Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R0T0

Protein Details
Accession A6R0T0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-188TTTSTHTPTRNRERTRQPKPPKAKSTAIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-82GRGGPGARTG
86-89GRGR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG aje:HCAG_03237  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MTATTLQSQSSTAQTPSLDQAPAHDERISPNDTGSRRTGRRGRGGNSGSGGNVNTSRNRTLFYGSGRRGGDPGRGGPGARTGAISGRGRGRLRSDASNTTRTVAGMGRLFGGRLTREEPQTADDGGSDRSLVQGEQATLRPNAPEFIPGVHVATTTPTPTTTSTHTPTRNRERTRQPKPPKAKSTAIDIATRTHEDITNGVYECPICTSELGRKTKVWSCSLCWTVFHLSCIKKWSNNEGSVMARPRQQQGQDGHGHPRQWRCPGCNLPHDILPSTYSCWCEKETDPRPLPGLPPHSCGQTCSKARKGCPHPCDSPCGELLPCLEHKCARPCHEGLCGACEETIEAKCYCGKSQTKMMCSNREEEKHSCLTHGKGTSEETVEEWVGCFDCREICDRAYDCGIHTCRKRCHPQDAAVPHCPSSPDVITHCSCGKTPLSDIPGYVARTSCQDPIPNCKEPCGRLLPCQHECPILCHAGPCPPCFLKVSITCRCGKGVFQSICNQGASEPPHCFRVCKATMNCGRHTCGEHCCPGERKAIERQATKRKLKSLNVANRPNDHDIEAEHICTRVCGRLLKCSKHMCQELCHKGSCGTCREAIFEEIPCNCGRSVLYPPLPCGTQPPLCHYDCARPKSCGHPQTSHNCHTDDESCPKCPFLTEKRCLCATKTLKNQPCWLADPRCGLVCNKELKCGSHTCKNLCHRPGECEDLAQPCQQPCGKIKKLCSHPCSDPCHAPFPCQEKTPCQSLITITCPCGRLKQEKRCNAYRDNRNRLQQTQSQAPSALKCDDECARLQRNRSLASALNISIDPFTTSATTDGDSLATATLPYSPETLDLYLTLSTTSTLSTLQTYETTFYTLATSQTKRSARFPPARSQLRAFIHSLAADWGFISESYDPEPHRHVAVFKGAHWVPPRGLGAEVAGGTVAQVGIGIGGLSVGECVKMRERERTRSREARKAAAAAAAERSRGVLDSGGDGDSAAVGAGSGNGWAQVASRKRPTAAPPEAAFVFGEVGGGDKGRTLVLRSGVGLGGKVKGKAGAAGSGSESRSEGGWKPFPAGFAEDVVDDWEEEVEKEEKGQLGVSENGAVGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.25
4 0.26
5 0.24
6 0.2
7 0.23
8 0.27
9 0.29
10 0.28
11 0.26
12 0.23
13 0.26
14 0.32
15 0.32
16 0.26
17 0.26
18 0.31
19 0.31
20 0.35
21 0.37
22 0.41
23 0.42
24 0.51
25 0.57
26 0.59
27 0.67
28 0.7
29 0.68
30 0.69
31 0.68
32 0.63
33 0.58
34 0.5
35 0.41
36 0.35
37 0.31
38 0.23
39 0.23
40 0.22
41 0.25
42 0.29
43 0.32
44 0.31
45 0.33
46 0.32
47 0.34
48 0.35
49 0.38
50 0.43
51 0.41
52 0.47
53 0.46
54 0.45
55 0.43
56 0.4
57 0.38
58 0.33
59 0.33
60 0.31
61 0.31
62 0.3
63 0.28
64 0.32
65 0.27
66 0.24
67 0.22
68 0.17
69 0.19
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.29
74 0.36
75 0.37
76 0.4
77 0.42
78 0.43
79 0.46
80 0.49
81 0.49
82 0.52
83 0.56
84 0.57
85 0.53
86 0.47
87 0.43
88 0.35
89 0.31
90 0.23
91 0.22
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.17
98 0.19
99 0.15
100 0.17
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.28
105 0.28
106 0.27
107 0.28
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.16
131 0.17
132 0.15
133 0.15
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.2
149 0.25
150 0.29
151 0.36
152 0.44
153 0.49
154 0.57
155 0.65
156 0.71
157 0.71
158 0.76
159 0.79
160 0.82
161 0.86
162 0.87
163 0.86
164 0.87
165 0.91
166 0.92
167 0.9
168 0.86
169 0.84
170 0.75
171 0.73
172 0.69
173 0.61
174 0.54
175 0.45
176 0.41
177 0.37
178 0.36
179 0.28
180 0.23
181 0.21
182 0.19
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.19
197 0.28
198 0.33
199 0.33
200 0.35
201 0.39
202 0.45
203 0.47
204 0.46
205 0.41
206 0.4
207 0.46
208 0.48
209 0.43
210 0.38
211 0.37
212 0.37
213 0.35
214 0.32
215 0.31
216 0.29
217 0.31
218 0.37
219 0.36
220 0.34
221 0.37
222 0.44
223 0.45
224 0.45
225 0.45
226 0.42
227 0.41
228 0.42
229 0.42
230 0.35
231 0.32
232 0.32
233 0.34
234 0.37
235 0.36
236 0.38
237 0.37
238 0.42
239 0.44
240 0.43
241 0.47
242 0.44
243 0.46
244 0.43
245 0.48
246 0.46
247 0.48
248 0.51
249 0.48
250 0.54
251 0.59
252 0.61
253 0.6
254 0.6
255 0.53
256 0.5
257 0.48
258 0.4
259 0.32
260 0.28
261 0.22
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.2
268 0.22
269 0.24
270 0.32
271 0.37
272 0.45
273 0.46
274 0.45
275 0.46
276 0.43
277 0.43
278 0.39
279 0.41
280 0.33
281 0.34
282 0.34
283 0.35
284 0.34
285 0.34
286 0.34
287 0.34
288 0.38
289 0.41
290 0.48
291 0.49
292 0.53
293 0.61
294 0.64
295 0.65
296 0.66
297 0.66
298 0.66
299 0.63
300 0.65
301 0.57
302 0.5
303 0.41
304 0.35
305 0.28
306 0.22
307 0.21
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.23
314 0.3
315 0.35
316 0.38
317 0.41
318 0.4
319 0.42
320 0.43
321 0.42
322 0.35
323 0.32
324 0.27
325 0.21
326 0.2
327 0.16
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.14
335 0.16
336 0.16
337 0.21
338 0.24
339 0.26
340 0.35
341 0.4
342 0.43
343 0.5
344 0.55
345 0.55
346 0.53
347 0.54
348 0.52
349 0.49
350 0.49
351 0.42
352 0.43
353 0.39
354 0.37
355 0.35
356 0.31
357 0.29
358 0.3
359 0.3
360 0.25
361 0.22
362 0.24
363 0.23
364 0.21
365 0.2
366 0.15
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.05
376 0.07
377 0.08
378 0.11
379 0.13
380 0.13
381 0.18
382 0.19
383 0.2
384 0.21
385 0.2
386 0.17
387 0.22
388 0.24
389 0.26
390 0.3
391 0.36
392 0.4
393 0.47
394 0.57
395 0.55
396 0.62
397 0.62
398 0.62
399 0.64
400 0.66
401 0.64
402 0.59
403 0.55
404 0.46
405 0.4
406 0.35
407 0.26
408 0.22
409 0.17
410 0.14
411 0.15
412 0.19
413 0.19
414 0.2
415 0.21
416 0.18
417 0.18
418 0.19
419 0.18
420 0.15
421 0.16
422 0.18
423 0.2
424 0.2
425 0.19
426 0.19
427 0.21
428 0.2
429 0.19
430 0.15
431 0.12
432 0.14
433 0.16
434 0.16
435 0.15
436 0.18
437 0.19
438 0.28
439 0.34
440 0.38
441 0.37
442 0.38
443 0.4
444 0.37
445 0.4
446 0.38
447 0.33
448 0.33
449 0.39
450 0.43
451 0.43
452 0.44
453 0.4
454 0.36
455 0.35
456 0.32
457 0.28
458 0.22
459 0.19
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.21
464 0.18
465 0.2
466 0.18
467 0.19
468 0.2
469 0.21
470 0.2
471 0.24
472 0.31
473 0.33
474 0.36
475 0.37
476 0.36
477 0.36
478 0.31
479 0.26
480 0.23
481 0.27
482 0.25
