FuNGI

A6QYC2

Protein Details

Accession

A6QYC2

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
344-368	AESNLPERRKKLKEKSNFRNPTQSF	Hydrophilic
1184-1208	YISTCDTCQRVKPKRHRQYGELGTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
353-354	KK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, plas 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR032567 LDOC1-rel IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
KEGG	aje:HCAG_02379 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MASTRSIRRTCATAEPEATNTSEENRETRTPATESAQQASTSPMEPDSEHSSEGDTSSEDLNAIEAEKIAVTRRIKKLQAEKELRELQHRCNTLLQELDETIPATRNTLEAHPNHGRDATSVNCNRENATSILGPPEPTLLAPNTLVESAVTTVSGRRSRVPLWQLELRDPGMSGHPPRRDVEKFRGQSMKEFENFVTAAIAFHASDLDYYNEHDHRKVIEAVTHFNVEMQQRWYQHTHDMRILPPWEEFVSWMQCQVTDPDKSFRDADRQYWKTEQQEDQTVQQFASHLQSIEGRLRHSYSEYHRKSHLYMKVLPSIRREFDKYATKLEELSYDATLHKLAMAESNLPERRKKLKEKSNFRNPTQSFNNRNNAARNATISAESRCKNALSFTVTVEITTPKSLQKVLALVDSGSEVNCVDEFWAKDHNLEAAHRKTKMVKSIDGCIMRSFGEYNIATTVTDHKGNAQQTSHSFHAMKMKDYNLVLGFPWLKQTNPLIDWSDGQFFFRSSGDEQQPQIISEQDVLAEVLTGARVGMLVVLPTECSKDPKHAPRVFSAAYSDLPTGLPDYVMPYAHIFSEEAAISAQRPEEAEHRIDLEPGARPPFMPIYNLSETELAALREYLKNALDKGWIQPSSSPAGAPILFVPKKDGGLRLCVDYRGLNRITIKNRYPLPLISELLDRLSKAKVFTKLDLRDAYPRILIAAKDRWKTAFRTRYGHFEYVVMPFGLANAPATFQAYINNALSDLLDICCVVYLDDILIFSNSKQEHKVHVTKVLERLERANLFAKLSKCEFEVDKVSFLGLSPLLQPHYSKLTKGSKKGERKATFMWTESAQSAFNELKSRFMRAPLLAHFDPARRIQIEPDASTFAVAAILSQLQDDGHWHPVAFWSRKLIDAETRYDTHDKELLAIVAAFKNWRHYLEGSQYPIQVWSDHANLQYFMTTKELNRRQARWAEALSAYDFVLLHRPGSKNPADGPSRRADYSEAYNGQTMLPTLQQKLKHGVKLGWEADTSFQNDISSDVVCARVSNEQNAPFNERKALHTSTSYTSRVNSSPLMRVEQYMPRIAVNKAILGDSAYTEMPESFTSFLSKAQKIDSFAAEQREKVKEKGMTVAENMLWTISEDDILRADGRAYVPQQKALIDEIISANHDDPQGGHFGIKKSIDSIQDKYYWHGLVRDVKDYISTCDTCQRVKPKRHRQYGELGTIPLPSNPFESITMDFITGLPASLYIPPPNLRCDFSDCGYIYQVYDLYSLHQKHYSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.45
3	0.44
4	0.42
5	0.39
6	0.31
7	0.26
8	0.24
9	0.24
10	0.23
11	0.24
12	0.28
13	0.29
14	0.31
15	0.33
16	0.34
17	0.33
18	0.34
19	0.37
20	0.38
21	0.38
22	0.39
23	0.39
24	0.34
25	0.31
26	0.31
27	0.29
28	0.23
29	0.2
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.22
34	0.25
35	0.25
36	0.24
37	0.24
38	0.25
39	0.24
40	0.23
41	0.2
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.13
46	0.11
47	0.1
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.08
55	0.09
56	0.11
57	0.18
58	0.23
59	0.32
60	0.4
61	0.48
62	0.52
63	0.61
64	0.69
65	0.71
66	0.77
67	0.76
68	0.72
69	0.73
70	0.76
71	0.69
72	0.68
73	0.62
74	0.59
75	0.59
76	0.57
77	0.5
78	0.48
79	0.49
80	0.43
81	0.43
82	0.36
83	0.3
84	0.29
85	0.28
86	0.23
87	0.21
88	0.18
89	0.18
90	0.16
91	0.15
92	0.14
93	0.14
94	0.16
95	0.2
96	0.26
97	0.24
98	0.33
99	0.39
100	0.4
101	0.4
102	0.39
103	0.35
104	0.29
105	0.32
106	0.28
107	0.3
108	0.34
109	0.37
110	0.39
111	0.39
112	0.4
113	0.37
114	0.37
115	0.29
116	0.27
117	0.23
118	0.21
119	0.24
120	0.23
121	0.21
122	0.18
123	0.18
124	0.15
125	0.14
126	0.16
127	0.13
128	0.15
129	0.14
130	0.15
131	0.15
132	0.14
133	0.14
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.1
141	0.17
142	0.21
143	0.22
144	0.25
145	0.29
146	0.31
147	0.4
148	0.44
149	0.42
150	0.45
151	0.49
152	0.47
153	0.47
154	0.48
155	0.41
156	0.35
157	0.29
158	0.24
159	0.22
160	0.25
161	0.27
162	0.31
163	0.35
164	0.37
165	0.39
166	0.46
167	0.49
168	0.51
169	0.54
170	0.57
171	0.55
172	0.59
173	0.64
174	0.57
175	0.57
176	0.56
177	0.53
178	0.44
179	0.44
180	0.37
181	0.34
182	0.33
183	0.26
184	0.21
185	0.14
186	0.13
187	0.11
188	0.12
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.11
198	0.16
199	0.2
200	0.21
201	0.22
202	0.23
203	0.23
204	0.26
205	0.27
206	0.24
207	0.25
208	0.25
209	0.29
210	0.29
211	0.29
212	0.24
213	0.22
214	0.24
215	0.21
216	0.22
217	0.21
218	0.23
219	0.24
220	0.29
221	0.31
222	0.29
223	0.37
224	0.4
225	0.41
226	0.42
227	0.43
228	0.39
229	0.43
230	0.42
231	0.34
232	0.28
233	0.27
234	0.22
235	0.19
236	0.2
237	0.18
238	0.21
239	0.19
240	0.21
241	0.18
242	0.17
243	0.18
244	0.2
245	0.21
246	0.2
247	0.22
248	0.27
249	0.28
250	0.31
251	0.32
252	0.31
253	0.35
254	0.35
255	0.4
256	0.44
257	0.45
258	0.47
259	0.49
260	0.52
261	0.49
262	0.53
263	0.5
264	0.44
265	0.49
266	0.47
267	0.46
268	0.45
269	0.4
270	0.33
271	0.29
272	0.25
273	0.19
274	0.2
275	0.17
276	0.12
277	0.13
278	0.14
279	0.17
280	0.22
281	0.22
282	0.2
283	0.21
284	0.22
285	0.22
286	0.22
287	0.26
288	0.29
289	0.39
290	0.41
291	0.43
292	0.45
293	0.46
294	0.47
295	0.49
296	0.47
297	0.41
298	0.44
299	0.44
300	0.49
301	0.51
302	0.51
303	0.49
304	0.48
305	0.45
306	0.43
307	0.43
308	0.38
309	0.4
310	0.47
311	0.43
312	0.44
313	0.44
314	0.4
315	0.36
316	0.34
317	0.29
318	0.21
319	0.21
320	0.15
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.13
325	0.11
326	0.1
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.21
334	0.24
335	0.26
336	0.28
337	0.31
338	0.39
339	0.45
340	0.54
341	0.57
342	0.63
343	0.72
344	0.8
345	0.86
346	0.88
347	0.88
348	0.8
349	0.81
350	0.72
351	0.69
352	0.67
353	0.66
354	0.62
355	0.61
356	0.66
357	0.59
358	0.61
359	0.57
360	0.52
361	0.46
362	0.39
363	0.34
364	0.27
365	0.24
366	0.23
367	0.21
368	0.2
369	0.23
370	0.22
371	0.22
372	0.21
373	0.21
374	0.19
375	0.19
376	0.2
377	0.18
378	0.19
379	0.18
380	0.2
381	0.19
382	0.19
383	0.18
384	0.16
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.11
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.1
401	0.07
402	0.07
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.08
409	0.08
410	0.1
411	0.14
412	0.14
413	0.14
414	0.15
415	0.16
416	0.14
417	0.16
418	0.22
419	0.24
420	0.28
421	0.28
422	0.29
423	0.34
424	0.37
425	0.43
426	0.39
427	0.38
428	0.36
429	0.41
430	0.46
431	0.41
432	0.38
433	0.3
434	0.27
435	0.22
436	0.2
437	0.16
438	0.1
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.16
447	0.12
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.19
452	0.21
453	0.22
454	0.19
455	0.19
456	0.21
457	0.26
458	0.25
459	0.23
460	0.22
461	0.21
462	0.29
463	0.27
464	0.27
465	0.25
466	0.25
467	0.25
468	0.25
469	0.25
470	0.17
471	0.17
472	0.14
473	0.14
474	0.14
475	0.11
476	0.15
477	0.13
478	0.12
479	0.15
480	0.17
481	0.17
482	0.17
483	0.2
484	0.18
485	0.18
486	0.2
487	0.19
488	0.2
489	0.17
490	0.17
491	0.15
492	0.12
493	0.13
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.17
498	0.2
499	0.22
500	0.22
501	0.24
502	0.24
503	0.22
504	0.21
505	0.15
506	0.12
507	0.1
508	0.1
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.02
519	0.02
520	0.02
521	0.02
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.04
528	0.04
529	0.06
530	0.06
531	0.1
532	0.1
533	0.16
534	0.24
535	0.32
536	0.42
537	0.44
538	0.46
539	0.45
540	0.49
541	0.44
542	0.37
543	0.3
544	0.21
545	0.18
546	0.18
547	0.15
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.07
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.06
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.09
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.15
581	0.15
582	0.15
583	0.14
584	0.12
585	0.11
586	0.12
587	0.13
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.14
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.17
596	0.19
597	0.19
598	0.19
599	0.16
600	0.16
601	0.15
602	0.15
603	0.08
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.1
613	0.1
614	0.1
615	0.1
616	0.12
617	0.16
618	0.16
619	0.15
620	0.16
621	0.17
622	0.18
623	0.17
624	0.15
625	0.1
626	0.11
627	0.11
628	0.1
629	0.09
630	0.13
631	0.13
632	0.13
633	0.16
634	0.15
635	0.16
636	0.17
637	0.2
638	0.14
639	0.18
640	0.19
641	0.19
642	0.19
643	0.18
644	0.17
645	0.16
646	0.16
647	0.16
648	0.16
649	0.15
650	0.18
651	0.23
652	0.27
653	0.31
654	0.32
655	0.32
656	0.34
657	0.34
658	0.33
659	0.28
660	0.28
661	0.25
662	0.23
663	0.19
664	0.18
665	0.16
666	0.16
667	0.15
668	0.11
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.11
673	0.15
674	0.2
675	0.22
676	0.25
677	0.32
678	0.33
679	0.36
680	0.35
681	0.33
682	0.32
683	0.31
684	0.29
685	0.21
686	0.19
687	0.16
688	0.15
689	0.14
690	0.13
691	0.18
692	0.23
693	0.24
694	0.25
695	0.27
696	0.28
697	0.32
698	0.38
699	0.39
700	0.37
701	0.41
702	0.42
703	0.48
704	0.51
705	0.47
706	0.38
707	0.31
708	0.29
709	0.25
710	0.24
711	0.16
712	0.1
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.06
717	0.05
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.08
725	0.09
726	0.11
727	0.11
728	0.11
729	0.1
730	0.1
731	0.09
732	0.08
733	0.07
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.09
751	0.1
752	0.12
753	0.15
754	0.16
755	0.21
756	0.28
757	0.34
758	0.31
759	0.37
760	0.38
761	0.38
762	0.43
763	0.43
764	0.37
765	0.33
766	0.33
767	0.31
768	0.29
769	0.28
770	0.25
771	0.2
772	0.21
773	0.24
774	0.23
775	0.21
776	0.22
777	0.21
778	0.18
779	0.19
780	0.19
781	0.18
782	0.22
783	0.19
784	0.19
785	0.18
786	0.17
787	0.15
788	0.14
789	0.12
790	0.07
791	0.07
792	0.06
793	0.08
794	0.09
795	0.1
796	0.1
797	0.11
798	0.18
799	0.18
800	0.18
801	0.24
802	0.33
803	0.39
804	0.45
805	0.52
806	0.54
807	0.64
808	0.71
809	0.74
810	0.67
811	0.66
812	0.63
813	0.61
814	0.54
815	0.46
816	0.4
817	0.3
818	0.29
819	0.24
820	0.21
821	0.15
822	0.12
823	0.14
824	0.12
825	0.13
826	0.16
827	0.16
828	0.22
829	0.23
830	0.26
831	0.24
832	0.26
833	0.28
834	0.24
835	0.28
836	0.23
837	0.3
838	0.26
839	0.27
840	0.26
841	0.24
842	0.25
843	0.23
844	0.24
845	0.18
846	0.18
847	0.19
848	0.24
849	0.26
850	0.24
851	0.24
852	0.23
853	0.21
854	0.21
855	0.19
856	0.12
857	0.09
858	0.07
859	0.06
860	0.04
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.05
865	0.04
866	0.05
867	0.07
868	0.09
869	0.12
870	0.12
871	0.12
872	0.12
873	0.18
874	0.25
875	0.25
876	0.24
877	0.25
878	0.26
879	0.29
880	0.3
881	0.27
882	0.26
883	0.27
884	0.31
885	0.29
886	0.3
887	0.31
888	0.32
889	0.3
890	0.26
891	0.26
892	0.22
893	0.19
894	0.19
895	0.16
896	0.14
897	0.13
898	0.11
899	0.09
900	0.09
901	0.09
902	0.08
903	0.14
904	0.15
905	0.16
906	0.19
907	0.2
908	0.24
909	0.31
910	0.35
911	0.34
912	0.35
913	0.34
914	0.31
915	0.3
916	0.26
917	0.19
918	0.16
919	0.15
920	0.15
921	0.17
922	0.18
923	0.18
924	0.18
925	0.17
926	0.17
927	0.14
928	0.13
929	0.14
930	0.14
931	0.15
932	0.25
933	0.32
934	0.39
935	0.45
936	0.47
937	0.51
938	0.56
939	0.58
940	0.52
941	0.46
942	0.4
943	0.35
944	0.34
945	0.28
946	0.22
947	0.18
948	0.14
949	0.13
950	0.09
951	0.14
952	0.13
953	0.13
954	0.17
955	0.19
956	0.2
957	0.27
958	0.28
959	0.26
960	0.29
961	0.35
962	0.36
963	0.37
964	0.4
965	0.4
966	0.41
967	0.38
968	0.36
969	0.31
970	0.29
971	0.32
972	0.34
973	0.3
974	0.28
975	0.28
976	0.27
977	0.25
978	0.22
979	0.17
980	0.11
981	0.13
982	0.14
983	0.16
984	0.21
985	0.23
986	0.26
987	0.35
988	0.39
989	0.39
990	0.39
991	0.39
992	0.39
993	0.45
994	0.43
995	0.36
996	0.31
997	0.28
998	0.26
999	0.27
1000	0.23
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.1
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.09
1013	0.1
1014	0.16
1015	0.18
1016	0.22
1017	0.26
1018	0.29
1019	0.34
1020	0.36
1021	0.41
1022	0.36
1023	0.36
1024	0.38
1025	0.34
1026	0.34
1027	0.36
1028	0.37
1029	0.32
1030	0.33
1031	0.35
1032	0.33
1033	0.37
1034	0.36
1035	0.31
1036	0.29
1037	0.31
1038	0.29
1039	0.28
1040	0.28
1041	0.25
1042	0.29
1043	0.31
1044	0.33
1045	0.3
1046	0.31
1047	0.32
1048	0.34
1049	0.34
1050	0.31
1051	0.3
1052	0.27
1053	0.29
1054	0.27
1055	0.29
1056	0.24
1057	0.22
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.17
1061	0.16
1062	0.16
1063	0.11
1064	0.12
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.11
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.19
1077	0.24
1078	0.26
1079	0.26
1080	0.29
1081	0.32
1082	0.33
1083	0.36
1084	0.33
1085	0.31
1086	0.32
1087	0.39
1088	0.36
1089	0.34
1090	0.36
1091	0.4
1092	0.41
1093	0.38
1094	0.42
1095	0.38
1096	0.38
1097	0.44
1098	0.42
1099	0.37
1100	0.35
1101	0.37
1102	0.3
1103	0.26
1104	0.24
1105	0.17
1106	0.13
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.08
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.11
1119	0.13
1120	0.16
1121	0.2
1122	0.27
1123	0.28
1124	0.32
1125	0.33
1126	0.31
1127	0.31
1128	0.29
1129	0.27
1130	0.18
1131	0.19
1132	0.16
1133	0.16
1134	0.16
1135	0.16
1136	0.14
1137	0.15
1138	0.14
1139	0.12
1140	0.12
1141	0.13
1142	0.15
1143	0.14
1144	0.15
1145	0.17
1146	0.19
1147	0.24
1148	0.25
1149	0.24
1150	0.23
1151	0.28
1152	0.34
1153	0.35
1154	0.36
1155	0.36
1156	0.39
1157	0.4
1158	0.41
1159	0.41
1160	0.35
1161	0.32
1162	0.3
1163	0.31
1164	0.36
1165	0.38
1166	0.39
1167	0.35
1168	0.34
1169	0.36
1170	0.35
1171	0.34
1172	0.31
1173	0.29
1174	0.26
1175	0.33
1176	0.36
1177	0.35
1178	0.41
1179	0.47
1180	0.51
1181	0.6
1182	0.7
1183	0.73
1184	0.82
1185	0.89
1186	0.88
1187	0.84
1188	0.84
1189	0.83
1190	0.79
1191	0.7
1192	0.61
1193	0.51
1194	0.47
1195	0.42
1196	0.33
1197	0.25
1198	0.18
1199	0.19
1200	0.18
1201	0.2
1202	0.19
1203	0.21
1204	0.21
1205	0.22
1206	0.22
1207	0.2
1208	0.19
1209	0.16
1210	0.17
1211	0.13
1212	0.11
1213	0.08
1214	0.08
1215	0.09
1216	0.12
1217	0.15
1218	0.15
1219	0.19
1220	0.24
1221	0.27
1222	0.33
1223	0.34
1224	0.34
1225	0.35
1226	0.4
1227	0.4
1228	0.38
1229	0.43
1230	0.38
1231	0.37
1232	0.37
1233	0.34
1234	0.27
1235	0.24
1236	0.23
1237	0.16
1238	0.16
1239	0.13
1240	0.15
1241	0.23
1242	0.24
1243	0.26

A6QYC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer