Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6R8J6

Protein Details
Accession A6R8J6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-53NPIPSPRPRLQQKPTTHPKTSTHydrophilic
417-440GPSTTKAKRGRPKGAKNFRPPPPTHydrophilic
555-579RVPGSGMGRRPRKRRKGRMGDVGYLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-436KAKRGRPKGAKNFRP
561-572MGRRPRKRRKGR
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG aje:HCAG_06637  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MTSMRPPARFPRAPGGGIRGPVQRLASLRNPNPIPSPRPRLQQKPTTHPKTSTCPNPGCPAPNIVEDDGMKVCSGCGTVVSEANIVSEITFGESASGAAVVQGTFVGAGQSYGRSFGPGFQRGGGMESREITEQNGNRYIAQLSRALNVPESATKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAVCLYIACRRQDGNTVMLIDFADVLMINVFKLGRAYKALLDELRLGGNVFIMNPIDPESLIYRFAKQLEFGSSMMQVASEAVRIVQRMNRDWMITGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTIREVVYVVKVTELTIHQRLKEFKATESGDLTVDQFRSVQLENAHDPPAFTQGKRLKQAMKQKNASTEIANGDEDENARQLTTTSSAPRTMRVDADGFAIPDVPIDPALLADKDGVVPPGPSTTKAKRGRPKGAKNFRPPPPTASELASESALESEMQELLTTGTNLLASTNCTTSHTAPTAQCTATPQPPKPIPSTPDIDASEFDSDPEVKYCLLSPAEVEIKERIWVHENKDYLRMQQAKALKRALAAEEDLMNGRVPGSGMGRRPRKRRKGRMGDVGYLDGKEGGGEESMDGGGGARGTRASTPAEATRRMLEQRGFSKKINYRLLEEMYEDGDERKAVERRGNSESGEGEGGNGGWRRSRRSASVSSVRSSIVVSDRSAAAAAASGAGLGIRGPVRERVVKGSRSGSSVPAFVSAVPTIPSPAPAPAPTSSSTQPQPTATTLGEEAEAATPTPPSTNPHEEILGYIPGPERGEEDADVDGEDTDDDEEDVVEDDHVDEAFAGNYYGGASDDDDDYYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.48
4 0.46
5 0.44
6 0.39
7 0.35
8 0.36
9 0.34
10 0.3
11 0.28
12 0.32
13 0.37
14 0.42
15 0.44
16 0.5
17 0.5
18 0.5
19 0.55
20 0.56
21 0.55
22 0.55
23 0.6
24 0.57
25 0.66
26 0.72
27 0.74
28 0.77
29 0.79
30 0.78
31 0.8
32 0.85
33 0.84
34 0.81
35 0.76
36 0.73
37 0.72
38 0.72
39 0.7
40 0.68
41 0.65
42 0.63
43 0.64
44 0.63
45 0.59
46 0.52
47 0.47
48 0.41
49 0.39
50 0.39
51 0.33
52 0.32
53 0.28
54 0.29
55 0.25
56 0.22
57 0.18
58 0.13
59 0.13
60 0.1
61 0.11
62 0.08
63 0.08
64 0.1
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.1
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.17
104 0.24
105 0.27
106 0.28
107 0.27
108 0.28
109 0.27
110 0.29
111 0.26
112 0.2
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.23
120 0.23
121 0.27
122 0.31
123 0.3
124 0.29
125 0.3
126 0.3
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.19
131 0.2
132 0.22
133 0.21
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.19
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.16
143 0.19
144 0.2
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.15
157 0.19
158 0.22
159 0.27
160 0.27
161 0.29
162 0.27
163 0.29
164 0.34
165 0.34
166 0.32
167 0.28
168 0.25
169 0.25
170 0.25
171 0.24
172 0.23
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.26
178 0.27
179 0.26
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.14
186 0.11
187 0.08
188 0.06
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.12
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.16
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.13
253 0.16
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.22
258 0.26
259 0.31
260 0.3
261 0.31
262 0.28
263 0.3
264 0.29
265 0.29
266 0.27
267 0.2
268 0.16
269 0.13
270 0.11
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.08
279 0.11
280 0.14
281 0.17
282 0.18
283 0.22
284 0.27
285 0.31
286 0.3
287 0.32
288 0.3
289 0.3
290 0.32
291 0.29
292 0.23
293 0.19
294 0.17
295 0.12
296 0.13
297 0.11
298 0.13
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.25
303 0.28
304 0.29
305 0.34
306 0.31
307 0.26
308 0.32
309 0.32
310 0.29
311 0.28
312 0.25
313 0.19
314 0.18
315 0.18
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.14
326 0.16
327 0.18
328 0.2
329 0.17
330 0.17
331 0.15
332 0.21
333 0.19
334 0.16
335 0.23
336 0.28
337 0.34
338 0.38
339 0.4
340 0.38
341 0.43
342 0.55
343 0.55
344 0.58
345 0.57
346 0.56
347 0.59
348 0.57
349 0.52
350 0.42
351 0.35
352 0.27
353 0.23
354 0.21
355 0.15
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.11
369 0.12
370 0.16
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.14
379 0.16
380 0.14
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.15
407 0.17
408 0.27
409 0.34
410 0.42
411 0.48
412 0.56
413 0.64
414 0.69
415 0.77
416 0.78
417 0.82
418 0.82
419 0.84
420 0.84
421 0.81
422 0.76
423 0.67
424 0.6
425 0.54
426 0.49
427 0.41
428 0.34
429 0.28
430 0.23
431 0.22
432 0.18
433 0.13
434 0.1
435 0.09
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.1
458 0.13
459 0.14
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.18
464 0.21
465 0.22
466 0.2
467 0.18
468 0.19
469 0.21
470 0.25
471 0.29
472 0.27
473 0.32
474 0.35
475 0.37
476 0.38
477 0.39
478 0.35
479 0.34
480 0.36
481 0.31
482 0.33
483 0.31
484 0.28
485 0.24
486 0.23
487 0.21
488 0.17
489 0.15
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.12
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.16
509 0.16
510 0.14
511 0.18
512 0.21
513 0.24
514 0.28
515 0.3
516 0.28
517 0.34
518 0.33
519 0.29
520 0.34
521 0.33
522 0.28
523 0.32
524 0.38
525 0.37
526 0.41
527 0.41
528 0.33
529 0.31
530 0.32
531 0.28
532 0.23
533 0.18
534 0.15
535 0.13
536 0.13
537 0.12
538 0.11
539 0.1
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.12
547 0.17
548 0.26
549 0.36
550 0.43
551 0.54
552 0.64
553 0.72
554 0.79
555 0.86
556 0.88
557 0.9
558 0.91
559 0.91
560 0.86
561 0.8
562 0.7
563 0.62
564 0.51
565 0.4
566 0.31
567 0.2
568 0.14
569 0.09
570 0.08
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.06
586 0.06
587 0.08
588 0.1
589 0.11
590 0.14
591 0.19
592 0.23
593 0.24
594 0.25
595 0.26
596 0.27
597 0.28
598 0.3
599 0.27
600 0.29
601 0.36
602 0.43
603 0.44
604 0.42
605 0.5
606 0.51
607 0.57
608 0.6
609 0.53
610 0.49
611 0.5
612 0.51
613 0.43
614 0.38
615 0.3
616 0.23
617 0.21
618 0.17
619 0.13
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.15
624 0.18
625 0.2
626 0.26
627 0.29
628 0.33
629 0.39
630 0.4
631 0.35
632 0.34
633 0.32
634 0.28
635 0.25
636 0.19
637 0.14
638 0.12
639 0.11
640 0.12
641 0.12
642 0.11
643 0.15
644 0.17
645 0.23
646 0.29
647 0.33
648 0.35
649 0.41
650 0.47
651 0.51
652 0.58
653 0.55
654 0.51
655 0.48
656 0.43
657 0.36
658 0.3
659 0.24
660 0.19
661 0.18
662 0.16
663 0.17
664 0.17
665 0.17
666 0.17
667 0.14
668 0.09
669 0.08
670 0.07
671 0.05
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.03
678 0.05
679 0.06
680 0.07
681 0.09
682 0.14
683 0.18
684 0.24
685 0.26
686 0.33
687 0.39
688 0.42
689 0.44
690 0.46
691 0.43
692 0.42
693 0.42
694 0.38
695 0.32
696 0.3
697 0.26
698 0.23
699 0.21
700 0.17
701 0.18
702 0.14
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.13
707 0.13
708 0.14
709 0.12
710 0.14
711 0.16
712 0.16
713 0.2
714 0.19
715 0.22
716 0.22
717 0.26
718 0.26
719 0.29
720 0.32
721 0.32
722 0.34
723 0.33
724 0.34
725 0.31
726 0.33
727 0.27
728 0.26
729 0.22
730 0.2
731 0.19
732 0.15
733 0.14
734 0.12
735 0.12
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.11
741 0.11
742 0.14
743 0.22
744 0.29
745 0.31
746 0.33
747 0.34
748 0.33
749 0.33
750 0.32
751 0.26
752 0.18
753 0.17
754 0.16
755 0.17
756 0.18
757 0.16
758 0.15
759 0.16
760 0.19
761 0.18
762 0.18
763 0.17
764 0.16
765 0.16
766 0.14
767 0.11
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.07
777 0.08
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.08
783 0.08
784 0.07
785 0.06
786 0.06
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.08
797 0.09
798 0.11