FuNGI

A6RCC2

Protein Details

Accession

A6RCC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
119-143	SKEFGIKSRKWKTKSMKHTIPQAST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-43	GKNSKKP

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.333, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR045209 Rrp5 IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	aje:HCAG_07280 -
Pfam	View protein in Pfam PF00575 S1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd05696 S1_Rrp5_repeat_hs4 cd05698 S1_Rrp5_repeat_hs6_sc5

Amino Acid Sequences

MAPIKRKGNGPDESGSRQPQKRVKVIAGVQRKDVNGGKNSKKPAEKSKDSLDSPSKTPAVSVLREEEPAFPRGGANILSPLEQKQIHIQATRDVLFEQKGAQAQDDIDNEDGTQKKQSSKEFGIKSRKWKTKSMKHTIPQASTKEEVRIEGLNFKQKIEKLLNSSQEEEDNSDGDDDDGDDDLDLKSYFKLGQYLRAAVTSTETEVNHGKIKGKKHIELSVDPREANSGLSKSDLVVNATVQASVLSLEDHGLVMDLGLEDGQTRGFMSSKEIPHDLELLQIKEGTVFLCVVTGHNANGNVVKLSANLPTAGSIKKSHFLTSAPTIHSFLPGTAAEILLTQVTSTGMAGKIMGMLDAVVDIVQSGATAGKEDITARYHVGAKIKGRLICTFPTAEPLKLGFSILDHVVKFMPTVLDRKSSCEVVPAISAIVPEVKVTKVEPGLGVYAQFNDKHYGFVHISRLSDDKVDSISSTQGPYMVDSTHEARIVGFSALDNLYLLSLERKVIDQPFLRLEDVTVGAVVKGKIEKLLIGPDGISGLIVSLADGISGLVPGMHMSDTKLQHPEKKFREGVQVSARILSVNLEKRQLRLTLKKTLLNSESSTWCDYSDILPGNKSPGTIISIQSHGAIVQFYGEVRGFLPVSEMSEAYIKDPAQHFNIGQVVNVHALNVDAELRKLVVSCKDQLSSTEAYKRALEHIHPGNTVSGTVFEKSNEDILLKLEDSGLVARLNAEHVSDGQASRNGAALARIRVGQKLNELLILNIQKSHQLIKVTNKPSLKQARQRGELPTKFEDLRKDPR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.57
3	0.58
4	0.58
5	0.61
6	0.62
7	0.65
8	0.68
9	0.68
10	0.65
11	0.64
12	0.67
13	0.67
14	0.7
15	0.64
16	0.61
17	0.58
18	0.54
19	0.51
20	0.49
21	0.46
22	0.44
23	0.51
24	0.54
25	0.57
26	0.64
27	0.67
28	0.69
29	0.69
30	0.72
31	0.73
32	0.72
33	0.71
34	0.74
35	0.74
36	0.69
37	0.7
38	0.67
39	0.61
40	0.56
41	0.56
42	0.48
43	0.39
44	0.37
45	0.35
46	0.33
47	0.31
48	0.32
49	0.3
50	0.31
51	0.33
52	0.34
53	0.32
54	0.3
55	0.29
56	0.26
57	0.22
58	0.2
59	0.19
60	0.2
61	0.15
62	0.14
63	0.16
64	0.16
65	0.17
66	0.18
67	0.19
68	0.22
69	0.21
70	0.21
71	0.25
72	0.31
73	0.33
74	0.36
75	0.35
76	0.35
77	0.4
78	0.4
79	0.33
80	0.27
81	0.25
82	0.23
83	0.22
84	0.19
85	0.17
86	0.19
87	0.19
88	0.19
89	0.17
90	0.18
91	0.22
92	0.21
93	0.21
94	0.18
95	0.18
96	0.17
97	0.21
98	0.21
99	0.18
100	0.22
101	0.23
102	0.28
103	0.34
104	0.4
105	0.43
106	0.49
107	0.56
108	0.58
109	0.64
110	0.69
111	0.69
112	0.73
113	0.75
114	0.77
115	0.72
116	0.75
117	0.77
118	0.77
119	0.82
120	0.82
121	0.81
122	0.78
123	0.84
124	0.81
125	0.77
126	0.73
127	0.65
128	0.59
129	0.52
130	0.48
131	0.42
132	0.36
133	0.31
134	0.26
135	0.26
136	0.22
137	0.26
138	0.28
139	0.32
140	0.32
141	0.32
142	0.35
143	0.34
144	0.39
145	0.38
146	0.39
147	0.38
148	0.44
149	0.51
150	0.48
151	0.5
152	0.44
153	0.4
154	0.37
155	0.32
156	0.26
157	0.19
158	0.16
159	0.13
160	0.12
161	0.1
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.05
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.09
176	0.09
177	0.16
178	0.15
179	0.23
180	0.25
181	0.27
182	0.27
183	0.27
184	0.26
185	0.2
186	0.22
187	0.15
188	0.13
189	0.14
190	0.14
191	0.16
192	0.17
193	0.19
194	0.2
195	0.21
196	0.26
197	0.27
198	0.33
199	0.41
200	0.45
201	0.48
202	0.49
203	0.53
204	0.52
205	0.53
206	0.55
207	0.54
208	0.49
209	0.44
210	0.39
211	0.35
212	0.3
213	0.25
214	0.21
215	0.13
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.13
227	0.12
228	0.09
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.11
256	0.17
257	0.19
258	0.22
259	0.23
260	0.23
261	0.23
262	0.25
263	0.19
264	0.18
265	0.18
266	0.16
267	0.15
268	0.15
269	0.13
270	0.12
271	0.12
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.08
280	0.09
281	0.08
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.11
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.14
302	0.19
303	0.2
304	0.19
305	0.19
306	0.19
307	0.21
308	0.24
309	0.27
310	0.23
311	0.24
312	0.24
313	0.23
314	0.24
315	0.19
316	0.13
317	0.12
318	0.1
319	0.11
320	0.09
321	0.09
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.05
326	0.05
327	0.03
328	0.03
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.02
350	0.02
351	0.02
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.12
365	0.13
366	0.16
367	0.18
368	0.18
369	0.22
370	0.25
371	0.26
372	0.26
373	0.26
374	0.25
375	0.23
376	0.23
377	0.2
378	0.16
379	0.2
380	0.19
381	0.18
382	0.16
383	0.15
384	0.14
385	0.12
386	0.12
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.09
401	0.1
402	0.15
403	0.16
404	0.2
405	0.21
406	0.21
407	0.2
408	0.2
409	0.19
410	0.15
411	0.15
412	0.11
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.05
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.09
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.09
431	0.1
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.13
441	0.16
442	0.16
443	0.17
444	0.21
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.2
449	0.16
450	0.16
451	0.15
452	0.11
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.08
457	0.1
458	0.09
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.12
469	0.12
470	0.13
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.09
476	0.07
477	0.05
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.1
492	0.11
493	0.16
494	0.16
495	0.18
496	0.21
497	0.22
498	0.22
499	0.19
500	0.18
501	0.15
502	0.14
503	0.11
504	0.09
505	0.07
506	0.06
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.07
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.02
538	0.03
539	0.03
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.06
544	0.13
545	0.15
546	0.17
547	0.24
548	0.26
549	0.33
550	0.4
551	0.48
552	0.47
553	0.53
554	0.54
555	0.5
556	0.58
557	0.52
558	0.52
559	0.49
560	0.48
561	0.4
562	0.38
563	0.36
564	0.25
565	0.24
566	0.19
567	0.18
568	0.2
569	0.22
570	0.27
571	0.28
572	0.29
573	0.33
574	0.36
575	0.37
576	0.4
577	0.43
578	0.46
579	0.5
580	0.52
581	0.51
582	0.52
583	0.47
584	0.42
585	0.39
586	0.33
587	0.32
588	0.3
589	0.31
590	0.24
591	0.22
592	0.19
593	0.18
594	0.15
595	0.18
596	0.19
597	0.17
598	0.18
599	0.18
600	0.21
601	0.21
602	0.2
603	0.15
604	0.13
605	0.15
606	0.16
607	0.18
608	0.18
609	0.19
610	0.19
611	0.19
612	0.17
613	0.14
614	0.12
615	0.1
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.08
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.1
625	0.1
626	0.09
627	0.12
628	0.1
629	0.12
630	0.13
631	0.12
632	0.11
633	0.14
634	0.14
635	0.13
636	0.16
637	0.14
638	0.17
639	0.2
640	0.22
641	0.23
642	0.25
643	0.24
644	0.24
645	0.29
646	0.24
647	0.23
648	0.2
649	0.18
650	0.18
651	0.18
652	0.14
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.08
657	0.1
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.13
665	0.17
666	0.2
667	0.25
668	0.28
669	0.29
670	0.29
671	0.3
672	0.32
673	0.29
674	0.29
675	0.32
676	0.3
677	0.31
678	0.32
679	0.31
680	0.3
681	0.31
682	0.28
683	0.3
684	0.36
685	0.37
686	0.36
687	0.36
688	0.34
689	0.3
690	0.29
691	0.21
692	0.16
693	0.14
694	0.15
695	0.15
696	0.13
697	0.15
698	0.16
699	0.18
700	0.16
701	0.14
702	0.13
703	0.15
704	0.17
705	0.15
706	0.14
707	0.12
708	0.11
709	0.12
710	0.12
711	0.12
712	0.09
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.1
720	0.11
721	0.14
722	0.16
723	0.16
724	0.17
725	0.2
726	0.2
727	0.19
728	0.2
729	0.17
730	0.15
731	0.19
732	0.2
733	0.2
734	0.21
735	0.24
736	0.23
737	0.28
738	0.3
739	0.29
740	0.3
741	0.31
742	0.3
743	0.31
744	0.3
745	0.26
746	0.3
747	0.31
748	0.26
749	0.23
750	0.23
751	0.23
752	0.24
753	0.27
754	0.24
755	0.27
756	0.31
757	0.4
758	0.5
759	0.51
760	0.56
761	0.56
762	0.54
763	0.59
764	0.64
765	0.64
766	0.64
767	0.7
768	0.73
769	0.75
770	0.77
771	0.77
772	0.77
773	0.72
774	0.69
775	0.63
776	0.59
777	0.56
778	0.55
779	0.54

A6RCC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer