Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QU98

Protein Details
Accession A6QU98    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-100ENTLRVKSKPKSPTRTPAKPTRTGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 8, mito 4, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG aje:HCAG_00954  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTTLPRDRPSGQQTRGIFENPDPFAHVAHAVVQDDEEAIDFEDTYDGLGDQLDEDQDAFNDDTFGGGADENTLRVKSKPKSPTRTPAKPTRTGYELYQDPGYIPEIQAKSAVWGTGVGQKSKAEDDTQSLKPAAPAKKIMSLEEVEAQMRAQSKKPQATEQLSAPPPPLPTIPQFPGTAAQVAAPLTMPLHDRSAPPPDGMLPLSLQEFPPLDQGQYAQLGKDARAAQAFQHQQSFPAMEAILPRPGMPPTPNHHQNRLPPNPAPQYPIRQAQHHHPKPQASMGPPGPLPATSGMPPNMVPMTEEQRKASLIEDAKRAKRNHKIFLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNVTDPESEASLSEDFYYQVYSQIRGAPRQHPRQPLGYFAQTYLFQTGGRSAGGMGRRQFYTGDNHMQRMQQQVQRAVEAAKLRPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKRPDSSDGQKTSNVKKGHHTALSASDRKSILNNIENVYGTLMQMEDHERNMPPPPDESDLESVERHMEWRQKMQSFNQKLWADMKILEPIVPGSSTPHPFIAFLSYPKGKKAIPRIFRQIDQEQRVTILTMIIVHLDSLDVVQRAQLQSGESQPPLPVREEVDLFSHAVMPSLLGYVNEAPINIITGLLGLVIGQTHVQTVAKTRVGLGVLTMLLSRAELVKEAGGVEDEQWKPWTELYNTLFDRLEPVFGDIFPGTINSGNDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIAVKDRVMETVAQSKTLPADMASQRLGNVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.5
4 0.48
5 0.55
6 0.55
7 0.56
8 0.56
9 0.5
10 0.43
11 0.37
12 0.41
13 0.35
14 0.34
15 0.32
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.23
20 0.16
21 0.18
22 0.19
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.09
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.25
69 0.28
70 0.37
71 0.46
72 0.55
73 0.64
74 0.71
75 0.79
76 0.81
77 0.85
78 0.84
79 0.84
80 0.82
81 0.81
82 0.77
83 0.72
84 0.66
85 0.58
86 0.52
87 0.5
88 0.44
89 0.38
90 0.34
91 0.28
92 0.25
93 0.24
94 0.23
95 0.16
96 0.15
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.18
109 0.21
110 0.19
111 0.2
112 0.2
113 0.22
114 0.24
115 0.25
116 0.2
117 0.19
118 0.24
119 0.28
120 0.3
121 0.31
122 0.29
123 0.27
124 0.28
125 0.34
126 0.34
127 0.32
128 0.35
129 0.34
130 0.41
131 0.41
132 0.39
133 0.36
134 0.32
135 0.29
136 0.28
137 0.26
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.19
145 0.26
146 0.34
147 0.41
148 0.44
149 0.48
150 0.53
151 0.56
152 0.55
153 0.51
154 0.51
155 0.46
156 0.43
157 0.38
158 0.31
159 0.26
160 0.25
161 0.23
162 0.18
163 0.2
164 0.25
165 0.27
166 0.27
167 0.27
168 0.26
169 0.27
170 0.25
171 0.22
172 0.16
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.18
187 0.25
188 0.25
189 0.24
190 0.23
191 0.21
192 0.22
193 0.21
194 0.18
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.17
210 0.17
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.2
216 0.19
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.16
221 0.24
222 0.27
223 0.23
224 0.27
225 0.25
226 0.25
227 0.26
228 0.26
229 0.18
230 0.15
231 0.14
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.15
241 0.14
242 0.18
243 0.22
244 0.31
245 0.4
246 0.43
247 0.48
248 0.51
249 0.58
250 0.63
251 0.64
252 0.59
253 0.52
254 0.56
255 0.56
256 0.52
257 0.48
258 0.41
259 0.41
260 0.4
261 0.47
262 0.41
263 0.38
264 0.4
265 0.46
266 0.54
267 0.53
268 0.55
269 0.51
270 0.52
271 0.51
272 0.54
273 0.47
274 0.38
275 0.38
276 0.33
277 0.31
278 0.28
279 0.27
280 0.22
281 0.17
282 0.16
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.22
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.18
305 0.2
306 0.26
307 0.31
308 0.35
309 0.42
310 0.44
311 0.46
312 0.52
313 0.55
314 0.56
315 0.56
316 0.58
317 0.53
318 0.6
319 0.6
320 0.51
321 0.45
322 0.39
323 0.33
324 0.26
325 0.23
326 0.18
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.16
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.17
335 0.17
336 0.21
337 0.23
338 0.23
339 0.25
340 0.23
341 0.23
342 0.22
343 0.2
344 0.14
345 0.11
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.06
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.15
371 0.16
372 0.19
373 0.22
374 0.26
375 0.34
376 0.42
377 0.47
378 0.49
379 0.5
380 0.53
381 0.51
382 0.47
383 0.42
384 0.36
385 0.3
386 0.25
387 0.24
388 0.17
389 0.17
390 0.14
391 0.1
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.1
401 0.13
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.19
409 0.2
410 0.27
411 0.26
412 0.27
413 0.29
414 0.29
415 0.29
416 0.29
417 0.3
418 0.25
419 0.27
420 0.3
421 0.29
422 0.28
423 0.27
424 0.22
425 0.2
426 0.19
427 0.18
428 0.21
429 0.25
430 0.27
431 0.32
432 0.36
433 0.41
434 0.43
435 0.46
436 0.42
437 0.42
438 0.43
439 0.41
440 0.37
441 0.29
442 0.26
443 0.2
444 0.17
445 0.12
446 0.09
447 0.11
448 0.11
449 0.19
450 0.21
451 0.23
452 0.26
453 0.28
454 0.3
455 0.31
456 0.38
457 0.37
458 0.45
459 0.51
460 0.52
461 0.55
462 0.53
463 0.51
464 0.48
465 0.46
466 0.43
467 0.38
468 0.37
469 0.35
470 0.38
471 0.4
472 0.42
473 0.4
474 0.35
475 0.37
476 0.41
477 0.42
478 0.39
479 0.35
480 0.29
481 0.35
482 0.4
483 0.37
484 0.32
485 0.31
486 0.29
487 0.29
488 0.29
489 0.24
490 0.22
491 0.23
492 0.25
493 0.22
494 0.23
495 0.23
496 0.22
497 0.2
498 0.15
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.05
503 0.06
504 0.1
505 0.09
506 0.1
507 0.12
508 0.12
509 0.13
510 0.18
511 0.19
512 0.17
513 0.18
514 0.2
515 0.22
516 0.23
517 0.25
518 0.24
519 0.24
520 0.24
521 0.22
522 0.19
523 0.16
524 0.15
525 0.13
526 0.14
527 0.19
528 0.2
529 0.27
530 0.34
531 0.36
532 0.39
533 0.46
534 0.53
535 0.51
536 0.51
537 0.52
538 0.46
539 0.44
540 0.43
541 0.37
542 0.28
543 0.24
544 0.24
545 0.17
546 0.17
547 0.16
548 0.14
549 0.12
550 0.12
551 0.1
552 0.09
553 0.1
554 0.14
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.18
560 0.19
561 0.2
562 0.17
563 0.16
564 0.21
565 0.24
566 0.25
567 0.26
568 0.28
569 0.24
570 0.3
571 0.39
572 0.43
573 0.45
574 0.52
575 0.6
576 0.62
577 0.63
578 0.64
579 0.61
580 0.6
581 0.58
582 0.52
583 0.43
584 0.4
585 0.37
586 0.31
587 0.22
588 0.14
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.11
604 0.11
605 0.12
606 0.13
607 0.12
608 0.14
609 0.19
610 0.21
611 0.18
612 0.19
613 0.2
614 0.21
615 0.22
616 0.22
617 0.19
618 0.18
619 0.2
620 0.21
621 0.21
622 0.2
623 0.2
624 0.18
625 0.17
626 0.17
627 0.13
628 0.13
629 0.11
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.06
635 0.08
636 0.08
637 0.1
638 0.1
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.11
643 0.08
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.12
661 0.18
662 0.19
663 0.2
664 0.2
665 0.22
666 0.22
667 0.21
668 0.17
669 0.13
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.09
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.1
688 0.17
689 0.17
690 0.18
691 0.2
692 0.21
693 0.21
694 0.23
695 0.28
696 0.22
697 0.3
698 0.31
699 0.39
700 0.38
701 0.39
702 0.37
703 0.31
704 0.33
705 0.25
706 0.24
707 0.15
708 0.17
709 0.15
710 0.15
711 0.18
712 0.14
713 0.14
714 0.12
715 0.12
716 0.11
717 0.13
718 0.13
719 0.13
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.14
724 0.14
725 0.12
726 0.12
727 0.09
728 0.09
729 0.08
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.06
738 0.09
739 0.12
740 0.13
741 0.14
742 0.14
743 0.15
744 0.19
745 0.22
746 0.21
747 0.24
748 0.27
749 0.28
750 0.3
751 0.29
752 0.26
753 0.25
754 0.23
755 0.21
756 0.26
757 0.24
758 0.23
759 0.23
760 0.24
761 0.24
762 0.24
763 0.21
764 0.13
765 0.21
766 0.22
767 0.26
768 0.27
769 0.26
770 0.25
771 0.28
772 0.29
773 0.21
774 0.23
775 0.2
776 0.2
777 0.2
778 0.19
779 0.16
780 0.14
781 0.14
782 0.11
783 0.09