Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QXN8

Protein Details
Accession A6QXN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-261IMPGSVPEPKKKKEKKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-261PKKKKEKKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG aje:HCAG_02145  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSRHARVEEVSDSDPDDMDPVDFDPANLPANSIISPANIPSATTSRLSPQAQTSASAQSYPPQIDNRDIPRYYQCLYPIYFDKTRSRAEGRKVNKKLAVENPLARDILDAVQVLGLRVGILEPEKLHPKDWANPGRVRVQLKTDDGTPVTDIVKNKHHLYIKVAQYLHEHPTTEESPFRLRIRGLSVPENPVPPPAAPRGWKLGTILPFHSPALTGGGVSDNPFKEAMLEMQQQGLGGDMPIMPGSVPEPKKKKEKKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.15
4 0.11
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.16
14 0.15
15 0.15
16 0.12
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.26
34 0.26
35 0.25
36 0.26
37 0.29
38 0.28
39 0.29
40 0.27
41 0.25
42 0.25
43 0.23
44 0.2
45 0.18
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.21
50 0.23
51 0.26
52 0.31
53 0.34
54 0.38
55 0.37
56 0.36
57 0.37
58 0.38
59 0.36
60 0.33
61 0.29
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.26
66 0.29
67 0.3
68 0.31
69 0.34
70 0.35
71 0.36
72 0.38
73 0.4
74 0.4
75 0.45
76 0.5
77 0.53
78 0.59
79 0.61
80 0.62
81 0.59
82 0.55
83 0.53
84 0.5
85 0.48
86 0.41
87 0.41
88 0.38
89 0.36
90 0.34
91 0.28
92 0.21
93 0.16
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.05
110 0.07
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.17
115 0.19
116 0.25
117 0.33
118 0.37
119 0.36
120 0.37
121 0.39
122 0.41
123 0.43
124 0.39
125 0.31
126 0.29
127 0.28
128 0.27
129 0.26
130 0.22
131 0.2
132 0.18
133 0.18
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.19
141 0.22
142 0.23
143 0.27
144 0.29
145 0.28
146 0.32
147 0.38
148 0.36
149 0.39
150 0.37
151 0.33
152 0.34
153 0.35
154 0.33
155 0.27
156 0.23
157 0.18
158 0.23
159 0.22
160 0.21
161 0.19
162 0.18
163 0.2
164 0.24
165 0.25
166 0.22
167 0.21
168 0.22
169 0.27
170 0.29
171 0.3
172 0.31
173 0.32
174 0.35
175 0.36
176 0.36
177 0.3
178 0.26
179 0.24
180 0.19
181 0.2
182 0.19
183 0.22
184 0.23
185 0.25
186 0.31
187 0.3
188 0.31
189 0.3
190 0.31
191 0.31
192 0.32
193 0.31
194 0.26
195 0.27
196 0.26
197 0.24
198 0.19
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.1
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.16
208 0.13
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.18
222 0.16
223 0.1
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.16
234 0.21
235 0.3
236 0.38
237 0.45
238 0.56
239 0.67
240 0.76
241 0.78