Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QVD3

Protein Details
Accession A6QVD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
455-474LEKERERETRRGMKKSVKRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-122RRKAKK
413-474RKLRRAHDEEKNEERKALVEKTKKEERDRLLRGMSAEEQRKYLEKERERETRRGMKKSVKRG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG aje:HCAG_01340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSGLLQNIFKGDPNAPSTAPSSGDDADPDFAEFASGNPEPLPPVIHPASASTPGAAGTPQSATGGALPAAADHARPYTAWYRIWERHSRQDFVQEAFVIPFIACLLLLHVWGMGKNRRKAKKWAQAHLPILQSEFAVVGYGGVGARRAPSADNVQAEGLPAAAASADLVVPESVLKEKTGTEFATYATGRQNVAFLDVSINLFRWYNPLYMLGDSVISMFLDSWPVPVERVQCTAYAFDGKERDLVPAPSVVEKELIEQRTKGANNSSYDGFVFAVVHKNCMRRLREDRYDISLTFTKDNPKLPEWATVMSESAEITELMLTTDLIKAIEEAGEDFEYLIITDQPLDKPTKIDETTPGKRINLSLCLPKSNSYSSTLPIFTYFLRLTDRVVSTAHFRAEVVRKLRNTRDEEVRKLRRAHDEEKNEERKALVEKTKKEERDRLLRGMSAEEQRKYLEKERERETRRGMKKSVKRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.27
4 0.28
5 0.27
6 0.26
7 0.22
8 0.23
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.13
17 0.11
18 0.12
19 0.1
20 0.08
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.18
29 0.12
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.21
34 0.22
35 0.25
36 0.26
37 0.25
38 0.18
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.13
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.15
64 0.18
65 0.22
66 0.24
67 0.28
68 0.35
69 0.4
70 0.48
71 0.52
72 0.52
73 0.59
74 0.63
75 0.61
76 0.55
77 0.57
78 0.53
79 0.46
80 0.43
81 0.33
82 0.28
83 0.25
84 0.24
85 0.15
86 0.12
87 0.1
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.04
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.14
100 0.19
101 0.27
102 0.34
103 0.44
104 0.52
105 0.57
106 0.66
107 0.72
108 0.75
109 0.76
110 0.77
111 0.77
112 0.77
113 0.76
114 0.71
115 0.62
116 0.51
117 0.43
118 0.35
119 0.25
120 0.17
121 0.13
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.1
137 0.15
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.15
145 0.1
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.02
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.1
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.21
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.22
252 0.23
253 0.26
254 0.24
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.14
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.14
263 0.13
264 0.17
265 0.19
266 0.21
267 0.25
268 0.32
269 0.34
270 0.34
271 0.43
272 0.48
273 0.53
274 0.56
275 0.54
276 0.53
277 0.53
278 0.45
279 0.41
280 0.36
281 0.3
282 0.27
283 0.26
284 0.26
285 0.26
286 0.31
287 0.3
288 0.29
289 0.31
290 0.3
291 0.34
292 0.3
293 0.29
294 0.26
295 0.22
296 0.21
297 0.17
298 0.16
299 0.1
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.24
338 0.24
339 0.25
340 0.3
341 0.36
342 0.41
343 0.45
344 0.46
345 0.39
346 0.39
347 0.4
348 0.36
349 0.33
350 0.3
351 0.33
352 0.32
353 0.36
354 0.36
355 0.36
356 0.36
357 0.34
358 0.32
359 0.29
360 0.29
361 0.27
362 0.3
363 0.27
364 0.24
365 0.22
366 0.22
367 0.16
368 0.2
369 0.18
370 0.16
371 0.19
372 0.19
373 0.2
374 0.25
375 0.26
376 0.22
377 0.22
378 0.22
379 0.23
380 0.26
381 0.25
382 0.19
383 0.18
384 0.24
385 0.3
386 0.36
387 0.36
388 0.4
389 0.44
390 0.5
391 0.58
392 0.6
393 0.6
394 0.59
395 0.65
396 0.65
397 0.7
398 0.73
399 0.75
400 0.73
401 0.71
402 0.71
403 0.71
404 0.71
405 0.7
406 0.69
407 0.69
408 0.7
409 0.75
410 0.77
411 0.67
412 0.6
413 0.53
414 0.46
415 0.42
416 0.43
417 0.42
418 0.43
419 0.49
420 0.56
421 0.65
422 0.69
423 0.72
424 0.73
425 0.72
426 0.74
427 0.73
428 0.72
429 0.66
430 0.61
431 0.54
432 0.5
433 0.47
434 0.45
435 0.46
436 0.4
437 0.38
438 0.38
439 0.42
440 0.43
441 0.47
442 0.48
443 0.5
444 0.56
445 0.63
446 0.71
447 0.73
448 0.75
449 0.76
450 0.76
451 0.76
452 0.77
453 0.77
454 0.77