Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RDE0

Protein Details
Accession A6RDE0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
554-584WIGASKLPSSRKGKKRRRRTASKGAAHEKAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-580LPSSRKGKKRRRRTASKGAAH
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 9.5, cyto_nucl 6.5, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026832  Asteroid  
IPR039436  Asteroid_dom  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG aje:HCAG_07648  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12813  XPG_I_2  
Amino Acid Sequences MEIHPRKIFDRRPLHWRFKPMPETAFVVPTVIEDLKYRWSPEEVVRCTASAPELQNAIAACGDYGISGGACGSIFAGRTQVVPGEADQFCAIAARETGCAVLTGDSDLLVHDLGAEGSVIFIDSIETGDPLPNYKPAGAGAGPGPGPDIASIFSIRATQVRPATVAKKLGVPSFQRLAYELNRDSHASFPTIIQRAKGSDSLGIVAKSANYIAFMKEYDLGGHAAADSCAWISNTLTAIADPRLSELYAQYELPAFAVPGEAANVYLHDLIEHHDRRTAWTQGSEFRLIAYSLLNQRYATGGAQGRRKEAVIEHMRKGQRIAPVLFALLGRREVEERLEAFLQQVNLFVSAVYNDDAGGGGGGDGDDGNGVCGGSARDPTALWRAFALYDILARMAPDERPSVGQLRRFLERGYCGEKLEWDDIHLHAQRKAVLYSLRMLKDVLAASGEMPEPMLDEGLAALISEATGLLGDLPWLRDCHQRTCGIGGDEGGEGPRRVVEGLVLLLKEEGEGEGGQELGGSLVEGPGLLGASSHHQGDRGQLNNASTAGAGEGWIGASKLPSSRKGKKRRRRTASKGAAHEKAPTTAKHAMNIYDILRQVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.79
4 0.76
5 0.76
6 0.78
7 0.73
8 0.67
9 0.6
10 0.58
11 0.5
12 0.45
13 0.35
14 0.28
15 0.22
16 0.18
17 0.19
18 0.15
19 0.13
20 0.12
21 0.14
22 0.21
23 0.24
24 0.25
25 0.24
26 0.26
27 0.3
28 0.36
29 0.45
30 0.41
31 0.44
32 0.43
33 0.4
34 0.38
35 0.35
36 0.29
37 0.24
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.14
46 0.12
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.05
51 0.06
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.05
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.15
146 0.17
147 0.18
148 0.2
149 0.23
150 0.25
151 0.27
152 0.29
153 0.24
154 0.27
155 0.28
156 0.28
157 0.3
158 0.29
159 0.3
160 0.31
161 0.31
162 0.26
163 0.26
164 0.28
165 0.26
166 0.29
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.27
171 0.26
172 0.25
173 0.23
174 0.18
175 0.16
176 0.16
177 0.21
178 0.24
179 0.24
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.24
185 0.18
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.19
263 0.23
264 0.27
265 0.28
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.27
271 0.24
272 0.2
273 0.17
274 0.17
275 0.14
276 0.13
277 0.09
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.16
290 0.21
291 0.22
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.19
296 0.17
297 0.22
298 0.27
299 0.3
300 0.31
301 0.37
302 0.38
303 0.37
304 0.38
305 0.32
306 0.27
307 0.27
308 0.26
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.19
313 0.15
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.1
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.14
389 0.2
390 0.22
391 0.26
392 0.29
393 0.3
394 0.32
395 0.32
396 0.31
397 0.28
398 0.28
399 0.28
400 0.29
401 0.27
402 0.26
403 0.25
404 0.26
405 0.26
406 0.25
407 0.21
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.23
412 0.25
413 0.23
414 0.23
415 0.25
416 0.26
417 0.26
418 0.26
419 0.23
420 0.2
421 0.2
422 0.23
423 0.28
424 0.26
425 0.25
426 0.25
427 0.22
428 0.23
429 0.22
430 0.16
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.11
435 0.1
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.02
454 0.02
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.05
460 0.07
461 0.08
462 0.1
463 0.12
464 0.2
465 0.23
466 0.29
467 0.34
468 0.36
469 0.36
470 0.38
471 0.4
472 0.34
473 0.31
474 0.24
475 0.2
476 0.18
477 0.16
478 0.14
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.09
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.14
523 0.14
524 0.21
525 0.28
526 0.27
527 0.29
528 0.3
529 0.31
530 0.31
531 0.31
532 0.25
533 0.17
534 0.15
535 0.11
536 0.09
537 0.08
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.08
546 0.14
547 0.18
548 0.27
549 0.36
550 0.46
551 0.56
552 0.67
553 0.77
554 0.82
555 0.89
556 0.92
557 0.94
558 0.94
559 0.94
560 0.94
561 0.94
562 0.92
563 0.91
564 0.87
565 0.81
566 0.71
567 0.67
568 0.58
569 0.54
570 0.48
571 0.39
572 0.38
573 0.42
574 0.42
575 0.41
576 0.42
577 0.37
578 0.36
579 0.39
580 0.34
581 0.3