Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A6R6E9

Protein Details
Accession A6R6E9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-288ITSTSKNKVTKPKPKVEHKKVKKARRSGKTTNTHMVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-280NKVTKPKPKVEHKKVKKARRSGK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11, nucl 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG aje:HCAG_05207  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MSYFQNQINQFSSSVVSAAGRLPQDRRTAGGNLAAAGSSSVATSTTAQAVRSSSTNAVANGRRHDADTVYSQPANTGTGKDIMTQVVFAIDHMKSKDYALKFADILSYLSLQQQGHDPGYIQALKRILQSHDKVEYDPSGANGEGTFRFKPPHNIRSAEQLLRKLQSQPTAQGMSVRELREGWPNIVQAIDKLEEEGKLLVTRNKKDNQPKMVWANDPSLIQHFDPEFRQIWEKIKIPDQQTVTDELEKAGITSTSKNKVTKPKPKVEHKKVKKARRSGKTTNTHMVGVLRDYSHLKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.14
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.15
8 0.17
9 0.2
10 0.25
11 0.31
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.33
18 0.28
19 0.22
20 0.21
21 0.19
22 0.15
23 0.12
24 0.1
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.08
31 0.09
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.16
41 0.18
42 0.19
43 0.19
44 0.24
45 0.28
46 0.31
47 0.32
48 0.34
49 0.31
50 0.31
51 0.31
52 0.27
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.2
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.09
77 0.08
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.14
83 0.2
84 0.17
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.2
91 0.14
92 0.14
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.15
107 0.16
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.17
113 0.19
114 0.18
115 0.23
116 0.25
117 0.26
118 0.29
119 0.28
120 0.26
121 0.26
122 0.24
123 0.18
124 0.17
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.23
138 0.29
139 0.35
140 0.37
141 0.39
142 0.39
143 0.46
144 0.49
145 0.43
146 0.38
147 0.35
148 0.33
149 0.31
150 0.31
151 0.26
152 0.24
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.25
157 0.25
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.2
162 0.23
163 0.21
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.22
168 0.22
169 0.21
170 0.19
171 0.19
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.14
188 0.2
189 0.24
190 0.31
191 0.35
192 0.43
193 0.52
194 0.59
195 0.63
196 0.6
197 0.63
198 0.62
199 0.6
200 0.55
201 0.47
202 0.41
203 0.35
204 0.31
205 0.25
206 0.22
207 0.21
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.21
214 0.19
215 0.19
216 0.23
217 0.23
218 0.27
219 0.31
220 0.34
221 0.34
222 0.39
223 0.43
224 0.42
225 0.46
226 0.43
227 0.41
228 0.39
229 0.4
230 0.36
231 0.32
232 0.29
233 0.23
234 0.21
235 0.17
236 0.16
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.15
241 0.21
242 0.27
243 0.32
244 0.35
245 0.42
246 0.52
247 0.61
248 0.66
249 0.69
250 0.73
251 0.78
252 0.86
253 0.9
254 0.91
255 0.92
256 0.91
257 0.93
258 0.93
259 0.94
260 0.92
261 0.92
262 0.91
263 0.9
264 0.89
265 0.88
266 0.88
267 0.87
268 0.85
269 0.83
270 0.75
271 0.65
272 0.57
273 0.49
274 0.41
275 0.33
276 0.29
277 0.2
278 0.2