Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6QTE2

Protein Details
Accession A6QTE2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-70PVKKPAQSDGPPRKRGRPRKNPSDTPKQVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSBasic
93-114SSKPAPTPSKRGRPKKSATEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-73PRKRGRPPKLDATGNPVKKPAQSDGPPRKRGRPRKNPSDTPKQVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSKKP
100-108PSKRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG aje:HCAG_00648  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MADAPLPRKRGRPPKLDATGNPVKKPAQSDGPPRKRGRPRKNPSDTPKQVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSKKPRLSTDAAAITTTTTSSSSSSSKPAPTPSKRGRPKKSATEAAAKAVNGAGAAGFLLDKIIGIYSLDCKEVEDNWPDDAEEMELTITRTSESPLGLIGGFNLGVIQGTMLFATDKRTLDKFRAVMSKRGRVAGGARGGNGEGETGSSHDGDDIPRAAGPARVKDLRVYFSWRGRSTGEGEIHTEEGTSPQDGYLVFTSNEAITFNGVAGFPALGEKCKFKGTKIDDDAADAPEPWTSFSRKAAEEAAVSRWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.8
4 0.71
5 0.69
6 0.7
7 0.66
8 0.59
9 0.52
10 0.46
11 0.42
12 0.45
13 0.42
14 0.41
15 0.43
16 0.53
17 0.6
18 0.68
19 0.74
20 0.75
21 0.79
22 0.81
23 0.84
24 0.85
25 0.85
26 0.85
27 0.87
28 0.93
29 0.93
30 0.91
31 0.91
32 0.87
33 0.82
34 0.79
35 0.71
36 0.65
37 0.63
38 0.63
39 0.62
40 0.61
41 0.63
42 0.62
43 0.69
44 0.75
45 0.76
46 0.78
47 0.78
48 0.83
49 0.83
50 0.82
51 0.81
52 0.78
53 0.78
54 0.76
55 0.72
56 0.71
57 0.68
58 0.68
59 0.65
60 0.63
61 0.59
62 0.56
63 0.52
64 0.5
65 0.47
66 0.41
67 0.36
68 0.31
69 0.24
70 0.2
71 0.17
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.1
77 0.12
78 0.13
79 0.17
80 0.19
81 0.22
82 0.23
83 0.3
84 0.38
85 0.4
86 0.49
87 0.55
88 0.63
89 0.7
90 0.78
91 0.79
92 0.79
93 0.81
94 0.82
95 0.81
96 0.77
97 0.71
98 0.69
99 0.62
100 0.55
101 0.49
102 0.38
103 0.3
104 0.22
105 0.18
106 0.09
107 0.08
108 0.05
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.08
171 0.11
172 0.11
173 0.14
174 0.17
175 0.18
176 0.21
177 0.26
178 0.23
179 0.24
180 0.32
181 0.32
182 0.38
183 0.42
184 0.46
185 0.42
186 0.42
187 0.38
188 0.31
189 0.31
190 0.29
191 0.28
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.16
198 0.1
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.12
216 0.14
217 0.16
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.27
222 0.29
223 0.28
224 0.28
225 0.33
226 0.33
227 0.37
228 0.44
229 0.41
230 0.41
231 0.39
232 0.39
233 0.36
234 0.37
235 0.34
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.24
241 0.2
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.13
273 0.17
274 0.18
275 0.26
276 0.27
277 0.26
278 0.36
279 0.4
280 0.49
281 0.52
282 0.55
283 0.48
284 0.52
285 0.51
286 0.43
287 0.37
288 0.26
289 0.21
290 0.17
291 0.17
292 0.15
293 0.17
294 0.19
295 0.21
296 0.27
297 0.32
298 0.31
299 0.34
300 0.34
301 0.34
302 0.33
303 0.32