FuNGI

A6R713

Protein Details

Accession

A6R713

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
356-388	MSPVPVPQQKSKPNPQQKRMSRRKSPPLSSNED	Hydrophilic
424-465	AVAWDRSQRRQKQVAEWKSREAKEARERRKSRRDGIPLNEHA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
440-456	WKSREAKEARERRKSRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 10, mito 5, cyto_pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding
KEGG	aje:HCAG_05421 -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSVVAPNLAALIGEVVGARLISHAGSLTNLSKYPASTVQILGAEKALFRALKTKGNTPKYGLLYHSSFIGRAGPKNKGRISRFLANKCSIASRIDNFSETPSTKFGNALKQQVEERLEFYATGAAPTKNEVAMKNAMDAVLADIDVDEAGSDVEMKDTDEVTEKKRKCPILHTSHPTSHIPHPPQVAVRHAFTPYERHRPDRQKFTILRHLTPCSITIMTGKLTLHKSPKRKRDGIDYQQRTSSSSPTSSHTSISVKDGGHLSDEYSPAVGGNSPQISVVGELGELDLHGTSSHRFVESTDNGAADYKQTINKGDEVPSEQGLMNIDASPTVTSITTKDTEKMTRALLGDGGLRTMSPVPVPQQKSKPNPQQKRMSRRKSPPLSSNEDKNPLTWHESEITGYAPTDPNDDGYGINGIGFKPTAAVAWDRSQRRQKQVAEWKSREAKEARERRKSRRDGIPLNEHAENTGHNYKKVKFDITTED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.05
4	0.05
5	0.05
6	0.05
7	0.06
8	0.05
9	0.06
10	0.06
11	0.07
12	0.08
13	0.11
14	0.13
15	0.15
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.18
20	0.22
21	0.23
22	0.24
23	0.24
24	0.24
25	0.25
26	0.27
27	0.27
28	0.23
29	0.21
30	0.18
31	0.16
32	0.16
33	0.16
34	0.13
35	0.13
36	0.19
37	0.21
38	0.28
39	0.32
40	0.4
41	0.47
42	0.54
43	0.57
44	0.55
45	0.59
46	0.55
47	0.55
48	0.48
49	0.44
50	0.39
51	0.36
52	0.34
53	0.27
54	0.23
55	0.21
56	0.25
57	0.22
58	0.26
59	0.3
60	0.36
61	0.41
62	0.49
63	0.54
64	0.57
65	0.58
66	0.61
67	0.64
68	0.64
69	0.68
70	0.66
71	0.68
72	0.62
73	0.58
74	0.51
75	0.46
76	0.38
77	0.33
78	0.3
79	0.26
80	0.28
81	0.29
82	0.29
83	0.26
84	0.28
85	0.29
86	0.26
87	0.25
88	0.23
89	0.23
90	0.22
91	0.25
92	0.25
93	0.29
94	0.33
95	0.37
96	0.36
97	0.37
98	0.38
99	0.4
100	0.4
101	0.31
102	0.28
103	0.23
104	0.22
105	0.19
106	0.18
107	0.16
108	0.12
109	0.13
110	0.14
111	0.12
112	0.12
113	0.14
114	0.15
115	0.13
116	0.15
117	0.14
118	0.16
119	0.2
120	0.2
121	0.19
122	0.18
123	0.16
124	0.14
125	0.14
126	0.11
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.03
135	0.02
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.04
141	0.04
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.07
146	0.11
147	0.13
148	0.18
149	0.27
150	0.29
151	0.34
152	0.4
153	0.45
154	0.43
155	0.49
156	0.54
157	0.55
158	0.62
159	0.63
160	0.62
161	0.6
162	0.61
163	0.54
164	0.47
165	0.44
166	0.43
167	0.39
168	0.37
169	0.36
170	0.34
171	0.36
172	0.34
173	0.33
174	0.28
175	0.26
176	0.24
177	0.23
178	0.22
179	0.19
180	0.25
181	0.25
182	0.33
183	0.34
184	0.38
185	0.47
186	0.56
187	0.63
188	0.65
189	0.64
190	0.62
191	0.64
192	0.65
193	0.66
194	0.59
195	0.55
196	0.48
197	0.46
198	0.38
199	0.35
200	0.29
201	0.21
202	0.18
203	0.15
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.11
209	0.13
210	0.15
211	0.18
212	0.25
213	0.3
214	0.4
215	0.47
216	0.56
217	0.61
218	0.64
219	0.63
220	0.65
221	0.69
222	0.69
223	0.71
224	0.67
225	0.59
226	0.57
227	0.54
228	0.46
229	0.37
230	0.3
231	0.2
232	0.18
233	0.18
234	0.19
235	0.23
236	0.21
237	0.2
238	0.2
239	0.2
240	0.18
241	0.19
242	0.2
243	0.15
244	0.16
245	0.16
246	0.14
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.1
251	0.11
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.04
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.09
284	0.16
285	0.17
286	0.2
287	0.19
288	0.18
289	0.18
290	0.19
291	0.18
292	0.11
293	0.11
294	0.09
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.15
299	0.18
300	0.19
301	0.2
302	0.2
303	0.21
304	0.22
305	0.2
306	0.2
307	0.17
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.1
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.06
321	0.07
322	0.11
323	0.12
324	0.13
325	0.16
326	0.18
327	0.21
328	0.23
329	0.24
330	0.22
331	0.23
332	0.22
333	0.21
334	0.18
335	0.16
336	0.16
337	0.13
338	0.13
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.07
345	0.09
346	0.14
347	0.22
348	0.27
349	0.33
350	0.41
351	0.49
352	0.57
353	0.66
354	0.72
355	0.75
356	0.8
357	0.82
358	0.85
359	0.86
360	0.89
361	0.9
362	0.89
363	0.88
364	0.88
365	0.9
366	0.89
367	0.86
368	0.84
369	0.8
370	0.79
371	0.74
372	0.73
373	0.68
374	0.65
375	0.58
376	0.5
377	0.46
378	0.4
379	0.4
380	0.33
381	0.29
382	0.24
383	0.25
384	0.24
385	0.21
386	0.19
387	0.14
388	0.14
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.15
393	0.14
394	0.15
395	0.15
396	0.16
397	0.14
398	0.13
399	0.14
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.09
404	0.1
405	0.1
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.12
412	0.14
413	0.21
414	0.29
415	0.33
416	0.42
417	0.51
418	0.58
419	0.65
420	0.7
421	0.68
422	0.71
423	0.78
424	0.8
425	0.81
426	0.76
427	0.76
428	0.76
429	0.72
430	0.69
431	0.61
432	0.6
433	0.6
434	0.67
435	0.68
436	0.7
437	0.77
438	0.8
439	0.87
440	0.87
441	0.85
442	0.85
443	0.85
444	0.83
445	0.85
446	0.84
447	0.79
448	0.75
449	0.68
450	0.57
451	0.48
452	0.4
453	0.32
454	0.29
455	0.33
456	0.3
457	0.33
458	0.38
459	0.41
460	0.49
461	0.53
462	0.52
463	0.45

A6R713

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer