Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RFG5

Protein Details
Accession A6RFG5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-76VADHEKKTKKIIRRKRRPARPQVDLATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-69KKTKKIIRRKRRPAR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG aje:HCAG_08381  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MADVAAMQQLTVPSTSPGPDTRIQEASTPSMDLAVSTGADTSLATSSTDVADHEKKTKKIIRRKRRPARPQVDLATPGTAATRARTKSGHTCFLARAVPQGHECDYLHRLPGLHDLFNPNVDCFGRDKHSDYRDDMGGVGSFMRQNRTLYIGRIHVSDDIEEIVARHFAEWGQVERIRVLNSRGVAFVTYTNEANSQFAKEAMSHQSLDHNEVLNVRWATVDPNPLAQKRDAQRIEEQAAEAVRKALPAEFVAELEGRDPEARKRKKIEGSFGLSGYEPPDEVWYARTRELEQEKEARQIEASEARLIEDAPAATQQQVEGGGCGILSSSTLSALNGFTGGNFTTKEAAPASSGPLVAYDSDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.15
4 0.18
5 0.21
6 0.27
7 0.3
8 0.34
9 0.36
10 0.35
11 0.36
12 0.37
13 0.36
14 0.31
15 0.27
16 0.22
17 0.2
18 0.18
19 0.14
20 0.12
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.14
38 0.18
39 0.21
40 0.29
41 0.35
42 0.36
43 0.45
44 0.52
45 0.56
46 0.63
47 0.71
48 0.75
49 0.79
50 0.89
51 0.91
52 0.94
53 0.95
54 0.96
55 0.94
56 0.9
57 0.86
58 0.79
59 0.73
60 0.65
61 0.55
62 0.45
63 0.35
64 0.28
65 0.2
66 0.17
67 0.12
68 0.12
69 0.18
70 0.18
71 0.21
72 0.22
73 0.26
74 0.35
75 0.4
76 0.44
77 0.39
78 0.4
79 0.38
80 0.41
81 0.38
82 0.28
83 0.27
84 0.22
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.21
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.24
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.17
98 0.25
99 0.23
100 0.2
101 0.21
102 0.23
103 0.23
104 0.25
105 0.25
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.16
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.28
116 0.32
117 0.34
118 0.35
119 0.35
120 0.32
121 0.3
122 0.26
123 0.19
124 0.15
125 0.12
126 0.09
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.18
194 0.19
195 0.21
196 0.2
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.13
210 0.17
211 0.21
212 0.22
213 0.24
214 0.23
215 0.28
216 0.28
217 0.37
218 0.35
219 0.35
220 0.37
221 0.4
222 0.41
223 0.35
224 0.31
225 0.23
226 0.22
227 0.19
228 0.14
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.09
246 0.1
247 0.17
248 0.27
249 0.34
250 0.4
251 0.46
252 0.54
253 0.62
254 0.67
255 0.68
256 0.65
257 0.66
258 0.62
259 0.56
260 0.48
261 0.39
262 0.33
263 0.25
264 0.18
265 0.1
266 0.08
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.13
271 0.16
272 0.18
273 0.21
274 0.23
275 0.22
276 0.3
277 0.36
278 0.37
279 0.38
280 0.42
281 0.42
282 0.47
283 0.46
284 0.38
285 0.32
286 0.29
287 0.28
288 0.26
289 0.26
290 0.21
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.16
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.15
332 0.15
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.21
339 0.19
340 0.19
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.16