Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6RE89

Protein Details
Accession A6RE89    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MTTVRAAKRMIHRSRHRRGAGFPHydrophilic
309-329RYRSRYKSVLHKKVQKHGRKVBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG aje:HCAG_07954  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
Amino Acid Sequences MTTVRAAKRMIHRSRHRRGAGFPHSHPLLYRAVLGLRSQEQPLQVVKMSNGKTAGDAEPPSCPILLARGEALMLSSAVAQVVFEMVTDCSMMTAAETERAYGERAVDDPDGKRRRWTREEDGCLVALKTDGFSWPEIKERFPQRQLGSLRQRWYTTLQNMQAIPATDEWRQEGKCKRAHRFLGSAGEPLPTSKPPTPLETSHRYPGRQPQTRDPATPKAEPCTPSLSSTVTAMCPVCNSVVEVEASGAFNAPNNCMPVGEQLRFCENHQKETARCEWSRHRYPFIAWDCLDDRLTQFHPRLRWILNDPRYRSRYKSVLHKKVQKHGRKVLSQNVLHRTGYYGLRGHGILSEHVVRHFARDIDSLAGIDALVSKYGTVVYAQEVLVPELLEMLVQKDMGVDLKGARRILKESNKIGKLFNYSGLSACQAMTHTNYSGDIHATQPPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.89
3 0.86
4 0.8
5 0.79
6 0.79
7 0.78
8 0.75
9 0.67
10 0.66
11 0.6
12 0.55
13 0.48
14 0.41
15 0.34
16 0.27
17 0.26
18 0.19
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.22
23 0.21
24 0.23
25 0.23
26 0.24
27 0.23
28 0.25
29 0.27
30 0.25
31 0.24
32 0.23
33 0.23
34 0.29
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.27
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.18
49 0.16
50 0.12
51 0.15
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.06
81 0.06
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.14
94 0.17
95 0.18
96 0.27
97 0.31
98 0.31
99 0.39
100 0.43
101 0.5
102 0.55
103 0.61
104 0.62
105 0.67
106 0.73
107 0.68
108 0.63
109 0.54
110 0.47
111 0.38
112 0.28
113 0.18
114 0.12
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.19
123 0.2
124 0.22
125 0.28
126 0.34
127 0.41
128 0.42
129 0.49
130 0.43
131 0.5
132 0.52
133 0.54
134 0.57
135 0.54
136 0.54
137 0.5
138 0.49
139 0.43
140 0.44
141 0.41
142 0.36
143 0.37
144 0.35
145 0.36
146 0.35
147 0.33
148 0.3
149 0.24
150 0.2
151 0.15
152 0.16
153 0.13
154 0.14
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.24
159 0.29
160 0.33
161 0.38
162 0.45
163 0.5
164 0.55
165 0.59
166 0.57
167 0.53
168 0.5
169 0.5
170 0.43
171 0.37
172 0.29
173 0.25
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.11
178 0.14
179 0.15
180 0.2
181 0.21
182 0.26
183 0.28
184 0.3
185 0.36
186 0.38
187 0.39
188 0.41
189 0.42
190 0.38
191 0.37
192 0.43
193 0.47
194 0.47
195 0.48
196 0.5
197 0.56
198 0.58
199 0.58
200 0.53
201 0.51
202 0.48
203 0.48
204 0.4
205 0.34
206 0.36
207 0.34
208 0.31
209 0.28
210 0.25
211 0.22
212 0.23
213 0.2
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.1
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.14
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.21
250 0.22
251 0.23
252 0.27
253 0.24
254 0.28
255 0.31
256 0.33
257 0.31
258 0.35
259 0.4
260 0.36
261 0.36
262 0.36
263 0.42
264 0.48
265 0.56
266 0.54
267 0.53
268 0.48
269 0.49
270 0.53
271 0.48
272 0.44
273 0.34
274 0.34
275 0.31
276 0.32
277 0.31
278 0.22
279 0.18
280 0.17
281 0.19
282 0.2
283 0.22
284 0.24
285 0.25
286 0.28
287 0.32
288 0.3
289 0.32
290 0.34
291 0.41
292 0.46
293 0.51
294 0.53
295 0.58
296 0.61
297 0.6
298 0.58
299 0.54
300 0.53
301 0.5
302 0.56
303 0.59
304 0.65
305 0.7
306 0.75
307 0.74
308 0.76
309 0.82
310 0.8
311 0.78
312 0.77
313 0.76
314 0.75
315 0.74
316 0.74
317 0.73
318 0.67
319 0.65
320 0.61
321 0.57
322 0.49
323 0.43
324 0.37
325 0.31
326 0.29
327 0.25
328 0.21
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.18
333 0.16
334 0.16
335 0.13
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.19
341 0.16
342 0.18
343 0.2
344 0.18
345 0.17
346 0.18
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.12
388 0.18
389 0.22
390 0.24
391 0.26
392 0.27
393 0.31
394 0.4
395 0.46
396 0.49
397 0.55
398 0.63
399 0.65
400 0.64
401 0.63
402 0.58
403 0.55
404 0.49
405 0.45
406 0.38
407 0.34
408 0.34
409 0.33
410 0.3
411 0.23
412 0.21
413 0.15
414 0.13
415 0.15
416 0.17
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.22
424 0.19
425 0.18