FuNGI

A6QV35

Protein Details

Accession

A6QV35

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
464-488	ATKLKEFKEKKEKAKKDKDNSGGKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-424	GRSGRGRGGSRGS
468-481	KEFKEKKEKAKKDK

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 8, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR013103 RVT_2
KEGG	aje:HCAG_01242 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2

Amino Acid Sequences

MMMMSLHARALLMNEPSNPPETPFRFAAGLNTAPDTVRPAARPTQPTQSTRTTRQLSEAGSHHDEAARRSEALLSDEVLSDVQLQRLMMTFEMEKERRKIMEEKRKALEIELKLEEMRARRAANNPQNADNNTPTTPTARTHTWDPDLGERLEYNLYDPDSRVGKAIAQFKEDVKSMTKPNALTGTSNFLTWNASMKTKLVDAQCWGIIEKQQVQNPLQDPEWAPFWDARNRWTYAFISNSLGANVRPRFIKNDENRIAYTLWRAIEEEYSIPKTQLRREAVLEFTSLGGTQVTNVHSFFDKFRAAIMKLEMMDAHPPDAWVFDIFYSALPNVWRGYVQKKIEEAQESKSTPVVLDVHLLMEEIRSRLDPPKDKKPAQSVNTAANAAQSGATAAADSANNNSANTSNSARGGRSGRGRGGSRGSGRGGAGNPPTCSECNRSHFGTVCWFTNPDQAPDDWKANNATKLKEFKEKKEKAKKDKDNSGGKTQLVITDGSESFQMANLAKVINVPACFVEPHKEPLTIWDSGAGCHIASDRSRFSTLFTIDSPTVQVANKAVLKVQGVGMASIPVGERLIEFNHVYYVPGLSANLISAGLMERQGYIRRDMHVDAGNYFEFLSPTGNDVFYANLSRNNIYILSDSPPTFDGVMNDQEYGAVAYVAVPKPKTISTDYDPNAGSLGPFSREEVERLINPKDPDTDSFVISPPNRLPAVVPKQLPFDEWHRRLGHIGENNILKMARDPRFGIAIIGPKKLSFCATCVKAKQRRATYNKNSAPRRATRKALKIWVDIFGGGETLGTENDISSYAGKKLAMIITDDATRNQMGTDPPSYPVTRWVSERSIGLIIEKARSLLIDSSAPEKMLVDPSNGRLYISKDVIFQEDLHLMDPSAPATGHPKTLPTAARQAAAAIPSPIPSPTPGPIPSVNDLFIDEEVQPLRPLFLVPTNNWWIDYEISARIPTFLVQNTPISPSPPIEIEDTPTITGNNDSVGESSVGDGSDDLPSDPEIYGLPIPKNLTRAKASPEWKFYYKACVKEVNRLKQIGAWRLIERTPNMAVLRGQWVFDKKFNNMGKVVRYKARWVVCGNYQQKGVNYSKTFAPVVSASTSRLSWQSRHPEGGTFCKSIW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.25
3	0.27
4	0.3
5	0.28
6	0.27
7	0.32
8	0.34
9	0.36
10	0.35
11	0.35
12	0.34
13	0.34
14	0.35
15	0.3
16	0.3
17	0.26
18	0.26
19	0.24
20	0.22
21	0.22
22	0.23
23	0.21
24	0.22
25	0.22
26	0.25
27	0.33
28	0.4
29	0.46
30	0.46
31	0.53
32	0.57
33	0.58
34	0.59
35	0.62
36	0.61
37	0.62
38	0.67
39	0.62
40	0.56
41	0.58
42	0.56
43	0.49
44	0.47
45	0.43
46	0.41
47	0.4
48	0.39
49	0.35
50	0.34
51	0.33
52	0.3
53	0.32
54	0.27
55	0.23
56	0.23
57	0.25
58	0.23
59	0.24
60	0.23
61	0.18
62	0.17
63	0.17
64	0.17
65	0.14
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.12
70	0.13
71	0.12
72	0.12
73	0.14
74	0.15
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.15
79	0.24
80	0.27
81	0.31
82	0.33
83	0.38
84	0.37
85	0.41
86	0.47
87	0.49
88	0.57
89	0.61
90	0.65
91	0.65
92	0.68
93	0.64
94	0.59
95	0.56
96	0.49
97	0.46
98	0.4
99	0.37
100	0.32
101	0.33
102	0.33
103	0.27
104	0.28
105	0.26
106	0.27
107	0.3
108	0.37
109	0.47
110	0.52
111	0.58
112	0.57
113	0.58
114	0.62
115	0.61
116	0.59
117	0.51
118	0.46
119	0.37
120	0.36
121	0.31
122	0.28
123	0.27
124	0.24
125	0.26
126	0.26
127	0.29
128	0.32
129	0.38
130	0.39
131	0.39
132	0.39
133	0.4
134	0.41
135	0.38
136	0.34
137	0.27
138	0.25
139	0.24
140	0.21
141	0.17
142	0.16
143	0.17
144	0.17
145	0.17
146	0.2
147	0.2
148	0.2
149	0.2
150	0.17
151	0.19
152	0.23
153	0.31
154	0.28
155	0.29
156	0.31
157	0.31
158	0.34
159	0.32
160	0.28
161	0.24
162	0.27
163	0.28
164	0.32
165	0.34
166	0.31
167	0.34
168	0.37
169	0.34
170	0.32
171	0.3
172	0.31
173	0.27
174	0.27
175	0.23
176	0.19
177	0.19
178	0.17
179	0.21
180	0.16
181	0.17
182	0.18
183	0.19
184	0.2
185	0.19
186	0.24
187	0.21
188	0.21
189	0.22
190	0.24
191	0.24
192	0.23
193	0.23
194	0.2
195	0.2
196	0.22
197	0.27
198	0.29
199	0.31
200	0.35
201	0.35
202	0.4
203	0.39
204	0.38
205	0.32
206	0.3
207	0.28
208	0.25
209	0.27
210	0.21
211	0.2
212	0.2
213	0.23
214	0.28
215	0.28
216	0.3
217	0.32
218	0.34
219	0.33
220	0.34
221	0.32
222	0.29
223	0.3
224	0.28
225	0.26
226	0.26
227	0.25
228	0.22
229	0.21
230	0.17
231	0.21
232	0.21
233	0.2
234	0.2
235	0.21
236	0.26
237	0.3
238	0.4
239	0.39
240	0.49
241	0.52
242	0.54
243	0.53
244	0.49
245	0.45
246	0.36
247	0.32
248	0.25
249	0.2
250	0.17
251	0.17
252	0.16
253	0.16
254	0.17
255	0.15
256	0.16
257	0.19
258	0.18
259	0.18
260	0.2
261	0.23
262	0.27
263	0.34
264	0.35
265	0.34
266	0.37
267	0.39
268	0.39
269	0.36
270	0.31
271	0.23
272	0.19
273	0.16
274	0.12
275	0.1
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.15
286	0.15
287	0.17
288	0.16
289	0.15
290	0.17
291	0.2
292	0.2
293	0.21
294	0.21
295	0.2
296	0.19
297	0.19
298	0.17
299	0.14
300	0.16
301	0.14
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.11
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.12
323	0.16
324	0.23
325	0.25
326	0.27
327	0.29
328	0.31
329	0.34
330	0.37
331	0.35
332	0.32
333	0.35
334	0.33
335	0.32
336	0.3
337	0.26
338	0.2
339	0.2
340	0.17
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.09
354	0.15
355	0.23
356	0.31
357	0.36
358	0.46
359	0.55
360	0.58
361	0.62
362	0.66
363	0.67
364	0.62
365	0.63
366	0.55
367	0.5
368	0.49
369	0.43
370	0.33
371	0.25
372	0.22
373	0.15
374	0.12
375	0.07
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.13
394	0.15
395	0.16
396	0.16
397	0.19
398	0.2
399	0.22
400	0.26
401	0.28
402	0.28
403	0.31
404	0.33
405	0.32
406	0.33
407	0.33
408	0.3
409	0.29
410	0.28
411	0.24
412	0.23
413	0.23
414	0.2
415	0.18
416	0.2
417	0.19
418	0.19
419	0.19
420	0.21
421	0.19
422	0.21
423	0.23
424	0.25
425	0.27
426	0.31
427	0.31
428	0.31
429	0.31
430	0.3
431	0.32
432	0.28
433	0.24
434	0.21
435	0.21
436	0.2
437	0.26
438	0.25
439	0.2
440	0.2
441	0.19
442	0.22
443	0.23
444	0.25
445	0.18
446	0.19
447	0.21
448	0.21
449	0.27
450	0.26
451	0.25
452	0.28
453	0.33
454	0.34
455	0.4
456	0.42
457	0.45
458	0.53
459	0.59
460	0.65
461	0.71
462	0.77
463	0.78
464	0.86
465	0.86
466	0.84
467	0.85
468	0.83
469	0.81
470	0.76
471	0.71
472	0.63
473	0.53
474	0.46
475	0.37
476	0.29
477	0.21
478	0.17
479	0.11
480	0.11
481	0.11
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.09
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.12
503	0.11
504	0.16
505	0.17
506	0.17
507	0.16
508	0.2
509	0.23
510	0.2
511	0.18
512	0.17
513	0.16
514	0.16
515	0.16
516	0.12
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.06
521	0.07
522	0.1
523	0.1
524	0.12
525	0.13
526	0.13
527	0.15
528	0.17
529	0.18
530	0.17
531	0.16
532	0.17
533	0.16
534	0.16
535	0.14
536	0.1
537	0.11
538	0.09
539	0.09
540	0.07
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.06
587	0.1
588	0.11
589	0.14
590	0.15
591	0.16
592	0.18
593	0.19
594	0.21
595	0.21
596	0.2
597	0.17
598	0.17
599	0.16
600	0.14
601	0.14
602	0.1
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.06
607	0.07
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.07
614	0.08
615	0.07
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.1
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.12
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.11
633	0.1
634	0.11
635	0.13
636	0.13
637	0.12
638	0.12
639	0.11
640	0.1
641	0.09
642	0.07
643	0.04
644	0.03
645	0.04
646	0.08
647	0.09
648	0.1
649	0.1
650	0.1
651	0.12
652	0.13
653	0.16
654	0.15
655	0.19
656	0.22
657	0.3
658	0.31
659	0.33
660	0.32
661	0.29
662	0.26
663	0.21
664	0.17
665	0.09
666	0.09
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.11
671	0.11
672	0.13
673	0.14
674	0.15
675	0.15
676	0.18
677	0.2
678	0.21
679	0.22
680	0.22
681	0.22
682	0.22
683	0.22
684	0.25
685	0.25
686	0.22
687	0.22
688	0.21
689	0.23
690	0.22
691	0.23
692	0.16
693	0.19
694	0.18
695	0.17
696	0.17
697	0.22
698	0.29
699	0.32
700	0.33
701	0.3
702	0.33
703	0.33
704	0.34
705	0.27
706	0.28
707	0.33
708	0.33
709	0.38
710	0.36
711	0.37
712	0.37
713	0.36
714	0.35
715	0.29
716	0.28
717	0.26
718	0.26
719	0.25
720	0.24
721	0.22
722	0.16
723	0.15
724	0.22
725	0.2
726	0.22
727	0.23
728	0.24
729	0.26
730	0.26
731	0.23
732	0.17
733	0.22
734	0.22
735	0.22
736	0.21
737	0.19
738	0.2
739	0.19
740	0.2
741	0.13
742	0.13
743	0.19
744	0.23
745	0.27
746	0.32
747	0.41
748	0.46
749	0.53
750	0.59
751	0.6
752	0.67
753	0.71
754	0.76
755	0.76
756	0.79
757	0.79
758	0.8
759	0.75
760	0.71
761	0.7
762	0.67
763	0.67
764	0.62
765	0.64
766	0.63
767	0.67
768	0.68
769	0.69
770	0.65
771	0.6
772	0.55
773	0.49
774	0.41
775	0.33
776	0.26
777	0.18
778	0.14
779	0.09
780	0.07
781	0.05
782	0.05
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.05
788	0.06
789	0.06
790	0.07
791	0.08
792	0.09
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.13
797	0.13
798	0.13
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.16
803	0.17
804	0.14
805	0.15
806	0.14
807	0.12
808	0.11
809	0.12
810	0.11
811	0.14
812	0.16
813	0.15
814	0.18
815	0.21
816	0.22
817	0.2
818	0.26
819	0.27
820	0.27
821	0.29
822	0.31
823	0.31
824	0.32
825	0.32
826	0.26
827	0.23
828	0.21
829	0.19
830	0.17
831	0.15
832	0.15
833	0.15
834	0.12
835	0.11
836	0.11
837	0.12
838	0.1
839	0.11
840	0.11
841	0.12
842	0.15
843	0.16
844	0.16
845	0.14
846	0.13
847	0.13
848	0.17
849	0.17
850	0.17
851	0.18
852	0.22
853	0.26
854	0.25
855	0.24
856	0.21
857	0.24
858	0.26
859	0.27
860	0.24
861	0.22
862	0.24
863	0.25
864	0.25
865	0.21
866	0.18
867	0.18
868	0.17
869	0.16
870	0.15
871	0.12
872	0.12
873	0.12
874	0.1
875	0.08
876	0.08
877	0.07
878	0.13
879	0.14
880	0.16
881	0.16
882	0.17
883	0.18
884	0.24
885	0.26
886	0.24
887	0.31
888	0.3
889	0.3
890	0.28
891	0.28
892	0.24
893	0.23
894	0.2
895	0.13
896	0.12
897	0.12
898	0.12
899	0.12
900	0.11
901	0.12
902	0.14
903	0.14
904	0.19
905	0.19
906	0.23
907	0.25
908	0.28
909	0.3
910	0.29
911	0.28
912	0.23
913	0.23
914	0.2
915	0.18
916	0.15
917	0.12
918	0.12
919	0.12
920	0.13
921	0.13
922	0.11
923	0.12
924	0.1
925	0.11
926	0.11
927	0.17
928	0.2
929	0.21
930	0.28
931	0.32
932	0.32
933	0.32
934	0.31
935	0.26
936	0.23
937	0.23
938	0.19
939	0.16
940	0.17
941	0.17
942	0.16
943	0.15
944	0.14
945	0.14
946	0.15
947	0.14
948	0.15
949	0.17
950	0.19
951	0.2
952	0.24
953	0.23
954	0.22
955	0.22
956	0.21
957	0.21
958	0.2
959	0.21
960	0.2
961	0.2
962	0.22
963	0.24
964	0.24
965	0.22
966	0.21
967	0.2
968	0.17
969	0.17
970	0.13
971	0.11
972	0.1
973	0.1
974	0.1
975	0.12
976	0.11
977	0.1
978	0.11
979	0.1
980	0.09
981	0.09
982	0.08
983	0.08
984	0.09
985	0.09
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.11
990	0.1
991	0.1
992	0.09
993	0.11
994	0.13
995	0.17
996	0.17
997	0.19
998	0.22
999	0.24
1000	0.3
1001	0.31
1002	0.34
1003	0.35
1004	0.38
1005	0.41
1006	0.47
1007	0.51
1008	0.53
1009	0.57
1010	0.58
1011	0.56
1012	0.57
1013	0.51
1014	0.53
1015	0.53
1016	0.5
1017	0.47
1018	0.5
1019	0.5
1020	0.56
1021	0.65
1022	0.64
1023	0.64
1024	0.6
1025	0.56
1026	0.51
1027	0.57
1028	0.54
1029	0.49
1030	0.43
1031	0.39
1032	0.41
1033	0.43
1034	0.43
1035	0.37
1036	0.34
1037	0.3
1038	0.32
1039	0.3
1040	0.29
1041	0.28
1042	0.25
1043	0.3
1044	0.26
1045	0.25
1046	0.25
1047	0.31
1048	0.33
1049	0.38
1050	0.4
1051	0.36
1052	0.45
1053	0.48
1054	0.48
1055	0.46
1056	0.48
1057	0.51
1058	0.54
1059	0.57
1060	0.55
1061	0.53
1062	0.55
1063	0.58
1064	0.58
1065	0.54
1066	0.5
1067	0.5
1068	0.51
1069	0.58
1070	0.56
1071	0.52
1072	0.5
1073	0.48
1074	0.46
1075	0.48
1076	0.45
1077	0.44
1078	0.42
1079	0.41
1080	0.41
1081	0.42
1082	0.4
1083	0.32
1084	0.32
1085	0.23
1086	0.24
1087	0.25
1088	0.23
1089	0.21
1090	0.23
1091	0.23
1092	0.21
1093	0.27
1094	0.28
1095	0.28
1096	0.36
1097	0.44
1098	0.47
1099	0.53
1100	0.52
1101	0.52
1102	0.53
1103	0.59
1104	0.56

A6QV35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer