FuNGI

A6R469

Protein Details

Accession

A6R469

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-71	IDSVPVSPERKRKNREKDGHSAKKRKHEVSNYAAQPEAEESSPKAKRKEKKDRKHKKHKHHDDFEPSAP	Basic
76-97	SPNPRSQITKKHKHQSQATQDE	Hydrophilic
475-510	EEPETEMPVRRKKGKEKEKEKEKEKKKKKKGKKTTL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-29	ERKRKNREKDGHSAKKRKH
44-62	SPKAKRKEKKDRKHKKHKH
484-508	RRKKGKEKEKEKEKEKKKKKKGKKT

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	aje:HCAG_04427 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MDIDSVPVSPERKRKNREKDGHSAKKRKHEVSNYAAQPEAEESSPKAKRKEKKDRKHKKHKHHDDFEPSAPTLPASPNPRSQITKKHKHQSQATQDEEEEPPTTSRKPLTKASASRLESASTDSTESSPFHLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLSPLLLTYFPPLRGIVLAYSNASISSIPPSPSSPSTPHNLDESPKPHPLTLAMSAGEYGVLYVYLTATFLVFRPERGQALEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWRWVAPGQESTTSMSEAVAPKDRGGSVGVGIGVDDDDDDDDDDDDEDKSSDFDSDKENFRPLPASSAAMLDHSTQHQNNGGLEPPFEAFEDASAGYFQTRSGRRVRGMVRFRVRDVDVIPGAEHDKGFISIEGTMLSPEEEARLVEEERKRAGFAPSSSSSAVAAAAAGVSGGNGNVAPQQAVMSGGLGTSRASTATAAVEIEEEPETEMPVRRKKGKEKEKEKEKEKKKKKKGKKTTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.77
3	0.86
4	0.9
5	0.89
6	0.89
7	0.9
8	0.92
9	0.92
10	0.9
11	0.86
12	0.87
13	0.88
14	0.84
15	0.83
16	0.82
17	0.8
18	0.78
19	0.81
20	0.73
21	0.66
22	0.59
23	0.49
24	0.4
25	0.33
26	0.28
27	0.19
28	0.17
29	0.17
30	0.25
31	0.32
32	0.36
33	0.43
34	0.49
35	0.57
36	0.67
37	0.76
38	0.78
39	0.83
40	0.89
41	0.92
42	0.94
43	0.97
44	0.96
45	0.96
46	0.96
47	0.97
48	0.97
49	0.94
50	0.93
51	0.91
52	0.86
53	0.79
54	0.72
55	0.61
56	0.51
57	0.42
58	0.32
59	0.25
60	0.22
61	0.23
62	0.25
63	0.29
64	0.33
65	0.37
66	0.42
67	0.46
68	0.48
69	0.53
70	0.57
71	0.64
72	0.68
73	0.74
74	0.74
75	0.77
76	0.82
77	0.81
78	0.82
79	0.8
80	0.74
81	0.66
82	0.61
83	0.56
84	0.48
85	0.39
86	0.29
87	0.21
88	0.19
89	0.19
90	0.2
91	0.19
92	0.24
93	0.28
94	0.31
95	0.37
96	0.43
97	0.5
98	0.54
99	0.58
100	0.61
101	0.58
102	0.57
103	0.51
104	0.44
105	0.35
106	0.33
107	0.28
108	0.19
109	0.18
110	0.15
111	0.15
112	0.16
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.12
120	0.11
121	0.13
122	0.1
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.06
130	0.06
131	0.08
132	0.09
133	0.11
134	0.12
135	0.13
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.11
140	0.13
141	0.13
142	0.12
143	0.12
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.1
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.05
152	0.06
153	0.08
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.12
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.13
176	0.16
177	0.18
178	0.21
179	0.21
180	0.21
181	0.25
182	0.27
183	0.27
184	0.26
185	0.25
186	0.24
187	0.27
188	0.28
189	0.27
190	0.29
191	0.29
192	0.26
193	0.25
194	0.25
195	0.22
196	0.21
197	0.18
198	0.14
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.11
203	0.07
204	0.05
205	0.03
206	0.03
207	0.02
208	0.02
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.04
215	0.04
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.14
223	0.15
224	0.11
225	0.15
226	0.16
227	0.13
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.06
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.14
253	0.16
254	0.16
255	0.2
256	0.23
257	0.3
258	0.31
259	0.31
260	0.32
261	0.32
262	0.32
263	0.29
264	0.25
265	0.17
266	0.15
267	0.15
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.12
272	0.1
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.15
277	0.15
278	0.14
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.13
283	0.12
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.12
312	0.15
313	0.19
314	0.2
315	0.22
316	0.21
317	0.21
318	0.23
319	0.19
320	0.2
321	0.17
322	0.17
323	0.15
324	0.16
325	0.15
326	0.13
327	0.14
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.18
335	0.19
336	0.19
337	0.19
338	0.19
339	0.15
340	0.16
341	0.15
342	0.13
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.08
347	0.07
348	0.09
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.13
357	0.16
358	0.19
359	0.26
360	0.31
361	0.33
362	0.4
363	0.45
364	0.48
365	0.53
366	0.59
367	0.61
368	0.59
369	0.59
370	0.57
371	0.52
372	0.45
373	0.38
374	0.35
375	0.27
376	0.24
377	0.22
378	0.18
379	0.19
380	0.17
381	0.16
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.18
404	0.22
405	0.24
406	0.28
407	0.28
408	0.28
409	0.28
410	0.32
411	0.3
412	0.28
413	0.32
414	0.31
415	0.34
416	0.33
417	0.31
418	0.26
419	0.21
420	0.19
421	0.11
422	0.09
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.04
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.07
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.1
459	0.09
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.13
467	0.19
468	0.24
469	0.33
470	0.4
471	0.48
472	0.57
473	0.66
474	0.75
475	0.8
476	0.84
477	0.86
478	0.9
479	0.92
480	0.94
481	0.93
482	0.93
483	0.93
484	0.93
485	0.93
486	0.93
487	0.94
488	0.94
489	0.95
490	0.96

A6R469

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer