Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QYQ2

Protein Details
Accession A6QYQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138SATTPSTTKRHKKYKYNTLPTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-283GR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR025721  Exosome_cplx_N_dom  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG aje:HCAG_02509  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14382  ECR1_N  
PF10447  EXOSC1  
Amino Acid Sequences MTATGSVPSIAVPGQRLGPTSSFIPGPGTHIQHSFVCASIAGPVVIQKGEEELSRQYQQQPISKQQRTLVSVARSFAQTQTVAGNYTAVTGNNPTSSGSTNYVQQQQPQRPPNTTSSATTPSTTKRHKKYKYNTLPTVDSVVLARVTRVQKRQATLSILVVLDDNPSSPYPATTAAADGLPHSLLSTTNADPLNADDLRFQALIRKEDVRAVEKDRVVMDEMFRVGDIVRAVVISLGDQSFYYCSTARNDLGVVMGRSEEGNVLVPVSWREMVDGRSGKREGRKVARPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.17
13 0.21
14 0.24
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.29
19 0.27
20 0.29
21 0.24
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.14
40 0.19
41 0.21
42 0.23
43 0.25
44 0.29
45 0.34
46 0.38
47 0.41
48 0.46
49 0.55
50 0.56
51 0.56
52 0.56
53 0.57
54 0.54
55 0.51
56 0.47
57 0.41
58 0.39
59 0.36
60 0.33
61 0.27
62 0.25
63 0.22
64 0.19
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.15
87 0.18
88 0.21
89 0.26
90 0.26
91 0.3
92 0.35
93 0.39
94 0.47
95 0.52
96 0.51
97 0.48
98 0.51
99 0.5
100 0.47
101 0.42
102 0.35
103 0.31
104 0.33
105 0.31
106 0.28
107 0.25
108 0.24
109 0.3
110 0.36
111 0.41
112 0.46
113 0.55
114 0.63
115 0.71
116 0.76
117 0.8
118 0.83
119 0.83
120 0.8
121 0.73
122 0.67
123 0.57
124 0.5
125 0.39
126 0.28
127 0.19
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.1
133 0.13
134 0.18
135 0.21
136 0.27
137 0.29
138 0.31
139 0.34
140 0.32
141 0.32
142 0.29
143 0.26
144 0.21
145 0.18
146 0.16
147 0.14
148 0.11
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.08
173 0.11
174 0.1
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.14
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.14
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.22
194 0.25
195 0.28
196 0.27
197 0.26
198 0.29
199 0.32
200 0.31
201 0.32
202 0.29
203 0.27
204 0.26
205 0.23
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.1
231 0.12
232 0.16
233 0.2
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.2
239 0.21
240 0.17
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.14
255 0.15
256 0.12
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.26
261 0.31
262 0.3
263 0.36
264 0.38
265 0.41
266 0.48
267 0.53
268 0.54
269 0.58