Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A6QX01

Protein Details
Accession A6QX01    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-64VKEMAKKIVKEDKKSKKREPSPSESESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-55APKSKVKEMAKKIVKEDKKSKKRE
447-482GGGRGGGGRGGGRGGARGGRGGGGRGGGAPRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG aje:HCAG_01908  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKIKSSSKTSKGEDKVVSKVKNGSVTKSSVAPKSKVKEMAKKIVKEDKKSKKREPSPSESESESESSDGTEASSSESESESETETKPAPTKAATKTARVEPESESESESESESESESESDSVSEESSSSEDEKPATNGKKVETSESNESESESDSDSDSNSDSEASATEETKPVAKAVAKESTIEESDNDSDSSEGSEEDSSDESSDDSAEESAEESEEAENAEAEKPSSKSQKRKAEDEEEEVSAPKKTKVDSNEGGNLFIGNLSWNVDEEWLRSEFEEFGELAGVRIVTDRDSGRSRGFGYVEFTNAADAAKAHAAKKDAELDGRKLNVDFANGRSNAAPKERAQSRAQNFGDQTSPESDTLFIGNIAFSANENMISEAFAEHGSILGVRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVDEARSAFQALNGADLGGRSMRLDFSSPRQNSGGGGRGGGGRGGGRGGARGGRGGGGRGGGAPRGGRGGSTNRGGFGDYRGTKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.63
3 0.64
4 0.65
5 0.61
6 0.55
7 0.56
8 0.52
9 0.54
10 0.52
11 0.49
12 0.45
13 0.46
14 0.44
15 0.44
16 0.45
17 0.43
18 0.47
19 0.46
20 0.49
21 0.51
22 0.57
23 0.6
24 0.63
25 0.65
26 0.68
27 0.74
28 0.74
29 0.73
30 0.73
31 0.74
32 0.74
33 0.74
34 0.76
35 0.76
36 0.78
37 0.83
38 0.86
39 0.86
40 0.89
41 0.9
42 0.89
43 0.87
44 0.85
45 0.8
46 0.74
47 0.64
48 0.56
49 0.48
50 0.4
51 0.31
52 0.23
53 0.18
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.2
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.23
78 0.29
79 0.31
80 0.4
81 0.4
82 0.42
83 0.46
84 0.5
85 0.53
86 0.47
87 0.45
88 0.37
89 0.39
90 0.37
91 0.32
92 0.27
93 0.21
94 0.21
95 0.2
96 0.17
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.23
123 0.25
124 0.26
125 0.27
126 0.28
127 0.33
128 0.33
129 0.36
130 0.33
131 0.36
132 0.38
133 0.38
134 0.38
135 0.32
136 0.32
137 0.27
138 0.24
139 0.19
140 0.13
141 0.12
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.18
166 0.23
167 0.21
168 0.22
169 0.23
170 0.23
171 0.22
172 0.2
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.13
217 0.22
218 0.28
219 0.36
220 0.45
221 0.55
222 0.57
223 0.62
224 0.64
225 0.63
226 0.6
227 0.56
228 0.49
229 0.4
230 0.36
231 0.31
232 0.25
233 0.18
234 0.16
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.15
239 0.19
240 0.26
241 0.27
242 0.3
243 0.35
244 0.33
245 0.33
246 0.28
247 0.24
248 0.16
249 0.13
250 0.1
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.2
309 0.19
310 0.22
311 0.24
312 0.25
313 0.27
314 0.27
315 0.26
316 0.21
317 0.23
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.22
323 0.22
324 0.23
325 0.21
326 0.23
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.2
331 0.28
332 0.31
333 0.35
334 0.37
335 0.44
336 0.44
337 0.51
338 0.5
339 0.47
340 0.44
341 0.41
342 0.38
343 0.29
344 0.28
345 0.21
346 0.22
347 0.17
348 0.17
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.09
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.12
383 0.16
384 0.16
385 0.19
386 0.26
387 0.29
388 0.29
389 0.29
390 0.28
391 0.28
392 0.32
393 0.32
394 0.32
395 0.31
396 0.32
397 0.32
398 0.31
399 0.3
400 0.26
401 0.22
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.14
424 0.16
425 0.22
426 0.33
427 0.33
428 0.36
429 0.36
430 0.35
431 0.34
432 0.36
433 0.36
434 0.26
435 0.25
436 0.22
437 0.22
438 0.22
439 0.2
440 0.16
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.1
447 0.12
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.15
452 0.17
453 0.17
454 0.17
455 0.17
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.14
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.18
468 0.24
469 0.28
470 0.34
471 0.34
472 0.32
473 0.33
474 0.34
475 0.3
476 0.28
477 0.32
478 0.28
479 0.32
480 0.34