483 0.25
484 0.28
485 0.3
486 0.3
487 0.29
488 0.24
489 0.15
490 0.18
491 0.19
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.2
496 0.2
497 0.2
498 0.18
499 0.23
500 0.23
501 0.29
502 0.29
503 0.34
504 0.41
505 0.45
506 0.47
507 0.4
508 0.4
509 0.34
510 0.36
511 0.29
512 0.27
513 0.26
514 0.26
515 0.24
516 0.26
517 0.27
518 0.26
519 0.3
520 0.26
521 0.26
522 0.3
523 0.36
524 0.38
525 0.41
526 0.45
527 0.5
528 0.58
529 0.61
530 0.57
531 0.57
532 0.59
533 0.57
534 0.59
535 0.58
536 0.59
537 0.62
538 0.65
539 0.6
540 0.56
541 0.56
542 0.5
543 0.41
544 0.32
545 0.23
546 0.17
547 0.19
548 0.17
549 0.14
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.08
556 0.09
557 0.13
558 0.14
559 0.23
560 0.29
561 0.32
562 0.37
563 0.42
564 0.43
565 0.45
566 0.49
567 0.4
568 0.39
569 0.46
570 0.48
571 0.44
572 0.42
573 0.36
574 0.34
575 0.35
576 0.34
577 0.27
578 0.21
579 0.22
580 0.22
581 0.23
582 0.22
583 0.21
584 0.18
585 0.16
586 0.16
587 0.14
588 0.15
589 0.13
590 0.13
591 0.11
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.14
596 0.19
597 0.23
598 0.22
599 0.24
600 0.24
601 0.24
602 0.21
603 0.21
604 0.2
605 0.2
606 0.2
607 0.25
608 0.29
609 0.29
610 0.31
611 0.28
612 0.33
613 0.36
614 0.41
615 0.38
616 0.36
617 0.37
618 0.44
619 0.51
620 0.48
621 0.45
622 0.44
623 0.48
624 0.55
625 0.59
626 0.57
627 0.51
628 0.45
629 0.41
630 0.38
631 0.35
632 0.29
633 0.3
634 0.27
635 0.28
636 0.27
637 0.27
638 0.24
639 0.23
640 0.26
641 0.28
642 0.35
643 0.4
644 0.44
645 0.47
646 0.5
647 0.5
648 0.45
649 0.45
650 0.41
651 0.41
652 0.47
653 0.54
654 0.57
655 0.59
656 0.62
657 0.56
658 0.53
659 0.49
660 0.46
661 0.4
662 0.37
663 0.37
664 0.33
665 0.3
666 0.28
667 0.25
668 0.22
669 0.24
670 0.29
671 0.26
672 0.31
673 0.31
674 0.31
675 0.34
676 0.38
677 0.37
678 0.37
679 0.41
680 0.38
681 0.46
682 0.51
683 0.56
684 0.52
685 0.54
686 0.47
687 0.49
688 0.49
689 0.47
690 0.4
691 0.32
692 0.31
693 0.29
694 0.29
695 0.25
696 0.24
697 0.18
698 0.22
699 0.22
700 0.22
701 0.24
702 0.33
703 0.38
704 0.4
705 0.47
706 0.52
707 0.61
708 0.68
709 0.66
710 0.62
711 0.62
712 0.65
713 0.65
714 0.6
715 0.57
716 0.5
717 0.54
718 0.48
719 0.44
720 0.43
721 0.41
722 0.4
723 0.38
724 0.37
725 0.35
726 0.39
727 0.41
728 0.37
729 0.31
730 0.3
731 0.28
732 0.29
733 0.27
734 0.25
735 0.22
736 0.22
737 0.23
738 0.23
739 0.25
740 0.27
741 0.33
742 0.42
743 0.51
744 0.58
745 0.65
746 0.72
747 0.75
748 0.76
749 0.74
750 0.75
751 0.75
752 0.75
753 0.76
754 0.76
755 0.76
756 0.75
757 0.7
758 0.66
759 0.6
760 0.56
761 0.55
762 0.5
763 0.43
764 0.4
765 0.37
766 0.32
767 0.3
768 0.26
769 0.18
770 0.16
771 0.18
772 0.19
773 0.19
774 0.21
775 0.24
776 0.31
777 0.34
778 0.37
779 0.38
780 0.41
781 0.41
782 0.39
783 0.36
784 0.3
785 0.29
786 0.28
787 0.23
788 0.2
789 0.17
790 0.17
791 0.14
792 0.12
793 0.1
794 0.08
795 0.08
796 0.07
797 0.08
798 0.08
799 0.09
800 0.1
801 0.09
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.07
807 0.06
808 0.05
809 0.05
810 0.06
811 0.07
812 0.08
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.11
817 0.12
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.09
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.06
829 0.07
830 0.07
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.1
835 0.11
836 0.12
837 0.12
838 0.13
839 0.12
840 0.12
841 0.13
842 0.12
843 0.14
844 0.18
845 0.2
846 0.21
847 0.29
848 0.33
849 0.34
850 0.39
851 0.44
852 0.48
853 0.56
854 0.58
855 0.6
856 0.66
857 0.7
858 0.69
859 0.64
860 0.63
861 0.57
862 0.56
863 0.48
864 0.39
865 0.34
866 0.29
867 0.26
868 0.2
869 0.16
870 0.12
871 0.1
872 0.09
873 0.07
874 0.07
875 0.09
876 0.08
877 0.09
878 0.11
879 0.15
880 0.16
881 0.18
882 0.22
883 0.22
884 0.23
885 0.23
886 0.22
887 0.22
888 0.29
889 0.28
890 0.25
891 0.31
892 0.3
893 0.33
894 0.35
895 0.35
896 0.28
897 0.31
898 0.32
899 0.25
900 0.25
901 0.2
902 0.17
903 0.16
904 0.15
905 0.1
906 0.09
907 0.07
908 0.06
909 0.06
910 0.05
911 0.03
912 0.03
913 0.03
914 0.03
915 0.03
916 0.03
917 0.02
918 0.02
919 0.02
920 0.02
921 0.03
922 0.03
923 0.04
924 0.05
925 0.07
926 0.14
927 0.22
928 0.25
929 0.35
930 0.42
931 0.52
932 0.62
933 0.68
934 0.71
935 0.75
936 0.8
937 0.79
938 0.76
939 0.73
940 0.67
941 0.61
942 0.53
943 0.46
944 0.39
945 0.31
946 0.32
947 0.26
948 0.22
949 0.2
950 0.19
951 0.16
952 0.15
953 0.15
954 0.1
955 0.1
956 0.12
957 0.13
958 0.13
959 0.12
960 0.11
961 0.1
962 0.08
963 0.07
964 0.05
965 0.03
966 0.03
967 0.03
968 0.03
969 0.03
970 0.04
971 0.04
972 0.04
973 0.04
974 0.05
975 0.06
976 0.13
977 0.19
978 0.26
979 0.33
980 0.36
981 0.38
982 0.43
983 0.49
984 0.52
985 0.54
986 0.54
987 0.48
988 0.5
989 0.48
990 0.44
991 0.37
992 0.27
993 0.21
994 0.13
995 0.12
996 0.07
997 0.08
998 0.07
999 0.08
1000 0.07
1001 0.07
1002 0.07
1003 0.09
1004 0.1
1005 0.11
1006 0.15
1007 0.18
1008 0.2
1009 0.2
1010 0.21
1011 0.21
1012 0.21
1013 0.19
1014 0.16
1015 0.17
1016 0.19
1017 0.19
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.19
1021 0.21
1022 0.21
1023 0.2
1024 0.19
1025 0.2
1026 0.22
1027 0.23
1028 0.23
1029 0.21
1030 0.2
1031 0.16
1032 0.16
1033 0.18
1034 0.2
1035 0.25
1036 0.3
1037 0.3
1038 0.34
1039 0.34
1040 0.35
1041 0.34
1042 0.32
1043 0.26
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.18
1047 0.17
1048 0.18
1049 0.15
1050 0.11
1051 0.1
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.12
1056 0.12
1057 0.12
1058 0.13
1059 0.16
1060 0.16
1061 0.16
1062 0.18
1063 0.16
1064 0.18
1065 0.2
1066 0.2
1067 0.19