FuNGI

A6R9L7

Protein Details

Accession

A6R9L7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
137-158	DRQYEVRKKNQNLQKVPKQNLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	aje:HCAG_05655 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2

Amino Acid Sequences

MSAENSSSKASLFLDSPRKWNLWYNMILGLATELQVLDLISEESPNRMSEIPEPVSPEFPIEYTMEARVKWEMENSRYNNDRNIYKEKLAGVSKIRQEIFRTVAFSELEIATNGNSHIDMKDLLIALKKRLSPRTADRQYEVRKKNQNLQKVPKQNLDQWLDAWTLIEAEIKHSGIDGNFDIWEDFFHINMTIDNPYAAIRKREVEIGGKENFSFADVVNDFRSEYRKKGYSKPGLLVSNLATFNGRQARQSRSRTCVCGSKHSWVKCYYLNPSQRPEGWKENEQRRKKVDEALKNEDIKKKIDAAITKVAASNTEMIEPTLGGMVLLKTSREPTDHSIDHPTDQSSITSDIMPVDRSTRCLNVNVESSPSNQRPYLRDSWIFDTGAERHICNNRSRFLTYEPSEEQIYTGDSTTRVVGYGTVWTYMTNNLGKQFRVILRNAAYIPFSHTNLIAWKPCYHIGGIYLDGKTFRLRRISDNSIFARIEVYGGLLVTEYHRTSENTLVLTNIAPSGKPAEPARISQSEPTKISKSSTTSSYTSKSSTASSKIWHQRLGHPSMRAVEHLPIDAKGVQISDIKDIAKNIDIEDKELCEPCHLAKAKNQISRRPHIRSKLPFERLHADIVQGPSYCYNGERWLIHFVLRWIKRQFDCETKVIRIDNERAIKESDIFKDWVIELGLEIEYSSEYIHEQNGAAERAAYAKIPNEILNRNRSQKLDHRAHIGYLVGYDSTNIFRIWIPHLDRVIRTRDVIFNENRRYNPDEPHIEKQLRDWVVQEVEFLDIEVQEPRVGTPQQENNLCSDIDIFRPDEIPPRTENVDKDNEDINEALEAQLMADILPTPDPTPEPDSNTAIEPDLPIDTHPILSHNRAPRANEISSDFNESNIIEAVSLAKENQNRMINAAFAEPLSRSEPFKIHRSQLPDPPQHWNDVNKHPYRDEWINAAKWEWDSITQQNTYEIVNRPSKDTPVIPLRWVFIYKFDDDGYLTKFKARICVRGDLQPVSDLDTKAHTLAARTFRILLAIINAFDLDAEQLDGVNAFVNSSLDELVYVELPDGWWKLKGVWNLKKNTYVLRLRRALYGLRRSPLLWLKELSNTLKRLGFVPIPEDKCLFTNGRIIIFFYVDDTVVVSHPDDREEKDQLIKDLKNTYEFRQMGNLEWFLNMRITRDRSSKKLWLCQDAYIDKLVDTYHLAHARKASTPLSSIPLAPYQGTASPEDTHYYQRRIGSCIYAAVMTRPDIAYAVGKLATYMTNPSERHSAEIALSPICEIRRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.39
4	0.42
5	0.43
6	0.43
7	0.5
8	0.48
9	0.46
10	0.46
11	0.44
12	0.41
13	0.4
14	0.37
15	0.28
16	0.23
17	0.16
18	0.12
19	0.1
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.05
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.09
29	0.09
30	0.11
31	0.13
32	0.13
33	0.15
34	0.15
35	0.17
36	0.2
37	0.28
38	0.29
39	0.29
40	0.34
41	0.33
42	0.34
43	0.32
44	0.3
45	0.23
46	0.2
47	0.2
48	0.16
49	0.17
50	0.17
51	0.21
52	0.21
53	0.2
54	0.22
55	0.22
56	0.22
57	0.21
58	0.27
59	0.29
60	0.33
61	0.43
62	0.44
63	0.5
64	0.54
65	0.55
66	0.54
67	0.52
68	0.52
69	0.49
70	0.53
71	0.5
72	0.48
73	0.49
74	0.45
75	0.46
76	0.44
77	0.42
78	0.41
79	0.43
80	0.45
81	0.49
82	0.48
83	0.44
84	0.46
85	0.46
86	0.44
87	0.39
88	0.36
89	0.3
90	0.31
91	0.28
92	0.24
93	0.22
94	0.18
95	0.16
96	0.14
97	0.14
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.1
106	0.11
107	0.1
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.19
112	0.21
113	0.23
114	0.27
115	0.31
116	0.35
117	0.42
118	0.44
119	0.45
120	0.53
121	0.6
122	0.64
123	0.65
124	0.62
125	0.64
126	0.71
127	0.74
128	0.71
129	0.7
130	0.7
131	0.71
132	0.77
133	0.76
134	0.76
135	0.76
136	0.8
137	0.81
138	0.81
139	0.81
140	0.79
141	0.76
142	0.72
143	0.71
144	0.66
145	0.56
146	0.47
147	0.44
148	0.36
149	0.31
150	0.25
151	0.15
152	0.11
153	0.09
154	0.12
155	0.09
156	0.11
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.12
163	0.15
164	0.13
165	0.12
166	0.12
167	0.13
168	0.13
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.13
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.1
183	0.11
184	0.15
185	0.18
186	0.19
187	0.2
188	0.23
189	0.24
190	0.28
191	0.29
192	0.31
193	0.33
194	0.35
195	0.36
196	0.34
197	0.32
198	0.29
199	0.26
200	0.2
201	0.16
202	0.11
203	0.15
204	0.14
205	0.17
206	0.18
207	0.18
208	0.18
209	0.18
210	0.25
211	0.2
212	0.24
213	0.3
214	0.35
215	0.4
216	0.48
217	0.58
218	0.61
219	0.64
220	0.64
221	0.63
222	0.58
223	0.55
224	0.47
225	0.39
226	0.34
227	0.28
228	0.24
229	0.18
230	0.16
231	0.21
232	0.26
233	0.25
234	0.24
235	0.29
236	0.37
237	0.45
238	0.55
239	0.56
240	0.56
241	0.6
242	0.6
243	0.59
244	0.58
245	0.52
246	0.53
247	0.5
248	0.52
249	0.55
250	0.54
251	0.55
252	0.5
253	0.5
254	0.45
255	0.46
256	0.43
257	0.45
258	0.51
259	0.51
260	0.53
261	0.54
262	0.53
263	0.53
264	0.52
265	0.52
266	0.49
267	0.53
268	0.57
269	0.64
270	0.7
271	0.73
272	0.75
273	0.71
274	0.72
275	0.66
276	0.66
277	0.65
278	0.64
279	0.65
280	0.65
281	0.66
282	0.64
283	0.66
284	0.63
285	0.55
286	0.48
287	0.42
288	0.37
289	0.34
290	0.35
291	0.33
292	0.32
293	0.37
294	0.36
295	0.34
296	0.32
297	0.28
298	0.24
299	0.22
300	0.19
301	0.12
302	0.13
303	0.12
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.07
309	0.06
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.1
318	0.11
319	0.12
320	0.16
321	0.2
322	0.27
323	0.28
324	0.29
325	0.34
326	0.34
327	0.34
328	0.31
329	0.27
330	0.21
331	0.2
332	0.18
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.12
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.11
342	0.13
343	0.13
344	0.15
345	0.17
346	0.19
347	0.2
348	0.23
349	0.25
350	0.24
351	0.27
352	0.25
353	0.25
354	0.22
355	0.24
356	0.27
357	0.27
358	0.26
359	0.26
360	0.28
361	0.29
362	0.35
363	0.38
364	0.36
365	0.38
366	0.39
367	0.41
368	0.41
369	0.38
370	0.31
371	0.28
372	0.24
373	0.26
374	0.23
375	0.18
376	0.2
377	0.26
378	0.29
379	0.32
380	0.35
381	0.34
382	0.37
383	0.38
384	0.36
385	0.35
386	0.4
387	0.35
388	0.37
389	0.34
390	0.32
391	0.32
392	0.29
393	0.25
394	0.17
395	0.16
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.1
414	0.13
415	0.12
416	0.12
417	0.17
418	0.18
419	0.18
420	0.18
421	0.22
422	0.23
423	0.25
424	0.25
425	0.25
426	0.26
427	0.28
428	0.27
429	0.24
430	0.2
431	0.16
432	0.21
433	0.19
434	0.18
435	0.16
436	0.16
437	0.16
438	0.18
439	0.2
440	0.18
441	0.17
442	0.17
443	0.19
444	0.2
445	0.2
446	0.18
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.15
451	0.15
452	0.13
453	0.13
454	0.13
455	0.13
456	0.15
457	0.15
458	0.16
459	0.21
460	0.23
461	0.28
462	0.36
463	0.43
464	0.42
465	0.46
466	0.45
467	0.42
468	0.4
469	0.34
470	0.27
471	0.19
472	0.16
473	0.1
474	0.09
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.16
488	0.16
489	0.15
490	0.15
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.11
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.1
500	0.1
501	0.13
502	0.13
503	0.18
504	0.19
505	0.21
506	0.25
507	0.24
508	0.24
509	0.26
510	0.3
511	0.29
512	0.29
513	0.31
514	0.28
515	0.27
516	0.27
517	0.26
518	0.25
519	0.23
520	0.24
521	0.25
522	0.25
523	0.27
524	0.27
525	0.26
526	0.23
527	0.22
528	0.2
529	0.18
530	0.18
531	0.2
532	0.19
533	0.19
534	0.26
535	0.34
536	0.35
537	0.37
538	0.37
539	0.4
540	0.45
541	0.5
542	0.45
543	0.38
544	0.37
545	0.34
546	0.33
547	0.27
548	0.22
549	0.17
550	0.14
551	0.14
552	0.13
553	0.11
554	0.12
555	0.11
556	0.1
557	0.08
558	0.07
559	0.08
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.11
570	0.1
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.15
575	0.15
576	0.14
577	0.15
578	0.15
579	0.1
580	0.11
581	0.1
582	0.17
583	0.17
584	0.17
585	0.2
586	0.3
587	0.36
588	0.41
589	0.44
590	0.44
591	0.49
592	0.55
593	0.59
594	0.56
595	0.55
596	0.55
597	0.6
598	0.59
599	0.63
600	0.64
601	0.63
602	0.58
603	0.55
604	0.53
605	0.46
606	0.41
607	0.32
608	0.24
609	0.2
610	0.19
611	0.17
612	0.13
613	0.12
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.08
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.11
622	0.12
623	0.15
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.15
628	0.22
629	0.23
630	0.27
631	0.25
632	0.29
633	0.3
634	0.33
635	0.34
636	0.33
637	0.35
638	0.34
639	0.35
640	0.31
641	0.33
642	0.29
643	0.27
644	0.23
645	0.22
646	0.24
647	0.25
648	0.25
649	0.24
650	0.24
651	0.23
652	0.22
653	0.22
654	0.18
655	0.16
656	0.17
657	0.15
658	0.15
659	0.15
660	0.13
661	0.1
662	0.08
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.03
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.06
678	0.07
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.07
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.06
688	0.07
689	0.08
690	0.09
691	0.12
692	0.13
693	0.18
694	0.21
695	0.27
696	0.3
697	0.34
698	0.36
699	0.34
700	0.36
701	0.39
702	0.45
703	0.46
704	0.44
705	0.44
706	0.42
707	0.41
708	0.37
709	0.3
710	0.2
711	0.13
712	0.12
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.05
717	0.06
718	0.07
719	0.06
720	0.07
721	0.07
722	0.09
723	0.12
724	0.17
725	0.19
726	0.21
727	0.23
728	0.24
729	0.25
730	0.27
731	0.29
732	0.25
733	0.23
734	0.21
735	0.23
736	0.24
737	0.28
738	0.3
739	0.33
740	0.38
741	0.41
742	0.39
743	0.4
744	0.43
745	0.4
746	0.4
747	0.38
748	0.39
749	0.41
750	0.44
751	0.47
752	0.42
753	0.4
754	0.37
755	0.39
756	0.33
757	0.28
758	0.25
759	0.21
760	0.21
761	0.21
762	0.19
763	0.12
764	0.11
765	0.1
766	0.09
767	0.07
768	0.05
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.05
773	0.06
774	0.06
775	0.09
776	0.1
777	0.11
778	0.16
779	0.2
780	0.25
781	0.28
782	0.29
783	0.27
784	0.28
785	0.27
786	0.21
787	0.18
788	0.14
789	0.12
790	0.13
791	0.12
792	0.1
793	0.11
794	0.12
795	0.18
796	0.19
797	0.2
798	0.19
799	0.22
800	0.24
801	0.26
802	0.27
803	0.25
804	0.3
805	0.29
806	0.29
807	0.3
808	0.27
809	0.25
810	0.24
811	0.19
812	0.12
813	0.11
814	0.09
815	0.06
816	0.06
817	0.04
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.04
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.06
828	0.07
829	0.1
830	0.16
831	0.18
832	0.22
833	0.24
834	0.26
835	0.26
836	0.26
837	0.24
838	0.18
839	0.17
840	0.12
841	0.1
842	0.09
843	0.08
844	0.07
845	0.09
846	0.09
847	0.09
848	0.09
849	0.11
850	0.13
851	0.17
852	0.23
853	0.26
854	0.31
855	0.33
856	0.35
857	0.38
858	0.42
859	0.39
860	0.35
861	0.33
862	0.31
863	0.3
864	0.34
865	0.27
866	0.22
867	0.22
868	0.2
869	0.17
870	0.13
871	0.12
872	0.06
873	0.06
874	0.07
875	0.06
876	0.07
877	0.06
878	0.1
879	0.12
880	0.14
881	0.2
882	0.23
883	0.23
884	0.25
885	0.25
886	0.22
887	0.2
888	0.2
889	0.13
890	0.09
891	0.1
892	0.08
893	0.1
894	0.12
895	0.12
896	0.13
897	0.15
898	0.2
899	0.23
900	0.29
901	0.32
902	0.34
903	0.37
904	0.44
905	0.46
906	0.51
907	0.56
908	0.56
909	0.53
910	0.58
911	0.54
912	0.51
913	0.49
914	0.46
915	0.44
916	0.47
917	0.53
918	0.49
919	0.51
920	0.48
921	0.46
922	0.46
923	0.44
924	0.37
925	0.34
926	0.35
927	0.34
928	0.33
929	0.32
930	0.27
931	0.23
932	0.22
933	0.16
934	0.14
935	0.15
936	0.18
937	0.22
938	0.21
939	0.21
940	0.22
941	0.22
942	0.2
943	0.22
944	0.21
945	0.23
946	0.28
947	0.29
948	0.32
949	0.33
950	0.34
951	0.33
952	0.3
953	0.31
954	0.33
955	0.34
956	0.32
957	0.32
958	0.32
959	0.3
960	0.31
961	0.24
962	0.22
963	0.24
964	0.23
965	0.23
966	0.21
967	0.2
968	0.2
969	0.22
970	0.2
971	0.18
972	0.18
973	0.19
974	0.21
975	0.21
976	0.29
977	0.3
978	0.33
979	0.35
980	0.42
981	0.42
982	0.46
983	0.49
984	0.42
985	0.4
986	0.34
987	0.3
988	0.28
989	0.29
990	0.22
991	0.2
992	0.2
993	0.2
994	0.18
995	0.2
996	0.15
997	0.14
998	0.2
999	0.25
1000	0.24
1001	0.25
1002	0.25
1003	0.23
1004	0.24
1005	0.22
1006	0.16
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.11
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.08
1015	0.05
1016	0.04
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.05
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.05
1024	0.05
1025	0.05
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.05
1032	0.06
1033	0.06
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.14
1046	0.2
1047	0.27
1048	0.35
1049	0.44
1050	0.51
1051	0.56
1052	0.59
1053	0.62
1054	0.58
1055	0.57
1056	0.55
1057	0.56
1058	0.55
1059	0.57
1060	0.59
1061	0.55
1062	0.56
1063	0.53
1064	0.51
1065	0.51
1066	0.54
1067	0.5
1068	0.46
1069	0.46
1070	0.43
1071	0.47
1072	0.48
1073	0.43
1074	0.36
1075	0.32
1076	0.32
1077	0.36
1078	0.4
1079	0.39
1080	0.37
1081	0.35
1082	0.36
1083	0.36
1084	0.34
1085	0.31
1086	0.31
1087	0.28
1088	0.24
1089	0.27
1090	0.32
1091	0.33
1092	0.34
1093	0.34
1094	0.3
1095	0.29
1096	0.32
1097	0.28
1098	0.22
1099	0.25
1100	0.25
1101	0.27
1102	0.26
1103	0.26
1104	0.23
1105	0.21
1106	0.19
1107	0.14
1108	0.13
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.09
1114	0.1
1115	0.09
1116	0.11
1117	0.12
1118	0.15
1119	0.17
1120	0.21
1121	0.26
1122	0.29
1123	0.31
1124	0.34
1125	0.36
1126	0.38
1127	0.43
1128	0.4
1129	0.4
1130	0.42
1131	0.42
1132	0.43
1133	0.43
1134	0.42
1135	0.45
1136	0.44
1137	0.41
1138	0.42
1139	0.41
1140	0.37
1141	0.39
1142	0.36
1143	0.27
1144	0.27
1145	0.26
1146	0.2
1147	0.24
1148	0.2
1149	0.18
1150	0.24
1151	0.29
1152	0.34
1153	0.43
1154	0.48
1155	0.5
1156	0.57
1157	0.62
1158	0.62
1159	0.67
1160	0.67
1161	0.67
1162	0.63
1163	0.61
1164	0.61
1165	0.55
1166	0.49
1167	0.43
1168	0.37
1169	0.27
1170	0.25
1171	0.21
1172	0.15
1173	0.15
1174	0.15
1175	0.2
1176	0.27
1177	0.28
1178	0.29
1179	0.34
1180	0.35
1181	0.36
1182	0.38
1183	0.32
1184	0.28
1185	0.3
1186	0.3
1187	0.3
1188	0.29
1189	0.27
1190	0.25
1191	0.26
1192	0.25
1193	0.23
1194	0.21
1195	0.19
1196	0.21
1197	0.22
1198	0.21
1199	0.21
1200	0.21
1201	0.22
1202	0.25
1203	0.25
1204	0.31
1205	0.35
1206	0.37
1207	0.39
1208	0.43
1209	0.44
1210	0.44
1211	0.45
1212	0.4
1213	0.35
1214	0.33
1215	0.3
1216	0.25
1217	0.23
1218	0.22
1219	0.21
1220	0.17
1221	0.18
1222	0.17
1223	0.16
1224	0.15
1225	0.16
1226	0.16
1227	0.15
1228	0.16
1229	0.14
1230	0.13
1231	0.13
1232	0.14
1233	0.14
1234	0.12
1235	0.15
1236	0.17
1237	0.24
1238	0.24
1239	0.28
1240	0.34
1241	0.34
1242	0.37
1243	0.34
1244	0.32
1245	0.27
1246	0.31
1247	0.3
1248	0.23
1249	0.22
1250	0.19
1251	0.2

A6R9L7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer