Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6R5I1

Protein Details
Accession A6R5I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-301EFEKRGAAKKRQREAKFKSKLHDLKKRTRVEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-300KRGAAKKRQREAKFKSKLHDLKKRTRVE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12, mito 6.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG aje:HCAG_04889  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
Amino Acid Sequences MEAHQKTDSPPKAGFSTIFNTQTPLTPEQLRRIEVRRMKAKVLREQEDAAVRSGSLPSSSATPGQKRPSSAISPPKPRSSSRDTRYNKSDGRSLDEIRPARNFSKYVEFDLSKMTDTKGGFLTAEDDPHNKVLYSGERDEKPTQMTFKEWERYQLLRSLQRDKAGPFEPGLSVLNTTEQKSCRECGSIEIDWKWEETLRCAVCNPCKEKFPEKYSLLTKTEAKEDYLLTDQRPNPHKATWNNMMLYLRFQVEQYAFSPKKWGSPEALDAEFEKRGAAKKRQREAKFKSKLHDLKKRTRVEAYRRSRQAAAEAGSGEHFGDDLGSGKHVHQWRRLVDNPETGIGVKACVHCAMEIEELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.31
3 0.31
4 0.33
5 0.35
6 0.31
7 0.31
8 0.29
9 0.32
10 0.33
11 0.31
12 0.28
13 0.32
14 0.36
15 0.43
16 0.46
17 0.45
18 0.45
19 0.48
20 0.54
21 0.53
22 0.59
23 0.59
24 0.58
25 0.63
26 0.64
27 0.67
28 0.66
29 0.68
30 0.64
31 0.59
32 0.57
33 0.53
34 0.54
35 0.47
36 0.39
37 0.3
38 0.24
39 0.21
40 0.2
41 0.16
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.17
48 0.22
49 0.27
50 0.33
51 0.41
52 0.43
53 0.43
54 0.45
55 0.46
56 0.46
57 0.48
58 0.52
59 0.53
60 0.6
61 0.63
62 0.67
63 0.64
64 0.63
65 0.62
66 0.61
67 0.62
68 0.59
69 0.64
70 0.62
71 0.66
72 0.68
73 0.69
74 0.64
75 0.57
76 0.56
77 0.47
78 0.48
79 0.45
80 0.43
81 0.39
82 0.43
83 0.41
84 0.38
85 0.39
86 0.36
87 0.34
88 0.34
89 0.3
90 0.26
91 0.34
92 0.32
93 0.34
94 0.35
95 0.33
96 0.3
97 0.33
98 0.31
99 0.22
100 0.21
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.15
121 0.19
122 0.21
123 0.24
124 0.25
125 0.3
126 0.31
127 0.3
128 0.29
129 0.26
130 0.25
131 0.21
132 0.22
133 0.21
134 0.24
135 0.28
136 0.26
137 0.28
138 0.3
139 0.3
140 0.29
141 0.31
142 0.3
143 0.3
144 0.34
145 0.36
146 0.34
147 0.35
148 0.36
149 0.31
150 0.32
151 0.27
152 0.25
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.18
171 0.16
172 0.17
173 0.21
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.17
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.22
189 0.25
190 0.31
191 0.33
192 0.29
193 0.32
194 0.36
195 0.43
196 0.46
197 0.46
198 0.48
199 0.46
200 0.49
201 0.49
202 0.5
203 0.44
204 0.4
205 0.37
206 0.3
207 0.33
208 0.29
209 0.26
210 0.21
211 0.19
212 0.19
213 0.2
214 0.19
215 0.16
216 0.22
217 0.23
218 0.29
219 0.34
220 0.36
221 0.35
222 0.37
223 0.44
224 0.4
225 0.46
226 0.46
227 0.45
228 0.42
229 0.41
230 0.39
231 0.32
232 0.3
233 0.24
234 0.18
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.15
240 0.14
241 0.22
242 0.22
243 0.22
244 0.27
245 0.24
246 0.3
247 0.31
248 0.32
249 0.26
250 0.29
251 0.34
252 0.33
253 0.33
254 0.28
255 0.26
256 0.26
257 0.23
258 0.19
259 0.14
260 0.12
261 0.18
262 0.25
263 0.34
264 0.4
265 0.5
266 0.6
267 0.69
268 0.75
269 0.8
270 0.81
271 0.82
272 0.83
273 0.78
274 0.74
275 0.75
276 0.76
277 0.75
278 0.76
279 0.74
280 0.74
281 0.79
282 0.8
283 0.74
284 0.75
285 0.74
286 0.75
287 0.77
288 0.76
289 0.76
290 0.74
291 0.74
292 0.67
293 0.6
294 0.54
295 0.49
296 0.42
297 0.34
298 0.3
299 0.26
300 0.24
301 0.23
302 0.18
303 0.11
304 0.09
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.18
314 0.24
315 0.3
316 0.35
317 0.43
318 0.47
319 0.54
320 0.6
321 0.6
322 0.59
323 0.6
324 0.55
325 0.49
326 0.45
327 0.37
328 0.33
329 0.26
330 0.22
331 0.19
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.19
336 0.16
337 0.18
338 0.2
339 0.19