FuNGI

A6RCV0

Protein Details

Accession

A6RCV0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1121-1147	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, extr 5, cyto 4, pero 3, nucl 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_07458 -
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MCQLLPTLPSWASALPCRTQACEWHPQAPNSKRASSCSPPWRQVPQGCSGAASTNGRSGGAYTNRSVNPVNTARWASTPQAGGYSEFHQQPETDAVMDYLTNLSPPARCLIGGDINVRHDAFEPGAVNLHRGGELVQWASEHGMDFVGEIGVPTHAAGHVIDLTFSNVAFASTTVRQDLHCGSDHQSMITMLPTTPQTQLSDARIKITDSQLEPFADLVRGLMVDMPCPEGVGNVAQLDDLAQHFTQSLLAAAQAVSKPAQQGRTTAPWWTADCRRAHRELTTHQTEAAKHQFKDAVRKAKRAYWRQVINEARDGRDLYRVVAWHKLEPNLRAPPLVIGDQVIEETAAKAEALQQAILKRYNSADDLEYDPLDDEHWSGMGNLPWNPRVGMEEVERNTIGVQSTSPGTDGITVRMLKACWQHVSLFIQQLYNCCLRLCHFPRAWKLAEVAMIPKVGKRDRSSVRSWRPIALLSVISKGLERIIARRLAYTALIHGIVSPQHGGALPRRSAMDLVAAFTHEVEAAFAQNKEVSMVTMDVQGAFDAVLRRRLLQRMAQQGWPRELLQLIDSFLTERRAQVRLEGTTTAAHQMQCGTPQGSPLSPILFLLYLAELLWQNSELRFGYADDLNIWRATHSLDNNATLLRQDIQSILRRLIWRPHVSTRAKKARAVAQHIRSLGKTRDGPPADALRKAVTTCVVPSLLYGTEAWYGGRTQPARHTGRSGEVSSRLGWHVGTVEKVLTMAARGVLPVFRTTPIATLYRDAGLPSAMVALEEAKIRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPAVNRPTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKSATQAFKKWWRSQPSTDLYVFSDGSERNLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSPMSHVFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGIRGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAVSSTAAPAYGLEATPTVSGIRTVAKQLSQEARRKWWSGACGKLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAVAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.31
4	0.32
5	0.34
6	0.35
7	0.4
8	0.41
9	0.47
10	0.48
11	0.52
12	0.56
13	0.58
14	0.65
15	0.64
16	0.66
17	0.62
18	0.65
19	0.58
20	0.58
21	0.61
22	0.58
23	0.61
24	0.62
25	0.65
26	0.65
27	0.69
28	0.71
29	0.71
30	0.71
31	0.65
32	0.63
33	0.58
34	0.52
35	0.46
36	0.4
37	0.33
38	0.31
39	0.3
40	0.23
41	0.23
42	0.23
43	0.22
44	0.21
45	0.2
46	0.24
47	0.27
48	0.29
49	0.27
50	0.34
51	0.35
52	0.38
53	0.38
54	0.32
55	0.34
56	0.35
57	0.36
58	0.34
59	0.36
60	0.34
61	0.35
62	0.37
63	0.31
64	0.31
65	0.31
66	0.26
67	0.27
68	0.26
69	0.26
70	0.25
71	0.25
72	0.26
73	0.26
74	0.26
75	0.24
76	0.23
77	0.23
78	0.24
79	0.23
80	0.18
81	0.16
82	0.16
83	0.15
84	0.15
85	0.13
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.08
90	0.1
91	0.1
92	0.12
93	0.14
94	0.13
95	0.13
96	0.14
97	0.19
98	0.23
99	0.25
100	0.28
101	0.28
102	0.29
103	0.31
104	0.29
105	0.25
106	0.21
107	0.2
108	0.16
109	0.17
110	0.16
111	0.14
112	0.19
113	0.18
114	0.19
115	0.17
116	0.18
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.11
121	0.14
122	0.14
123	0.13
124	0.12
125	0.12
126	0.13
127	0.13
128	0.11
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.09
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.09
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.1
159	0.12
160	0.14
161	0.15
162	0.16
163	0.16
164	0.19
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.21
169	0.24
170	0.29
171	0.3
172	0.26
173	0.25
174	0.22
175	0.2
176	0.19
177	0.15
178	0.09
179	0.11
180	0.13
181	0.13
182	0.15
183	0.16
184	0.17
185	0.19
186	0.23
187	0.27
188	0.33
189	0.31
190	0.32
191	0.31
192	0.31
193	0.32
194	0.32
195	0.32
196	0.26
197	0.28
198	0.28
199	0.28
200	0.27
201	0.23
202	0.2
203	0.15
204	0.12
205	0.1
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.1
213	0.12
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.08
235	0.08
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.13
246	0.16
247	0.21
248	0.2
249	0.23
250	0.27
251	0.32
252	0.32
253	0.31
254	0.3
255	0.28
256	0.3
257	0.32
258	0.33
259	0.33
260	0.38
261	0.43
262	0.47
263	0.48
264	0.48
265	0.47
266	0.47
267	0.47
268	0.51
269	0.49
270	0.44
271	0.42
272	0.42
273	0.38
274	0.39
275	0.42
276	0.39
277	0.34
278	0.36
279	0.39
280	0.38
281	0.48
282	0.49
283	0.5
284	0.49
285	0.55
286	0.55
287	0.58
288	0.65
289	0.64
290	0.65
291	0.63
292	0.66
293	0.63
294	0.69
295	0.68
296	0.62
297	0.61
298	0.53
299	0.46
300	0.4
301	0.38
302	0.3
303	0.29
304	0.26
305	0.19
306	0.2
307	0.2
308	0.2
309	0.25
310	0.25
311	0.25
312	0.27
313	0.31
314	0.32
315	0.34
316	0.38
317	0.37
318	0.36
319	0.32
320	0.29
321	0.26
322	0.24
323	0.22
324	0.16
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.08
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.08
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.13
342	0.15
343	0.18
344	0.21
345	0.17
346	0.16
347	0.17
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.16
352	0.15
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.15
357	0.14
358	0.12
359	0.11
360	0.09
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.08
367	0.08
368	0.1
369	0.13
370	0.15
371	0.16
372	0.17
373	0.16
374	0.15
375	0.16
376	0.15
377	0.15
378	0.15
379	0.2
380	0.2
381	0.22
382	0.22
383	0.2
384	0.18
385	0.17
386	0.14
387	0.09
388	0.08
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.15
402	0.15
403	0.15
404	0.19
405	0.2
406	0.18
407	0.2
408	0.2
409	0.22
410	0.26
411	0.25
412	0.24
413	0.22
414	0.22
415	0.2
416	0.21
417	0.22
418	0.19
419	0.17
420	0.14
421	0.14
422	0.14
423	0.24
424	0.27
425	0.32
426	0.34
427	0.4
428	0.45
429	0.5
430	0.49
431	0.4
432	0.36
433	0.29
434	0.27
435	0.22
436	0.18
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.15
442	0.16
443	0.2
444	0.22
445	0.29
446	0.35
447	0.41
448	0.46
449	0.52
450	0.58
451	0.61
452	0.6
453	0.54
454	0.48
455	0.44
456	0.38
457	0.3
458	0.23
459	0.15
460	0.15
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.1
465	0.08
466	0.09
467	0.08
468	0.09
469	0.13
470	0.16
471	0.16
472	0.16
473	0.17
474	0.15
475	0.16
476	0.14
477	0.11
478	0.09
479	0.09
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.07
490	0.12
491	0.16
492	0.16
493	0.17
494	0.18
495	0.18
496	0.17
497	0.16
498	0.15
499	0.1
500	0.11
501	0.1
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.06
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.07
531	0.07
532	0.11
533	0.12
534	0.13
535	0.16
536	0.18
537	0.19
538	0.23
539	0.28
540	0.33
541	0.35
542	0.38
543	0.4
544	0.4
545	0.39
546	0.35
547	0.29
548	0.21
549	0.19
550	0.14
551	0.12
552	0.1
553	0.09
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.1
559	0.09
560	0.1
561	0.12
562	0.13
563	0.13
564	0.16
565	0.18
566	0.16
567	0.18
568	0.17
569	0.15
570	0.13
571	0.14
572	0.12
573	0.11
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.11
580	0.1
581	0.09
582	0.1
583	0.11
584	0.1
585	0.11
586	0.1
587	0.1
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.09
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.1
621	0.1
622	0.14
623	0.14
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.14
628	0.1
629	0.11
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.11
635	0.16
636	0.17
637	0.17
638	0.19
639	0.2
640	0.22
641	0.26
642	0.31
643	0.29
644	0.32
645	0.36
646	0.42
647	0.46
648	0.51
649	0.55
650	0.58
651	0.56
652	0.55
653	0.53
654	0.51
655	0.52
656	0.53
657	0.52
658	0.46
659	0.47
660	0.47
661	0.44
662	0.38
663	0.36
664	0.29
665	0.26
666	0.25
667	0.24
668	0.32
669	0.32
670	0.32
671	0.31
672	0.37
673	0.34
674	0.32
675	0.29
676	0.22
677	0.21
678	0.2
679	0.17
680	0.11
681	0.1
682	0.09
683	0.1
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.07
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.08
697	0.08
698	0.13
699	0.13
700	0.13
701	0.19
702	0.28
703	0.31
704	0.31
705	0.33
706	0.3
707	0.34
708	0.35
709	0.32
710	0.25
711	0.24
712	0.24
713	0.22
714	0.22
715	0.17
716	0.14
717	0.13
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.09
722	0.08
723	0.08
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.06
735	0.07
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.1
740	0.11
741	0.12
742	0.14
743	0.15
744	0.14
745	0.15
746	0.15
747	0.14
748	0.14
749	0.13
750	0.11
751	0.09
752	0.08
753	0.06
754	0.06
755	0.05
756	0.04
757	0.04
758	0.04
759	0.05
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.09
766	0.09
767	0.13
768	0.14
769	0.16
770	0.18
771	0.23
772	0.24
773	0.28
774	0.3
775	0.26
776	0.25
777	0.23
778	0.22
779	0.18
780	0.21
781	0.19
782	0.21
783	0.21
784	0.2
785	0.2
786	0.26
787	0.27
788	0.24
789	0.22
790	0.18
791	0.19
792	0.2
793	0.24
794	0.25
795	0.32
796	0.4
797	0.44
798	0.5
799	0.52
800	0.59
801	0.65
802	0.67
803	0.67
804	0.61
805	0.62
806	0.59
807	0.59
808	0.53
809	0.45
810	0.35
811	0.27
812	0.27
813	0.21
814	0.17
815	0.14
816	0.12
817	0.11
818	0.12
819	0.13
820	0.13
821	0.14
822	0.16
823	0.18
824	0.17
825	0.16
826	0.16
827	0.16
828	0.14
829	0.13
830	0.11
831	0.1
832	0.11
833	0.17
834	0.15
835	0.16
836	0.19
837	0.19
838	0.19
839	0.26
840	0.28
841	0.27
842	0.32
843	0.36
844	0.41
845	0.5
846	0.58
847	0.59
848	0.64
849	0.68
850	0.69
851	0.7
852	0.7
853	0.66
854	0.62
855	0.55
856	0.48
857	0.41
858	0.36
859	0.31
860	0.22
861	0.2
862	0.15
863	0.16
864	0.17
865	0.16
866	0.16
867	0.2
868	0.2
869	0.2
870	0.21
871	0.21
872	0.19
873	0.19
874	0.17
875	0.14
876	0.14
877	0.12
878	0.12
879	0.13
880	0.13
881	0.15
882	0.18
883	0.17
884	0.16
885	0.16
886	0.15
887	0.13
888	0.17
889	0.15
890	0.12
891	0.13
892	0.14
893	0.14
894	0.13
895	0.14
896	0.11
897	0.13
898	0.12
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.1
903	0.09
904	0.09
905	0.07
906	0.07
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.06
913	0.07
914	0.09
915	0.11
916	0.11
917	0.12
918	0.12
919	0.12
920	0.12
921	0.15
922	0.14
923	0.15
924	0.16
925	0.23
926	0.27
927	0.27
928	0.26
929	0.23
930	0.22
931	0.2
932	0.22
933	0.15
934	0.12
935	0.12
936	0.12
937	0.12
938	0.13
939	0.13
940	0.11
941	0.1
942	0.09
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.08
947	0.08
948	0.09
949	0.09
950	0.11
951	0.12
952	0.14
953	0.16
954	0.18
955	0.18
956	0.21
957	0.27
958	0.27
959	0.28
960	0.28
961	0.35
962	0.42
963	0.48
964	0.47
965	0.43
966	0.46
967	0.44
968	0.45
969	0.38
970	0.3
971	0.24
972	0.22
973	0.21
974	0.17
975	0.17
976	0.14
977	0.15
978	0.13
979	0.16
980	0.15
981	0.15
982	0.14
983	0.13
984	0.12
985	0.13
986	0.13
987	0.11
988	0.12
989	0.13
990	0.13
991	0.16
992	0.18
993	0.18
994	0.19
995	0.22
996	0.23
997	0.22
998	0.21
999	0.18
1000	0.18
1001	0.16
1002	0.14
1003	0.1
1004	0.08
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.09
1008	0.08
1009	0.07
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.16
1015	0.18
1016	0.2
1017	0.21
1018	0.27
1019	0.35
1020	0.4
1021	0.47
1022	0.48
1023	0.54
1024	0.58
1025	0.59
1026	0.57
1027	0.53
1028	0.53
1029	0.53
1030	0.56
1031	0.52
1032	0.49
1033	0.46
1034	0.49
1035	0.47
1036	0.44
1037	0.37
1038	0.34
1039	0.31
1040	0.33
1041	0.35
1042	0.35
1043	0.36
1044	0.38
1045	0.43
1046	0.41
1047	0.43
1048	0.48
1049	0.51
1050	0.45
1051	0.44
1052	0.46
1053	0.41
1054	0.39
1055	0.35
1056	0.27
1057	0.27
1058	0.33
1059	0.33
1060	0.32
1061	0.34
1062	0.34
1063	0.39
1064	0.39
1065	0.39
1066	0.37
1067	0.42
1068	0.39
1069	0.39
1070	0.41
1071	0.37
1072	0.4
1073	0.4
1074	0.4
1075	0.33
1076	0.29
1077	0.28
1078	0.25
1079	0.31
1080	0.38
1081	0.35
1082	0.36
1083	0.37
1084	0.44
1085	0.46
1086	0.52
1087	0.54
1088	0.52
1089	0.59
1090	0.56
1091	0.6
1092	0.54
1093	0.52
1094	0.46
1095	0.42
1096	0.39
1097	0.35
1098	0.38
1099	0.4
1100	0.43
1101	0.45
1102	0.49
1103	0.48
1104	0.47
1105	0.46
1106	0.47
1107	0.44
1108	0.49
1109	0.53
1110	0.52
1111	0.49
1112	0.54
1113	0.54
1114	0.57
1115	0.62
1116	0.64
1117	0.66
1118	0.71
1119	0.78
1120	0.77
1121	0.82
1122	0.81
1123	0.81
1124	0.82
1125	0.83
1126	0.82
1127	0.82
1128	0.84
1129	0.77
1130	0.7
1131	0.63
1132	0.57
1133	0.48
1134	0.4
1135	0.31
1136	0.22
1137	0.2
1138	0.19
1139	0.15
1140	0.1
1141	0.09
1142	0.09
1143	0.1
1144	0.09
1145	0.09
1146	0.11
1147	0.12
1148	0.13
1149	0.14
1150	0.14
1151	0.14
1152	0.16
1153	0.17
1154	0.17

A6RCV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer