FuNGI

A6RFF5

Protein Details

Accession

A6RFF5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MTYVRKGSKTRAQQHRSVQSRD	Hydrophilic
1131-1157	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 24, nucl 1, cyto 1, plas 1, cyto_nucl 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_08371 -
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MTYVRKGSKTRAQQHRSVQSRDLLWVSVNGCHILNVYRQPGTDAVMDYLTNLSPPARCLIGGDINVRHDAFEPGAVNLHRGGELVQWASEHGMDFVGEIGVPTHAAGHVIDLTFSNVAFASTTVRQDLHCGSDHQSMITMLPTTPQTQLSDARIKITDSQLEPFADLVRGLMVDMPCPEGVGNVAQLDDLAQHFTQSLLAAAQAVSKPAQQGRTTAPWWTADCRRAHRELTTHQTEAAKHQFKDAVRKAKRAYWRQVINEARDGRDLYRVVAWHKLEPNLRAHPLVIGDQVIEETAAKAEALQQAILKRYNSADDLEYDPLDDEHWSGMGNLPWNPRVGMEEVERNTIGVQSTSPGTDGITVRMLKACWQHVSLFIQQLYNCCLRLCHFPRAWKLAEVAMIPKVGKRDRSSVRSWRPIALLSVISKGLERIIARRLAYTALIHGIVSPQHGGALPRRSAMDLVATFTHEVEAAFAQNKEVSMVTMDVQGAFDAVLRRRLLQRMAQQGWPRELLQLIDSFLTERRAQVRLEGTTTAAHQMQCGTPQGSPLSPILFLLYLAELLWQNSELRFGYADDLNIWRATHSLDNNATLLRQDIQSILRWGEINKVAFAPEKLEMIHLTRKRHNEAPAVVVSEDLTVHPVTAPAGQEPALRLLGVHFNRRLTWRPHVSTRAKKGKGPWPSTSGSLGKTRDGPPADALRKAVTTCVVPSLLYGTEAWYGGRTQPARHTGRSGEVSSRLGWHVGTVEKVLTMAARGVLPVFRTTPIAALYRDAGLPSAMVALEEAKIRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPEVNRHTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKNAAQAFKEWWRSQPSTDLYVFSDGSERSLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSSMSHIFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGIRGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAVSSTAAPAYGLEATPTVSGVRTVAKQLSQEARRKWWSGACGRLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAVAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.84
3	0.82
4	0.77
5	0.71
6	0.66
7	0.61
8	0.57
9	0.48
10	0.38
11	0.31
12	0.3
13	0.26
14	0.24
15	0.23
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.18
20	0.17
21	0.2
22	0.23
23	0.27
24	0.27
25	0.27
26	0.29
27	0.29
28	0.29
29	0.27
30	0.22
31	0.2
32	0.19
33	0.19
34	0.17
35	0.17
36	0.14
37	0.12
38	0.11
39	0.11
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.16
46	0.2
47	0.25
48	0.27
49	0.3
50	0.3
51	0.31
52	0.34
53	0.32
54	0.27
55	0.22
56	0.22
57	0.18
58	0.19
59	0.17
60	0.16
61	0.21
62	0.2
63	0.2
64	0.19
65	0.19
66	0.15
67	0.15
68	0.15
69	0.12
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.13
74	0.14
75	0.15
76	0.14
77	0.12
78	0.09
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.06
85	0.05
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.11
108	0.13
109	0.15
110	0.16
111	0.17
112	0.17
113	0.21
114	0.23
115	0.22
116	0.22
117	0.22
118	0.25
119	0.31
120	0.31
121	0.27
122	0.26
123	0.23
124	0.21
125	0.2
126	0.17
127	0.1
128	0.12
129	0.14
130	0.14
131	0.16
132	0.18
133	0.18
134	0.2
135	0.25
136	0.28
137	0.34
138	0.33
139	0.34
140	0.33
141	0.33
142	0.34
143	0.34
144	0.34
145	0.28
146	0.31
147	0.3
148	0.3
149	0.29
150	0.24
151	0.21
152	0.16
153	0.13
154	0.11
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.1
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.12
164	0.13
165	0.12
166	0.09
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.09
190	0.08
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.14
195	0.18
196	0.23
197	0.21
198	0.24
199	0.29
200	0.34
201	0.34
202	0.33
203	0.32
204	0.3
205	0.32
206	0.34
207	0.35
208	0.35
209	0.4
210	0.45
211	0.49
212	0.5
213	0.51
214	0.5
215	0.5
216	0.5
217	0.53
218	0.52
219	0.46
220	0.44
221	0.44
222	0.4
223	0.41
224	0.44
225	0.41
226	0.36
227	0.38
228	0.4
229	0.4
230	0.5
231	0.51
232	0.52
233	0.5
234	0.57
235	0.57
236	0.6
237	0.67
238	0.66
239	0.67
240	0.65
241	0.68
242	0.65
243	0.71
244	0.7
245	0.64
246	0.63
247	0.56
248	0.48
249	0.43
250	0.4
251	0.32
252	0.31
253	0.27
254	0.21
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.26
259	0.27
260	0.27
261	0.29
262	0.33
263	0.34
264	0.36
265	0.41
266	0.39
267	0.4
268	0.35
269	0.32
270	0.28
271	0.26
272	0.24
273	0.18
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.05
286	0.08
287	0.11
288	0.11
289	0.12
290	0.14
291	0.16
292	0.19
293	0.22
294	0.19
295	0.18
296	0.18
297	0.2
298	0.19
299	0.19
300	0.17
301	0.17
302	0.19
303	0.19
304	0.18
305	0.16
306	0.15
307	0.13
308	0.12
309	0.1
310	0.08
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.08
316	0.09
317	0.11
318	0.14
319	0.16
320	0.17
321	0.18
322	0.18
323	0.16
324	0.17
325	0.17
326	0.16
327	0.16
328	0.22
329	0.22
330	0.24
331	0.24
332	0.21
333	0.19
334	0.18
335	0.16
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.14
348	0.14
349	0.14
350	0.16
351	0.16
352	0.16
353	0.2
354	0.22
355	0.2
356	0.21
357	0.21
358	0.23
359	0.28
360	0.26
361	0.26
362	0.23
363	0.23
364	0.22
365	0.23
366	0.23
367	0.2
368	0.18
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.25
373	0.28
374	0.33
375	0.35
376	0.41
377	0.47
378	0.52
379	0.51
380	0.42
381	0.38
382	0.31
383	0.29
384	0.23
385	0.19
386	0.15
387	0.14
388	0.13
389	0.13
390	0.17
391	0.17
392	0.22
393	0.24
394	0.31
395	0.37
396	0.43
397	0.49
398	0.54
399	0.6
400	0.64
401	0.62
402	0.56
403	0.5
404	0.46
405	0.4
406	0.31
407	0.24
408	0.17
409	0.16
410	0.14
411	0.13
412	0.12
413	0.1
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.14
419	0.17
420	0.17
421	0.18
422	0.18
423	0.16
424	0.17
425	0.15
426	0.12
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.13
440	0.18
441	0.18
442	0.18
443	0.19
444	0.19
445	0.19
446	0.18
447	0.17
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.12
482	0.13
483	0.14
484	0.17
485	0.2
486	0.21
487	0.24
488	0.3
489	0.35
490	0.37
491	0.41
492	0.42
493	0.42
494	0.41
495	0.37
496	0.31
497	0.22
498	0.2
499	0.16
500	0.13
501	0.11
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.1
508	0.09
509	0.1
510	0.12
511	0.14
512	0.14
513	0.17
514	0.19
515	0.18
516	0.19
517	0.18
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.09
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.12
529	0.11
530	0.09
531	0.11
532	0.12
533	0.11
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.09
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.1
570	0.1
571	0.13
572	0.13
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.13
577	0.1
578	0.1
579	0.07
580	0.06
581	0.06
582	0.07
583	0.08
584	0.09
585	0.11
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.1
590	0.13
591	0.15
592	0.14
593	0.13
594	0.13
595	0.13
596	0.13
597	0.13
598	0.11
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.11
605	0.18
606	0.2
607	0.23
608	0.28
609	0.32
610	0.36
611	0.4
612	0.41
613	0.39
614	0.36
615	0.36
616	0.31
617	0.29
618	0.24
619	0.2
620	0.16
621	0.11
622	0.1
623	0.06
624	0.07
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.08
637	0.1
638	0.08
639	0.08
640	0.07
641	0.08
642	0.14
643	0.15
644	0.19
645	0.19
646	0.19
647	0.21
648	0.24
649	0.28
650	0.26
651	0.33
652	0.36
653	0.38
654	0.43
655	0.5
656	0.56
657	0.59
658	0.64
659	0.66
660	0.61
661	0.6
662	0.62
663	0.6
664	0.61
665	0.59
666	0.52
667	0.47
668	0.47
669	0.46
670	0.43
671	0.37
672	0.29
673	0.29
674	0.26
675	0.22
676	0.25
677	0.25
678	0.27
679	0.26
680	0.25
681	0.24
682	0.3
683	0.31
684	0.27
685	0.26
686	0.22
687	0.21
688	0.2
689	0.18
690	0.11
691	0.1
692	0.09
693	0.1
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.09
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.13
709	0.13
710	0.14
711	0.19
712	0.28
713	0.31
714	0.32
715	0.33
716	0.3
717	0.34
718	0.36
719	0.32
720	0.25
721	0.24
722	0.24
723	0.22
724	0.22
725	0.18
726	0.14
727	0.13
728	0.11
729	0.1
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.08
734	0.07
735	0.08
736	0.07
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.07
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.13
753	0.14
754	0.13
755	0.13
756	0.13
757	0.12
758	0.12
759	0.11
760	0.09
761	0.07
762	0.07
763	0.06
764	0.05
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.07
774	0.08
775	0.09
776	0.09
777	0.13
778	0.14
779	0.16
780	0.18
781	0.23
782	0.24
783	0.28
784	0.3
785	0.27
786	0.25
787	0.23
788	0.22
789	0.19
790	0.21
791	0.19
792	0.21
793	0.21
794	0.2
795	0.2
796	0.26
797	0.27
798	0.24
799	0.22
800	0.18
801	0.19
802	0.21
803	0.24
804	0.25
805	0.32
806	0.4
807	0.45
808	0.5
809	0.52
810	0.59
811	0.65
812	0.67
813	0.67
814	0.61
815	0.63
816	0.59
817	0.6
818	0.53
819	0.46
820	0.37
821	0.28
822	0.29
823	0.24
824	0.21
825	0.17
826	0.15
827	0.13
828	0.15
829	0.16
830	0.17
831	0.17
832	0.17
833	0.18
834	0.18
835	0.17
836	0.16
837	0.15
838	0.12
839	0.11
840	0.11
841	0.1
842	0.11
843	0.17
844	0.16
845	0.16
846	0.19
847	0.19
848	0.2
849	0.25
850	0.25
851	0.21
852	0.21
853	0.22
854	0.26
855	0.31
856	0.38
857	0.34
858	0.37
859	0.43
860	0.43
861	0.43
862	0.43
863	0.4
864	0.37
865	0.37
866	0.34
867	0.28
868	0.29
869	0.27
870	0.2
871	0.19
872	0.14
873	0.14
874	0.14
875	0.13
876	0.13
877	0.19
878	0.19
879	0.2
880	0.23
881	0.22
882	0.22
883	0.22
884	0.2
885	0.15
886	0.16
887	0.12
888	0.12
889	0.14
890	0.13
891	0.15
892	0.18
893	0.18
894	0.16
895	0.16
896	0.15
897	0.13
898	0.17
899	0.15
900	0.12
901	0.12
902	0.12
903	0.12
904	0.12
905	0.13
906	0.1
907	0.1
908	0.1
909	0.09
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.08
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.07
920	0.07
921	0.07
922	0.07
923	0.07
924	0.09
925	0.11
926	0.11
927	0.12
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.15
932	0.14
933	0.15
934	0.16
935	0.23
936	0.27
937	0.27
938	0.26
939	0.23
940	0.22
941	0.2
942	0.22
943	0.15
944	0.12
945	0.12
946	0.12
947	0.12
948	0.13
949	0.14
950	0.11
951	0.11
952	0.09
953	0.09
954	0.09
955	0.09
956	0.08
957	0.08
958	0.09
959	0.09
960	0.11
961	0.12
962	0.14
963	0.16
964	0.18
965	0.18
966	0.21
967	0.27
968	0.27
969	0.28
970	0.28
971	0.35
972	0.42
973	0.48
974	0.47
975	0.43
976	0.46
977	0.44
978	0.45
979	0.38
980	0.3
981	0.24
982	0.22
983	0.21
984	0.17
985	0.17
986	0.14
987	0.15
988	0.13
989	0.16
990	0.15
991	0.15
992	0.14
993	0.13
994	0.12
995	0.13
996	0.13
997	0.11
998	0.12
999	0.13
1000	0.13
1001	0.16
1002	0.18
1003	0.18
1004	0.19
1005	0.22
1006	0.23
1007	0.22
1008	0.21
1009	0.18
1010	0.18
1011	0.16
1012	0.14
1013	0.1
1014	0.08
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.08
1019	0.07
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.16
1025	0.18
1026	0.2
1027	0.21
1028	0.27
1029	0.35
1030	0.4
1031	0.47
1032	0.48
1033	0.54
1034	0.58
1035	0.59
1036	0.57
1037	0.53
1038	0.53
1039	0.53
1040	0.57
1041	0.52
1042	0.49
1043	0.47
1044	0.51
1045	0.48
1046	0.44
1047	0.39
1048	0.35
1049	0.33
1050	0.33
1051	0.35
1052	0.34
1053	0.35
1054	0.37
1055	0.42
1056	0.39
1057	0.42
1058	0.48
1059	0.51
1060	0.45
1061	0.44
1062	0.46
1063	0.41
1064	0.39
1065	0.35
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.33
1069	0.33
1070	0.32
1071	0.34
1072	0.34
1073	0.39
1074	0.39
1075	0.39
1076	0.37
1077	0.42
1078	0.39
1079	0.39
1080	0.41
1081	0.37
1082	0.41
1083	0.4
1084	0.4
1085	0.33
1086	0.29
1087	0.28
1088	0.25
1089	0.31
1090	0.38
1091	0.35
1092	0.36
1093	0.37
1094	0.44
1095	0.46
1096	0.52
1097	0.54
1098	0.52
1099	0.59
1100	0.56
1101	0.6
1102	0.54
1103	0.52
1104	0.46
1105	0.42
1106	0.39
1107	0.35
1108	0.38
1109	0.4
1110	0.43
1111	0.45
1112	0.49
1113	0.48
1114	0.47
1115	0.46
1116	0.47
1117	0.44
1118	0.49
1119	0.53
1120	0.52
1121	0.49
1122	0.54
1123	0.54
1124	0.57
1125	0.62
1126	0.64
1127	0.66
1128	0.71
1129	0.78
1130	0.77
1131	0.82
1132	0.81
1133	0.81
1134	0.82
1135	0.83
1136	0.82
1137	0.82
1138	0.84
1139	0.77
1140	0.7
1141	0.63
1142	0.57
1143	0.48
1144	0.4
1145	0.31
1146	0.22
1147	0.2
1148	0.19
1149	0.15
1150	0.1
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.1
1154	0.09
1155	0.09
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.13
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.14
1162	0.16
1163	0.17
1164	0.17

A6RFF5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer