Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6R590

Protein Details
Accession A6R590    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
510-531SDYKKFEKARELKKHIDRIRKDBasic
609-633DPQVFKNLKIFKKPPKREGDEIFDRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-201ERAGKEAKAIRKQESAEIAAKKKTPAKATTTDKRGKGRKA
220-244RKVPAKKTSKAVKAEPADTKKTKAK
516-535EKARELKKHIDRIRKDYKKG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
KEGG aje:HCAG_04798  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MNSSDDDVPLVGKRKSNGHSKATFALSDELISKSTDPSVSASPKVNGYANPGLTIRHGPVDPQDAEMHDAEVNGAGLSKRKSRGSDMIRKSYAEPESSEEDKPLSKRRRVSAQQKMDDSDPDDAPIISKLAKGKAKAVTVSQSATDGSLGKDLMAEKSRIEERAGKEAKAIRKQESAEIAAKKKTPAKATTTDKRGKGRKALVNGIKISESSDEDIPLARKVPAKKTSKAVKAEPADTKKTKAKAAVKNESSEELEAEDAEEEYRWWEDPAKGDGTIKWTTLEHNGVIFPPPYEPLPKHVKMKYDGIPITLAPEAEEVAGFFGSMLNSTHNVENPTFQKNFFTDFTAYIKNSGGAKDPNGNPVAVKSFEKCDFKPIFEYYEAARLEKKSLPSAEKKRLKAEKDELEAPYMYCMWDGRKQKVGNFRVEPPALFRGRGEHPKTGKVKTRVMPEQITINIGKEAKVPVPPPGHKWKEIKHDQEGTWLAMWQENVNGNYKYVMLAANSDIKGLSDYKKFEKARELKKHIDRIRKDYKKGLKHELMSERQKATAVYLIDQFALRAGNEKGEDEADTVGCCSLKFEHVTLKPPNTVIFDFLGKDSIRFYDEVEVDPQVFKNLKIFKKPPKREGDEIFDRLTTSSGWDNRDSPPQLIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.49
4 0.53
5 0.57
6 0.57
7 0.58
8 0.61
9 0.56
10 0.5
11 0.42
12 0.38
13 0.29
14 0.26
15 0.24
16 0.19
17 0.17
18 0.17
19 0.15
20 0.14
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.23
26 0.26
27 0.29
28 0.31
29 0.31
30 0.32
31 0.34
32 0.33
33 0.27
34 0.31
35 0.34
36 0.31
37 0.31
38 0.29
39 0.27
40 0.27
41 0.29
42 0.23
43 0.21
44 0.2
45 0.19
46 0.23
47 0.3
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.24
52 0.27
53 0.26
54 0.23
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.11
64 0.15
65 0.21
66 0.25
67 0.3
68 0.33
69 0.39
70 0.49
71 0.55
72 0.62
73 0.64
74 0.69
75 0.66
76 0.65
77 0.6
78 0.57
79 0.5
80 0.42
81 0.35
82 0.3
83 0.34
84 0.35
85 0.34
86 0.27
87 0.26
88 0.28
89 0.3
90 0.36
91 0.39
92 0.43
93 0.5
94 0.55
95 0.64
96 0.7
97 0.77
98 0.77
99 0.79
100 0.79
101 0.75
102 0.71
103 0.62
104 0.55
105 0.47
106 0.4
107 0.3
108 0.24
109 0.21
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.13
114 0.09
115 0.12
116 0.14
117 0.2
118 0.24
119 0.25
120 0.3
121 0.34
122 0.37
123 0.36
124 0.36
125 0.34
126 0.32
127 0.32
128 0.26
129 0.21
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.14
144 0.19
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.26
149 0.26
150 0.36
151 0.38
152 0.33
153 0.36
154 0.41
155 0.46
156 0.48
157 0.49
158 0.42
159 0.45
160 0.46
161 0.46
162 0.44
163 0.4
164 0.38
165 0.39
166 0.38
167 0.37
168 0.37
169 0.36
170 0.38
171 0.39
172 0.38
173 0.38
174 0.41
175 0.47
176 0.54
177 0.59
178 0.63
179 0.65
180 0.64
181 0.67
182 0.68
183 0.65
184 0.65
185 0.65
186 0.62
187 0.61
188 0.65
189 0.62
190 0.6
191 0.55
192 0.48
193 0.39
194 0.33
195 0.29
196 0.21
197 0.16
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.16
208 0.2
209 0.28
210 0.35
211 0.4
212 0.43
213 0.51
214 0.58
215 0.61
216 0.62
217 0.57
218 0.56
219 0.54
220 0.55
221 0.54
222 0.5
223 0.5
224 0.46
225 0.47
226 0.45
227 0.44
228 0.42
229 0.43
230 0.47
231 0.48
232 0.56
233 0.61
234 0.58
235 0.57
236 0.55
237 0.49
238 0.41
239 0.32
240 0.23
241 0.14
242 0.12
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.09
255 0.1
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.19
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.17
269 0.17
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.16
283 0.24
284 0.26
285 0.32
286 0.34
287 0.37
288 0.37
289 0.42
290 0.41
291 0.4
292 0.37
293 0.32
294 0.3
295 0.25
296 0.24
297 0.19
298 0.14
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.06
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.15
322 0.19
323 0.18
324 0.18
325 0.19
326 0.18
327 0.21
328 0.18
329 0.19
330 0.16
331 0.17
332 0.19
333 0.2
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.14
343 0.19
344 0.2
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.14
352 0.14
353 0.12
354 0.15
355 0.2
356 0.24
357 0.22
358 0.29
359 0.29
360 0.29
361 0.32
362 0.29
363 0.28
364 0.25
365 0.26
366 0.18
367 0.23
368 0.22
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.2
373 0.21
374 0.22
375 0.2
376 0.23
377 0.28
378 0.35
379 0.43
380 0.5
381 0.55
382 0.56
383 0.61
384 0.65
385 0.63
386 0.61
387 0.61
388 0.57
389 0.54
390 0.55
391 0.47
392 0.42
393 0.39
394 0.31
395 0.23
396 0.17
397 0.12
398 0.08
399 0.08
400 0.1
401 0.16
402 0.21
403 0.24
404 0.31
405 0.33
406 0.37
407 0.47
408 0.48
409 0.49
410 0.48
411 0.48
412 0.47
413 0.46
414 0.42
415 0.35
416 0.37
417 0.3
418 0.27
419 0.23
420 0.22
421 0.27
422 0.36
423 0.36
424 0.37
425 0.39
426 0.47
427 0.51
428 0.53
429 0.56
430 0.53
431 0.56
432 0.54
433 0.6
434 0.57
435 0.57
436 0.53
437 0.46
438 0.43
439 0.36
440 0.34
441 0.26
442 0.21
443 0.19
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.16
448 0.15
449 0.18
450 0.18
451 0.22
452 0.29
453 0.31
454 0.35
455 0.44
456 0.47
457 0.5
458 0.55
459 0.55
460 0.58
461 0.65
462 0.66
463 0.63
464 0.64
465 0.58
466 0.59
467 0.54
468 0.45
469 0.36
470 0.3
471 0.22
472 0.18
473 0.18
474 0.12
475 0.13
476 0.15
477 0.16
478 0.19
479 0.19
480 0.18
481 0.18
482 0.18
483 0.15
484 0.12
485 0.12
486 0.08
487 0.09
488 0.11
489 0.16
490 0.16
491 0.16
492 0.15
493 0.14
494 0.15
495 0.16
496 0.19
497 0.18
498 0.22
499 0.26
500 0.35
501 0.37
502 0.38
503 0.46
504 0.52
505 0.58
506 0.65
507 0.68
508 0.69
509 0.76
510 0.83
511 0.81
512 0.82
513 0.77
514 0.76
515 0.79
516 0.78
517 0.75
518 0.74
519 0.76
520 0.75
521 0.76
522 0.76
523 0.72
524 0.68
525 0.71
526 0.7
527 0.69
528 0.67
529 0.66
530 0.57
531 0.5
532 0.47
533 0.39
534 0.33
535 0.29
536 0.22
537 0.18
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.19
542 0.16
543 0.13
544 0.12
545 0.1
546 0.11
547 0.11
548 0.14
549 0.15
550 0.16
551 0.17
552 0.17
553 0.18
554 0.15
555 0.16
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.14
565 0.17
566 0.18
567 0.26
568 0.29
569 0.37
570 0.42
571 0.45
572 0.43
573 0.42
574 0.43
575 0.39
576 0.37
577 0.32
578 0.27
579 0.25
580 0.23
581 0.23
582 0.24
583 0.19
584 0.19
585 0.18
586 0.17
587 0.18
588 0.16
589 0.18
590 0.21
591 0.22
592 0.24
593 0.25
594 0.24
595 0.23
596 0.24
597 0.23
598 0.2
599 0.2
600 0.19
601 0.24
602 0.32
603 0.37
604 0.46
605 0.54
606 0.6
607 0.7
608 0.8
609 0.82
610 0.84
611 0.85
612 0.84
613 0.82
614 0.81
615 0.78
616 0.72
617 0.65
618 0.54
619 0.47
620 0.39
621 0.32
622 0.23
623 0.18
624 0.22
625 0.24
626 0.28
627 0.3
628 0.32
629 0.35
630 0.44
631 0.44