Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RD16

Protein Details
Accession A6RD16    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
694-713GYRSRYKSVVHEKVRKHGRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-390KPPSKRRRLSTPPSGPASRRPRFRIPRAA
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG aje:HCAG_07524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MPASHQPPYPIPSASQSLHTAPAPSISPQTLSHPLPPRPPPSSRPLQVPPSPPFKDQHEVQSRAGDTRPNDFDEFFAGLDSLRVPIPSDAAVERSSRYLQDERHGSHGFPDGDEDRGQEKDDESLPVPSPAVECGLVGSTGTKALPGDGSSTLVLDPTPHAGFLEPGSGQDTSHRQEWPRSSSDDPLPFNPPITVDSDDSATDRSAVDSTFTSPAKRDTSSRATSISHSPKADGGSNEAGTGIAGVRSTLLKRQRRRGPGTGAMHPMVAVEVPVIADRLEEGISSSMRYENGLSSRPRTRQQETRARSRREVPDTQDCKLPGKSVQCVEDDTTMSDTGGSSAHSDDTDDDYRASSEEDGSMKPPSKRRRLSTPPSGPASRRPRFRIPRAAAAAGREGDEREDCRVRTTTAKDRSTNPGNRNHGPDTYAHSRPPIDYETRSCPLPLLARGEAVMLSSRVAQVVFEMFMGRPMTASDLAGETTAAADTERDYSEREVEGLGGKRRRWTREEDDRLMTLKQDGFSWPEIEERFPHRQLGSLRQRWYTKLQNTHASNPPTNKRRQEWNCRASAGEPLPTSKPPTPVETSLGYLGGQPQPADDRATPNAKPRTPSPSSTVTAMCPVCNSVVEVEASSAFNAANNRMQVREQLRFCENHRKETARREWSRLRYPIIAWDRLDDRLTQFHPRLRRILDGSGYRSRYKSVVHEKVRKHGRKILSRSVLHSTGYYGLRGHEILSAHVVSHFKDAIHSLAGIDSVASKYGTVVYAQEVLVPELLEMLVQEDMRVDAKVARRILKESNEIGNLLNLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.32
4 0.31
5 0.33
6 0.31
7 0.28
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.2
12 0.22
13 0.2
14 0.22
15 0.21
16 0.27
17 0.32
18 0.32
19 0.39
20 0.43
21 0.47
22 0.53
23 0.59
24 0.6
25 0.59
26 0.63
27 0.6
28 0.61
29 0.66
30 0.62
31 0.62
32 0.62
33 0.64
34 0.65
35 0.67
36 0.65
37 0.64
38 0.64
39 0.59
40 0.55
41 0.53
42 0.53
43 0.49
44 0.54
45 0.54
46 0.55
47 0.54
48 0.57
49 0.51
50 0.47
51 0.45
52 0.4
53 0.32
54 0.35
55 0.37
56 0.35
57 0.35
58 0.33
59 0.32
60 0.3
61 0.29
62 0.21
63 0.18
64 0.13
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.23
85 0.26
86 0.28
87 0.35
88 0.41
89 0.4
90 0.46
91 0.46
92 0.4
93 0.38
94 0.42
95 0.35
96 0.27
97 0.3
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.19
103 0.19
104 0.21
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.21
113 0.2
114 0.2
115 0.17
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.14
152 0.09
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.15
158 0.19
159 0.19
160 0.23
161 0.26
162 0.26
163 0.33
164 0.39
165 0.41
166 0.4
167 0.41
168 0.4
169 0.43
170 0.48
171 0.47
172 0.44
173 0.41
174 0.41
175 0.37
176 0.35
177 0.3
178 0.24
179 0.19
180 0.2
181 0.2
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.21
202 0.23
203 0.24
204 0.24
205 0.27
206 0.35
207 0.37
208 0.38
209 0.36
210 0.34
211 0.35
212 0.41
213 0.41
214 0.38
215 0.35
216 0.34
217 0.33
218 0.34
219 0.34
220 0.26
221 0.24
222 0.22
223 0.22
224 0.21
225 0.19
226 0.16
227 0.13
228 0.12
229 0.07
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.13
237 0.22
238 0.31
239 0.38
240 0.48
241 0.57
242 0.65
243 0.72
244 0.73
245 0.71
246 0.72
247 0.69
248 0.64
249 0.59
250 0.5
251 0.42
252 0.35
253 0.27
254 0.18
255 0.13
256 0.08
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.17
280 0.18
281 0.21
282 0.28
283 0.31
284 0.37
285 0.41
286 0.45
287 0.49
288 0.57
289 0.62
290 0.62
291 0.69
292 0.72
293 0.7
294 0.68
295 0.67
296 0.66
297 0.63
298 0.62
299 0.57
300 0.59
301 0.57
302 0.55
303 0.51
304 0.43
305 0.39
306 0.35
307 0.3
308 0.23
309 0.24
310 0.26
311 0.25
312 0.26
313 0.24
314 0.25
315 0.24
316 0.22
317 0.19
318 0.16
319 0.15
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.07
342 0.06
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.12
348 0.15
349 0.18
350 0.26
351 0.33
352 0.41
353 0.48
354 0.51
355 0.59
356 0.65
357 0.7
358 0.73
359 0.72
360 0.67
361 0.65
362 0.62
363 0.53
364 0.53
365 0.56
366 0.5
367 0.48
368 0.49
369 0.55
370 0.61
371 0.67
372 0.68
373 0.62
374 0.64
375 0.61
376 0.57
377 0.48
378 0.4
379 0.35
380 0.24
381 0.21
382 0.14
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.14
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.2
394 0.25
395 0.31
396 0.37
397 0.42
398 0.41
399 0.43
400 0.49
401 0.53
402 0.54
403 0.5
404 0.49
405 0.51
406 0.51
407 0.53
408 0.48
409 0.4
410 0.34
411 0.3
412 0.29
413 0.29
414 0.28
415 0.23
416 0.23
417 0.23
418 0.22
419 0.24
420 0.2
421 0.17
422 0.18
423 0.21
424 0.26
425 0.26
426 0.26
427 0.23
428 0.2
429 0.19
430 0.19
431 0.18
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.13
438 0.11
439 0.09
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.05
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.04
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.13
484 0.15
485 0.2
486 0.23
487 0.23
488 0.3
489 0.35
490 0.39
491 0.39
492 0.44
493 0.47
494 0.55
495 0.62
496 0.6
497 0.58
498 0.54
499 0.52
500 0.44
501 0.35
502 0.26
503 0.19
504 0.15
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.15
509 0.16
510 0.14
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.18
515 0.21
516 0.26
517 0.26
518 0.28
519 0.25
520 0.29
521 0.31
522 0.39
523 0.43
524 0.44
525 0.46
526 0.49
527 0.5
528 0.49
529 0.52
530 0.51
531 0.48
532 0.5
533 0.52
534 0.55
535 0.57
536 0.6
537 0.61
538 0.57
539 0.53
540 0.51
541 0.56
542 0.54
543 0.58
544 0.58
545 0.56
546 0.61
547 0.67
548 0.72
549 0.73
550 0.73
551 0.69
552 0.63
553 0.59
554 0.49
555 0.47
556 0.37
557 0.3
558 0.24
559 0.23
560 0.25
561 0.25
562 0.3
563 0.26
564 0.3
565 0.27
566 0.32
567 0.34
568 0.34
569 0.36
570 0.32
571 0.31
572 0.26
573 0.24
574 0.19
575 0.15
576 0.16
577 0.14
578 0.13
579 0.11
580 0.11
581 0.14
582 0.15
583 0.18
584 0.16
585 0.18
586 0.22
587 0.27
588 0.28
589 0.35
590 0.41
591 0.4
592 0.42
593 0.41
594 0.45
595 0.45
596 0.47
597 0.43
598 0.41
599 0.41
600 0.4
601 0.38
602 0.3
603 0.32
604 0.29
605 0.24
606 0.18
607 0.18
608 0.15
609 0.15
610 0.14
611 0.09
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.1
617 0.1
618 0.09
619 0.09
620 0.07
621 0.09
622 0.1
623 0.12
624 0.15
625 0.17
626 0.18
627 0.19
628 0.2
629 0.25
630 0.3
631 0.35
632 0.33
633 0.36
634 0.38
635 0.4
636 0.44
637 0.48
638 0.45
639 0.46
640 0.5
641 0.52
642 0.53
643 0.61
644 0.67
645 0.66
646 0.68
647 0.68
648 0.71
649 0.73
650 0.77
651 0.72
652 0.66
653 0.58
654 0.54
655 0.56
656 0.53
657 0.49
658 0.4
659 0.39
660 0.36
661 0.35
662 0.36
663 0.27
664 0.24
665 0.25
666 0.27
667 0.31
668 0.34
669 0.37
670 0.44
671 0.47
672 0.51
673 0.47
674 0.51
675 0.47
676 0.49
677 0.5
678 0.47
679 0.49
680 0.5
681 0.51
682 0.47
683 0.44
684 0.41
685 0.37
686 0.35
687 0.39
688 0.42
689 0.48
690 0.55
691 0.63
692 0.65
693 0.73
694 0.8
695 0.78
696 0.74
697 0.72
698 0.72
699 0.73
700 0.78
701 0.78
702 0.76
703 0.71
704 0.69
705 0.68
706 0.6
707 0.5
708 0.42
709 0.34
710 0.3
711 0.28
712 0.25
713 0.19
714 0.18
715 0.19
716 0.19
717 0.18
718 0.15
719 0.15
720 0.15
721 0.18
722 0.17
723 0.15
724 0.18
725 0.18
726 0.16
727 0.19
728 0.19
729 0.15
730 0.17
731 0.18
732 0.18
733 0.18
734 0.17
735 0.13
736 0.12
737 0.13
738 0.1
739 0.09
740 0.08
741 0.07
742 0.08
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.1
747 0.11
748 0.1
749 0.1
750 0.12
751 0.14
752 0.14
753 0.16
754 0.15
755 0.16
756 0.16
757 0.15
758 0.12
759 0.1
760 0.1
761 0.07
762 0.06
763 0.07
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.09
769 0.11
770 0.11
771 0.1
772 0.14
773 0.2
774 0.28
775 0.32
776 0.38
777 0.4
778 0.44
779 0.51
780 0.53
781 0.53
782 0.51
783 0.52
784 0.48
785 0.46
786 0.42