Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RDD5

Protein Details
Accession A6RDD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-74DSDHNHCQRRRQSSHPKEGDEYRRHRRKSHRTHSTEDKSENBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-64RRHRRKSHR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9, pero 2, cyto 1, plas 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG aje:HCAG_07643  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22584  Rcat_RBR_unk  
Amino Acid Sequences MAPLIRSLFFFTTSGAEGRTTSSRNPARTASVLDSDHNHCQRRRQSSHPKEGDEYRRHRRKSHRTHSTEDKSENASRENHRAQKGSATPKKTHSRRDLSSTVSMSMPVHPSIISTARPTVSSRGKTKESVRRDPLKRSATQRAVAESWMKPSPSPISLPLRLGEQSDWNLAKTALRSSAPKTKSGKQVSPAKQGRKGGGVKTITSPTSLPEKTVTCLTCFDDIPVSKAAQLSCSHSMCEDCLKRLFTLSVTDPQHMPPKCCTTDHIPLKHVDNLFDIEFKIKWNKKYKEYTTKNRLYCPSKGCGEWIKPSNIHIDTGGGATGGRRFGICVSCHTKVCGLCNGKWHIDGECPKDDEMKRFVETARENGWQRCYSCSAMIELTEGCNHMTCRCGAEFCIVCAARWKTCACPWFNNFRHILMEDPDDVVPPQVPLPQNNPYFDHVDLAAIAAAYYGQIHVGYLANPNEPLFQPRAGREAVPFGGNGNGGFVAPFEDMGGYGEVPQAAPVHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.18
6 0.22
7 0.22
8 0.23
9 0.32
10 0.37
11 0.4
12 0.44
13 0.43
14 0.44
15 0.44
16 0.46
17 0.4
18 0.4
19 0.37
20 0.35
21 0.37
22 0.37
23 0.43
24 0.45
25 0.47
26 0.44
27 0.52
28 0.59
29 0.65
30 0.66
31 0.68
32 0.73
33 0.77
34 0.86
35 0.83
36 0.79
37 0.74
38 0.77
39 0.77
40 0.75
41 0.73
42 0.73
43 0.76
44 0.75
45 0.78
46 0.8
47 0.81
48 0.82
49 0.84
50 0.84
51 0.81
52 0.85
53 0.87
54 0.85
55 0.81
56 0.72
57 0.65
58 0.6
59 0.58
60 0.52
61 0.45
62 0.42
63 0.4
64 0.47
65 0.51
66 0.53
67 0.53
68 0.54
69 0.51
70 0.53
71 0.56
72 0.58
73 0.57
74 0.56
75 0.55
76 0.61
77 0.7
78 0.69
79 0.71
80 0.7
81 0.71
82 0.7
83 0.74
84 0.69
85 0.64
86 0.62
87 0.54
88 0.45
89 0.37
90 0.33
91 0.26
92 0.25
93 0.22
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.2
106 0.25
107 0.3
108 0.35
109 0.39
110 0.42
111 0.45
112 0.49
113 0.57
114 0.59
115 0.59
116 0.63
117 0.66
118 0.7
119 0.72
120 0.75
121 0.75
122 0.72
123 0.69
124 0.66
125 0.68
126 0.63
127 0.63
128 0.56
129 0.51
130 0.45
131 0.41
132 0.38
133 0.29
134 0.27
135 0.25
136 0.24
137 0.19
138 0.21
139 0.23
140 0.2
141 0.22
142 0.23
143 0.28
144 0.3
145 0.31
146 0.28
147 0.27
148 0.26
149 0.25
150 0.2
151 0.17
152 0.16
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.14
163 0.16
164 0.2
165 0.29
166 0.29
167 0.35
168 0.38
169 0.42
170 0.5
171 0.54
172 0.54
173 0.53
174 0.62
175 0.61
176 0.67
177 0.67
178 0.63
179 0.62
180 0.61
181 0.55
182 0.51
183 0.49
184 0.4
185 0.4
186 0.36
187 0.31
188 0.31
189 0.32
190 0.25
191 0.22
192 0.21
193 0.15
194 0.21
195 0.19
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.24
201 0.22
202 0.16
203 0.18
204 0.19
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.15
225 0.21
226 0.18
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.12
234 0.15
235 0.14
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.27
242 0.25
243 0.26
244 0.22
245 0.26
246 0.27
247 0.27
248 0.28
249 0.28
250 0.37
251 0.42
252 0.42
253 0.38
254 0.38
255 0.4
256 0.41
257 0.35
258 0.26
259 0.2
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.19
268 0.21
269 0.28
270 0.38
271 0.43
272 0.5
273 0.59
274 0.67
275 0.69
276 0.74
277 0.77
278 0.77
279 0.8
280 0.74
281 0.7
282 0.68
283 0.62
284 0.59
285 0.53
286 0.47
287 0.41
288 0.38
289 0.36
290 0.35
291 0.33
292 0.34
293 0.34
294 0.32
295 0.31
296 0.32
297 0.35
298 0.3
299 0.27
300 0.21
301 0.17
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.12
315 0.13
316 0.18
317 0.24
318 0.26
319 0.27
320 0.28
321 0.29
322 0.27
323 0.29
324 0.31
325 0.29
326 0.28
327 0.34
328 0.37
329 0.35
330 0.35
331 0.33
332 0.26
333 0.28
334 0.32
335 0.3
336 0.3
337 0.3
338 0.29
339 0.36
340 0.36
341 0.34
342 0.33
343 0.31
344 0.28
345 0.28
346 0.29
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.29
351 0.31
352 0.33
353 0.34
354 0.39
355 0.35
356 0.35
357 0.34
358 0.33
359 0.3
360 0.29
361 0.27
362 0.23
363 0.2
364 0.19
365 0.17
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.12
375 0.11
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.21
381 0.21
382 0.2
383 0.27
384 0.23
385 0.22
386 0.29
387 0.31
388 0.26
389 0.29
390 0.3
391 0.27
392 0.32
393 0.39
394 0.36
395 0.42
396 0.45
397 0.53
398 0.55
399 0.57
400 0.54
401 0.48
402 0.46
403 0.39
404 0.36
405 0.28
406 0.28
407 0.22
408 0.22
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.15
413 0.13
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.16
418 0.19
419 0.24
420 0.32
421 0.35
422 0.37
423 0.4
424 0.38
425 0.39
426 0.36
427 0.32
428 0.24
429 0.21
430 0.18
431 0.15
432 0.12
433 0.08
434 0.07
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.13
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.18
451 0.2
452 0.2
453 0.23
454 0.21
455 0.24
456 0.27
457 0.28
458 0.32
459 0.3
460 0.31
461 0.28
462 0.31
463 0.29
464 0.25
465 0.23
466 0.2
467 0.2
468 0.2
469 0.17
470 0.13
471 0.11
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.09
484 0.09
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.11