Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RHH7

Protein Details
Accession A6RHH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-378CPICQRNSSRHGLRRRKIGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021605  CFIA_Pcf11_C  
IPR045154  PCF11-like  
Gene Ontology GO:0005849  C:mRNA cleavage factor complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
KEGG aje:HCAG_09100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11526  CFIA_Pcf11  
Amino Acid Sequences LPTQEAQPYGQPLQDLIDLSALHRDIENLISTARTDFANNPLDPSLQQKLKALLDLQNILQQQKLPQDQLKLIRDQVSQLSPTPKPQLPPRVVPTPPVTQGPVQPIQSHTPQPNLQSLLNPATIAELIKATANQQSRTPPPPPLPHIAPFLQPQASSTPPPPPHSTAPNLAENPLIASLRARGLLPPAAASAPPTPPNLPFILSGQSVYTPPAVISQLPNPLEVKINIQMTSASIRIPRPNLISTLYEEKSNRCGTCGRRFYSDDQGKEKKARHLDWHFKTNQRMTEASKRGQSRSWYLDEREWIKSREFDDDTGRPTGDSATFANGSMSDSTATAAKKSSQKQWIHAPNDAALRNAPCPICQRNSSRHGLRRRKIGSGMMLNRGTPDSVLGKRKAKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.16
4 0.17
5 0.15
6 0.16
7 0.2
8 0.17
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.13
13 0.16
14 0.17
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.2
25 0.27
26 0.26
27 0.28
28 0.29
29 0.29
30 0.27
31 0.31
32 0.32
33 0.28
34 0.3
35 0.3
36 0.34
37 0.34
38 0.36
39 0.33
40 0.31
41 0.32
42 0.32
43 0.3
44 0.29
45 0.3
46 0.28
47 0.26
48 0.21
49 0.21
50 0.26
51 0.29
52 0.3
53 0.32
54 0.36
55 0.4
56 0.47
57 0.48
58 0.43
59 0.43
60 0.43
61 0.4
62 0.38
63 0.36
64 0.31
65 0.28
66 0.29
67 0.31
68 0.28
69 0.32
70 0.36
71 0.34
72 0.35
73 0.42
74 0.48
75 0.48
76 0.54
77 0.56
78 0.56
79 0.54
80 0.54
81 0.51
82 0.46
83 0.43
84 0.37
85 0.34
86 0.28
87 0.31
88 0.33
89 0.32
90 0.28
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.32
95 0.34
96 0.3
97 0.31
98 0.32
99 0.33
100 0.35
101 0.33
102 0.3
103 0.26
104 0.28
105 0.25
106 0.23
107 0.2
108 0.16
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.09
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.12
119 0.15
120 0.16
121 0.18
122 0.23
123 0.27
124 0.32
125 0.33
126 0.32
127 0.36
128 0.41
129 0.43
130 0.44
131 0.43
132 0.41
133 0.42
134 0.39
135 0.35
136 0.3
137 0.29
138 0.24
139 0.2
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.17
144 0.17
145 0.22
146 0.24
147 0.28
148 0.31
149 0.32
150 0.33
151 0.36
152 0.38
153 0.35
154 0.36
155 0.36
156 0.33
157 0.29
158 0.26
159 0.22
160 0.19
161 0.14
162 0.11
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.12
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.15
224 0.17
225 0.19
226 0.2
227 0.21
228 0.22
229 0.22
230 0.21
231 0.21
232 0.26
233 0.24
234 0.24
235 0.23
236 0.23
237 0.26
238 0.29
239 0.26
240 0.22
241 0.27
242 0.3
243 0.4
244 0.45
245 0.42
246 0.43
247 0.46
248 0.48
249 0.54
250 0.54
251 0.48
252 0.48
253 0.51
254 0.5
255 0.53
256 0.53
257 0.49
258 0.51
259 0.51
260 0.53
261 0.58
262 0.65
263 0.64
264 0.69
265 0.66
266 0.63
267 0.67
268 0.62
269 0.56
270 0.49
271 0.46
272 0.44
273 0.49
274 0.49
275 0.46
276 0.47
277 0.46
278 0.45
279 0.47
280 0.45
281 0.42
282 0.42
283 0.44
284 0.42
285 0.42
286 0.44
287 0.45
288 0.45
289 0.44
290 0.42
291 0.39
292 0.36
293 0.37
294 0.35
295 0.37
296 0.35
297 0.31
298 0.34
299 0.35
300 0.36
301 0.34
302 0.32
303 0.25
304 0.23
305 0.23
306 0.17
307 0.16
308 0.13
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.18
325 0.25
326 0.3
327 0.39
328 0.45
329 0.49
330 0.54
331 0.63
332 0.67
333 0.64
334 0.63
335 0.56
336 0.51
337 0.53
338 0.48
339 0.39
340 0.32
341 0.3
342 0.27
343 0.3
344 0.26
345 0.23
346 0.29
347 0.34
348 0.36
349 0.41
350 0.46
351 0.5
352 0.57
353 0.63
354 0.66
355 0.69
356 0.74
357 0.78
358 0.78
359 0.8
360 0.77
361 0.74
362 0.7
363 0.67
364 0.65
365 0.64
366 0.62
367 0.6
368 0.56
369 0.5
370 0.47
371 0.42
372 0.34
373 0.23
374 0.22
375 0.2
376 0.26
377 0.34
378 0.39