FuNGI

A6RCT4

Protein Details

Accession

A6RCT4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MTYVRKGSKTRAQQHRSVQSRD	Hydrophilic
1075-1101	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 24, nucl 1, cyto 1, plas 1, cyto_nucl 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_07442 -
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MTYVRKGSKTRAQQHRSVQSRDLLWVSVNGCHILNVYRQPETDAVMDYLTNLSPPARCLIGGDINVRHDAFEPGAVNLHRGGELVQWASEHGMDFVGEIGVPTHAAGHVIDLTFSNVAFASTTVRQDLHCGSDHQSMITMLPTTPQTQLSDARIKITDSQLEPFADLVRGLMVDMPCPEGVGNVAQLDDLAQHFTQSLLAAAQAVSKPAQQGRTTAPWWTADCRRAHRELTTHQTEAAKHQFKDAVRKAKRAYWRQVINEARDGRDLYRVVAWHKLEPNLRAPPLVIGDQVIEETAAKAEALQQAILKRYNSADDLEAPPQARMEITVRMLKACWQHVSLFIQQLYNCCLRLCHFPRAWKLAEVAMIPKVGKRDRSSVRSWRPIALLSVISKGLERIIARRLAYTALIHGIVSPQHGGALPRRSAMDLVAAFTHEVEAAFAQNKEVSMVTMDVQGAFDAVLRRRLLQRMAQQGWPRELLQLIDSFLTERRAQVRLEGTTTAAHQMQCGTPQGSPLSPILFLLYLAELLWQNSELRFGYADDLNIWRATHSLDNNATLLRQDIQSILRWGEINKVAFAPEKLEMIHLTRKRHNEAPAVVVSEDLTVHPVTAPAGQEPALRWLGVHFDRRLTWRPHVSTRAKKARAVAQHIQSLGRPETGPQQMLCGRRSPSVWFPHCSMAQRPGTAAARSQQGTRAGVGRGVLPVFRTTPIATLYRDAGLPSAMVALEEAKIRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPAVNRPTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKSAAQAFKEWWRSQPSTDLYVFSDGSERNLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSPMSHVFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGIRGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAASSTAAPAYGLEATPTVSGVRTVAKQLSQEARRKWWSGACGKLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAFAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.84
3	0.82
4	0.77
5	0.71
6	0.66
7	0.61
8	0.57
9	0.48
10	0.38
11	0.31
12	0.3
13	0.26
14	0.24
15	0.23
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.18
20	0.17
21	0.2
22	0.25
23	0.27
24	0.28
25	0.29
26	0.32
27	0.32
28	0.32
29	0.29
30	0.24
31	0.21
32	0.19
33	0.18
34	0.16
35	0.16
36	0.13
37	0.11
38	0.09
39	0.11
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.16
46	0.2
47	0.25
48	0.27
49	0.3
50	0.3
51	0.31
52	0.33
53	0.31
54	0.27
55	0.22
56	0.21
57	0.18
58	0.18
59	0.17
60	0.15
61	0.21
62	0.2
63	0.2
64	0.19
65	0.19
66	0.15
67	0.14
68	0.15
69	0.12
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.13
74	0.14
75	0.14
76	0.14
77	0.12
78	0.09
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.06
85	0.05
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.1
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.11
108	0.13
109	0.15
110	0.16
111	0.17
112	0.17
113	0.21
114	0.23
115	0.22
116	0.21
117	0.22
118	0.25
119	0.31
120	0.31
121	0.27
122	0.26
123	0.23
124	0.21
125	0.2
126	0.16
127	0.1
128	0.12
129	0.13
130	0.14
131	0.16
132	0.17
133	0.18
134	0.2
135	0.24
136	0.28
137	0.34
138	0.32
139	0.34
140	0.33
141	0.32
142	0.34
143	0.34
144	0.34
145	0.28
146	0.3
147	0.3
148	0.29
149	0.28
150	0.24
151	0.21
152	0.15
153	0.13
154	0.11
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.1
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.09
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.09
190	0.08
191	0.09
192	0.1
193	0.11
194	0.14
195	0.17
196	0.23
197	0.21
198	0.24
199	0.29
200	0.34
201	0.34
202	0.33
203	0.32
204	0.3
205	0.31
206	0.34
207	0.34
208	0.35
209	0.4
210	0.45
211	0.49
212	0.5
213	0.5
214	0.49
215	0.49
216	0.5
217	0.53
218	0.51
219	0.45
220	0.44
221	0.44
222	0.4
223	0.41
224	0.44
225	0.41
226	0.35
227	0.38
228	0.4
229	0.39
230	0.49
231	0.51
232	0.51
233	0.5
234	0.57
235	0.57
236	0.59
237	0.67
238	0.65
239	0.66
240	0.65
241	0.67
242	0.64
243	0.71
244	0.7
245	0.64
246	0.62
247	0.55
248	0.47
249	0.42
250	0.4
251	0.31
252	0.31
253	0.27
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.26
259	0.26
260	0.26
261	0.29
262	0.33
263	0.34
264	0.35
265	0.4
266	0.39
267	0.38
268	0.33
269	0.31
270	0.27
271	0.26
272	0.23
273	0.17
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.1
278	0.08
279	0.06
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.08
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.13
291	0.15
292	0.19
293	0.22
294	0.18
295	0.17
296	0.18
297	0.2
298	0.19
299	0.18
300	0.17
301	0.18
302	0.2
303	0.2
304	0.21
305	0.19
306	0.18
307	0.16
308	0.15
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.12
313	0.15
314	0.18
315	0.18
316	0.19
317	0.19
318	0.21
319	0.23
320	0.23
321	0.23
322	0.21
323	0.21
324	0.24
325	0.28
326	0.27
327	0.26
328	0.24
329	0.24
330	0.23
331	0.23
332	0.24
333	0.21
334	0.19
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.25
339	0.29
340	0.34
341	0.36
342	0.42
343	0.48
344	0.52
345	0.52
346	0.43
347	0.39
348	0.31
349	0.3
350	0.24
351	0.2
352	0.15
353	0.15
354	0.13
355	0.13
356	0.17
357	0.18
358	0.23
359	0.24
360	0.32
361	0.38
362	0.44
363	0.5
364	0.55
365	0.61
366	0.64
367	0.63
368	0.57
369	0.51
370	0.46
371	0.4
372	0.32
373	0.25
374	0.17
375	0.17
376	0.14
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.09
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.14
385	0.17
386	0.18
387	0.18
388	0.18
389	0.17
390	0.17
391	0.15
392	0.12
393	0.1
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.08
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.08
405	0.13
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.19
410	0.19
411	0.19
412	0.18
413	0.17
414	0.11
415	0.12
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.09
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.13
448	0.13
449	0.15
450	0.17
451	0.2
452	0.22
453	0.25
454	0.31
455	0.36
456	0.38
457	0.41
458	0.42
459	0.43
460	0.42
461	0.37
462	0.31
463	0.23
464	0.2
465	0.16
466	0.13
467	0.11
468	0.1
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.13
477	0.14
478	0.15
479	0.17
480	0.2
481	0.18
482	0.19
483	0.18
484	0.16
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.12
489	0.11
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.04
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.13
538	0.13
539	0.14
540	0.14
541	0.14
542	0.13
543	0.1
544	0.1
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.11
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.13
557	0.14
558	0.14
559	0.13
560	0.13
561	0.12
562	0.13
563	0.13
564	0.11
565	0.09
566	0.09
567	0.08
568	0.09
569	0.09
570	0.11
571	0.18
572	0.19
573	0.23
574	0.28
575	0.32
576	0.35
577	0.39
578	0.41
579	0.38
580	0.36
581	0.35
582	0.31
583	0.28
584	0.24
585	0.19
586	0.16
587	0.11
588	0.1
589	0.06
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.07
600	0.07
601	0.08
602	0.09
603	0.12
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.09
608	0.14
609	0.15
610	0.19
611	0.16
612	0.17
613	0.19
614	0.23
615	0.29
616	0.29
617	0.31
618	0.34
619	0.37
620	0.41
621	0.48
622	0.53
623	0.55
624	0.61
625	0.65
626	0.61
627	0.59
628	0.58
629	0.56
630	0.53
631	0.53
632	0.49
633	0.43
634	0.43
635	0.41
636	0.38
637	0.32
638	0.29
639	0.22
640	0.17
641	0.13
642	0.12
643	0.18
644	0.19
645	0.2
646	0.16
647	0.19
648	0.22
649	0.26
650	0.26
651	0.23
652	0.23
653	0.23
654	0.25
655	0.25
656	0.28
657	0.34
658	0.36
659	0.34
660	0.35
661	0.37
662	0.38
663	0.37
664	0.32
665	0.3
666	0.29
667	0.27
668	0.25
669	0.25
670	0.25
671	0.23
672	0.22
673	0.17
674	0.19
675	0.19
676	0.2
677	0.19
678	0.2
679	0.2
680	0.2
681	0.2
682	0.16
683	0.16
684	0.16
685	0.13
686	0.11
687	0.11
688	0.1
689	0.08
690	0.09
691	0.09
692	0.1
693	0.11
694	0.1
695	0.11
696	0.13
697	0.15
698	0.14
699	0.15
700	0.15
701	0.14
702	0.14
703	0.13
704	0.1
705	0.08
706	0.07
707	0.06
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.13
722	0.14
723	0.16
724	0.18
725	0.22
726	0.23
727	0.27
728	0.3
729	0.26
730	0.24
731	0.23
732	0.21
733	0.18
734	0.21
735	0.19
736	0.2
737	0.2
738	0.2
739	0.2
740	0.25
741	0.26
742	0.23
743	0.21
744	0.18
745	0.19
746	0.2
747	0.23
748	0.25
749	0.32
750	0.39
751	0.44
752	0.5
753	0.51
754	0.58
755	0.64
756	0.67
757	0.67
758	0.6
759	0.62
760	0.59
761	0.58
762	0.52
763	0.44
764	0.34
765	0.26
766	0.27
767	0.21
768	0.17
769	0.14
770	0.12
771	0.11
772	0.12
773	0.12
774	0.12
775	0.13
776	0.16
777	0.17
778	0.17
779	0.16
780	0.15
781	0.15
782	0.14
783	0.12
784	0.11
785	0.1
786	0.11
787	0.16
788	0.15
789	0.16
790	0.17
791	0.17
792	0.18
793	0.23
794	0.24
795	0.2
796	0.21
797	0.22
798	0.24
799	0.31
800	0.38
801	0.33
802	0.35
803	0.41
804	0.42
805	0.41
806	0.43
807	0.4
808	0.37
809	0.37
810	0.34
811	0.28
812	0.28
813	0.27
814	0.19
815	0.19
816	0.14
817	0.16
818	0.17
819	0.16
820	0.16
821	0.2
822	0.2
823	0.2
824	0.21
825	0.21
826	0.18
827	0.18
828	0.16
829	0.13
830	0.14
831	0.11
832	0.12
833	0.13
834	0.13
835	0.15
836	0.17
837	0.17
838	0.16
839	0.15
840	0.15
841	0.13
842	0.16
843	0.15
844	0.12
845	0.13
846	0.13
847	0.14
848	0.13
849	0.14
850	0.11
851	0.13
852	0.12
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.1
857	0.09
858	0.08
859	0.07
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.06
864	0.06
865	0.06
866	0.06
867	0.06
868	0.09
869	0.11
870	0.11
871	0.11
872	0.12
873	0.12
874	0.12
875	0.15
876	0.14
877	0.15
878	0.16
879	0.23
880	0.27
881	0.27
882	0.26
883	0.23
884	0.22
885	0.2
886	0.22
887	0.15
888	0.12
889	0.12
890	0.12
891	0.12
892	0.13
893	0.13
894	0.11
895	0.1
896	0.09
897	0.09
898	0.08
899	0.09
900	0.07
901	0.08
902	0.09
903	0.09
904	0.11
905	0.11
906	0.14
907	0.16
908	0.18
909	0.18
910	0.2
911	0.27
912	0.26
913	0.27
914	0.28
915	0.35
916	0.42
917	0.48
918	0.47
919	0.42
920	0.45
921	0.44
922	0.45
923	0.37
924	0.3
925	0.24
926	0.21
927	0.2
928	0.16
929	0.17
930	0.13
931	0.14
932	0.13
933	0.16
934	0.15
935	0.15
936	0.14
937	0.13
938	0.12
939	0.13
940	0.13
941	0.11
942	0.12
943	0.12
944	0.13
945	0.16
946	0.18
947	0.18
948	0.19
949	0.22
950	0.23
951	0.22
952	0.21
953	0.18
954	0.18
955	0.15
956	0.14
957	0.1
958	0.08
959	0.09
960	0.09
961	0.09
962	0.08
963	0.07
964	0.08
965	0.08
966	0.11
967	0.12
968	0.15
969	0.18
970	0.19
971	0.21
972	0.27
973	0.35
974	0.4
975	0.46
976	0.48
977	0.54
978	0.58
979	0.59
980	0.56
981	0.53
982	0.53
983	0.53
984	0.56
985	0.52
986	0.48
987	0.46
988	0.49
989	0.46
990	0.43
991	0.37
992	0.33
993	0.31
994	0.33
995	0.35
996	0.35
997	0.36
998	0.37
999	0.42
1000	0.41
1001	0.43
1002	0.48
1003	0.5
1004	0.45
1005	0.44
1006	0.45
1007	0.41
1008	0.39
1009	0.35
1010	0.27
1011	0.27
1012	0.32
1013	0.33
1014	0.32
1015	0.34
1016	0.34
1017	0.39
1018	0.39
1019	0.39
1020	0.37
1021	0.42
1022	0.39
1023	0.38
1024	0.41
1025	0.37
1026	0.4
1027	0.4
1028	0.39
1029	0.33
1030	0.29
1031	0.28
1032	0.25
1033	0.31
1034	0.38
1035	0.35
1036	0.36
1037	0.37
1038	0.44
1039	0.45
1040	0.52
1041	0.54
1042	0.52
1043	0.59
1044	0.56
1045	0.6
1046	0.54
1047	0.52
1048	0.46
1049	0.42
1050	0.39
1051	0.35
1052	0.37
1053	0.4
1054	0.43
1055	0.45
1056	0.49
1057	0.48
1058	0.47
1059	0.46
1060	0.47
1061	0.44
1062	0.49
1063	0.53
1064	0.52
1065	0.49
1066	0.54
1067	0.54
1068	0.57
1069	0.62
1070	0.63
1071	0.66
1072	0.71
1073	0.78
1074	0.77
1075	0.82
1076	0.81
1077	0.81
1078	0.82
1079	0.83
1080	0.82
1081	0.82
1082	0.84
1083	0.77
1084	0.71
1085	0.65
1086	0.6
1087	0.5
1088	0.42
1089	0.34
1090	0.24
1091	0.23
1092	0.22
1093	0.17
1094	0.11
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.1
1100	0.11
1101	0.12
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.14
1105	0.14
1106	0.16
1107	0.17
1108	0.17

A6RCT4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer