FuNGI

A6RFB4

Protein Details

Accession

A6RFB4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-62	FDRRLTWRPHVSTRAKKARA	Hydrophilic
490-516	LCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
75-78	RRAP

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 6, nucl 4, plas 2, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	aje:HCAG_08330 -
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR

Amino Acid Sequences

MIHLTRKRHNEAPAVVVSEDLTVHPVTAPAGQEPALRWLGVHFDRRLTWRPHVSTRAKKARAVAQHIPESGKDQRRAPSRRSAEGGHHLRGSLTALWHRGLVRRPHAASKAHGQEWGVFRTTPIATLYRDAGLPSAMVALEEAKIRFATRLQVVDEKHPLASRIAPPMITRGRGAGTRQRSKTKIQRLGALLPAVNRPTLAIPHYSEGCGTDPTEGVDKKSAAQAFKEWWRSLTRSTDLYVFSDGSERNLDNSRQVGYGFIVYQGNKQLASFSAALSPMSHVFDAEAVGACRALECAVKLLPCVTEDSSNPQIWLCLDNTSVIWGIRGSAAASSNWAYNRCHELLRQHNVGLKWAPGHMGIEGNEEADRLAKRAVSSTAAPAYGLEATPTVSGVRTVAKQLSQEARRKWWSGACGKLSDWYRGWSFSRPTVEYQVKAPPELTMPRHALHRWLALRSSHGDFSWYHRRFQHADARLTCVCGHNKSPEHLVLCRHSQRHFLHWPKRPAARPHNRATAVAYLGSLTPTDFVELLDCTQFYTRYCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.43
3	0.37
4	0.3
5	0.22
6	0.19
7	0.13
8	0.12
9	0.09
10	0.1
11	0.09
12	0.1
13	0.1
14	0.12
15	0.13
16	0.12
17	0.14
18	0.14
19	0.16
20	0.17
21	0.22
22	0.2
23	0.19
24	0.17
25	0.17
26	0.24
27	0.26
28	0.32
29	0.28
30	0.3
31	0.34
32	0.4
33	0.47
34	0.46
35	0.49
36	0.52
37	0.56
38	0.61
39	0.68
40	0.72
41	0.74
42	0.79
43	0.81
44	0.75
45	0.73
46	0.71
47	0.69
48	0.68
49	0.66
50	0.63
51	0.6
52	0.61
53	0.6
54	0.55
55	0.48
56	0.44
57	0.45
58	0.45
59	0.42
60	0.41
61	0.47
62	0.56
63	0.61
64	0.61
65	0.63
66	0.61
67	0.62
68	0.62
69	0.57
70	0.54
71	0.58
72	0.58
73	0.51
74	0.46
75	0.4
76	0.36
77	0.33
78	0.29
79	0.2
80	0.18
81	0.18
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.22
86	0.25
87	0.3
88	0.35
89	0.37
90	0.43
91	0.45
92	0.49
93	0.53
94	0.52
95	0.48
96	0.49
97	0.5
98	0.44
99	0.43
100	0.37
101	0.37
102	0.37
103	0.36
104	0.29
105	0.22
106	0.21
107	0.23
108	0.23
109	0.18
110	0.17
111	0.17
112	0.16
113	0.18
114	0.19
115	0.16
116	0.16
117	0.15
118	0.13
119	0.11
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.06
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.15
136	0.16
137	0.19
138	0.2
139	0.25
140	0.27
141	0.31
142	0.33
143	0.29
144	0.27
145	0.25
146	0.24
147	0.2
148	0.23
149	0.21
150	0.22
151	0.22
152	0.21
153	0.21
154	0.27
155	0.28
156	0.25
157	0.22
158	0.19
159	0.2
160	0.21
161	0.24
162	0.25
163	0.32
164	0.4
165	0.44
166	0.5
167	0.51
168	0.58
169	0.64
170	0.67
171	0.67
172	0.6
173	0.62
174	0.58
175	0.58
176	0.51
177	0.43
178	0.33
179	0.25
180	0.25
181	0.19
182	0.16
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.14
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.19
208	0.2
209	0.17
210	0.17
211	0.18
212	0.2
213	0.25
214	0.3
215	0.26
216	0.25
217	0.28
218	0.29
219	0.3
220	0.31
221	0.28
222	0.24
223	0.25
224	0.25
225	0.23
226	0.22
227	0.2
228	0.15
229	0.12
230	0.14
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.15
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.09
245	0.1
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.11
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.1
265	0.07
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.17
295	0.2
296	0.2
297	0.2
298	0.17
299	0.17
300	0.16
301	0.17
302	0.11
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.08
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.06
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.11
323	0.13
324	0.13
325	0.15
326	0.2
327	0.2
328	0.21
329	0.21
330	0.28
331	0.34
332	0.4
333	0.39
334	0.35
335	0.38
336	0.37
337	0.37
338	0.3
339	0.23
340	0.17
341	0.16
342	0.15
343	0.11
344	0.12
345	0.09
346	0.1
347	0.1
348	0.12
349	0.11
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.12
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.16
367	0.16
368	0.14
369	0.13
370	0.11
371	0.1
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.09
382	0.09
383	0.12
384	0.14
385	0.15
386	0.16
387	0.21
388	0.29
389	0.34
390	0.4
391	0.42
392	0.48
393	0.51
394	0.52
395	0.5
396	0.46
397	0.46
398	0.46
399	0.49
400	0.45
401	0.42
402	0.4
403	0.43
404	0.41
405	0.38
406	0.32
407	0.29
408	0.27
409	0.28
410	0.3
411	0.3
412	0.31
413	0.32
414	0.37
415	0.35
416	0.37
417	0.43
418	0.45
419	0.4
420	0.39
421	0.4
422	0.36
423	0.35
424	0.31
425	0.24
426	0.24
427	0.28
428	0.29
429	0.28
430	0.3
431	0.3
432	0.35
433	0.34
434	0.35
435	0.33
436	0.38
437	0.34
438	0.34
439	0.36
440	0.33
441	0.36
442	0.35
443	0.35
444	0.29
445	0.26
446	0.25
447	0.23
448	0.29
449	0.37
450	0.34
451	0.35
452	0.36
453	0.42
454	0.43
455	0.5
456	0.52
457	0.49
458	0.56
459	0.53
460	0.57
461	0.52
462	0.5
463	0.45
464	0.4
465	0.37
466	0.33
467	0.35
468	0.37
469	0.4
470	0.42
471	0.46
472	0.45
473	0.44
474	0.43
475	0.44
476	0.41
477	0.46
478	0.5
479	0.49
480	0.46
481	0.52
482	0.52
483	0.55
484	0.6
485	0.62
486	0.64
487	0.7
488	0.77
489	0.75
490	0.81
491	0.8
492	0.8
493	0.81
494	0.82
495	0.81
496	0.81
497	0.83
498	0.76
499	0.69
500	0.62
501	0.56
502	0.47
503	0.39
504	0.3
505	0.21
506	0.19
507	0.18
508	0.15
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.1
513	0.09
514	0.09
515	0.1
516	0.11
517	0.13
518	0.14
519	0.13
520	0.14
521	0.16
522	0.17
523	0.17

A6RFB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer