
13	0.09
14	0.09
15	0.1
16	0.13
17	0.17
18	0.21
19	0.24
20	0.29
21	0.32
22	0.4
23	0.48
24	0.56
25	0.61
26	0.65
27	0.73
28	0.77
29	0.81
30	0.81
31	0.78
32	0.79
33	0.8
34	0.82
35	0.74
36	0.65
37	0.57
38	0.54
39	0.5
40	0.4
41	0.3
42	0.21
43	0.21
44	0.23
45	0.25
46	0.2
47	0.19
48	0.18
49	0.18
50	0.16
51	0.13
52	0.11
53	0.08
54	0.07
55	0.08
56	0.08
57	0.07
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.15
68	0.16
69	0.21
70	0.22
71	0.2
72	0.2
73	0.2
74	0.2
75	0.17
76	0.18
77	0.17
78	0.17
79	0.17
80	0.18
81	0.17
82	0.17
83	0.2
84	0.19
85	0.17
86	0.18
87	0.22
88	0.25
89	0.3
90	0.31
91	0.31
92	0.36
93	0.39
94	0.39
95	0.43
96	0.42
97	0.39
98	0.39
99	0.36
100	0.3
101	0.26
102	0.25
103	0.18
104	0.19
105	0.22
106	0.21
107	0.21
108	0.22
109	0.25
110	0.28
111	0.29
112	0.33
113	0.33
114	0.34
115	0.34
116	0.36
117	0.35
118	0.34
119	0.37
120	0.33
121	0.33
122	0.34
123	0.36
124	0.37
125	0.35
126	0.34
127	0.33
128	0.31
129	0.27
130	0.24
131	0.22
132	0.17
133	0.15
134	0.14
135	0.11
136	0.16
137	0.16
138	0.16
139	0.19
140	0.19
141	0.2
142	0.21
143	0.21
144	0.15
145	0.14
146	0.16
147	0.13
148	0.12
149	0.11
150	0.1
151	0.07
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.1
157	0.12
158	0.16
159	0.21
160	0.24
161	0.27
162	0.29
163	0.29
164	0.28
165	0.27
166	0.24
167	0.2
168	0.17
169	0.15
170	0.11
171	0.1
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.1
178	0.12
179	0.14
180	0.13
181	0.15
182	0.2
183	0.22
184	0.23
185	0.24
186	0.24
187	0.3
188	0.34
189	0.34
190	0.29
191	0.27
192	0.26
193	0.3
194	0.32
195	0.27
196	0.24
197	0.24
198	0.24
199	0.22
200	0.22
201	0.17
202	0.16
203	0.18
204	0.2
205	0.21
206	0.23
207	0.23
208	0.23
209	0.25
210	0.26
211	0.21
212	0.2
213	0.18
214	0.16
215	0.15
216	0.14
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.11
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.12
230	0.11
231	0.13
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.16
236	0.18
237	0.15
238	0.16
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.14
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.13
288	0.16
289	0.19
290	0.22
291	0.24
292	0.24
293	0.26
294	0.29
295	0.26
296	0.27
297	0.25
298	0.27
299	0.29
300	0.29
301	0.26
302	0.22
303	0.21
304	0.18
305	0.23
306	0.18
307	0.15
308	0.14
309	0.16
310	0.16
311	0.15
312	0.15
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.11
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.1
328	0.1
329	0.12
330	0.15
331	0.16
332	0.16
333	0.15
334	0.15
335	0.12
336	0.12
337	0.1
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.09
351	0.1
352	0.1
353	0.12
354	0.13
355	0.14
356	0.16
357	0.17
358	0.2
359	0.21
360	0.24
361	0.24
362	0.26
363	0.3
364	0.28
365	0.25
366	0.2
367	0.18
368	0.16
369	0.14
370	0.11
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.06
377	0.07
378	0.14
379	0.19
380	0.2
381	0.25
382	0.27
383	0.29
384	0.37
385	0.37
386	0.3
387	0.26
388	0.28
389	0.24
390	0.24
391	0.25
392	0.2
393	0.2
394	0.23
395	0.27
396	0.24
397	0.27
398	0.26
399	0.23
400	0.22
401	0.2
402	0.18
403	0.13
404	0.14
405	0.11
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.13
417	0.14
418	0.16
419	0.24
420	0.23
421	0.26
422	0.35
423	0.41
424	0.43
425	0.51
426	0.59
427	0.59
428	0.65
429	0.67
430	0.61
431	0.57
432	0.56
433	0.52
434	0.44
435	0.41
436	0.35
437	0.31
438	0.28
439	0.26
440	0.21
441	0.15
442	0.15
443	0.12
444	0.17
445	0.2
446	0.26
447	0.3
448	0.36
449	0.45
450	0.53
451	0.54
452	0.57
453	0.64
454	0.62
455	0.67
456	0.7
457	0.68
458	0.64
459	0.64
460	0.64
461	0.57
462	0.55
463	0.45
464	0.39
465	0.31
466	0.26
467	0.24
468	0.18
469	0.21
470	0.24
471	0.26
472	0.3
473	0.36
474	0.39
475	0.45
476	0.46
477	0.47
478	0.53
479	0.59
480	0.57
481	0.52
482	0.52
483	0.49
484	0.48
485	0.41
486	0.41
487	0.34
488	0.33
489	0.32
490	0.31
491	0.27
492	0.27
493	0.25

A6QX46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer