FuNGI

A6RA56

Protein Details

Accession

A6RA56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
345-368	ESNLPERRKKLKEKSNFRNPTQSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
353-354	KK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
KEGG	aje:HCAG_05844 -
Pfam	View protein in Pfam PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MASTRSIRRTRATAEPEATNTSEENRETRTPATESVQQASTSPMEPDSEHSSEGDTSSEDLNAIEAEKIAVTRRIKKLQAEKELRELQHRCNTLLQELDETIPATRNTLEAHPNHGRDATSVNCNRENATSILGPPEPTLQAPNTLVESAVTTVSGRRSRVPLWQLELRDPGMSGHPPRRDVEKFRGQSMKEFENFVTAAIAFHASDLDYYNEHDHRKVIEAVTHFNVEMQQRWYQHTHDMRILPPWEEFVSWMQCQVTDPDKSFRDADRQYWKTEQQEDQTVQQFASHLQSIEGRLRHPYSEYHRKSHLYMKVLPSIRREFDKYATKLEELSYDATLHKLAIAESNLPERRKKLKEKSNFRNPTQSFNNRNNAVEITTPKSLQKVLALVDSGSEVNCVDEFWAKDHNLEAAHRKTKMVKSIDGCIMRSFGEYNIATTVTDHKDPKHAPRVFSAAYSDLPTGLPDYVMPYAHIFSEEAAISAQRPEEAEHRIDLEPGARPPFMPIYNLSETELAALREYLKNALDKGWIQPSSSPAGAPILFVPKKDGGLRLCVDYRGLNRITIKNRYPLPLISELLDRLSKAKVFTKLDLRDAYHRILIAAKDRWKTAFRTRYGHFEYVVMPFGLANAPATFQAYINNALSDLLDICCVVYLDDILIFSNSKQEHKVHVTKVLERLERANLFAKLSKCTNGIEMEPDRVSTIVEWPTPKSIKEVQSFLGFANFYRRFIKSFSSIAAPLFELTKGSKKGERKATFMWTESAQSAFNELKSRFLRAPLLAHFDPARRIQIEPDASTFAVAAILSQLQDDGHWHPVAFWSRKLIDAETRYDTHDKELLAIVAAFKNWRHYLEGSQYPIQVWSDHANLQYFMTTKELNRRQARWAEALSAYDFVLLHRPGSKNPADGPSRRADYSEAYNGQTMLPTLQQKLKHGVKLGWEADTSFQNDISSDVVCARVSNEQNAPFNERKALHTSTSYTSRVNSSPLMRVEQYMPRIAVNKAILGDSAYTEMPESFTSFLSKAQKIDSFAAEQREKVKEKGMTVAENMLWTISEDDILRADGRAYVPQQKALIDEIISANHDDPQGGHFGLPASTFLHQTYDAILVIVDIYTKFTIYIPCTKNITADELAEIVYTKFYTIYGVPKNHISDRVCLQYLSTCLYWNGTRGSLNGIST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.56
3	0.53
4	0.51
5	0.47
6	0.39
7	0.32
8	0.28
9	0.28
10	0.26
11	0.26
12	0.27
13	0.29
14	0.31
15	0.33
16	0.34
17	0.33
18	0.34
19	0.36
20	0.38
21	0.38
22	0.39
23	0.39
24	0.34
25	0.31
26	0.31
27	0.28
28	0.22
29	0.2
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.21
34	0.25
35	0.25
36	0.24
37	0.24
38	0.25
39	0.24
40	0.23
41	0.2
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.13
46	0.11
47	0.1
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.08
55	0.09
56	0.11
57	0.18
58	0.23
59	0.32
60	0.4
61	0.48
62	0.52
63	0.61
64	0.68
65	0.71
66	0.76
67	0.76
68	0.72
69	0.73
70	0.76
71	0.69
72	0.68
73	0.62
74	0.59
75	0.59
76	0.57
77	0.5
78	0.48
79	0.48
80	0.43
81	0.43
82	0.35
83	0.3
84	0.29
85	0.27
86	0.23
87	0.21
88	0.18
89	0.17
90	0.16
91	0.15
92	0.14
93	0.14
94	0.16
95	0.2
96	0.26
97	0.24
98	0.33
99	0.38
100	0.39
101	0.4
102	0.39
103	0.35
104	0.29
105	0.32
106	0.27
107	0.3
108	0.34
109	0.37
110	0.39
111	0.39
112	0.39
113	0.37
114	0.37
115	0.28
116	0.27
117	0.23
118	0.2
119	0.24
120	0.22
121	0.21
122	0.19
123	0.2
124	0.18
125	0.17
126	0.2
127	0.17
128	0.2
129	0.2
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.18
134	0.14
135	0.15
136	0.12
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.1
141	0.17
142	0.21
143	0.21
144	0.24
145	0.29
146	0.31
147	0.39
148	0.43
149	0.42
150	0.44
151	0.48
152	0.47
153	0.46
154	0.48
155	0.4
156	0.34
157	0.29
158	0.24
159	0.22
160	0.24
161	0.26
162	0.31
163	0.34
164	0.37
165	0.39
166	0.45
167	0.48
168	0.5
169	0.54
170	0.56
171	0.54
172	0.58
173	0.63
174	0.56
175	0.57
176	0.55
177	0.52
178	0.43
179	0.43
180	0.37
181	0.33
182	0.32
183	0.25
184	0.21
185	0.14
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.08
197	0.11
198	0.16
199	0.19
200	0.21
201	0.22
202	0.22
203	0.22
204	0.26
205	0.27
206	0.23
207	0.24
208	0.25
209	0.28
210	0.29
211	0.28
212	0.24
213	0.21
214	0.23
215	0.2
216	0.22
217	0.2
218	0.23
219	0.23
220	0.28
221	0.3
222	0.29
223	0.36
224	0.39
225	0.4
226	0.41
227	0.42
228	0.39
229	0.42
230	0.41
231	0.34
232	0.28
233	0.26
234	0.21
235	0.19
236	0.19
237	0.17
238	0.21
239	0.19
240	0.2
241	0.18
242	0.17
243	0.18
244	0.2
245	0.21
246	0.19
247	0.22
248	0.26
249	0.28
250	0.3
251	0.32
252	0.3
253	0.34
254	0.34
255	0.39
256	0.43
257	0.44
258	0.46
259	0.49
260	0.52
261	0.48
262	0.52
263	0.49
264	0.43
265	0.48
266	0.45
267	0.45
268	0.44
269	0.39
270	0.33
271	0.29
272	0.24
273	0.18
274	0.2
275	0.16
276	0.12
277	0.12
278	0.14
279	0.16
280	0.21
281	0.21
282	0.18
283	0.22
284	0.23
285	0.23
286	0.23
287	0.27
288	0.31
289	0.41
290	0.45
291	0.45
292	0.48
293	0.5
294	0.51
295	0.54
296	0.51
297	0.45
298	0.46
299	0.46
300	0.49
301	0.51
302	0.5
303	0.48
304	0.47
305	0.44
306	0.42
307	0.42
308	0.37
309	0.39
310	0.46
311	0.42
312	0.43
313	0.43
314	0.39
315	0.35
316	0.33
317	0.28
318	0.2
319	0.2
320	0.15
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.11
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.12
333	0.2
334	0.24
335	0.25
336	0.28
337	0.3
338	0.38
339	0.44
340	0.53
341	0.57
342	0.62
343	0.71
344	0.8
345	0.85
346	0.87
347	0.87
348	0.8
349	0.8
350	0.71
351	0.68
352	0.66
353	0.65
354	0.61
355	0.6
356	0.65
357	0.56
358	0.56
359	0.5
360	0.42
361	0.33
362	0.29
363	0.24
364	0.21
365	0.2
366	0.2
367	0.19
368	0.2
369	0.19
370	0.17
371	0.16
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.15
394	0.16
395	0.14
396	0.16
397	0.21
398	0.24
399	0.28
400	0.28
401	0.29
402	0.33
403	0.36
404	0.42
405	0.39
406	0.38
407	0.36
408	0.4
409	0.45
410	0.41
411	0.38
412	0.3
413	0.27
414	0.22
415	0.2
416	0.16
417	0.1
418	0.14
419	0.13
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.16
426	0.13
427	0.17
428	0.18
429	0.18
430	0.24
431	0.27
432	0.34
433	0.4
434	0.41
435	0.39
436	0.41
437	0.45
438	0.39
439	0.36
440	0.31
441	0.22
442	0.19
443	0.19
444	0.16
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.05
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.07
461	0.06
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.07
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.05
471	0.06
472	0.07
473	0.1
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.15
481	0.13
482	0.12
483	0.13
484	0.14
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.15
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.18
493	0.2
494	0.21
495	0.2
496	0.17
497	0.17
498	0.16
499	0.16
500	0.09
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.1
508	0.1
509	0.11
510	0.12
511	0.12
512	0.11
513	0.13
514	0.18
515	0.17
516	0.17
517	0.17
518	0.18
519	0.19
520	0.19
521	0.16
522	0.11
523	0.12
524	0.11
525	0.11
526	0.09
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.17
531	0.16
532	0.17
533	0.18
534	0.21
535	0.15
536	0.19
537	0.2
538	0.19
539	0.19
540	0.18
541	0.18
542	0.16
543	0.16
544	0.16
545	0.16
546	0.15
547	0.18
548	0.23
549	0.27
550	0.31
551	0.31
552	0.32
553	0.33
554	0.34
555	0.32
556	0.27
557	0.27
558	0.24
559	0.23
560	0.19
561	0.18
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.1
570	0.14
571	0.19
572	0.21
573	0.23
574	0.3
575	0.31
576	0.34
577	0.34
578	0.32
579	0.3
580	0.3
581	0.29
582	0.21
583	0.19
584	0.16
585	0.16
586	0.15
587	0.15
588	0.17
589	0.2
590	0.21
591	0.21
592	0.23
593	0.24
594	0.28
595	0.33
596	0.37
597	0.35
598	0.39
599	0.4
600	0.46
601	0.49
602	0.46
603	0.37
604	0.3
605	0.28
606	0.23
607	0.23
608	0.15
609	0.1
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.05
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.07
622	0.08
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.07
630	0.07
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.09
648	0.1
649	0.11
650	0.14
651	0.15
652	0.2
653	0.27
654	0.32
655	0.29
656	0.35
657	0.36
658	0.36
659	0.41
660	0.41
661	0.36
662	0.31
663	0.31
664	0.29
665	0.27
666	0.26
667	0.23
668	0.19
669	0.19
670	0.22
671	0.22
672	0.2
673	0.21
674	0.2
675	0.18
676	0.18
677	0.19
678	0.16
679	0.15
680	0.18
681	0.18
682	0.18
683	0.17
684	0.17
685	0.15
686	0.13
687	0.13
688	0.08
689	0.11
690	0.1
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.19
695	0.2
696	0.2
697	0.21
698	0.25
699	0.3
700	0.32
701	0.33
702	0.3
703	0.31
704	0.31
705	0.26
706	0.22
707	0.15
708	0.12
709	0.2
710	0.19
711	0.19
712	0.21
713	0.22
714	0.21
715	0.23
716	0.26
717	0.21
718	0.21
719	0.21
720	0.21
721	0.2
722	0.19
723	0.18
724	0.15
725	0.11
726	0.11
727	0.09
728	0.08
729	0.09
730	0.14
731	0.15
732	0.17
733	0.23
734	0.27
735	0.35
736	0.45
737	0.47
738	0.46
739	0.48
740	0.52
741	0.49
742	0.45
743	0.39
744	0.3
745	0.28
746	0.24
747	0.21
748	0.15
749	0.12
750	0.14
751	0.12
752	0.13
753	0.16
754	0.16
755	0.22
756	0.22
757	0.26
758	0.24
759	0.26
760	0.28
761	0.24
762	0.28
763	0.23
764	0.29
765	0.26
766	0.26
767	0.26
768	0.23
769	0.25
770	0.23
771	0.24
772	0.18
773	0.18
774	0.18
775	0.24
776	0.26
777	0.24
778	0.24
779	0.23
780	0.21
781	0.21
782	0.19
783	0.12
784	0.09
785	0.07
786	0.05
787	0.04
788	0.05
789	0.05
790	0.04
791	0.05
792	0.04
793	0.05
794	0.07
795	0.09
796	0.12
797	0.12
798	0.12
799	0.12
800	0.17
801	0.25
802	0.25
803	0.23
804	0.25
805	0.25
806	0.28
807	0.29
808	0.27
809	0.26
810	0.27
811	0.3
812	0.29
813	0.29
814	0.3
815	0.31
816	0.3
817	0.26
818	0.26
819	0.21
820	0.19
821	0.19
822	0.15
823	0.13
824	0.13
825	0.11
826	0.09
827	0.09
828	0.09
829	0.08
830	0.14
831	0.15
832	0.16
833	0.18
834	0.2
835	0.24
836	0.3
837	0.35
838	0.34
839	0.35
840	0.34
841	0.3
842	0.3
843	0.26
844	0.19
845	0.16
846	0.15
847	0.15
848	0.16
849	0.18
850	0.18
851	0.17
852	0.17
853	0.17
854	0.14
855	0.13
856	0.14
857	0.14
858	0.15
859	0.25
860	0.31
861	0.39
862	0.45
863	0.47
864	0.51
865	0.56
866	0.58
867	0.52
868	0.46
869	0.4
870	0.35
871	0.34
872	0.27
873	0.22
874	0.18
875	0.14
876	0.12
877	0.09
878	0.14
879	0.13
880	0.13
881	0.17
882	0.19
883	0.2
884	0.27
885	0.28
886	0.26
887	0.29
888	0.35
889	0.35
890	0.37
891	0.4
892	0.4
893	0.41
894	0.38
895	0.36
896	0.31
897	0.29
898	0.32
899	0.34
900	0.3
901	0.28
902	0.28
903	0.27
904	0.25
905	0.22
906	0.17
907	0.11
908	0.13
909	0.14
910	0.16
911	0.21
912	0.23
913	0.26
914	0.35
915	0.39
916	0.39
917	0.39
918	0.39
919	0.39
920	0.45
921	0.43
922	0.36
923	0.31
924	0.28
925	0.26
926	0.27
927	0.23
928	0.16
929	0.15
930	0.13
931	0.13
932	0.13
933	0.12
934	0.1
935	0.08
936	0.08
937	0.09
938	0.09
939	0.09
940	0.1
941	0.16
942	0.18
943	0.22
944	0.26
945	0.29
946	0.34
947	0.36
948	0.41
949	0.37
950	0.36
951	0.38
952	0.35
953	0.34
954	0.36
955	0.37
956	0.32
957	0.33
958	0.35
959	0.34
960	0.38
961	0.36
962	0.31
963	0.29
964	0.31
965	0.29
966	0.28
967	0.28
968	0.25
969	0.29
970	0.31
971	0.33
972	0.3
973	0.31
974	0.33
975	0.34
976	0.34
977	0.32
978	0.3
979	0.27
980	0.29
981	0.27
982	0.29
983	0.24
984	0.22
985	0.2
986	0.19
987	0.18
988	0.16
989	0.16
990	0.11
991	0.12
992	0.1
993	0.09
994	0.1
995	0.1
996	0.1
997	0.1
998	0.11
999	0.1
1000	0.11
1001	0.14
1002	0.13
1003	0.19
1004	0.24
1005	0.26
1006	0.26
1007	0.29
1008	0.32
1009	0.33
1010	0.36
1011	0.33
1012	0.31
1013	0.32
1014	0.39
1015	0.36
1016	0.35
1017	0.36
1018	0.41
1019	0.41
1020	0.38
1021	0.42
1022	0.38
1023	0.38
1024	0.44
1025	0.42
1026	0.37
1027	0.36
1028	0.37
1029	0.3
1030	0.27
1031	0.25
1032	0.17
1033	0.13
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.1
1040	0.1
1041	0.12
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.12
1046	0.13
1047	0.17
1048	0.2
1049	0.28
1050	0.29
1051	0.32
1052	0.33
1053	0.31
1054	0.31
1055	0.29
1056	0.27
1057	0.19
1058	0.19
1059	0.16
1060	0.16
1061	0.17
1062	0.16
1063	0.14
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.15
1070	0.14
1071	0.14
1072	0.12
1073	0.13
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.11
1078	0.12
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.16
1082	0.15
1083	0.15
1084	0.16
1085	0.15
1086	0.14
1087	0.13
1088	0.12
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.08
1092	0.07
1093	0.05
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.11
1099	0.16
1100	0.2
1101	0.3
1102	0.3
1103	0.35
1104	0.39
1105	0.39
1106	0.41
1107	0.38
1108	0.4
1109	0.32
1110	0.29
1111	0.26
1112	0.22
1113	0.21
1114	0.18
1115	0.16
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.09
1119	0.08
1120	0.08
1121	0.08
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.21
1125	0.27
1126	0.31
1127	0.34
1128	0.39
1129	0.44
1130	0.45
1131	0.5
1132	0.45
1133	0.42
1134	0.45
1135	0.49
1136	0.44
1137	0.39
1138	0.37
1139	0.34
1140	0.33
1141	0.32
1142	0.27
1143	0.21
1144	0.21
1145	0.25
1146	0.25
1147	0.24
1148	0.25
1149	0.22
1150	0.23
1151	0.22
1152	0.28

A6RA56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer