FuNGI

A6QXQ7

Protein Details

Accession

A6QXQ7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
543-571	LEQLWRWVQRWKRREPPWGERHGRPPDKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
552-581	RWKRREPPWGERHGRPPDKKILKWHTGLRK

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto 7, nucl 6, cyto_pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
KEGG	aje:HCAG_02164 -
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MELLQAEREASNDTISVEDMESLIQRLPNRKAPGRSGITNEFLKMLGRTFVEAITALTNACWHWETYPDTFKEAKTVALRKPGKADYQTAGAWRPIALLDTIGKIVEAATAKRLRKIAEDHNLLPSQQMGARRGRSTETAIAQLLAQIRTVWQHPGQVASVLSLDMTGAYDKVLRERMVHILRRLGIPRDLVGWVASFMTNRKSTIAFEGKESDTFDIPAGIPQGSPLSPILFLFYNEELVRICSRPGRPVVCIAFVDDVNVMAYGQSTEDNCRELLRMHRACEEWAARHGAVFAPQKYELMHFTRARNQFNLQAELRLPGQTIQPKQVMRVLGVWLDSRLRWKGHLDAVAGKMKTQVRALSQTTQSTWGLPLRQARMVYNMVIRPALTYGAIAWHQPQGQGGTGPAKSGLALKLTTVQNSCLRIVAGAYKRTPTSTLEAETHTVPLDIHLDGLVAKAVNRMKASGMAQQIENACAAIRTRLRHRGVTRGAQRHMGAVVHPAALPVDWEQQWIQGAKERATAEMTPEQRANLDQASYNHWLKLEQLWRWVQRWKRREPPWGERHGRPPDKKILKWHTGLRKARSTIIIQLRSGKTGLAAFLNRYFKKY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.14
4	0.11
5	0.11
6	0.1
7	0.1
8	0.1
9	0.1
10	0.12
11	0.13
12	0.18
13	0.25
14	0.31
15	0.39
16	0.46
17	0.53
18	0.57
19	0.61
20	0.66
21	0.65
22	0.63
23	0.62
24	0.59
25	0.57
26	0.52
27	0.46
28	0.37
29	0.31
30	0.28
31	0.22
32	0.18
33	0.16
34	0.15
35	0.16
36	0.16
37	0.16
38	0.15
39	0.14
40	0.14
41	0.12
42	0.11
43	0.09
44	0.08
45	0.09
46	0.08
47	0.11
48	0.11
49	0.1
50	0.11
51	0.16
52	0.21
53	0.26
54	0.34
55	0.32
56	0.35
57	0.37
58	0.36
59	0.37
60	0.33
61	0.32
62	0.33
63	0.38
64	0.38
65	0.46
66	0.5
67	0.47
68	0.53
69	0.52
70	0.52
71	0.49
72	0.49
73	0.41
74	0.42
75	0.41
76	0.36
77	0.34
78	0.28
79	0.24
80	0.19
81	0.17
82	0.13
83	0.13
84	0.11
85	0.1
86	0.1
87	0.11
88	0.11
89	0.1
90	0.1
91	0.09
92	0.08
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.17
97	0.24
98	0.26
99	0.3
100	0.32
101	0.31
102	0.35
103	0.4
104	0.43
105	0.46
106	0.51
107	0.48
108	0.51
109	0.51
110	0.45
111	0.39
112	0.3
113	0.21
114	0.18
115	0.21
116	0.19
117	0.24
118	0.29
119	0.3
120	0.31
121	0.32
122	0.32
123	0.33
124	0.34
125	0.3
126	0.28
127	0.27
128	0.25
129	0.22
130	0.22
131	0.2
132	0.15
133	0.13
134	0.1
135	0.11
136	0.12
137	0.14
138	0.15
139	0.14
140	0.17
141	0.17
142	0.19
143	0.19
144	0.18
145	0.17
146	0.14
147	0.13
148	0.1
149	0.09
150	0.07
151	0.06
152	0.04
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.07
158	0.07
159	0.11
160	0.14
161	0.14
162	0.16
163	0.18
164	0.26
165	0.31
166	0.36
167	0.35
168	0.35
169	0.36
170	0.38
171	0.38
172	0.33
173	0.28
174	0.24
175	0.23
176	0.2
177	0.19
178	0.16
179	0.14
180	0.11
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.08
186	0.12
187	0.13
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.23
193	0.28
194	0.24
195	0.25
196	0.28
197	0.28
198	0.28
199	0.28
200	0.22
201	0.16
202	0.16
203	0.14
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.08
220	0.09
221	0.11
222	0.1
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.16
233	0.2
234	0.24
235	0.25
236	0.24
237	0.29
238	0.3
239	0.27
240	0.26
241	0.22
242	0.19
243	0.16
244	0.16
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.16
264	0.23
265	0.25
266	0.26
267	0.28
268	0.28
269	0.28
270	0.31
271	0.27
272	0.19
273	0.18
274	0.19
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.12
279	0.15
280	0.17
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.17
287	0.15
288	0.15
289	0.21
290	0.21
291	0.23
292	0.31
293	0.35
294	0.36
295	0.35
296	0.34
297	0.33
298	0.33
299	0.35
300	0.27
301	0.24
302	0.22
303	0.21
304	0.2
305	0.14
306	0.12
307	0.09
308	0.12
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.23
313	0.23
314	0.24
315	0.26
316	0.23
317	0.19
318	0.19
319	0.16
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.11
327	0.13
328	0.13
329	0.14
330	0.15
331	0.18
332	0.21
333	0.24
334	0.22
335	0.23
336	0.25
337	0.28
338	0.26
339	0.23
340	0.24
341	0.23
342	0.23
343	0.22
344	0.2
345	0.18
346	0.24
347	0.26
348	0.26
349	0.27
350	0.26
351	0.26
352	0.27
353	0.24
354	0.2
355	0.19
356	0.16
357	0.15
358	0.17
359	0.2
360	0.2
361	0.22
362	0.23
363	0.22
364	0.24
365	0.24
366	0.22
367	0.21
368	0.2
369	0.18
370	0.17
371	0.16
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.16
402	0.17
403	0.19
404	0.18
405	0.2
406	0.22
407	0.25
408	0.25
409	0.19
410	0.18
411	0.16
412	0.16
413	0.2
414	0.2
415	0.22
416	0.23
417	0.24
418	0.25
419	0.26
420	0.27
421	0.22
422	0.22
423	0.21
424	0.23
425	0.23
426	0.24
427	0.25
428	0.24
429	0.21
430	0.17
431	0.14
432	0.11
433	0.1
434	0.1
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.1
445	0.12
446	0.15
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.2
451	0.22
452	0.23
453	0.25
454	0.23
455	0.23
456	0.25
457	0.25
458	0.22
459	0.2
460	0.14
461	0.11
462	0.1
463	0.1
464	0.13
465	0.16
466	0.2
467	0.27
468	0.37
469	0.41
470	0.48
471	0.51
472	0.55
473	0.58
474	0.63
475	0.65
476	0.64
477	0.62
478	0.59
479	0.56
480	0.48
481	0.42
482	0.33
483	0.24
484	0.2
485	0.19
486	0.15
487	0.15
488	0.13
489	0.12
490	0.11
491	0.12
492	0.1
493	0.14
494	0.13
495	0.15
496	0.15
497	0.17
498	0.2
499	0.2
500	0.19
501	0.2
502	0.23
503	0.22
504	0.27
505	0.26
506	0.24
507	0.27
508	0.26
509	0.26
510	0.3
511	0.31
512	0.29
513	0.3
514	0.29
515	0.26
516	0.27
517	0.25
518	0.19
519	0.19
520	0.19
521	0.2
522	0.25
523	0.3
524	0.31
525	0.28
526	0.27
527	0.26
528	0.24
529	0.3
530	0.32
531	0.28
532	0.34
533	0.41
534	0.45
535	0.49
536	0.55
537	0.56
538	0.59
539	0.65
540	0.68
541	0.71
542	0.75
543	0.82
544	0.84
545	0.85
546	0.85
547	0.87
548	0.83
549	0.79
550	0.81
551	0.81
552	0.82
553	0.77
554	0.74
555	0.75
556	0.77
557	0.75
558	0.76
559	0.75
560	0.73
561	0.73
562	0.75
563	0.74
564	0.75
565	0.79
566	0.76
567	0.75
568	0.7
569	0.69
570	0.64
571	0.57
572	0.56
573	0.58
574	0.54
575	0.47
576	0.54
577	0.5
578	0.47
579	0.44
580	0.35
581	0.27
582	0.24
583	0.24
584	0.2
585	0.21
586	0.22
587	0.29
588	0.38

A6QXQ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer