Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6RDM0

Protein Details
Accession A6RDM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-448RTPLLPRRWILRRRHRRQRRVPNHSFSLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-439PLLPRRWILRRRHRRQRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR000477  RT_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG aje:HCAG_07728  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MASNTPAPTSDAGFTARQQQQLQQMIAEAIASIPRDGGPPGPPGPPGPPGPAAKPQDPDAPYTGHWKPDDLGFFDPNLDDKDAIGTGDIVYIGNHPYYRDVHLFTARVKDVARTKGEEAVRRNLTTCLRGTALEWYTAELTDIEKDFMIEVDISRGWIPSLTKRFQQRATQAWTAIKRDSYTLKDASEGRSVRSYCQAIFRNAKSAGISDTAAQLTAAYSNIYWEFRAQITEPTPATSMQDFLREVEGVASGFWRAPPRLSPTAAEAVDATPLLARTATVSSLDAEHTDNTAVVAHTDSITAPRETSAPSPAKALPPANNRNPDTRKASNRAYNAPCKTSNTNCNANSSRATKPPASLTLKTRNLNSSSQPHHEGTSTGLKHTITTQQDTSPDAAEEQDDQQDALYGNPRGRCAHRRQLRTPLLPRRWILRRRHRRQRRVPNHSFSLADDAPKAEGQQQEAVSTFMHNDHILIVSCKHCKASFTSNTKLHKHIRQLCCSPSPIITNANTATPHTPKLISSNAPPHTDAPGSAFRSWRYITASVYIKDPTKLTSICLDSGCTMSSVSKDWVLEQHPTITLLPSDLIKIKGLGDQLHDSTEYVNLPIHLPGKDPNDNPVTARITREVHIIKNTSAIPLIGIDILGPEGFILDPQRRIATIRACGDTVIPISVTPKPHRKPDRPIYSAHTLTVPAQSYALVPISYRGTLFPDRDYMFTPHHSTATLFAAITDSQFQAVPIQNANPRPLTIPARTRLGTLGDYDMTNEVRVCQADALAAYSSRPEPSNPLRTEHLTTSGTTIYGDDNTAARLAEVLQRYNIWNDKGNIANVSPDRWMRIPLHKDWRKDFRKAKVYPLSPRDKDIVDSTFDELHTHDRMGWTTEHTPFGAPVFVVWRTVFIHGKPIEKGRVVIDIRNLNKITEKDNYPMPRQTDILNALIGKKFISVIDATKWFYQWRVHPDDQHKLTVISHRGQEHLKVAAMGFCNSPQHVQRQIDYELRKHKDYAKAYIDDLVIFSDNLESHITHLNAVFLTLENLGVALNPEKSYIGFPTVTLLGQRVSLGAVQAPSLC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.29
3 0.32
4 0.34
5 0.35
6 0.38
7 0.44
8 0.49
9 0.48
10 0.39
11 0.36
12 0.31
13 0.29
14 0.23
15 0.14
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.2
27 0.22
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.29
32 0.31
33 0.31
34 0.3
35 0.33
36 0.35
37 0.38
38 0.45
39 0.47
40 0.47
41 0.48
42 0.46
43 0.49
44 0.47
45 0.46
46 0.39
47 0.36
48 0.33
49 0.37
50 0.36
51 0.34
52 0.34
53 0.32
54 0.3
55 0.33
56 0.36
57 0.32
58 0.33
59 0.28
60 0.28
61 0.28
62 0.27
63 0.23
64 0.22
65 0.2
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.15
84 0.17
85 0.22
86 0.24
87 0.25
88 0.28
89 0.33
90 0.34
91 0.33
92 0.38
93 0.34
94 0.33
95 0.3
96 0.32
97 0.35
98 0.4
99 0.41
100 0.38
101 0.39
102 0.45
103 0.49
104 0.5
105 0.48
106 0.5
107 0.5
108 0.47
109 0.46
110 0.44
111 0.43
112 0.4
113 0.37
114 0.31
115 0.27
116 0.27
117 0.26
118 0.29
119 0.26
120 0.24
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.12
145 0.14
146 0.2
147 0.28
148 0.31
149 0.36
150 0.45
151 0.51
152 0.55
153 0.61
154 0.59
155 0.59
156 0.64
157 0.61
158 0.56
159 0.57
160 0.55
161 0.49
162 0.45
163 0.39
164 0.32
165 0.32
166 0.34
167 0.32
168 0.33
169 0.32
170 0.3
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.36
175 0.32
176 0.29
177 0.33
178 0.33
179 0.32
180 0.37
181 0.35
182 0.29
183 0.37
184 0.38
185 0.39
186 0.46
187 0.45
188 0.45
189 0.43
190 0.43
191 0.35
192 0.32
193 0.26
194 0.21
195 0.2
196 0.13
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.18
217 0.19
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.23
222 0.21
223 0.22
224 0.18
225 0.17
226 0.14
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.17
245 0.25
246 0.29
247 0.3
248 0.3
249 0.3
250 0.35
251 0.33
252 0.3
253 0.23
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.12
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.2
295 0.2
296 0.2
297 0.23
298 0.25
299 0.26
300 0.28
301 0.3
302 0.29
303 0.36
304 0.44
305 0.48
306 0.54
307 0.54
308 0.59
309 0.6
310 0.59
311 0.57
312 0.56
313 0.57
314 0.55
315 0.61
316 0.58
317 0.58
318 0.61
319 0.59
320 0.61
321 0.56
322 0.54
323 0.49
324 0.47
325 0.48
326 0.46
327 0.47
328 0.44
329 0.49
330 0.45
331 0.51
332 0.48
333 0.45
334 0.43
335 0.4
336 0.38
337 0.34
338 0.37
339 0.32
340 0.31
341 0.32
342 0.36
343 0.37
344 0.37
345 0.39
346 0.45
347 0.5
348 0.5
349 0.49
350 0.45
351 0.43
352 0.42
353 0.4
354 0.38
355 0.36
356 0.38
357 0.4
358 0.37
359 0.34
360 0.32
361 0.27
362 0.24
363 0.27
364 0.24
365 0.2
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.25
371 0.19
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.24
376 0.25
377 0.24
378 0.18
379 0.15
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.11
393 0.11
394 0.14
395 0.15
396 0.17
397 0.19
398 0.23
399 0.3
400 0.35
401 0.44
402 0.49
403 0.56
404 0.59
405 0.67
406 0.7
407 0.7
408 0.71
409 0.71
410 0.68
411 0.66
412 0.62
413 0.58
414 0.59
415 0.6
416 0.61
417 0.62
418 0.68
419 0.73
420 0.84
421 0.88
422 0.9
423 0.93
424 0.94
425 0.94
426 0.93
427 0.91
428 0.87
429 0.8
430 0.71
431 0.6
432 0.49
433 0.45
434 0.34
435 0.26
436 0.19
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.13
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.11
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.18
468 0.25
469 0.31
470 0.36
471 0.42
472 0.47
473 0.52
474 0.53
475 0.55
476 0.52
477 0.48
478 0.51
479 0.54
480 0.54
481 0.55
482 0.56
483 0.54
484 0.51
485 0.47
486 0.38
487 0.3
488 0.25
489 0.21
490 0.2
491 0.17
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.13
502 0.12
503 0.15
504 0.17
505 0.16
506 0.17
507 0.24
508 0.26
509 0.27
510 0.27
511 0.25
512 0.24
513 0.23
514 0.2
515 0.16
516 0.18
517 0.19
518 0.19
519 0.19
520 0.18
521 0.21
522 0.21
523 0.19
524 0.18
525 0.16
526 0.16
527 0.19
528 0.22
529 0.19
530 0.2
531 0.2
532 0.17
533 0.17
534 0.17
535 0.13
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.15
540 0.16
541 0.17
542 0.16
543 0.15
544 0.13
545 0.13
546 0.12
547 0.09
548 0.08
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.12
557 0.13
558 0.14
559 0.13
560 0.14
561 0.13
562 0.14
563 0.13
564 0.11
565 0.09
566 0.08
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.11
577 0.11
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.09
592 0.1
593 0.09
594 0.1
595 0.14
596 0.19
597 0.23
598 0.23
599 0.26
600 0.26
601 0.26
602 0.26
603 0.26
604 0.25
605 0.21
606 0.22
607 0.21
608 0.2
609 0.2
610 0.25
611 0.23
612 0.21
613 0.24
614 0.24
615 0.21
616 0.22
617 0.22
618 0.17
619 0.15
620 0.13
621 0.1
622 0.08
623 0.08
624 0.05
625 0.05
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.03
631 0.02
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.06
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.13
642 0.17
643 0.19
644 0.23
645 0.25
646 0.25
647 0.25
648 0.25
649 0.23
650 0.2
651 0.16
652 0.1
653 0.07
654 0.06
655 0.08
656 0.11
657 0.15
658 0.19
659 0.28
660 0.31
661 0.41
662 0.51
663 0.56
664 0.64
665 0.7
666 0.75
667 0.68
668 0.68
669 0.64
670 0.62
671 0.55
672 0.46
673 0.36
674 0.26
675 0.25
676 0.25
677 0.19
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.07
685 0.06
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.13
692 0.16
693 0.18
694 0.17
695 0.21
696 0.21
697 0.22
698 0.25
699 0.23
700 0.22
701 0.24
702 0.27
703 0.24
704 0.23
705 0.22
706 0.2
707 0.19
708 0.19
709 0.16
710 0.12
711 0.1
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.1
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.11
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.16
725 0.2
726 0.22
727 0.24
728 0.21
729 0.2
730 0.2
731 0.24
732 0.26
733 0.27
734 0.31
735 0.32
736 0.36
737 0.36
738 0.35
739 0.31
740 0.29
741 0.24
742 0.2
743 0.19
744 0.15
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.12
749 0.12
750 0.1
751 0.09
752 0.09
753 0.1
754 0.09
755 0.08
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.08
764 0.09
765 0.1
766 0.11
767 0.1
768 0.17
769 0.25
770 0.35
771 0.34
772 0.37
773 0.4
774 0.42
775 0.45
776 0.4
777 0.37
778 0.28
779 0.27
780 0.26
781 0.22
782 0.19
783 0.15
784 0.14
785 0.1
786 0.1
787 0.1
788 0.08
789 0.08
790 0.09
791 0.09
792 0.08
793 0.07
794 0.06
795 0.07
796 0.12
797 0.13
798 0.14
799 0.14
800 0.16
801 0.17
802 0.22
803 0.24
804 0.22
805 0.25
806 0.25
807 0.28
808 0.3
809 0.3
810 0.27
811 0.23
812 0.26
813 0.22
814 0.22
815 0.21
816 0.19
817 0.21
818 0.21
819 0.24
820 0.23
821 0.32
822 0.36
823 0.41
824 0.52
825 0.54
826 0.6
827 0.64
828 0.71
829 0.67
830 0.72
831 0.72
832 0.71
833 0.75
834 0.71
835 0.74
836 0.72
837 0.73
838 0.72
839 0.73
840 0.73
841 0.64
842 0.65
843 0.58
844 0.49
845 0.45
846 0.4
847 0.33
848 0.26
849 0.26
850 0.25
851 0.24
852 0.23
853 0.21
854 0.18
855 0.19
856 0.17
857 0.16
858 0.15
859 0.15
860 0.16
861 0.18
862 0.18
863 0.19
864 0.23
865 0.25
866 0.26
867 0.25
868 0.24
869 0.22
870 0.22
871 0.17
872 0.12
873 0.1
874 0.12
875 0.12
876 0.13
877 0.13
878 0.14
879 0.14
880 0.19
881 0.21
882 0.18
883 0.26
884 0.27
885 0.31
886 0.32
887 0.36
888 0.37
889 0.36
890 0.37
891 0.3
892 0.36
893 0.34
894 0.33
895 0.35
896 0.38
897 0.38
898 0.44
899 0.42
900 0.35
901 0.38
902 0.37
903 0.35
904 0.33
905 0.35
906 0.31
907 0.38
908 0.43
909 0.43
910 0.47
911 0.47
912 0.43
913 0.41
914 0.39
915 0.38
916 0.35
917 0.31
918 0.27
919 0.24
920 0.24
921 0.24
922 0.23
923 0.17
924 0.14
925 0.13
926 0.11
927 0.13
928 0.12
929 0.14
930 0.19
931 0.22
932 0.24
933 0.24
934 0.26
935 0.24
936 0.26
937 0.3
938 0.31
939 0.37
940 0.43
941 0.47
942 0.54
943 0.61
944 0.67
945 0.65
946 0.61
947 0.54
948 0.46
949 0.44
950 0.43
951 0.41
952 0.35
953 0.36
954 0.35
955 0.37
956 0.38
957 0.39
958 0.34
959 0.31
960 0.28
961 0.24
962 0.22
963 0.23
964 0.23
965 0.2
966 0.18
967 0.17
968 0.19
969 0.2
970 0.24
971 0.23
972 0.28
973 0.35
974 0.37
975 0.38
976 0.41
977 0.44
978 0.48
979 0.49
980 0.5
981 0.52
982 0.54
983 0.53
984 0.52
985 0.54
986 0.56
987 0.57
988 0.59
989 0.56
990 0.53
991 0.52
992 0.52
993 0.46
994 0.36
995 0.31
996 0.24
997 0.17
998 0.14
999 0.13
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.13
1004 0.11
1005 0.13
1006 0.19
1007 0.19
1008 0.19
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.17
1012 0.17
1013 0.16
1014 0.1
1015 0.11
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.08
1019 0.08
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.08
1023 0.09
1024 0.11
1025 0.11
1026 0.13
1027 0.13
1028 0.15
1029 0.17
1030 0.17
1031 0.19
1032 0.17
1033 0.17
1034 0.2
1035 0.21
1036 0.2
1037 0.18
1038 0.17
1039 0.14
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.11
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.11
1046 0.12
1047 0.12